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江苏师范大学
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云南大学
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河南省医学遗传研...
2 篇
江苏第二师范学院
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上海水产大学
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江苏省丘陵地区镇...
2 篇
郑州大学人民医院
2 篇
四川大学
作者
10 篇
冯志新
10 篇
王海燕
10 篇
邵国青
7 篇
王秀娥
7 篇
王永山
7 篇
潘群兴
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王晓丽
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诸玉梅
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夏兴霞
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欧阳伟
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6 篇
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张亚东
6 篇
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赵庆勇
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家蚕不同品种丝腺的转录组测序分析
家蚕不同品种丝腺的转录组测序分析
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江苏省遗传学会第九次会员代表大会暨学术研讨会
作者:
李娟
侯成香
于焕君
张静
李木旺
江苏科技大学生物技术学院
中国农业科学院蚕业研究所江苏镇江
家蚕是重要的经济昆虫。茧丝作为家蚕主要的效益产品,是丝绸产业的原料,也是行业产量和质量效益的决定因素。茧丝产量是家蚕品种中最受重视的性状之一。传统的育种技术是基于相互连锁的表型选择,而非基因型选择。发掘影响家蚕主要经济...
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家蚕是重要的经济昆虫。茧丝作为家蚕主要的效益产品,是丝绸产业的原料,也是行业产量和质量效益的决定因素。茧丝产量是家蚕品种中最受重视的性状之一。传统的育种技术是基于相互连锁的表型选择,而非基因型选择。发掘影响家蚕主要经济性状的重要功能基因,并应用于育种实践,将是突破家蚕育种技术的关键技术。随着分子生物学的发展,家蚕基因组精细图的公布,为实现影响茧丝量性状的关键功能基因的发掘和机制的分析提供了基础。运用转录组测序技术构建家蚕多丝量品种(JS)和少丝量品种(L10)的差异表达谱,筛选出差异表达基因1401个(上调基因673个,下调基因738个)。随机挑选了10个差异显著的相关功能基因,应用荧光定量PCR技术对其表达量进行验证,基本与转录组测序结果一致。根据GO聚类分析和功能注释,发现上调的差异表达基因的功能主要与催化活性,代谢过程和结合功能有关。本研究获得的差异表达基因,特别是与代谢和催化相关的功能基因,可能参与丝蛋白的高效合成和分泌。为从分子水平上阐明家蚕茧丝产量性状差异形成的机制和提高茧丝产量提供借鉴。阐明茧丝产量性状决定的分子机制不仅对茧丝蛋白产量的调控机理、茧丝生产及品种选育等研究有重要的作用,也有助于开发有效的家蚕现代育种技术。对将来建立利用丝腺生物反应器高效生产特种蛋白的技术有重要价值。
关键词:
家蚕
丝腺
茧丝量
转录组
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维管植物BSP基因家族的起源、适应性进化及水稻OSBSP基因功能的初步研究
维管植物BSP基因家族的起源、适应性进化及水稻OSBSP基因功能的初...
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江苏省遗传学会第九次会员代表大会暨学术研讨会
作者:
王雨
费玉叶
杨泽峰
徐辰武
扬州大学江苏省作物遗传生理重点实验室/教育部功能基因组学重点实验室
多年生植物拥有一个季节性的氮素循环机制来实现氮素的高效利用,即秋季叶片中的蛋白降解,释放的氨基酸转运到茎木质部的薄壁细胞中合成茎皮储存蛋白(Bark storage protein,BSP),当春季到来时这些储存蛋白分解重新转运到生长的芽和叶中...
