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3 篇 qtl
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机构

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11 篇 江苏省农业科学院...
10 篇 江苏省农业科学院...
10 篇 扬州大学
9 篇 江苏省农业科学院...
6 篇 西南大学
6 篇 江苏省农业科学院...
4 篇 南京林业大学
3 篇 江苏师范大学
3 篇 西南民族大学
3 篇 河南省人民医院
3 篇 四川农业大学
3 篇 吉林大学
3 篇 云南大学
3 篇 河南省医学遗传研...
2 篇 江苏第二师范学院
2 篇 上海水产大学
2 篇 江苏省丘陵地区镇...
2 篇 郑州大学人民医院
2 篇 四川大学

作者

10 篇 冯志新
10 篇 王海燕
10 篇 邵国青
7 篇 王秀娥
7 篇 王永山
7 篇 潘群兴
7 篇 王晓丽
7 篇 诸玉梅
7 篇 夏兴霞
7 篇 欧阳伟
7 篇 王晶宇
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6 篇 张亚东
6 篇 杨蕾蕾
6 篇 赵庆勇
6 篇 张纹纹
6 篇 陈涛
6 篇 王才林
6 篇 李文良
6 篇 毛立

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小麦纹枯病抗性QTL遗传分析

小麦纹枯病抗性QTL遗传分析

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江苏省遗传学会第九次会员代表大会暨学术研讨会

作者：蒋彦婕朱芳芳蔡士宾吴纪中张巧凤江苏省农业科学院粮食作物研究所江苏省农业种质资源保护与利用平台江苏省农业科学院中心实验室

以Niavt14和徐州25杂交的重组自交系遗传群体为材料,研究小麦纹枯病抗性QTL。通过3年表型数据分析,结合构建的重组自交系遗传图谱,共检测到3个与纹枯病抗性相关的QTL。其中,染色体2B上检测到2个,分别是Qses. Jaas-2b1、Qses. Jaas-2b2。... 详细信息

以Niavt14和徐州25杂交的重组自交系遗传群体为材料,研究小麦纹枯病抗性QTL。通过3年表型数据分析,结合构建的重组自交系遗传图谱,共检测到3个与纹枯病抗性相关的QTL。其中,染色体2B上检测到2个,分别是Qses. Jaas-2b1、Qses. Jaas-2b2。Qses. Jaas-2b1在连续2年田间接种鉴定中可解释5.46%和8.56%的表型变异,Qses. Jaas-2b2在连续3年的田间纹枯病接种鉴定中可解释6.04%、8.10%、12.92%的表型变异。在染色体7D上检测到1个抗性QTL:***-7d,最高可解释11.25%的表型变异。说明与纹枯病抗性相关的QTLs有可能存在于小麦染色体2B和7D连锁群上。通过永久性遗传群体的分子标记分析可以初步确定纹枯病抗病基因的相关QTLs。

关键词：小麦纹枯病分子标记遗传图谱 QTL

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水稻香味性状的基因定位与特异性分子标记开发

水稻香味性状的基因定位与特异性分子标记开发

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中国遗传学会第九次全国会员代表大会暨学术研讨会

作者：郑景生王运斌江良荣黄育民王侯聪厦门大学生命科学学院厦门市植物遗传重点实验室

香米具有很高的市场价值,其中香味是评价稻米商业价值的重要指标之一,因此水稻香味的遗传机制研究和香稻新品种选育日益受到重视。我们从引进的水稻种质资源中鉴定筛选出优质香型水稻品种象牙香占做育种亲本,但其香味的分子遗传机制尚... 详细信息

