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- 24 篇 基础医学(可授医学...
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- 1 篇 教育学
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主题

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3 篇 甲基化特异性pcr
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3 篇 orf
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3 篇 外部引导序列
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机构

39 篇 广东省儿童医院
24 篇 华南农业大学
19 篇 广东省妇幼保健院...
13 篇 汕头大学
12 篇 prenatal diagnos...
11 篇 广州市妇女儿童医...
11 篇 暨南大学
9 篇 中山大学
8 篇 南方医科大学
6 篇 华南师范大学
6 篇 中山大学附属第一...
5 篇 广东省妇产医院
5 篇 广东省计划生育科...
5 篇 广东省生物资源应...
5 篇 中山大学生命科学...
5 篇 韩山师范学院
4 篇 广州医科大学
4 篇 laboratory of in...
4 篇 长江大学
4 篇 广东省妇幼保健院...

作者

16 篇 刘丽
16 篇 王波
12 篇 苏海浩
12 篇 胡兢晶
12 篇 李秀珍
11 篇 伍苑宾
10 篇 刘向东
10 篇 盛慧英
10 篇 丁俊彩
9 篇 尹爱华
9 篇 陈志雄
9 篇 蔡燕娜
8 篇 谢斌华
8 篇 郭媛媛
8 篇 程静
8 篇 密英鸽
7 篇 yin a
6 篇 wu j
6 篇 林瑞珠
6 篇 曹阳

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蝙蝠食性与甜味受体基因的功能演化

蝙蝠食性与甜味受体基因的功能演化

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第十四届全国野生动物生态与资源保护学术研讨会暨第九届中国动物学会兽类学分会全国代表大会

作者：焦恒武谢焕旺张礼标赵华斌武汉大学生命科学学院武汉 430072 武汉大学生命科学学院武汉 430072 广东省生物资源应用研究所广州510260 广东省生物资源应用研究所广州510260

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施氮量对全株小麦产量和营养价值的影响

施氮量对全株小麦产量和营养价值的影响

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中国草学会饲料生产专业委员会第九届代表大会暨第十八次学术研讨会

作者：李春江徐赵红张建国华南农业大学草业科学系/广东省草业工程技术研究中心广东广州510642

以石麦001小麦(TriticumaestivumL.)品种为材料,研究不同施氮量对全株小麦干物质产量、营养价值以及青贮品质的影响,为全株小麦青贮利用的施肥管理提供理论依据.试验设0、75、150、225、300kg·hm-25个不同施氮量处理,分基肥和拔节... 详细信息

以石麦001小麦(TriticumaestivumL.)品种为材料,研究不同施氮量对全株小麦干物质产量、营养价值以及青贮品质的影响,为全株小麦青贮利用的施肥管理提供理论依据.试验设0、75、150、225、300kg·hm-25个不同施氮量处理,分基肥和拔节肥,按照6:4施入.蜡熟期调查小麦的株高、分蘖数,并取样测产、分析营养成分,同时将材料实验室青贮2个月,分析其青贮品质.结果表明:施氮量0～150kg·hm-2之间,随着施氮量增加,小麦干草产量显著增加(p<0.05),当施氮量超过150kg·hm-2时,干草产量保持相对稳定.施氮量0～225kg·hm-2时,小麦的粗蛋白含量和干物质消化率都随施氮量的增加而显著提高(p<0.05),施氮量超过225kg·hm-2后,两者变化不大(p>0.05).相反,小麦的粗纤维、中性洗涤纤维以及酸性洗涤纤维随着施氮量的增加,趋向于减少.施氮量0～225kg·hm-2时,小麦可溶性碳水化合物(WSC)含量随着施氮量的增加而增加(p<0.05),施氮量高于225kg·hm-2后,WSC含量不再增加.高施氮量的全株小麦原材料中会积累较多硝态氮含量.综上所述,从全株小麦干物质产量和营养价值综合考虑,本实验中施氮量应保持在150kg·hm-2左右.

