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5 篇 广东省生物资源应...
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4 篇 长江大学
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作者

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基于ISSR标记的凤凰单丛茶品种(系)DNA指纹图谱的构建

基于ISSR标记的凤凰单丛茶品种(系)DNA指纹图谱的构建

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广东省遗传学会第九届代表大会暨学术研讨会

作者：梅洪娟马瑞君庄东红吴清韩汕头大学理学院生物系韩山师范学院生物系

凤凰单丛茶以香气似天然花果香著称,在国内外市场享有盛誉。在凤凰茶种植中,生产者往往在遗传背景不甚明了的情况下进行嫁接和杂交,导致茶树品种品系良莠不齐,变异性大,名称混杂繁多,产生了大量的同物异名和同名异物的问题,在实际生产... 详细信息

凤凰单丛茶以香气似天然花果香著称,在国内外市场享有盛誉。在凤凰茶种植中,生产者往往在遗传背景不甚明了的情况下进行嫁接和杂交,导致茶树品种品系良莠不齐,变异性大,名称混杂繁多,产生了大量的同物异名和同名异物的问题,在实际生产和研究中很难对凤凰单丛茶品种(系)进行准确地鉴定和区分;同时,茶农和茶商对凤凰单丛茶的分类方式多样,其中以成茶香型分类使用最为普遍,但这种方式又带有明显的人为因素,尚无科学的依据。针对凤凰单丛茶所存在的这些问题,本项研究利用ISSR分子标记技术,建立不同凤凰单丛茶品种(系)的DNA指纹图谱,旨在能够快速、准确地对不同凤凰单丛茶品种(系)进行鉴定和分类。在此基础,探讨了传统的成茶香型分类方式的分子基础。以4份凤凰单丛茶品种为材料,利用ISSR分子标记技术对UBC802-UBC899等58条ISSR引物进行筛选,得到了12条多态性好的ISSR引物。在确定最佳退火温度后,利用这12条ISSR引物对39份凤凰单丛茶品种(系)进行了扩增,从中筛选出6条核心引物,共扩增出84条带,平均每个引物扩增出14条带,其中多态性条带78条,多态性条带比例为92.86%,多态信息量平均为0.9456;其中引物UBC843多态性最为丰富,品种相似性系数在0.4063-0.9836之间。为将39份凤凰单丛茶品种全部区分开,对6条核心引物进行组合,发现在15组核心引物组合中,UBC827/UBC846的组合鉴别效率最高,品种最大相似性系数为0.9375,品种聚类区分率为100%;而引物组合UBC-843/UBC-856的鉴别效率最低,品种最大相似性系数为1,品种聚类区分率为74.36%,有10个品种无法区分。通过综合品种名称、国家地区编号、采样地点、高效核心引物组合名称以及ISSR数据代码,本研究建立了39种凤凰单丛茶的DNA指纹代码。在此基础之上,通过整合软件录入的更多相关信息,如品种指纹图谱代码、香型、海拔、ISSR-PCR扩增数据图片等,最终形成指纹图谱二维编码,为准确、快速地区分凤凰茶品种(系)提供的有力的工具,为构成凤凰单丛茶的DNA指纹图谱和凤凰单丛茶品种权益保护及信息平台的建立提供数据支持。对传统的成茶香型分类方式与本实验聚类分析结果比较发现,除桂花香的两个品种19与20,在聚类中是聚在一起的,其余同一香型的不同品种并未发现在分子水平存在着更大的一致性。因此推断,不同成茶香型的差异可能是在后基因组表达、基因调控的差异,或者是加工技术的不同而引起的。