香米具有很高的市场价值,其中香味是评价稻米商业价值的重要指标之一,因此水稻香味的遗传机制研究和香稻新品种选育日益受到重视。我们从引进的水稻种质资源中鉴定筛选出优质香型水稻品种象牙香占做育种亲本,但其香味的分子遗传机制尚不清楚。因此,本研究用象牙香占做亲本,分别与航2号、蜀恢88l和桂朝2号进行杂交,建立相应的F遗传分离群体研究象牙香占香味性状的遗传特性,应用SSR标记技术对象牙香占的香味基因进行定位,通过对香味基因的测序比对找出香稻与非香稻品种间基因序列的差异,开发设计出可以用于准确鉴定水稻香味性状的特异性分子标记,为提高香稻品种选育的准确性和选择效率以及快速培育香稻新品种提供科学依据。主要研究结果如下:（1）优质香型水稻品种象牙香占的香味性状遗传受1对隐性基因控制,其香味基因fgr-1,被定位于第8号染色体上SSR分子标记RM349l与RM223之间,与两标记间的遗传距离分别为2.5 cM和3.1 cM。（2）测序比对分析发现,象牙香占在香味基因的第7外显子上存在8个碱基的缺失和3个碱基的置换,从而导致水稻香味的产生。（3）推断象牙香占的香味基因fgr-1,与已克隆的fgr基因很可能是同一个基因。（4）根据测序结果,开发设计出3对水稻香味特异性分子标记FGR1、FGR2和FGR3,均可以准确鉴定香稻和非香稻品种或区分有香味的纯合隐性基凶型、无香味的纯合显性基因型和杂合基因型植株。

关键词：水稻香味遗传基因定位分子标记

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灵长目新大陆猴科间的系统发育关系研究

灵长目新大陆猴科间的系统发育关系研究

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中国遗传学会第九次全国会员代表大会暨学术研讨会

作者：王晓萍梁运鹏张亚平于黎云南大学/云南省生物资源保护与利用重点实验室中国科学院昆明动物研究所遗传资源与进化国家重点实验室云南大学/云南省高等教育动物遗传多样性与进化重点实验室

灵长目系统发育关系的构建一直是分子系统学家关注的热点问题之一。属于类人猿亚目(Anthropoidea)的新大陆猴(New World Monkey)是典型的经历快速辐射和近期物种形成事件的进化类群,其系统发育关系存在很多争议,尤其是灵长类唯一的夜行... 详细信息

灵长目系统发育关系的构建一直是分子系统学家关注的热点问题之一。属于类人猿亚目(Anthropoidea)的新大陆猴(New World Monkey)是典型的经历快速辐射和近期物种形成事件的进化类群,其系统发育关系存在很多争议,尤其是灵长类唯一的夜行性动物夜猴(Aotus)所属的青猴科(Aotidae)与绒猴科(Callithrichidae)和卷尾猴科(Cebidae)二者之间的系统发育关系一直存在很多争议。本研究对新大陆猴的5个科,即绒猴科(Callithrichidae),卷尾猴科(Cebidae),蜘蛛猴科(Atelidae),僧面猴科(Pitheciidae)和青猴科(Aotidae)共20个新大陆猴物种以及4个非新大陆猴物种的56个核基因非编码区片段(>33kb)进行系统发育分析。研究结果认为僧面猴科是新大陆猴中最先分歧的一枝,接下来一枝是蜘蛛猴科,青猴科与绒猴科/卷尾猴科聚为姐妹枝,而不支持青猴科与绒猴科关系最近或者青猴科与卷尾猴科关系更近的观点。分歧时间的估算结果表明新大陆猴的起源时间约为30.19 Mya(95%置信区间=19.69-28.54 Mya),而青猴科起源时间约为24.42 Mya(95%置信区间=15.77-24.27 Mya),卷尾猴科与狨猴科发生分歧的时间估算为23.55 Mya(95%置信区间:15.42-23.8l Mya),这个结果与前人研究基本一致。本研究结果不仅从一个新的角度为新大陆猴的系统发育关系提供了重要的系统发育信息,而且为灵长目乃至哺乳动物的分子系统学研究提供了一批新的核基因分子标记。