关键词：小麦施氮量干物质产量营养价值

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人偏肺病毒A与B基因型对小鼠致病性的观察

人偏肺病毒A与B基因型对小鼠致病性的观察

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广东省遗传学会第九届代表大会暨学术研讨会

作者：周真崔玉霞张永波秦弦李荣培刘平窦颖王莉佳赵晓东赵耀广东省儿童医院·广东省妇幼保健院贵州省人民医院儿科重庆医科大学附属儿童医院儿科研究所

目的人偏肺病毒(Human metapneumovirus hMPV)是2001年首次被分离的呼吸道病毒病原,可导致各年龄组人群呼吸道感染,以儿童感染为主,严重者威胁生命造成死亡,不仅如此,hMPV感染还与哮喘发生、发展有关。迄今为止,仅有少量关于hMPV基因型... 详细信息

目的人偏肺病毒(Human metapneumovirus hMPV)是2001年首次被分离的呼吸道病毒病原,可导致各年龄组人群呼吸道感染,以儿童感染为主,严重者威胁生命造成死亡,不仅如此,hMPV感染还与哮喘发生、发展有关。迄今为止,仅有少量关于hMPV基因型与临床致病性关系的研究报道,且结论不一致。本实验通过观察hMPV两亚型代表株NL/1/00(A亚型)与NL/1/99(B亚型)感染致病BALB/c小鼠后,小鼠在体重,体内病毒载量,肺部病理评分及气道反应性等方面的改变,明确病毒的基因型与致病性是否存在关联,从而为疾病的诊断、治疗、评估、预后提供依据。方法致病性的高低通过下列四项评价:1、感染病毒后宿主体重变化;2、宿主气道高反应变化;3、宿主肺部病理评分;4、宿主体内病毒复制的载量测定。本实验以雌性BALB/c小鼠为动物模型,随机分为4组,分别设空白对照组(即DMEM滴鼻组),A亚型组(NL/1/00滴鼻组),B亚型组(NL/1/99滴鼻组)及混合组(NL/1/00与NL/1/99混合滴鼻组),每项实验中每组小鼠各有8只。hMPV感染BALB/c小鼠后,通过使用real-time RT-PCR方法检测鼠肺内病毒载量的变化,肺功能检测仪监测小鼠气道反应性的变化及组织系统评分判定病理改变情况,来观测hMPV两亚型致病性的差异。各项数据均通过SAS统计软件分析。结果 hMPV可在小鼠体内复制存活约3周,于第4天到达复制高峰后逐渐减少,3周左右检测不到病毒;BALB/c小鼠感染hMPV后第1-6天会出现活动减少,饮食不佳,毛发直立,挠鼻,体重下降、气道反应性增高等变化;肺组织切片中可见有大量炎性细胞浸润。本实验中,对照组与hMPV感染组,在体重的动态监测、病毒载量、肺组织病理改变及气道反应性上有显著差异(P〉0.05),但hMPV A.B亚型及混合感染组之间无明显差异(P<0.05)。结论在BALB/c动物模型中,hMPV的A.B亚型的致病性无明显差异,基因型与致病性的高低无明确关联。

关键词：人偏肺病毒基因型致病性

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酪氨酸激酶抑制剂Neratinib逆转肿瘤多药耐药作用及其机制研究

酪氨酸激酶抑制剂Neratinib逆转肿瘤多药耐药作用及其机制研究

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广东省遗传学会第九届代表大会暨学术研讨会

作者：赵小琴符立梧广东省儿童医院·广东省妇幼保健院中山大学肿瘤防治中心华南肿瘤国家重点实验室

ATP结合盒膜通道转运蛋白(ATP-binding cassette,（ABC）transporters)能与抗肿瘤药物结合,利用ATP水解时释放的能量,将化疗药物泵出细胞外,从而降低其细胞毒作用,并导致多药耐药。而Nerat i nib是一种口服的不可逆的小分子酪氨酸激酶... 详细信息