关键词：凤凰单从茶 ISSR DNA指纹图谱二维码

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SCoT结合克隆测序鉴别地方柑桔品种

SCoT结合克隆测序鉴别地方柑桔品种

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广东省遗传学会第九届代表大会暨学术研讨会

作者：郭雁君郭丽英蒋惠张小凤吉前华肇庆学院果树研究所

广东省肇庆地区四会市种植柑橘历史悠久,柑橘资源丰富,最早的人工栽培可追溯到汉朝。柑橘类植物,因为彼此间容易杂交和开放性传粉,并且可以通过无性方式繁殖,因此经过自然杂交、人工驯化,选择和栽培,产生大量的地方品种和变异基因型,使... 详细信息

广东省肇庆地区四会市种植柑橘历史悠久,柑橘资源丰富,最早的人工栽培可追溯到汉朝。柑橘类植物,因为彼此间容易杂交和开放性传粉,并且可以通过无性方式繁殖,因此经过自然杂交、人工驯化,选择和栽培,产生大量的地方品种和变异基因型,使柑橘植物的分类问题复杂化。本研究收集35份肇庆地区特色柑橘试材进行SCoT标记分析,探讨地方柑橘品种的遗传多样性和亲缘关系,并对获得的目的片段克隆测序,通过测序结果探讨其遗传变异,为育种工作提供理论依据。选用的15条SCOT引物具有较高的多态性,共获得126条多态性条带,平均多态性达到95%。遗传相似系数值介于0.67—1.00之间,说明选用的供试材料间的遗传差异比较大。四会柑桔品种在遗传系数0.80处聚为一类,亲缘关系较近,在一定程度上反映了试材的地理分布情况,说明地理因素对柑橘的亲缘关系研究有很大影响。采用回收特异条带进行TA克隆和测序的方法,结果显示所有样品序列相似度非常高但也存在差异,有多个单碱基突变位点,同时也有少量插入——缺失突变的位点。每一种供试材料都存一个或多个突变位点可以作为特异位点与其他供试材料区分开.因此SCoT分子标记技术结合特异片段测序分析在地方柑橘品种遗传多样性研究中是有效的。S19引物的SCoT序列上,贡柑与行柑之间有20个单碱基突变和一个三碱基的插入序列。单碱基突变中16个集中在160bp一270bp之间,频率较高。贡柑与其他几个供试材料比对结果与之相似,这个区域的碱基序列形成了该品种的该基因的突变热点区域,而且以插入突变为主,其次是颠换,再次是转换。特征条带的序列研究,以及开发的其他引物的特征条带的序列研究,可以作为四会市地方柑橘品种贡柑的分离基因的一个标记,同时也可以作为该基因的突变热点的机理研究材料,也可以用于潜在的突变热点的识别和判断分析。同源性序列比对结果推测S19引物扩增的特异序列可能是一个核糖体蛋白编码序列的一部分,序列可能来自线粒体基因组或主基因组,该核糖体蛋白可能位于线粒体上。由行柑与贡柑的叶绿体基因trnl证据表明行柑可能是贡柑的母本。但SCoT测序结果中贡柑序列与行柑的比较,碱基突变频率高,因此在一定程度上说明此编码核糖体蛋白的序列更有可能来自主基因组而非线粒体基因组,并且可能来自贡柑的父本-一种橙的基因组。同时,该核糖体蛋白可能参与核糖体结构和参与翻译,在植株发育中起重要作用,而蛋白质的合成起始于N端,其序列组成对其生物学功能有巨大的影响,因此通过对蛋白质及其N端序列的研究有利于分析该蛋白质的结构,揭示蛋白质的生物学功能,本试验材料的碱基突变可能导致N端氨基酸的变异。

关键词：柑橘 SCOT 地方种质资源序列比对

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中菊头蝠(Rhinolophus affinis)不同叫声频率的亚种耳蜗比较转录组分析与杂交带上表达谱渐渗的证据

中菊头蝠(Rhinolophus affinis)不同叫声频率的亚种耳蜗比较转录...

