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5 篇 中国科学院大学
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4 篇 chengdu institut...
4 篇 四川农业大学
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1 篇 四川省动物学会
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作者

22 篇 岳碧松
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5 篇 江建平
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4 篇 张丽芳
4 篇 宋昭彬
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3 篇 杜联名
3 篇 杨光友
3 篇 bisong yue
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3 篇 jing li
3 篇 戚文华
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排序：

酒精保存液对两栖类标本的影响

酒精保存液对两栖类标本的影响

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四川省动物学会第十届会员代表大会暨第十一次学术研讨会

作者：舒国成李成中国科学院成都生物研究所中国科学院大学

生物学家常常直接测量两栖类标本的形态数据用于分类学、系统进化、生态学等研究。但是,保存液中的化学物质对标本会产生不可忽略的影响,如标本体色、头体长和体质量等会随时间而变化,从而导致研究结果与真实情况产生一定偏差。本文主... 详细信息

生物学家常常直接测量两栖类标本的形态数据用于分类学、系统进化、生态学等研究。但是,保存液中的化学物质对标本会产生不可忽略的影响,如标本体色、头体长和体质量等会随时间而变化,从而导致研究结果与真实情况产生一定偏差。本文主要讨论了保存于酒精中的20种两栖类标本头体长和体质量在10年间的变化。通过t检验发现,用酒精保存10年后的两栖类标本头体长与原始标本头体长及保存标本体质量与原始标本体质量均存在极显著差异（P<0.001）,头体长缩短和体质量减少因物种而异（头体长:0.82～13.92 mm,体质量:0.59～13.05 g）;头体长缩短比例和体质量减少比例也因物种而异（头体长:1.86%.68%,体质量:12.20%8.44%）。无尾类两栖动物与有尾类两栖动物的头体长减少量、头体长减少比例、体质量减少量及体质量减少比例均存在极显著差异（P<0.001）:无尾类两栖动物的头体长平均减少3.45 mm,减少比例平均为5.18%,体质量平均减少5.95 g,平均减少比例为24.51%;有尾类头体长平均减少13.88 mm,平均减少比例为9.65%;体质量平均减少3.73 g,平均减少比例为31.39%。本文揭示了两栖类标本在酒精保存过程中头体长缩短和体质量减轻的现象,建议以保存标本为研究对象时需谨慎对待和进行必要校正。

关键词：两栖类标本头体长体质量

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德国小蠊转座子进化分析

德国小蠊转座子进化分析

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四川省动物学会第十届会员代表大会暨第十一次学术研讨会

作者：牟必琴李午佼严超超范振鑫张修月岳碧松四川大学生命科学学院

转座子是真核生物基因组的重要组成部分。其中自主型的逆转座子如LTR和LINE元件在各类群物种的分子系统发育、遗传多样性等方面的研究中得到了广泛的应用。为了揭示德国小蠊Blattella germanica基因组中转座子的种类与分布,以及转座子... 详细信息

转座子是真核生物基因组的重要组成部分。其中自主型的逆转座子如LTR和LINE元件在各类群物种的分子系统发育、遗传多样性等方面的研究中得到了广泛的应用。为了揭示德国小蠊Blattella germanica基因组中转座子的种类与分布,以及转座子自身的遗传变异特性,本研究采用Repeat Modeler的de novo预测和使用Rep Base库进行同源性搜索相结合的方法,在德国小蠊中鉴定出了76个DNA转座子家族,占基因组的9.44%。逆转座子中非长末端重复逆转座子LINE家族33个,占基因组的7.12%,SINE家族37个,占基因组的2.59%,长末端重复逆转座子LTR家族24个,占基因组的0.3%。所有转座子序列长度占整个基因长度的19.46%。对转座子的插入时间进行估计的结果表明,大部分元件都是最近四万年进入到德国小蠊基因组中的。我们还比较了切叶蚁Acromyrmex echinatior、黒腹果蝇drosophila melanogaster、大蜜蜂Apis dorsata、佛罗里达弓背蚁Camponotus floridanus、印度跳蚁Harpegnathos saltator、西花蓟马Frankliniella occidentalis、东亚飞蝗Locusta migratoria、豌豆芽Acyrthosiphon pisum、大头美切叶蚁Atta cephalotes、古白蚁Zootermopsis nevadensis等十种昆虫与德国小蠊中共有的LINE和LTR超家族分支的差异,结果表明不同分支在不同昆虫中有着不同的扩张。基于转座子构建的进化树表明古白蚁与德国小蠊的关系最近,古白蚁是从德国小蠊祖先中分化而来的。德国小蠊LTR和LINE逆转座子的鉴定和系统进化分析有助于我们理解逆转座子的进化历程及其在昆虫进化中的作用。