ATP结合盒膜通道转运蛋白(ATP-binding cassette,（ABC）transporters)能与抗肿瘤药物结合,利用ATP水解时释放的能量,将化疗药物泵出细胞外,从而降低其细胞毒作用,并导致多药耐药。而Nerat i nib是一种口服的不可逆的小分子酪氨酸激酶抑制剂,通过与ATP结合位点结合而选择性抑制EGFR和Her-2等激酶活性。因此,本研究对酪氨酸激酶抑制剂neratinib与ABC转运蛋白的关系进行了探讨。Neratinib不仅显著逆转ABCB1过表达细胞对ABCBl底物阿霉素,长春新碱和紫杉醇的耐药性。更重要的是,neratinib体外显著增加从白血病患者骨髓中分离出来的ABCBl高表达白血病细胞对阿霉素的药物敏感性;体内显著增加ABCB1高表达细胞KBv200对传统抗癌药物敏感性,联合用药组抑瘤率为41.29%。机理研究表明,neratinib浓度依赖性地增加阿霉素和罗丹明123在ABCB1高表达细胞中的积累,以及罗丹明123在ABCB1高表达白血病细胞中的积累。同时,neratinib对ABCB1在蛋白和mRNA水平的表达均没有显著影响,但neratinib在较低浓度下能明显激活ABCB1ATPase活性而在较高浓度抑制其活性,并且抑制I-IAAP对P-gp的光结合性标记(IC=0.24 Pmol几)。Docking模拟neratinib与ABCB1最可能的结合位点,从计算机模拟角度佐证了TKIs与人源ABCB1的交叉反应。这些结果说明neratinib通过抑制ABCB1药物外排泵功能增加MDR细胞内的药物浓度,从而恢复MDR细胞对化疗药物的敏感性。Neratinib在有效逆转浓度下对Akt磷酸化水平没有明显阻断作用;表明neratinib逆转MDR与Akt通路的阻断作用无关。通过实验我们证明:Neratinib通过抑制ABCB1药物外排泵功能,在体内和体外逆转ABCB1介导的MDR,对指导临床联合用药具有一定意义。Neratinib在体外增加ABCB1底物阿霉素对ABCB1高表达白血病患者的白血病细胞的细胞毒作用,为克服白血病多药耐药提供理论依据。Neratinib对ABCG2和ABCC1介导的MDR没有明显逆转作用。

关键词：多药耐药 ABC transporters 酪氨酸激酶抑制剂 ABCB1/P-gP neratinib

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Clinical studies and cytogenetic analysis in neonate with the Wolf-Hirschhorn syndrome

Clinical studies and cytogenetic analysis in neonate with th...

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广东省遗传学会第九届代表大会暨学术研讨会

作者： LI Feng-zhen 唐斌 ZHONG Yin-huan ZHANG Yi-cong Department of Medical Genetics Center GuangDong Women and Children Hospital 广东省妇幼保健院医学遗传中心

Objective To investigate the clinical phenotype and genetic effect of the Wolf-Hirschhorn *** Conventional chromosome analysis of peripheral blood lymphocytes from the proband and her parents were cultured routinely for the karyotype analysis with G *** The karyotypes of the proband and her parents were 46,XX,1qh+,del(4)(p15-ter) de novo and normal,*** The proband was considered to be due to de novo terminal deletions and a new resource for analyzing the Wolf-Hirschhorn syndrome.