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第十四届全国野生动物生态与资源保护学术研讨会暨第九届中国动物学会兽类学分会全国代表大会

作者：孙海建王嘉颖张礼标 Stephen J.Rossiter 毛秀光华东师范大学河口海岸研究院广东省生物资源应用研究所广东省动物保护与资源利用重点实验室广东省野生动物保护与利用公共实验室英国伦敦玛丽女王大学生物及化学科学学院

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人巨细胞病毒临床病毒株UL148基因B细胞表位的预测及其免疫原性分析

人巨细胞病毒临床病毒株UL148基因B细胞表位的预测及其免疫原性分...

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广东省遗传学会第九届代表大会暨学术研讨会

作者：伍苑宾胡兢晶王波六苏海浩郭媛媛谢斌华密英鸽广东省儿童医院·广东省妇幼保健院

目的:预测与分析人巨细胞病毒临床病毒株UL148基因B细胞表位并制备人巨细胞病毒(HCMV)临床病毒株UL148基因的抗体对其进行免疫原性分析。方法:应用生物信息学方法,以HCMV UL148基因氨基酸序列为基础,采用SOPMA、GOR、HNN方法预测二级结... 详细信息

目的:预测与分析人巨细胞病毒临床病毒株UL148基因B细胞表位并制备人巨细胞病毒(HCMV)临床病毒株UL148基因的抗体对其进行免疫原性分析。方法:应用生物信息学方法,以HCMV UL148基因氨基酸序列为基础,采用SOPMA、GOR、HNN方法预测二级结构,以β-转角区域及无规则卷作为表位预测区域,结合Expasy服务器分析模式,分别选取Hopp&Woods亲水性参数、Zimmerman极性参数、Emini表面可及性参数、柔韧性参数及Jameson-Wolf抗原性参数进行综合预测,以高于阈值的氨基酸残基作为候选区域综合预测UL148基因B细胞表位;化学合成法合成3条HCMV UL148基因分值较高的抗原多肽,并予免疫新西兰大白兔(经初次免疫及加强免疫后)获取免疫兔血清,饱和硫酸铵沉淀法纯化兔血清中相应多肽抗体,并用间接Elisa法鉴定3条多肽在不同免疫时间的抗体效价及免疫原性。结果:HCMV pUL148氨基酸包含316个氨基酸残基,相对分子质量为36KD,等电点为9.15;应用SOPMA、GOR、HNN方案预测pUL148二级结构,均显示以α-螺旋为主,无规则卷及β-转角区域多位于14-21,98-106,132-139,174-181,191-197,267-272,235-240。TMHMM预测pUL148存在一个跨膜区域,为286-308位氨基酸,胞外区域为1-285位氨基酸。通过对pUL148氨基酸的极性、抗原性、亲水性、柔韧性、表面可及性参数预测,以高于阈值4-6位氨基酸残基的3条多肽作为表位预测候选区域。合成的3条多肽于1w、3w、5w不同时间段免疫新西兰大白兔,经初次免疫(1w)及加强免疫(3w、5w)后可明显诱导新西兰大白兔免疫血清抗体滴度增高;经间接Elisa法检测可得3条多肽均能刺激机体产生抗体,抗体效价随着免疫次数增加而升高,最高达1:12800以上。结论:综合分析pUL148二级结构、跨膜区域以及多参数预测,结果提示18-25、132-139、221-229、265-275提示多种方法预测重复性较高,可能为B细胞候选表位;将待选的区段通过统计分值计算各氨基酸残基的抗原性数值总和,最后得pUL148 B细胞表位平均抗原指数,取分值较高区域作为B细胞抗原表位。综合多种预测方法,HCMV UL148基因265-275、221-229、18-25位氨基酸序列区域内或其附近主要以无规则卷或β-转角结构为主,且抗原指数较高,极有可能是B细胞表位。化学合成的3条多肽,均能免疫新西兰大白兔产生抗体,随着免疫加强,其抗体水平相应增高,该抗体为研究HCMV临床病毒株UL148蛋白的功能及其免疫学特性奠定重要基础。

关键词：人巨细胞病毒 UL148 B细胞表位多肽免疫

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拟穴青蟹(Scylla paramamosain)抗脂多糖因子5(SpALF5)的分子克隆,表达分析及其抗菌活性

拟穴青蟹(Scylla paramamosain)抗脂多糖因子5(SpALF5)的分子克隆...