关键词：德国小蠊转座子进化分析

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医学生在川南地区防治肺吸虫病健康教育的效果评估

医学生在川南地区防治肺吸虫病健康教育的效果评估

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四川省动物学会第十届会员代表大会暨第十一次学术研讨会

作者：李江海刘茂刘孝清谢兴雨毛堂连彭小莉邓维婷熊琳王光西四川医科大学四川医科大学病原生物学教研室

目的通过在川南地区的肺吸虫病流行区开展健康教育并进行效果评估,探讨医学生对农村地区健康教育的作用。方法在2015年1—2月,由医学生为宣教员,在四川省泸州、宜宾等地的农村肺吸虫病流行地区,采用问卷调查的方式,对部分在校中小学生... 详细信息

目的通过在川南地区的肺吸虫病流行区开展健康教育并进行效果评估,探讨医学生对农村地区健康教育的作用。方法在2015年1—2月,由医学生为宣教员,在四川省泸州、宜宾等地的农村肺吸虫病流行地区,采用问卷调查的方式,对部分在校中小学生、村民的肺吸虫病相关知识、致病性、传染方式以及如何防治进行调查,并根据调查结果,采用在学校课堂上讲解和逐户走访两种方法进行预防肺吸虫病宣传教育。在讲解结束后,再次进行问卷调查,通过前后结果的对比得出健康宣讲前后居民对肺吸虫病认识的差异,比较在学校课堂上讲解和逐户走访两种方法进行预防肺吸虫病宣传教育的效果。结果 1、健康教育前后,知晓肺吸虫,分别为4.76%(34/715),95.52%(683/715);生吃、半生吃溪蟹会患病,分别为1.82%(13/715),93.57%(669/715)。2、在学校课堂上,讲解前后居民对肺吸虫及肺吸虫病的知晓率分别为5.28%(17/322)和100%(322/322);走访方式,讲解前后居民对肺吸虫及肺吸虫病的知晓率分别为4.32%(17/393)和91.49%(344/376),差异具有统计学意义(P<0.05)。结论经健康教育后,居民对肺吸虫、肺吸虫病知晓率大有提高,采取在课堂上为学生讲解的方式比逐户走访讲解的效果更好,医学生作为宣教员在农村地区进行肺吸虫病健康教育工作,达到了健康教育与健康促进的效果。

关键词：医学生肺吸虫病健康教育效果评估

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气候变化条件下中国西南山地鸟类多样性热点的变化

气候变化条件下中国西南山地鸟类多样性热点的变化

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四川省动物学会第十届会员代表大会暨第十一次学术研讨会

作者：吴永杰 Shane G.DuBay Robert K.Colwell 冉江洪雷富民四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室中国科学院动物研究所动物进化与系统学院重点实验室 Committee on Evolutionary Biology University of Chicago Life Sciences Section Integrative Research CenterField Museum of Natural History Department of Ecology and Evolutionary Biology University of Connecticut University of Colorado Museum of Natural History

横断山区作为中国鸟类物种最丰富的地区和全球25/34个生物多样性热点地区之一,是连接古北界和东洋界动物区系的重要地理连接带。经搜集本地区文献资料及标本馆标本数据,结合野外观测数据,我们整理了横断山区752种繁殖鸟的生态分布数据,... 详细信息