关键词： Wolf-Hirschhorn syndrome de novo karyotype analysis

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利用分子标记辅助选择改良水稻白叶枯病抗性

利用分子标记辅助选择改良水稻白叶枯病抗性

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广东省遗传学会第九届代表大会暨学术研讨会

作者：刘峰陈伟雄梁青陈玉英梁继生陈雪瑜广州市农业科学研究院

水稻作为我国的主要粮食作物容易受到病害侵袭,造成产量和品质的下降,对我国粮食安全造成负面影响。水稻白叶枯病(Xanthomonas oryzae ***,Xoo)作为水稻三大病害之一,容易受到环境诱发。这一特性使得水稻生产者难于对其发病做出快速有... 详细信息

水稻作为我国的主要粮食作物容易受到病害侵袭,造成产量和品质的下降,对我国粮食安全造成负面影响。水稻白叶枯病(Xanthomonas oryzae ***,Xoo)作为水稻三大病害之一,容易受到环境诱发。这一特性使得水稻生产者难于对其发病做出快速有效的预防和控制措施,从而造成不可估量的稻米减产。目前,最有效的对策是利用水稻自身的白叶枯病抗性来对病害进行预防和控制。一些水稻品种,尤其是地方品种,在同当地特有的白叶枯病病原菌进行生存竞争和协同进化的过程中逐渐形成对白叶枯病病菌具有抵抗作用的抗性基因。这些来自水稻基因组的抗病基因被分子育种者用来对非抗病的优良品系(品种)进行抗病性改良。通过分子标记辅助选择的育种手段将一个或者多个抗白叶枯病基因导入到待改良的品系(品种)中,大大增加了抗病育种的目的性和可行性。抗白叶枯病基因Xa7和Xa23已经被证实具有广谱持久抗病性。我们首先利用与该二基因紧密连锁的分子标记对已有品种(系)进行抗病基因鉴定。结果显示,在被检测的主要来自广东省水稻区域试验的55份水稻材料中有33份材料携带Xa23抗性基因,2份材料携带Xa7抗性基因。在田间对这些水稻材料接种白叶枯病Ⅳ型混合菌,携带Xa7和Xa23基因的材料均达到抗级以上。此结果说明,近年来广东育成的水稻品种中携带Xa23基因相对较多,而携带Xa7基因的水稻品种少,因此利用Xa7和Xa23改良广东水稻白叶枯病抗性具有一定的意义和应用前景。我们利用携带Xa7和Xa23基因的栽培种与高感白叶枯病的三系恢复系R998等、保持系深97B等进行杂交,并多次回交,结合分子标记分别在杂交和回交后代中选育携带Xa7和Xa23基因的穗系。至今已获得自交四代以上的穗系300多个,通过田间接种Ⅳ型混合菌,均达到抗级或高抗。接下来将对自交后相对稳定的穗系进行不育系测交,以期选育出抗病叶枯病的恢复系及杂交稻组合。

关键词：分子标记辅助选择白叶枯病水稻

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基于比较基因组学和转录组学对变形赖氨酸芽胞杆菌(Lysinibacillus varians GY32)细胞形态变化机理的研究

基于比较基因组学和转录组学对变形赖氨酸芽胞杆菌(Lysinibacillu...

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广东省遗传学会第九届代表大会暨学术研讨会

作者：朱春节许玫英孙国萍广东省微生物研究所

细菌细胞形态形成在一定程度上取决于细胞分裂和细胞周期变化。基于大肠杆菌和枯草芽孢杆菌模型提出的"Z环"分裂体（Z-ring divisome）理论和新月柄杆菌细胞周期性调控理论积累了对细菌形态形成调控机制的认识。本研究从河流... 详细信息