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广东省遗传学会第九届代表大会暨学术研讨会

作者：孙万伟李升康张昭周立镇朱烁汕头大学理学院海洋生物技术重点实验室

目的:拟穴青蟹(***)是中国粤东沿海地区的主要养殖蟹类,由于现代化高密度养殖规模的扩大,拟穴青蟹疾病的爆发日益频繁和严重,给青蟹养殖业造成了巨大的经济损失。抗脂多糖因子(ALF)是无脊椎动物体液免疫中的重要免疫因子,对感染的病原... 详细信息

目的:拟穴青蟹(***)是中国粤东沿海地区的主要养殖蟹类,由于现代化高密度养殖规模的扩大,拟穴青蟹疾病的爆发日益频繁和严重,给青蟹养殖业造成了巨大的经济损失。抗脂多糖因子(ALF)是无脊椎动物体液免疫中的重要免疫因子,对感染的病原菌起着重要的抗性作用,因此从拟穴青蟹体克隆ALF基因并对其抗菌活性及免疫机制进行深入研究具有非常重要的意义。材料与方法:通过RACE技术从拟穴青蟹血细胞中克隆获得SpALF5的cDNA全长序列,利用生物信息学方法预测蛋白质序列和结构域,分析物种同源性,构建系统进化树;以拟穴青蟹肌肉组织基因组DNA为模板,扩增得到SpALF5的基因组DNA序列,分析结构组成;通过实时荧光定量PCR,探究SpALF5在不同组织的特异性表达分布,并进一步研究在不同应激源刺激下(副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus,Vp),脂多糖(Lipopolysaccharide,LPS),聚肌胞(Polyinosinic-polytidylin Acid,Poly I:C),生理盐水(control group)),SpALF5在血细胞、脑、肌肉组织中不同时间段的差异表达;构建SpAFL5原核表达载体p32a-ALF5,转化大肠杆菌BL21,通过IPTG(Isopropyl-β-d-thiogalactoside)诱导表达SpALF5重组蛋白(rSpALF5),并用Ni-NTA *** Resin纯化蛋白,纯化获得的蛋白分别与革兰氏阳性菌、革兰氏阴性菌、真菌共培养,检测其体外抗菌活性。结论:SpALF5(Genbank ID:HF952161.1)cDNA全长975bp,开放阅读框(ORF)长375bp,共编码125个氨基酸,蛋白质三级结构预测只含有一个功能结构域(Superfamilies DUF3254),与三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)的PtALF4蛋白质序列同源性最高(49%)。近期甲壳纲ALF系统进化树分类显示:SpALF5聚丛于Group D类群。SpALF5基因组DNA序列全长1424bp,由3个内含子和4个外显子组成,内含子两端具有保守的GT-AG框。组织特异性表达结果表明,SpALF5在脑组织中表达量最高,其次是肌肉组织,而在血细胞中表达量最低。应激性表达结果显示:在注射应激源后的不同时间段,SpALF5在体内的转录水平显著性上调。诱导表达并纯化得到的rSpALF5蛋白约为32kDa(含***),在体外对革兰氏阴性菌(Vp、溶藻弧菌、大肠杆菌、嗜水气单胞菌),真菌(酿酒酵母)及某些革兰氏阳性菌(金黄色葡萄球菌)具有较强的抗菌活性。以上结果表明,SpALF5是一种潜在的免疫因子并在拟穴青蟹抵抗外源病菌感染中起重要的免疫防御作用。