关键词：系统发育新大陆猴夜猴进化

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麦洼牦牛SRY基因克隆及生物信息学分析

麦洼牦牛SRY基因克隆及生物信息学分析

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中国遗传学会第九次全国会员代表大会暨学术研讨会

作者：刘仲娜柴志欣马志杰曾贤彬宋乔乔钟金城动物遗传育种学国家民委——教育部重点实验室西南民族大学青海大学畜牧收科学院青海省放牧家畜营养与生态国家重点实验室培养基地青海高原牦牛研究中心

SRY是多数哺乳动物雄性性别决定基因,位于Y染色体。对牦牛SRy基因的深入研究有望在分子水平上实现人为控制牦牛的性别,为今后遗传育种在分子方面奠定理论基础。方法克隆测序SRY基因并利用生物信息学对其序列进行分析,利用DNAStar和Codon... 详细信息

SRY是多数哺乳动物雄性性别决定基因,位于Y染色体。对牦牛SRy基因的深入研究有望在分子水平上实现人为控制牦牛的性别,为今后遗传育种在分子方面奠定理论基础。方法克隆测序SRY基因并利用生物信息学对其序列进行分析,利用DNAStar和CodonW分析软件分别研究麦洼牦牛、普通牛、绵羊、由羊、猪、小鼠、鸡和人该基因编码区的同源性及密码子偏好性。结果麦洼牦牛SRY基因序列长721bp,含一个690bp的开放阅读框,共编码229个氨基酸;其编码区核苷酸序列与普通牛、绵羊、由羊、猪、小鼠、鸡、人相应序列间的同源性分别为99.9%、93.9%、91.2%、96.5%、43.3%、21.4%、69.1%。经聚类分析,麦洼牦牛首先与普通牛聚在一起,绵羊与山羊聚为一类,这两类相聚后再依次与猪、人、小鼠相聚;最后与鸡聚为一类,其结果与以往的生物学分类结果一致。该基因编码的蛋白质分子式为CHNCS,相对分子质量为2655.0,理论等电点PI为9.55,亲水性平均数为-0.855。其密码子偏好性分析显示,T3为0.2905、C3为0.3240、A3为0.3728、G3为0.2963,第3位碱基中G和C含量占第3位碱基总量的48.0%,同义密码子数为6l。结论麦洼牦牛SRY基因编码序列与普通牛、绵羊、山羊、猪、人具有较高的同源性,在物种进化过程中属于较为保守的序列。该基因对含A的密码子有较高的含偏好性,尽量避开以G结尾的密码子。同时该基因对碱性氨基酸的偏好大于酸性氨基酸,许且SRY基因所编码的蛋质属亲水性蛋白。

关键词：麦洼牦牛 SRY基因聚类分析密码子偏好性

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肿瘤线粒体基因组突变模式及其发生机制研究

肿瘤线粒体基因组突变模式及其发生机制研究

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中国遗传学会第九次全国会员代表大会暨学术研讨会

作者：刘佳王立东孙艳波李恩民许丽艳张亚平姚永刚孔庆鹏中国科学院昆明动物研究所遗传资源与进化国家重点实验室郑州大学医学院河南省食管癌重点开放实验室汕头大学医学院生物化学与分子生物学教研室中国科学院昆明动物研究所动物模型与人类疾病机理重点实验室

癌细胞的快速增殖等特点使得其代谢远高于正常细胞且需要获取更多的能量,但与正常细胞不同的是,癌细胞即便是在有氧条件下也主要是以产能效率更低地糖酵解方式获取能量(有氧糖酵解),提示有氧呼吸途径的作用很可能被严重削弱。而由于线粒... 详细信息