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多年生植物拥有一个季节性的氮素循环机制来实现氮素的高效利用,即秋季叶片中的蛋白降解,释放的氨基酸转运到茎木质部的薄壁细胞中合成茎皮储存蛋白(Bark storage protein,BSP),当春季到来时这些储存蛋白分解重新转运到生长的芽和叶中用于蛋白质的从头合成。通过系统鉴定发现BSP基因家族是维管植物特有的基因家族,已有研究表明杨树中BSP基因成员参与到氮素的储存与转运,然而对维管植物BSP基因的起源、适应性进化以及详细的分子功能还不清楚。为深入研究BSP基因的起源,及在不同植物物种中的分布、扩张模式、适应性进化及分子功能,本研究通过生物信息学的方法对
代表
性维管植物物种中的BSP基因进行了系统鉴定、系统发育分析和分子进化分析;通过Blast搜索及系统发育分析探索了维管植物BSP基因的起源;利用反向
遗传学
手段对水稻中的
代表
性成员进行了功能的初步研究;利用组织切片手段对水稻转基因植株部分组织叶鞘进行了研究。主要结果如下:1)以杨树BSP蛋白序列在phytozome中进行Blastp搜索,结果发现只在属于维管植物的物种中发现有BSP同源蛋白。2) Blast搜索表明维管植物BSP基因的同源基因大部分存在于细菌的基因组中。3)适应性进化分析表明,维管植物BSP基因进化的主要动力为纯化选择,使得该家族的功能在维管植物中得到固定。4)利用反向
遗传学
和分子生物学手段对水稻BSP基因家族成员OsBSP基因进行功能研究发现该基因主要在维管组织中表达,并且表达受到低温与干旱的显著抑制。其蛋白产物定位于叶绿体基质中。5)组织切片手段发现水稻野生型和突变体植株叶鞘部分细胞大小和数量发生改变。
关键词:
OsBSP
基因家族起源
适应性进化
非生物胁迫
组织切片
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玉米株高相关基因DWARF9的序列变异及其与产量相关性状的关联分析
玉米株高相关基因DWARF9的序列变异及其与产量相关性状的关联分析
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江苏省遗传学会第九次会员代表大会暨学术研讨会
作者:
潘亮
杨泽峰
徐辰武
扬州大学江苏省作物遗传生理重点实验室/教育部功能基因组学重点实验室
玉米Dwarf 9基因是显性矮杆基因,位于玉米的第5条染色体上,其突变体在DELLA结构域含有一个缺失了17个氨基酸的51bp的阅读框,这使得突变体植株表现出植株矮小,叶片黑绿,对赤霉素不敏感,株型不理想。为研究玉米Dwarf9基因序列的多态性及...
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玉米Dwarf 9基因是显性矮杆基因,位于玉米的第5条染色体上,其突变体在DELLA结构域含有一个缺失了17个氨基酸的51bp的阅读框,这使得突变体植株表现出植株矮小,叶片黑绿,对赤霉素不敏感,株型不理想。为研究玉米Dwarf9基因序列的多态性及其与主要农艺性状之间的关联,本研究对玉米Dwarf9基因在来源广泛的81份自交系中进行了目标序列重测序,并与株高、穗位高、雄长和雄分支数4个株型性状以及穗长、穗重、秃顶长、穗粗、穗行数、行粒数、粒重、百粒重和轴粗9个穗部性状进行关联分析。分析结果表明:(1)Dwarf 9基因在供试玉米自交系中共有107个变异位点,包括82个SNP和25个Indel。编码区发现了61个变异位点,包括52个SNP和9个Indel位点。(2)方差分析结果显示供试材料各性状间的平均值、标准差、变异系数均有较大的差异,各性状相关分析显示粒重与株高、雄长、穗长、穗重、穗行数、行粒数和百粒重呈极显著正相关,与穗位高呈显著正相关,但与雄分支数和秃顶长负相关。(3)关联分析发现,位于编码区1569bp处的SNP(A/C)与株高显著关联,贡献率为6.38%,且SNP569为非同义突变位点,能引起编码蛋白质序列的改变。位于编码区SNP75(G/T)分别与穗长和秃顶长显著相关,贡献率分别为7.85%和6.93%,并且SNP75也是一个非同义位点,能引起编码蛋白质序列的改变。此外SNP281和SNP307两位点处于完全连锁不平衡状态,对穗长和秃顶长的贡献率为19.86%和22.89%。
关键词:
玉米
产量性状
Dwarf9
序列变异
关联分析
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水稻水平转移基因OSAMI10的功能研究
水稻水平转移基因OSAMI10的功能研究
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江苏省遗传学会第九次会员代表大会暨学术研讨会
作者:
李小盼
陈庆
杨泽峰
徐辰武
扬州大学江苏省作物遗传生理重点实验室/教育部功能基因组学重点实验室
水稻OsAMI10基因(Os11g33090)属于推定的酰胺酶家族成员(Pfam获取号为PF01425)。酰胺酶是一类水解酰胺的酶的总称,在商业生物工艺中具有重要的应用价值。已有研究表明,陆生植物中的酰胺酶家族在进化上起源于水平基因转移事件,并以...