关键词：拟穴青蟹 SpALF5 抗菌活性

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黄曲霉毒素生物合成调控机制的基因组挖掘

黄曲霉毒素生物合成调控机制的基因组挖掘

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广东省遗传学会第九届代表大会暨学术研讨会

作者：支庆庆于雷贺竹梅中山大学生命科学大学院

黄曲霉毒素(aflatoxin,AF)生物合成的研究已成为研究真核生物次级代谢过程的模式系统,基于AF研究价值的重要性和控制的艰难性,人们对AF生物合成相关基因、酶及调控因子展开了大量研究,然而由于AF生物合成的复杂性,其代谢调控网络机制尚... 详细信息

黄曲霉毒素(aflatoxin,AF)生物合成的研究已成为研究真核生物次级代谢过程的模式系统,基于AF研究价值的重要性和控制的艰难性,人们对AF生物合成相关基因、酶及调控因子展开了大量研究,然而由于AF生物合成的复杂性,其代谢调控网络机制尚有许多未知。真菌基因组学及其他组学技术的快速发展使我们能够挖掘基因组信息,获取基因表达谱继而为AF生物合成调控网络的研究提供基础。本文重点讨论了利用黄曲霉基因组数据来研究AF合成代谢通路及调控机制,发现新的次生代谢物并揭示其代谢途径,以及运用转录组学、蛋白组学及代谢组学技术从多个层面来研究AF生物合成及黄曲霉代谢调控通路,为控制AF污染及其新的天然活性化合物的发现提供基础。黄曲霉基因组大小为36.8Mb,有超过12000多个功能基因,其中包含55个次生代谢基因簇。在AF生物合成中各具独特功能的30个基因聚集在一80 kb的区域,包括两个调控基因af1R和af1J。对黄曲霉基因组的注释及部分实验表明在黄曲霉基因簇之外有更多不同种类的基因可能参与AF及其他次生代谢物的合成,包括对AF合成起全局调控作用的1aeA和veA基因及一些转录因子基因、信号转导基因、真菌发育相关基因等等。此外,氮源、碳源、微量元素、温度、光、pH、及氧化压力等不同环境因素均影响AF合成。黄曲霉能产生丰富的次生代谢物,包括AF、杂色曲霉素,环匹阿尼酸等。基于网络的生物信息学软件SMURF(secondary metabol ite unique regions finder)极大地促进了新的次生代谢通路的发现,通过这一软件分析表明黄曲霉基因组包含至少70个主干基因,对其结构域分析有助于对真菌产生的多肽合成酶(PKSes),非核糖体多肽合成酶(NRPSes)等分子的研究,并促进一些具有药物活性、生物降解酶活的新型化合物的发现,为新型药物、生物燃料的开发等提供了思路。在基因组测序的基础上,转录组学和蛋白组学技术在AF生物合成机制中发挥着越来越重要的作用。转录组测序使我们能够获取黄曲霉基因在特定环境条件下的表达情况,进而研究不同环境因素对AF合成的影响。运用蛋白质组学技术分析黄曲霉胞内蛋白表达情况已有报道,如研究AF合成通路酶的表达与温度的相关联性,黄曲霉全细胞菌丝提取物的第一个蛋白表达谱及2-D蛋白组图谱已经完成,这些数据将为今后黄曲霉蛋白质组学的研究奠定基础。基因组学技术为真菌次生代谢机制的研究带来了巨大变革,未来综合利用转录组、蛋白组及代谢组数据从多个层面来研究真菌次生代谢机制将成为一种趋势,将为人类深入认识这一顽固分子做出贡献。

关键词：生物合成调控组学技术黄曲霉毒素基因组挖掘

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HADH2基因突变致2-甲基3-羟基丁酸尿症1例临床分析