横断山区作为中国鸟类物种最丰富的地区和全球25/34个生物多样性热点地区之一,是连接古北界和东洋界动物区系的重要地理连接带。经搜集本地区文献资料及标本馆标本数据,结合野外观测数据,我们整理了横断山区752种繁殖鸟的生态分布数据,并在此基础上获得横断山地区鸟类物种多样性的立体分布格局图。研究发现横断山区鸟类物种多样性丰富度在海拔800～1800 m最丰富,四川盆地西缘的岷山—邛崃山—大、小相岭山脉是连接古北界和东洋界重要的生物多样性通道,为生物多样性保护提供了新的理论依据。气候变化,特别是温度的变化会导致鸟类的垂直分布发生变化,进而影响本地区的鸟类多样性分布格局。通过利用两种模型(同质性响应和随机异质性响应)模拟温度变化对鸟类垂直分布的影响,研究发现在最近10万年左右,四川盆地和周缘山地对本地区的物种保存具有重要的意义。即冰期时,四川盆地物种丰富度较高,是鸟类物种的"避难地";而周围山地物种丰富度低,成为鸟类物种的地理隔离。而间冰期时,四川盆地物种丰富度反而不如山区物种丰富度高,盆地扮演着地理隔离的作用,山区成为了物种间冰期的"避难地"。这对历史和未来全面揭示气候变化对物种多样性的影响具有重要意义。

关键词：横断山鸟类生物多样性通道物种丰富度海拔梯度气候变化

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八种圈养灵长类动物毛首属线虫的种系发生研究

八种圈养灵长类动物毛首属线虫的种系发生研究

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四川省动物学会第十届会员代表大会暨第十一次学术研讨会

作者：李梅刘梅赵波古小彬汪涛赖为民杨光友四川农业大学动物医学院动物寄生虫病研究中心成都动物园

目的探讨圈养灵长类动物毛首属Trichuris spp.线虫的分子分类与种系发生。方法采集圈养灵长类动物的毛首线虫进行DNA抽提和线粒体cox1基因和核糖体ITS区基因的扩增,结合已发布的毛首属线虫相关序列信息进行分析,构建毛首线虫分子种系发... 详细信息

目的探讨圈养灵长类动物毛首属Trichuris spp.线虫的分子分类与种系发生。方法采集圈养灵长类动物的毛首线虫进行DNA抽提和线粒体cox1基因和核糖体ITS区基因的扩增,结合已发布的毛首属线虫相关序列信息进行分析,构建毛首线虫分子种系发生树,分析灵长类动物毛首线虫的分子系统关系。结果所测来自八种灵长类动物(川金丝猴、滇金丝猴、绿狒狒、绿猴、平顶猴、猕猴、白颊长臂猿、阿拉伯狒狒)的毛首线虫样品,经比对校正后所有样本的cox1序列大小为767 bp,无插入/缺失;ITS区基因全长为1202～1264bp,存在插入/缺失。所测八种毛首线虫样品的ITS区基因序列间同源性高于94.7%。川金丝猴与滇金丝猴毛首线虫样品的cox1基因序列间同源性为99.6%,其余六种灵长类动物的毛首线虫样品的cox1基因序列间相似性高于97.8%。基于cox1基因序列构建的两种进化树发现,所测的八种灵长类动物的毛首线虫与来自人的鞭形毛首线虫聚合到了一个分支树中。其中来自川金丝猴和滇金丝猴的毛首线虫单独聚合到一个小的分支树中,说明二者很可能是相同或者极其相近的种。基于ITS区基因序列构建的两种进化树发现,所测八种灵长类动物的毛首线虫与来自人的鞭形毛首线虫和狒狒的毛首线虫未定种聚合到一个大的分支树中,说明人和非人灵长类动物感染的毛首线虫是近缘种。结论川金丝猴与滇金丝猴的毛首线虫是相同或极其相近的种,而其余六种毛首线虫为与其亲缘关系较近的种。