癌细胞的快速增殖等特点使得其代谢远高于正常细胞且需要获取更多的能量,但与正常细胞不同的是,癌细胞即便是在有氧条件下也主要是以产能效率更低地糖酵解方式获取能量(有氧糖酵解),提示有氧呼吸途径的作用很可能被严重削弱。而由于线粒体DNA参与编码有氧呼吸的关键组成部分——呼吸链的多个复合体,通过对癌组织中线粒体DNA的突变模式及其产生机制的研究,则有可能对深入理解伴随着癌细胞能量获取方式的转变所可能带来的适应性变化提供新的证据。鉴于此,我们通过获取186例食管癌组织及癌旁正常组织的线粒体基因组序列,并将其与已报道的来自各种癌组织样本的1235条线粒体全基因组序列以及3639条来自一般人群的线粒体基因组序列进行了充分地比较研究。结果表明,无论是在食管癌还是其它类型的癌组织中,其线粒体DNA突变模式与一般人群的均明显不同。进一步分析提示,癌组织中线粒体DNA其受到的选择压力发生了较为明显的放松,该结果与癌细胞产能方式的转变(有氧呼吸→有氧糖酵解)及其伴随而来的呼吸链功能降低的预期相吻合。而通过一系列分析还表明,前人研究工作中对癌线粒体DNA突变模式存在的相互冲突的观点,主要是源自前期报道数据中的质量问题。由于大数癌线粒体DNA突变很可能仅仅只是选择压力放松所产生的结果,提示对于线粒体DNA在癌发生发展过程中的真正作用需要有新的认识。

关键词：肿瘤线粒体DNA 体细胞突变选择压力

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稳定表达猪CYP3A29基因的PAM细胞系构建及鉴定

稳定表达猪CYP3A29基因的PAM细胞系构建及鉴定

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江苏省遗传学会第九次会员代表大会暨学术研讨会

作者：郅西柱方晓敏赵芳周艳红涂枫李碧侠王学敏任守文南京农业大学动物科技学院江苏省农业科学院畜牧所

RT-PCR获取猪CYP3A29基因序列后与克隆载体PMD18-T相连,得到PMD18-T-CYP3A29重组质粒并测序验证,利用XhoI和NotI双酶切重组质粒及pcDNA3.1(+)/zeo,回收后连接,构建重组真核表达载体pcDNA3.1(+)/zeo-CYP3A29,双酶切及测序验证其正确性,并以脂质体2000将其转染至猪肺泡巨噬细胞系3D4/21,经zeocin抗性筛选,获得稳定表达CYP3A29基因的猪肺泡巨噬细胞系,借助RT-PCR及Wesrern-blot鉴定基因表达水平。最终,成功获得表达CYP3A29的细胞株,连续培养10代后,检测仍然有表达,证实稳定表达CYP3A29基因的猪肺泡巨噬细胞系构建成功。该细胞系构建为猪CYP3A29基因的分子功能研究提供了可能。

关键词：猪 CYP3A29 肺泡巨噬细胞稳定表达细胞系

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青稞4-香豆酸辅酶A连接酶基因克隆及表达分析

青稞4-香豆酸辅酶A连接酶基因克隆及表达分析

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中国遗传学会第九次全国会员代表大会暨学术研讨会

作者：杨晓云杨智敏孔德媛罗小娇刘新春四川农业大学农学院植物遗传育种学系大麦研究中心江苏省农业科学院植物保护研究所

黄酮类化合物(flavonoids)具有抗衰老、抗真菌、抗癌、降血脂和保护心脑血管等多种药理活性,已成为植物界和医药界的研究热点。青稞(Hordeumvulgare *** Hook.F)因在成熟期稃皮与籽粒分离,在植物学上称为裸大麦。是藏族人民制作糌粑主... 详细信息