HADH2基因突变致2-甲基3-羟基丁酸尿症1例临床分析

引用

广东省遗传学会第九届代表大会暨学术研讨会

作者：刘丽林瑞珠李秀珍梅慧芬程静蔡燕娜盛慧英黄永兰吴莫龄周知子广州市妇女儿童医疗中心遗传与内分泌科

目的总结分析1例HADH2基因突变所致2-甲基3-羟基丁酸尿症患儿临床资料,提高对2-甲基3-羟基丁酸尿症疾病认识。方法对1例2-甲基3-羟基丁酸尿症患儿临床表现和实验室检查结果进行梳理归纳分析。结果患儿,男,孕39周,足月剖宫产,出生时无窒... 详细信息

目的总结分析1例HADH2基因突变所致2-甲基3-羟基丁酸尿症患儿临床资料,提高对2-甲基3-羟基丁酸尿症疾病认识。方法对1例2-甲基3-羟基丁酸尿症患儿临床表现和实验室检查结果进行梳理归纳分析。结果患儿,男,孕39周,足月剖宫产,出生时无窒息史,生后母乳与配方奶混合喂养,胃纳一般,2月会笑,1岁发"爸爸、妈妈"等双音,1岁6月独站,2岁独行,但步态不稳,不会说话,实验室检查:血乳酸轻度升高(3-5mol/L),血酰基肉碱谱C5:1升高6倍(0.19umol/L),尿有机酸分析提示存在少量甲基巴豆酰甘氨酸,血糖、血氨和肝酶肌酶均正常,无代谢性酸中毒,头颅MRI未见明显异常。2岁1个月起运动能力和言语倒退,胃纳差,不能行走、不能独站,不能认人,无明确抽搐,查体:神清,表情呆滞,流涎,哭闹,不能交流,步态不稳,不能独站,双上肢内旋,四肢肌张力高,肌力低,心肺听诊未发现明显异常,腹软,肝脾未明显触及。3岁病情继续恶化,运动和认知能力倒退加重,并出现双眼上翻四肢强直抽搐,复查血酰基肉碱谱C5:1仍6倍升高,尿有机酸分析提示存在中量甲基巴豆酰甘氨酸和2-甲基3-羟基丁酸,谷丙转氨酶和谷草转氨酶轻度升高,头颅MRI提示基底节轻度异常信号影,脑电图提示异常尖波,仍无低血糖、高氨血症和代谢性酸中毒,HADH2基因检测提示存在致病突变,患儿母亲为该突变携带者,结合临床患儿最终诊断为2-甲基3-羟基丁酰辅酶A脱氢酶缺乏症。讨论2-甲基3-羟基丁酰辅酶A脱氢酶缺乏症是一种X伴性遗传性疾病,由于HADH2基因突变导致2-甲基3-羟基丁酰辅酶A脱氢酶缺陷,致异亮氨酸代谢障碍,2-甲基3-羟基丁酸尿症,男性发病,女性是否发病取决于同源染色体是否存在失活突变。该病临床表现为精神运动发育迟缓并倒退,疾病早期血C5:1即升高,尿中可见甲基巴豆酸,头颅MRI可以无明显异常,疾病晚期尿中方可见2-甲基3-羟基丁酸,疾病早期限制异亮氨酸摄入可能有助于改善预后。结论2-甲基3-羟基丁酰辅酶A脱氢酶缺陷和解酮障碍均可致2-甲基3-羟基丁酸尿症,血C5:1是早期筛查2-甲基3-羟基丁酰辅酶A脱氢酶缺发症关键指标,确诊2-甲基3-羟基丁酰辅酶A脱氢酶缺发症需进行HADH2基因突变分析。

关键词： 2-甲基3-羟基丁酸尿症 2-甲基3-羟基丁酰辅酶A脱氢酶缺乏症 HADH2基因酰基肉碱有机酸尿症

来源：评论

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Analyzing gene expression profile in K562 cells exposed to sodium valproate using microarray combined with the connectivity map database

Analyzing gene expression profile in K562 cells exposed to s...