关键词：圈养灵长类毛首线虫系统发生

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画稿溪国家级自然保护区的动物多样性调查与监测

画稿溪国家级自然保护区的动物多样性调查与监测

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四川省动物学会第十届会员代表大会暨第十一次学术研讨会

作者：李成戴强王燕梁茜茜王守红中国科学院成都生物研究所

四川省叙永县画稿溪自然保护区原记录动物多样性228种(未调查昆虫纲和鱼纲);2013年5月和8月,成都生物所组织了多学科专业人员对画稿溪保护区的动物多样性进行了综合考察,动物类群涵盖了昆虫纲、鱼纲、两栖纲、爬行纲、鸟纲和哺乳纲。调... 详细信息

四川省叙永县画稿溪自然保护区原记录动物多样性228种(未调查昆虫纲和鱼纲);2013年5月和8月,成都生物所组织了多学科专业人员对画稿溪保护区的动物多样性进行了综合考察,动物类群涵盖了昆虫纲、鱼纲、两栖纲、爬行纲、鸟纲和哺乳纲。调查新增208种,其中鱼纲26种;爬行纲2种;鸟纲18种;哺乳纲8种;昆虫纲动物154种。保护区动物总数达到22目99科320属436种,其中鱼纲(淡水鱼类)3目8科26属26种,两栖纲2目8科16属22种,爬行纲2目6科17属21种,鸟纲6目44科102属158种,哺乳纲7目23科45属55种;昆虫纲2目10科114属154种。在原调查报告30种保护动物的基础上(未包含省级重点保护动物),新增国家Ⅱ级重点保护野生动物3种,省级重点保护动物16种;画稿溪自然保护区分布的国家级和省级重点保护动物总数达49种,其中国家Ⅰ级保护动物3种,国家Ⅱ级保护动物30种,省级重点保护动物16种。2014年,基于本底调查结果,成都生物所采用样线法和围栏陷阱法,开展了环境指示物种两栖动物的监测工作,每年的6、8、10月分别监测10天。当年10条样线共发现两栖动物13种269只,以6月的物种和数量最多,13种102只;10组围栏陷阱共发现6种137只,以10月为捕获高峰,5种89只。监测结果初步揭示了两栖动物的生活习性和活动节律:6月以迁徙繁殖为主,10月以定点育肥为主。

关键词：画稿溪自然保护区动物多样性监测

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美洲大蠊不同虫态组脂溶性化学成分的GC-MS分析

美洲大蠊不同虫态组脂溶性化学成分的GC-MS分析

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四川省动物学会第十届会员代表大会暨第十一次学术研讨会

作者：邹媛马雯琦张丽芳范振鑫岳碧松张修月四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室四川大学生命科学学院四川省濒危野生动物保护生物学重点实验室

美洲大蠊Periplaneta americana为昆虫纲,蜚蠊目,大蠊属昆虫,是我国室内卫生害虫的优势种,同时也是重要的药用昆虫。近年来对美洲大蠊的药用研究越来越多,以美洲大蠊为原料已开发的"康复新液","肝龙胶囊"等已进入... 详细信息

美洲大蠊Periplaneta americana为昆虫纲,蜚蠊目,大蠊属昆虫,是我国室内卫生害虫的优势种,同时也是重要的药用昆虫。近年来对美洲大蠊的药用研究越来越多,以美洲大蠊为原料已开发的"康复新液","肝龙胶囊"等已进入临床应用,而且有较好的临床效果,然而有效要用成分和药用机理并不十分清楚,需要进一步研究。本研究使用气相色谱-质谱联用仪分别对美洲大蠊醇提物、乙酸乙酯提取物、正己烷提取物和石油醚提取物进行分析,比较雌成虫、雄成虫、7～8龄若虫、3～4龄若虫和刚蜕皮成虫五个虫态组脂溶性化学成分的差异。研究共鉴定了169种化合物,其中烷烃类49种,脂肪酸类63种,酯类30种,醇、醛、酮、酚等27种;五个虫态组都有的成分17种,雄虫特有成分22种,雌虫特有成分25种,7～8龄若虫特有成分22种,3～4龄若虫特有成分19种,刚蜕皮成虫特有成分13种;这些结果显示,美洲大蠊酯溶性成分主要以脂肪酸类和烷烃类为主,脂肪酸组成复杂,各虫态组在种类和含量上差异较大。同时,根据美洲大蠊五个虫态的GC-MS分析结果,查阅相关文献,从鉴定出的脂溶性化学成分中筛选出了11种具有药用活性的化学成分,而且雄成虫在含有药用活性成分的种类和含量上都高于其他虫态。这些结果为美洲大蠊的进一步开发和利用提供了重要基础数据。