黄酮类化合物(flavonoids)具有抗衰老、抗真菌、抗癌、降血脂和保护心脑血管等多种药理活性,已成为植物界和医药界的研究热点。青稞(Hordeumvulgare *** Hook.F)因在成熟期稃皮与籽粒分离,在植物学上称为裸大麦。是藏族人民制作糌粑主要原料,并富含黄酮和各种对人体有益的活性成分。4-香豆酸辅酶A连接酶(4CL;EC 6.2.1.12)位于苯丙烷类化合物生物合成途径的分支点上,催化4-香豆酸及其衍生物生成相应的硫酯酰CoA,直接参与植物次生代谢产物黄酮和木质素合成。本研究采用RT-PCR结合RACE方法,克隆了青稞4-香豆酸辅酶A连接酶基因(4CL)的全长,并利用QRT-PCR对该基因在青稞胚乳发育期的时空表达情况进行研究,青稞4CL基因cDNA全长序列2107bp,其中5-UTR为156bp,3-UTR为289bp,开放阅读框(ORF)1662bp,编码553个氨基酸。系统发育树结果表明青稞(Hordeum vulgare *** Hook.F)的4CL基因与短二柄草、柳枝稷、蒺藜草和玉米的4CL基因亲缘最近,同属于单子叶4CL基因簇。其编码的预测蛋白具有4-香豆酸辅酶A连接酶特征性保守肽基序AMP-binding盒(boxⅠ)和活性中心GEICIRG(boxⅡ),理论分子量为59.251kDa,为亲水性稳定性非分泌蛋白,定位于细胞质。以α螺旋(37.25%)和无规则卷曲(30.20%)为主要形式存在。定量表达结果表明,4CL基因在青稞胚乳发育不同时段和不同组织的表达丰度不同,在茎中表达量最高,其次是叶和籽粒。籽粒中4CL基因表达量在授粉后4天(4 DAP)最高,而后逐渐降低;茎中4CL基因表达量则在授粉后16天(16 DAP)达到峰值;而叶中4CL基因表达量在授粉后12天到16天有一个急剧升高的过程。研究结果为进一步研究4-香豆酸辅酶A连接酶与青稞黄酮生物合成之间的关系提供参考。

关键词：青稞 4-香豆酸辅酶A连接酶 RACE 荧光定量PCR

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望水白及其感赤霉病突变体受赤霉菌诱导基于基因芯片的转录谱分析

望水白及其感赤霉病突变体受赤霉菌诱导基于基因芯片的转录谱分析

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中国遗传学会第九次全国会员代表大会暨学术研讨会

作者：贾新平肖进赵维萍金夏红陈启广何立强曹爱忠王海燕王秀娥南京农业大学细胞遗传研究所作物遗传与种质创新国家重点实验室江苏省农业科学院生物技术研究所安徽省滁州学院

小麦品种望水自是商抗赤霉病的地方品种,利用快中子辐射望水白获得了一个稳定的干赤霉病突变体。前期研究表明,该突变体由于定位于小麦3B染色体短臂上的主效QFL缺失,导致其感病性提高。为了研究望水白响应赤霉菌侵染的分子机制,本研究利... 详细信息

小麦品种望水自是商抗赤霉病的地方品种,利用快中子辐射望水白获得了一个稳定的干赤霉病突变体。前期研究表明,该突变体由于定位于小麦3B染色体短臂上的主效QFL缺失,导致其感病性提高。为了研究望水白响应赤霉菌侵染的分子机制,本研究利用AffymetrixWheat Genome GeneChip进行基于基因芯片杂交的转录组分析,比较抗感材料中受赤霉菌诱导前后差异表达基因。结果表明,在望水白中检测到的上调表达基因有1,874个,下调表达基因有1,107个;在NAUH117中检测到的上调表达基因有2,143个,下调表达基因有1,670个。利用Blast2go对上述差异表达基因分别进行功能注释特征分析和GO分析,发现望水白受赤霉菌诱导的上调表达基因中,1,523个具有功能注释信息,753个具有GO信息;NAUH117受赤霉菌诱导的上调表达基因中,1,846个具有功能注释信息,1,041个具有GO信息。对望水白利NAUH117中的上调表达基因进行GO分类,发现与生物品质调控、解剖学结构发育、多细胞生物发育、核苷结合、裂解酶活性等相关的功能基因仅存NAUH117受赤霉菌诱导的上调表达基因中存住。KEGG代谢通路分析表明,望水白和NAUH117中的上调表达基因中有多个基因参与植物信号转导途径和植物与病原菌互作等抗病通路。其中,信号转导途径包括植物次生代谢、活性氧爆发、钙离子、磷脂酸分子、水杨酸、茉莉酸和乙烯等信号途径;植物与病原菌互作涉及PTI和ETI反应,推测这些抗病通路参与小麦抗赤霉病反应。染色体电子定位结果表明,望水白受赤霉菌诱导的上调表达基因中,具有定位信息的有231个(12.40%),定位到501个化点;NAUH117受赤霉菌诱导的上调表达基因中,具有定化信息的有197个(9.20%),定位到416个位点。