引用

广东省遗传学会第九届代表大会暨学术研讨会

作者： Zhang XZ Yin AH Lin DJ Zhu XY Ding Q Wang CH Chen YX Prenatal Diagnosis Centre Guangdong Women and Children Hospital

To explore the mechanism underlying antileukaemia effect of sodium valproate,the growth and survival of the K562 cell line were *** profiles of gene expression in K562 cells exposed to sodium valproate were assessed and *** differentially expressed genes identified were further used to query the connectivity map database to retrieve a ranked list of compounds that act on the same intracellular targets as sodiumvalproate.A significant increase in cell apoptosis and a change in gene expression profile were observed in valproate-exposed K562 *** significant enrichment analysis of gene ontology terms for the differentially expressed genes showed that these genes were involved in many important biological *** differentially expressed genes involved in apoptosis were verified by quantitative real-time *** connectivity map analysis showed gene expression profile in K562 cells exposed to sodium valproate was most similar to that of HDACi and PI3 K inhibitors,suggesting that sodium valproate might exert antileukaemic action by inhibiting HDAC as well as inhibiting PI3 K *** conclusion,our data might provide clues to elucidate the molecular and therapeutic potential of VPA in leukaemia treatment,and the connectivity map is a useful tool for exploring the molecular mechanism of drug action.

关键词：

来源：评论

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KCTD15基因影响鸡脂肪生成的遗传机制研究

KCTD15基因影响鸡脂肪生成的遗传机制研究

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广东省遗传学会第九届代表大会暨学术研讨会

作者：梁思思欧阳宏佳聂庆华张细权华南农业大学动物科学学院动物遗传育种与繁殖系

Potassium Channel Tetramerisation Domain Containing 15(KCTD15,钾离子通道四聚化结构域)含有典型的BTB/POZ结构域。已有的多个全基因组关联分析研究发现,人KCTDl5基因的多态性与肥胖、Ⅱ型糖尿病和儿童BMI等相关,该基因可能通过神... 详细信息

Potassium Channel Tetramerisation Domain Containing 15(KCTD15,钾离子通道四聚化结构域)含有典型的BTB/POZ结构域。已有的多个全基因组关联分析研究发现,人KCTDl5基因的多态性与肥胖、Ⅱ型糖尿病和儿童BMI等相关,该基因可能通过神经中枢调控来影响体重。有研究发现,在斑马鱼的胚胎中,KCTD15基因特异地结合到AP-2α的活化结构域,从而抑制神经嵴的发育。另有研究发现KCTD15可能抑制AP-2α的表达,进而抑制C/EBPα的活性,而C/EBPα是脂肪生成的诱导物。由此我们推测KCTD15基因可能抑制脂肪生成。我们用UCSC genome BLAT发现鸡的KCTD15基因位于11号染色体上,基因组序列全长47916 bp,含6个外显子,5个内含子。通过克隆获得了KCTD15基因3种不同的转录本(NCBI号JX500454-JX500456),长度分别为1377、1248和1153 bp。cKCTDl5-a和cKCTDl5-b拥有相同的开放阅读框(ORF)795bp,编码264个氨基酸;cKCTD15-c的开放阅读框为414bp,编码137个氨基酸。荧光定量PCR结果显示KCTD15基因在各个组织中都有表达,其中在下丘脑、皮脂、腹脂和十二指肠中有较高的表达。通过比较不同营养条件下(限饲、重饲、高脂饲料喂养和正常喂养条件)鸡cKCTDl5 mRNA在下丘脑、肝脏、皮脂和腹脂的表达差异,发现在限饲和重饲条件下,cKCTID15mRNA在各组织中都表现出明显的下调趋势;而在高脂饲料喂养的情况下,cKCTDl5 mRNA在下丘脑、皮脂和腹脂都呈下调趋势,其中在母鸡的皮脂的表达极显著下调,而在公鸡和母鸡的腹脂中的表达都显著下调,但在公鸡和母鸡的肝脏中其表达量却都呈上调趋势。以上研究表明KCTD15基因的表达受不同营养条件的调节,另外,由于鸡的脂肪酸合成主要在肝脏发生,我们推测KCTD15基因可能参与了这一过程,所以在高脂饲料喂养情况下,cKCTD15 mRNA在肝脏中的表达上调,而在脂肪组织由于受到反馈抑制而表达下调。参考NCBI数据库,选择四个SNP位点进行PCR-RFLP分型,并进行关联分析,发现其中的g.7300C>T(rsl5616322)与皮下脂肪厚和腹脂重极显著相关(P<0.01),g.32333C>T(rs14964286)与腹脂重显著相关(P<0.05),g.7414A>G与肌肉肉色和腿肌剪切力极显著相关(P<0.01)。这一结果进一步证明了KCTD15基因与脂肪性状密切相关。本研究还通过pcDNA3.1-KCTD15过表达质粒转染鸡前脂肪细胞,发现过表达KCTD15基因后,胞内AP-2α和C/EBPα的表达由于受到抑制而无法通过qPCR定量出来,这与前人的研究结果相符;而PPARγ、LPL、FTO等成脂相关基因的表达也显著下调,由此我们推断KCTD15基因可能参与抑制脂肪生成。