细菌细胞形态形成在一定程度上取决于细胞分裂和细胞周期变化。基于大肠杆菌和枯草芽孢杆菌模型提出的"Z环"分裂体（Z-ring divisome）理论和新月柄杆菌细胞周期性调控理论积累了对细菌形态形成调控机制的认识。本研究从河流底泥中富集分离到一株具有独特的丝状（10.0-466.1μm）-杆状（μm）细胞形态变化周期的菌株。经多相分类鉴定,确认是赖氨酸芽胞杆菌属（Lysinibacillus）的一个新种,将其命名为:变形赖氨酸芽胞杆菌（Lysinibacillus varians GY32）。比较基因组学分析结果显示,相比同属的其他菌株,GY32基因组中包含两个能诱导大肠杆菌形成丝状细胞的表层蛋白基因slfB、多了一个与细胞隔膜合成相关的基因maf、一个与细胞分裂相关的基因parA/soj。该基因组中还预测到43个组氨酸激酶基因和52个响应调节因子,对新月柄杆菌的研究已经证实这些双组分系统基因直接参与细胞周期的调控。此外,在该基因组中比例达到2.1%的前噬菌体序列,引入了两个影响细胞壁合成的肽聚糖酶基因cwlK。转录组学分析结果显示,一个非编码RNA（ncRNA）基因在两种细胞状态下的表达量是所有基因中最高的,推测其在基因表达调控中起重要作用。表层蛋白基因slfB在两种细胞形态下转录水平虽无显著差异,但在编码基因中总体表达量最高,说明其具有重要的生理生化作用。杆状细胞相对丝状细胞时期有30个直接与细胞膜合成相关的基因转录水平显著上调（p<0.05,fold change>2）。值得注意的是,经比较基因组分析得到的特有基因maf、parA/soj和cwlK均呈现显著上调趋势。此外,75个转录水平显著差异的转录调节因子中65个显著上调,仅10个显著下调,说明从丝状往杆状细胞转变的过程中,基因表达调节加剧。现有结果表明,在GY32形态变化过程中,与基因分裂、细胞周期、细胞表层蛋白以及细胞壁合成相关的特异基因是细胞分裂的分子基础。而大量的转录因子、双组分系统基因以及σ因子等调节蛋白基因则为细胞形态周期性变化提供了调控元件。上述结果结合进一步的基因功能研究,将获得有关细胞分裂调控的更深刻的认识,丰富细胞形态形成相关理论。

关键词：比较基因组学转录组学赖氨酸芽孢杆菌细胞分裂细胞周期

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薏苡丙酮酸脱羧酶基因克隆及淹水表达响应分析

薏苡丙酮酸脱羧酶基因克隆及淹水表达响应分析

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广东省遗传学会第九届代表大会暨学术研讨会

作者：陈大清陈双建何建君李亚男仲恺农业工程学院生命科学学院长江大学农学院

薏苡(Coix lacryma jobi L.)为禾本科C4植物,起源于东南亚的热带和亚热带地区,是古老的粮药兼用作物,具有较高的营养和医学价值,在中国至少有6000-10000年的栽培历史,同时具有耐涝、耐盐、耐旱等多抗性。我们以薏苡为材料,克隆丙酮酸脱... 详细信息

薏苡(Coix lacryma jobi L.)为禾本科C4植物,起源于东南亚的热带和亚热带地区,是古老的粮药兼用作物,具有较高的营养和医学价值,在中国至少有6000-10000年的栽培历史,同时具有耐涝、耐盐、耐旱等多抗性。我们以薏苡为材料,克隆丙酮酸脱羧酶基因(pyruvate decarboxylasel,PDCl)序列,应用RT-PCR分析基因对淹水表达的响应。根据玉米、水稻PDCl蛋白保守序列和甘蔗PDC片段设计两对简并引物,分别从薏苡cDNA中克隆出长度为471bp和972bp的两个片段;运用RACE技术克隆了薏苡PDCl 3'端编码序列,测序后对序列进行整合,通过分析重叠区的摇摆碱基密码子使用的偏好性(http://***/codon/),确定蛋白序列编码。整合后的核酸序列序列长度为1 398bp,与甘蔗PDC片段和玉米PDC3相似度为97%,与玉米和籼稻PDC2相似度分别为95%和91%;蛋白质序列与玉米PDC3相似度最高为97%,与籼稻和粳稻PDC2蛋白相似度为96%。RACE5′嵩上游序列克隆,获得了152bp片段,在线比对发现从薏苡中克隆的序列与玉米(Zay mays)、水稻(Oryza sativa japonica Group)的PDC基因家族的基因序列最大相似度均超过88%以上(http://***/***)。蛋白序列在线比对BlastP(http://***/cgi-bin/dnaaa)结果显示:与大麦、玉米PDC3和水稻PDC2相似度最高,分别为98%,96%和96%,与玉米和水稻其它PDC蛋白相似度也在80%以上。将克隆薏苡PDCl 5'端编码序列的部分与前述片段整合成1507bp序列。用C1ustalX软件将薏苡PDCl序列及其蛋白质序列与水稻、玉米、甘蔗、稗和拟南芥PDC家族共15个基因的核酸和蛋白序列分别进行比对,并采用邻接法(NJ),运用Mega4.0软件构建了进化树,初步确认我们克隆的薏苡PDCl与甘蔗PDC片段、玉米PDC3三者间都有很高的亲缘性,暗示我们初步获得了薏苡PDCl序列,进一步将通过两端特异引物,扩增全长cDNA序列进行验证。此外,我们采用半定量RT-PCR技术,以18sRNA为内参,初步研究了薏苡根和叶在淹水胁迫下的表达特点。结果表明:薏苡经淹水处理后,根和叶中PDC1的表达量在0-24h呈上升趋势,并达到最高值,24h后下降。