关键词：美洲大蠊不同虫态组化学成分 GC-MS分析

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两种猕猴和川金丝猴全基因组微卫星特征分析

两种猕猴和川金丝猴全基因组微卫星特征分析

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四川省动物学会第十届会员代表大会暨第十一次学术研讨会

作者：孙天琳李鹏杜联名邱实岳碧松李静四川大学生命科学学院四川省濒危野生动物保护生物学重点实验室

微卫星DNA又称为串联重复序列(STRs),广泛分布于真核生物和一些原核生物基因组中,具有种属间的分布和碱基组成特异性。由于微卫星序列具有高度多态性等优点因而是一种良好的分子标记而被广泛应用。但迄今人们对微卫星在全基因组水平上... 详细信息

微卫星DNA又称为串联重复序列(STRs),广泛分布于真核生物和一些原核生物基因组中,具有种属间的分布和碱基组成特异性。由于微卫星序列具有高度多态性等优点因而是一种良好的分子标记而被广泛应用。但迄今人们对微卫星在全基因组水平上的分布和组成上的差异的相关研究较少。随着测序技术的进步,多个物种的基因组已公布,这使我们可以在全基因组水平上对微卫星的分布和组成情况进行分析。利用本实验室开发的微卫星软件MSDB2.4.3,我们首次对已公布的两个猕猴属动物:恒河猴Macaca mulatta,食蟹猴Macaca fascicularis以及仰鼻猴属的川金丝猴Rhinopithecus roxellana基因组中完美型微卫星进行了系统分析和比较。猕猴属两种猴类中,恒河猴,食蟹猴基因组微卫星总量分别为1 200 114个,1 260 186个;略少于川金丝猴微卫星总量(1 368 292个)。微卫星总长度分别为23 974 368 bp,25 531 821 bp,28 650 405 bp,分别占基因组的8.37‰,8.89‰,9.88‰。从微卫星的总密度来说,恒河猴,食蟹猴,川金丝猴分别为419.08bp/Mb,438.81 bp/Mb,471.90 bp/Mb;而总丰度三者则分别为8371.92个/Mb,8890.45个/Mb,9880.98个/Mb。三个基因组中微卫星各重复类型数量都具有如下特点:单碱基>二碱基>四碱基>三碱基>五碱基>六碱基。从各碱基重复拷贝类别数量方面来说,三个物种中数量较多的都为A,AC,AAAT,AG,AAAC,AAAG,AT,AAT,AAC等。本研究系统分析了三种猴子的微卫星特征,为进一步筛选微卫星遗传标记提供了参考。

关键词：恒河猴食蟹猴川金丝猴基因组微卫星

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中华豆芫菁线粒体基因组全序列及鞘翅目系统发育分析

中华豆芫菁线粒体基因组全序列及鞘翅目系统发育分析

引用

四川省动物学会第十届会员代表大会暨第十一次学术研讨会

作者：杜超范振鑫张修月岳碧松四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室四川大学生命科学学院四川省濒危野生动物保护生物学重点实验室

芫菁是鞘翅目Coleoptera芜菁科Meloidae昆虫的统称。除新西兰、南极洲和波利尼西亚岛外,全世界均广泛分布。芫菁科昆虫全世界已知120个属,3000多种,中国已知15属,130余种。芫菁体内产生的萜类防御物质——斑蝥素(Cantharidin,CHO),具有... 详细信息