关键词：鸡 KCTD15基因基因克隆组织表达关联分析过表达

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模式识别受体OsLYP4,6在水稻基础天然免疫中的作用

模式识别受体OsLYP4,6在水稻基础天然免疫中的作用

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中国遗传学会第九次全国会员代表大会暨学术研讨会

作者：刘兵敖英李张群刘俊冯冬茹王金发王宏斌有害生物控制与资源利用国家重点实验室广东省热带亚热带植物资源与利用重点实验室中山大学生命科学学院

植物天然免疫反应是植物针对病原侵袭产生的基础防御反应,由植物细胞通过其表面的模式识别受体(pattern recognition receptors,PRR)对病原微生物的微生物相关分子模式(Microbe associated molecular pattern,MAMP)进行识别,既而将入侵... 详细信息

植物天然免疫反应是植物针对病原侵袭产生的基础防御反应,由植物细胞通过其表面的模式识别受体(pattern recognition receptors,PRR)对病原微生物的微生物相关分子模式(Microbe associated molecular pattern,MAMP)进行识别,既而将入侵信号由胞外向胞内传递,最终对病原产生防御反应。LysM蛋白是一类含有LysM(1ysin motif)结构域的蛋白质,已知的LysM蛋白在高等植物中主要参与豆科根瘤菌共生以及天然免疫。我们前期的研究发现,两个含LysM结构域的细胞膜蛋白OsLYP4与OsLYP6,可作为模式识别受体,既能识别真菌的病原物质——几丁质(chitin),又能识别细菌病原物质——肽聚糖(peptidoglycan,PGN),并引发水稻对真菌病原菌及细菌病原菌的防御反应。有趣的是,OsLYP4与OsLYP6只是通过GPI(glycosylphosphatidylinositol,GPI)锚定于细胞膜外侧,并不具备细胞内结构,因此它们应该需要共受体参与向细胞内进行信号转导。我们近期的研究表明,OsLYP4与OsLYP6之间可发生互作,并且OsLYP4还可与水稻另一LysM蛋白——CEBiP发生互作。此外,进一步的实验发现,OsLYP4/OsLYP6蛋白还可与水稻跨膜受体激酶——OsCERK1(LysM-RLK9)发生体内互作,并且这种互作依赖于MAMP(chitin或PGN)的存在。以上结果提示,定位于细胞膜外侧的OsLYP4/6蛋白可能通过与其他膜受体,以及跨膜受体激酶的共同作用,将胞外的MAMP信号向胞内传递。

关键词：植物基础天然免疫模式识别受体几丁质肽聚糖

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