关键词：薏苡丙酮酸脱羧酶基因克隆淹水表达

来源：评论

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影响鸡就巢行为基因的筛选和qRT-PCR验证

影响鸡就巢行为基因的筛选和qRT-PCR验证

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广东省遗传学会第九届代表大会暨学术研讨会

作者：王利徐海平聂庆华张细权华南农业大学

中国的地方品种鸡资源丰富,但均表现出较强的抱巢性,严重影响了其在实际生产中的经济效益。因此,探讨鸡抱巢的行为机制,在遗传育种上对于提高其产蛋性能具有潜在的经济价值。禽类的就巢行为受下丘脑-垂体-性腺(简称P-G-H)轴的高度调控,... 详细信息

中国的地方品种鸡资源丰富,但均表现出较强的抱巢性,严重影响了其在实际生产中的经济效益。因此,探讨鸡抱巢的行为机制,在遗传育种上对于提高其产蛋性能具有潜在的经济价值。禽类的就巢行为受下丘脑-垂体-性腺(简称P-G-H)轴的高度调控,前期通过对下丘脑和垂体组织的RNA-Seq筛选到了就巢和非就巢状态下差异表达的基因,通过生物信息学方法深入分析发现:可能与就巢相关的候选基因极显著地富集于Steroid biosynthesis通路上。本研究在此基础上,扩大样本量对筛选到的富集于Steroid biosynthesis通路上的差异基因及与促性腺激素合成相关的转录本进行qRT-PCR验证,分析其mRNA水平上的表达差异。活体采集300日龄正在产蛋和正在就巢的宁都三黄鸡个体各15只,采集其垂体和下丘脑组织抽提RNA,体外反转录合成其cDNA第一链,夸外显子区域设计引物,对筛选到的候选基因进行实时荧光定量PCR研究,以β-actin为内参,检测各基因在就巢期和产蛋期垂体及下丘脑组织中的mRNA表达差异。在就巢期和产蛋期垂体组织中FDFTl,COMT,SC4MOI,CYP51A1,SREBF2,GDF9,PRL基因的表达差异显著(P≤0.05);LSS,CYPllAl,SRD5A2,LIPA,PGR,CGA基因表达差异极显著(P≤0.01)。此外,在就巢期和产蛋期垂体组织中VIPR1的两种转录本VIPR1A3SS和VIPR1201的表达差异显著(P≤≤0.05);PGR基因的两种转录本PGR201和PGRA5SS的表达差异极显著(P≤0.01);而EGR1的两种转录本EGR1A3SS和EGR1瓜的表达存在差异,但未达到统计学显著水平(P>0.05)。在就巢期和产蛋期下丘脑组织中APOA1,CYP19A1,FTR,CGA,GDF10基因的表达均存在差异,但均未达到统计学显著水平(P>0.05)。调控Steroid biosynthesis通路上相关基因表达的转录因子SREBF2在就巢期和产蛋期垂体组织中mRNA表达差显著,且调控促性腺激素α亚基合成的基因CGA和EGR1在就巢期垂体组织中均下调表达;同时调控雌激素合成的关键基因CYP19A1在就巢期下丘脑组织中上调表达。Steroid类物质通常是性激素的合成前体或为其本身,而雌激素常可以通过负反馈调节作用于下丘脑和垂体组织,控制促性腺激素的合成进而影响到卵泡的形成与发育。因此推测:SREBF2、CGA、EGR1、CYP19A1等可能是影响鸡就巢行为的候选基因。