关键词：小麦赤霉病基因芯片差异表达基因基因电子定位

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一个水稻黄绿叶突变体ygl10的遗传分析和基因定位

一个水稻黄绿叶突变体ygl10的遗传分析和基因定位

引用

江苏省遗传学会第九次会员代表大会暨学术研讨会

作者：杨海莲刘敏郭旻李荣德张宏根严长杰扬州大学农学院江苏省作物遗传生理国家重点实验室培育点/教育部植物功能基因组学重点实验室

以籼稻93-11为背景的水稻突变体中发现一个黄绿叶突变体(yellow green leaf, ygl10)。形态分析表明,与野生型93-11相比,ygl10突变体株高、穗长降低,结实率下降。叶绿素含量测定表明,ygl10突变体中叶绿素a、叶绿素b和类胡萝卜素含量均极... 详细信息

以籼稻93-11为背景的水稻突变体中发现一个黄绿叶突变体(yellow green leaf, ygl10)。形态分析表明,与野生型93-11相比,ygl10突变体株高、穗长降低,结实率下降。叶绿素含量测定表明,ygl10突变体中叶绿素a、叶绿素b和类胡萝卜素含量均极显著降低,其中叶绿素b降幅最大,只有野生型的2%。叶绿体超微结构观察表明,突变体中类囊体和基粒片层数量明显减少。遗传分析结果表明,该黄绿叶突变体由一隐性核基因控制。进一步利用分子标记将ygl10定位在水稻第10染色体约380kb的区段内。对该区段内存在的ORF进行序列分析,发现编码叶绿素A氧化酶(chlorophyll a oxygenase)基因(OsCAO1)的第9个外显子存在5个碱基缺失,从而导致提前出现终止密码子,推测CAO1即为ygl10的候选基因。

关键词：水稻黄绿叶分子标记基因克隆

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甘薯(***)及其近缘野生种***(6x)、***(2x)中两个重复序列Itf＿1、Itf＿2的比较分析

甘薯(***)及其近缘野生种***(6x)、***(2x)中两个重复序列Itf＿1...

引用

江苏省遗传学会第九次会员代表大会暨学术研讨会

作者：陈孚尧俞立璇孙健英韩永华李宗芸江苏师范大学生命科学学院整合植物生物学研究所江苏师范大学江苏省药用植物生物技术重点实验室

本文比较分析了栽培种甘薯（I. batatas′Xushu18′）及其近缘野生种I. trifida（6x）、I. triloba（2x）中两个重复序列Itf、Itf。结果表明,Itf在三个物种中的重复单位长度均为409bp,碱基无变化;Itf在不同物种中重复单位的长度存在一... 详细信息

本文比较分析了栽培种甘薯（I. batatas′Xushu18′）及其近缘野生种I. trifida（6x）、I. triloba（2x）中两个重复序列Itf、Itf。结果表明,Itf在三个物种中的重复单位长度均为409bp,碱基无变化;Itf在不同物种中重复单位的长度存在一定的变化,其中I. trifida（6x）中的Itf-2为422bp;I. Triloba中的Itl为429bp;栽培种甘薯中的Ibxu18为429bp,这些结果表明,重复序列Itf、Itf在不同物种间具有高度的一致性,说明这些物种存在着非常相近的遗传基础。同时利用这两个重复序列作为探针,对其染色体进行了FISH杂交分析,探讨了他们在染色体上的分布形式。

关键词：甘薯重复序列野生种

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