芫菁是鞘翅目Coleoptera芜菁科Meloidae昆虫的统称。除新西兰、南极洲和波利尼西亚岛外,全世界均广泛分布。芫菁科昆虫全世界已知120个属,3000多种,中国已知15属,130余种。芫菁体内产生的萜类防御物质——斑蝥素(Cantharidin,CHO),具有多种药理作用,使其成为一类重要的资源昆虫。我们对中华豆芫菁的线粒体全基因组进行了测序,得到长度为15 717 bp的全序列。中华豆芫菁线粒体基因组包括13个蛋白编码基因,2个核糖体RNA基因组,22个转运RNA基因组和一个非编码的控制区。所有蛋白编码基因均以标准的ATN为起始密码子,TAA或TAG为终止密码子。除tRNA-Ser（AGN）缺少D臂不能形成稳定的环外,其他转运RNA均折叠成标准的三叶草结构;核糖体RNA两个亚基分别包含了48和32个螺旋结构。用重链上13个蛋白编码基因构建的鞘翅目45个种的系统发育树表明,中华豆芫菁与拟步甲科为姊妹群,形成拟步甲总科后,再与叶甲总科聚为一个进化支,构成多食亚目中最大的扁虫下目;多食亚目与原鞘亚目聚为一个进化支后和（肉食亚目+菌食亚目）聚为一大的进化支。鞘翅目中4个亚目以及多食亚目中下目的进化关系有待进一步研究。

关键词：中华豆芫菁线粒体基因组鞘翅目系统进化

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基于RNA-Seq数据的大熊猫基因组补充注释

基于RNA-Seq数据的大熊猫基因组补充注释

引用

四川省动物学会第十届会员代表大会暨第十一次学术研讨会

作者：汪自立李午佼杜联名范振鑫张修月岳碧松四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室四川大学生命科学学院四川省濒危野生动物保护生物学重点实验室

大熊猫Ailuropoda Melanoleura基因组已经测序并组装（AilMel.0）,随后Ensembl和NCBI分别先后发布了AilMel.0的注释结果。他们的注释主要依据已注释物种的同源对比,而这些对比的物种大部分与大熊猫的亲缘关系较远,这就可能造成不完全的... 详细信息

大熊猫Ailuropoda Melanoleura基因组已经测序并组装（AilMel.0）,随后Ensembl和NCBI分别先后发布了AilMel.0的注释结果。他们的注释主要依据已注释物种的同源对比,而这些对比的物种大部分与大熊猫的亲缘关系较远,这就可能造成不完全的注释。为了补充注释大熊猫基因组,我们利用大熊猫大熊猫三个组织共5个样本转录组资料,分别使用TopHat、Cufflinks和Trinity完成对RNA-seq数据的初步组装,并结合从头预测和同源对比,重新注释大熊猫基因组。本研究共注释了23 887个基因,共计25 294个转录子,其中有3382单外显子基因。在选择性剪接体方面,2.80%的基因有可变剪接亚型。在注释的转录子中,82.05%都包含起始、终止密码子,17.67%的转录子包含UTR区域,其中6.69%的转录子两端均含UTR。在证据源的支持上,47.37%的转录子被5个证据源支持,而被3种类型证据源支持的转录子也占了56.30%。被单个证据源支持的转录子仅占12.23%。在GO注释方面,AilMelnn共计注释16 664个转录子,共计112 720个条目。此外,将AilMelnn进一步与NCBI和Ensembl注释结果进行比较发现,大部分AilMelnn上注释基因结构与NCBI和Ensembl存在差异,其中最大差异来源于剪接形式上的差异。除此之外,AilMelnn注释了7651个NCBI和Ensembl中未被注释的基因,其中4962个基因在NCBI的NR库中存在相似序列。再将其余2689个未被注释的基因与Pfam数据库进行比较,发现其中81个基因编码的蛋白质序列存在功能域,这部分基因可能是未被发现的新基因。

关键词：大熊猫 RNA-seq 转录组组装基因组补充注释

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