关键词：就巢宁都三黄鸡 qRT-PCR Steroid biosynthesis

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CGSIV基因组学研究

CGSIV基因组学研究

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广东省遗传学会第九届代表大会暨学术研讨会

作者：李蔚张欣董传甫周天鸿暨南大学生命科学技术学院中山大学生命科学学院

中国大鲵(Chinese giant salamander,Andrias davidianus)是国家二级重点保护野生动物。为科学保护中国大鲵,我国许多地区都开展了大鲵驯养繁殖的研究,但最近几年在驯养的中国大鲵中发生了由虹彩病毒引起的病毒性疾病。论文从湖南张家... 详细信息

中国大鲵(Chinese giant salamander,Andrias davidianus)是国家二级重点保护野生动物。为科学保护中国大鲵,我国许多地区都开展了大鲵驯养繁殖的研究,但最近几年在驯养的中国大鲵中发生了由虹彩病毒引起的病毒性疾病。论文从湖南张家界驯养的中国大鲵病鲵中分离和鉴定了一株虹彩病毒(蛙病毒属),命名为中国大鲵虹彩病毒HN11株(Chinese giant salamander iridovirus strain HN11,CGSIV-HN11),对CGSIV-HN11的基因组进行了测序、分析和ORF注释及转录鉴定。1.病鲵临床症状及CGSIV-HN11的分离、鉴定。从中国湖南张家界大鲵驯养场病鲵上分离出一株病毒。病鲵临床症状为:肿胀的躯体、皮肤出血点和红斑、四肢溃疡等。内脏也有出血、脾肾肝病变,有灰白杂线状损伤、变脆等。病毒感染EPC、MFF-1、FHM和KCF-1细胞。细胞表现出对病毒不同的敏感性。在EPC和MFF-1细胞中病毒复制最快,FCIDs0值最高。FHM细胞对病毒中度敏感,但KCF-1细胞不敏感。电镜下观察分离到的病毒呈有或无囊膜的六边型二十面体结构的虹彩病毒状病毒粒子,直径约140-160 nm。在细胞质中可见晶格状排列和VAS区等。MCP PCR扩增片段比对认为该病毒可能是虹彩病毒蛙病毒。***-HN11基因组分析、ORF划分及注释。经测序后的CGSIV-HN11基因组106,366bp,GC含量为55%,共有27个串联重复序列,其中有2个特异的微卫星序列,一个是重复单位为双核苷酸CA,拷贝数62.5。CMTV,FV3,RGV STIV中也都存在着这个微卫星序列,但拷贝数不一样。另外一个是位于基因组第86,674-86,698碱基位置。这个序列是首次在虹彩病毒科已测序的基因组中发现的微卫星序列,重复单位为三核苷酸CCT,拷贝数8.3。预测了CGSIV-HN11基因组miRNA前体序列,获得19个可能的编码miRNA前体序列。ORF Finder工具推测了编码蛋白的ORF。CGSIV-HN11共有112个ORF,这些ORF编码的蛋白质序列长度从41到1,294氨基酸。分析了推定ORF在基因组的位置,转录方向,序列长度和同源序列的BLASTP搜索结果。鉴定了CGSIV-HN11的虹彩病毒核心基因组26个成员,蛙病毒核心基因组24个成员和ALRV特异基因群13个成员。

关键词： ORF 中国大鲵 CGSIV 基因组学湖南张家界

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