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水稻OsAMI10基因(Os11g33090)属于推定的酰胺酶家族成员(Pfam获取号为PF01425)。酰胺酶是一类水解酰胺的酶的总称,在商业生物工艺中具有重要的应用价值。已有研究表明,陆生植物中的酰胺酶家族在进化上起源于水平基因转移事件,并以细菌为供体。对从不同菌种中分离纯化得到酰胺酶来研究其性质及催化机理已有报道,但对其进化意义尚不明晰。本研究针对陆生植物中酰胺酶家族
代表
性成员水稻OsAMI10基因,利用生物信息学和反向
遗传学
的方法,对基因进行了一系列的功能研究:1.通过生物信息学分析,初步预测其蛋白结构、蛋白定位、蛋白生理生化性质,通过PLACE数据库对OsAMI10基因翻译起始位点上游2Kb的基因组序列进行扫描,共鉴定了452个顺式元件;2.利用一对基因组引物LP和RP以及T-DNA边界引物BP进行纯合突变体检测;3.以日本晴作为转化受体,通过农杆菌介导的方法构建GFP载体进行亚细胞定位;4.以突变体亲本材料(Dongjin)作为转化受体,以携带有双元载体OsAMI10-RNAi和OsAMI10-OX的农杆菌菌株EHA105介导,构建其RNAi和过表达载体;5.提取日本晴抽穗期不同组织总RNA,利用OsAMI10基因特异引物进行定量RT-PCR分析,结果表明:OsAMI10基因呈组成型表达,在各部位均检测到表达,但在叶和叶鞘中表达量相对较高,在小花、幼穗和根中表达量较低;6.为进一步明确OsAMI10基因的表达模式,构建OsAMI10promoter-GUS融合载体转化日本晴植株,在抽穗期进行GUS组织化学染色,GUS染色的结果和定量RT-PCR的结果基本吻合;7. RT-PCR表达分析还显示,OsAMI10基因表达受到逆境和植物激素的调节,但对不同非生物胁迫的响应不同。
关键词:
水稻
OsAMI10基因
水平基因转移
酰胺酶
非生物胁迫
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粘附分子EPCAM表达的表
遗传
调控机制的研究
粘附分子EPCAM表达的表遗传调控机制的研究
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江苏省遗传学会第九次会员代表大会暨学术研讨会
作者:
胡莹
崔鹤
张少丹
赵主江
樊红
发育与疾病相关基因教育部重点实验室东南大学医学院东南大学
很多肿瘤的发生发展都与原癌和/或抑癌基因的异常功能状态有关,DNA甲基化和组蛋白甲基化作用等表观
遗传
修饰通过调控肿瘤相关基因的表达,参与了肿瘤发生发展的过程。DNA甲基转移酶3A2(DNMT3A2)作为甲基转移酶在个体发育过程中对DNA甲基...
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很多肿瘤的发生发展都与原癌和/或抑癌基因的异常功能状态有关,DNA甲基化和组蛋白甲基化作用等表观
遗传
修饰通过调控肿瘤相关基因的表达,参与了肿瘤发生发展的过程。DNA甲基转移酶3A2(DNMT3A2)作为甲基转移酶在个体发育过程中对DNA甲基化模式的建立起到重要作用,其表达异常是肿瘤发生发展的重要原因之一。组蛋白甲基转移酶G9a,SUV39H1是常染色质主要的甲基转移酶,可以甲基化组蛋白H3K9、H3K27和H1bK26等,并与DNA甲基化密切相关。EpCAM是分子量约40kDa的跨膜糖蛋白,其广泛存在于多数上皮组织中,是非依赖钙离子的细胞粘附蛋白。EpCAM的表达下调
会
减少细胞粘附、增加细胞迁移的能力。目前有关其在肿瘤发生中EpCAM的表达异常的表观
遗传
机制尚不清楚。本研究旨在研究G9a,SUV39H1与DNMT3A2对EpCAM表达调控。在胃癌细胞系MKN45中稳定过表达3A2后,抑制了EpCAM的表达。对照细胞中EpCAM基因启动子上CpG岛的甲基化率为57.78%,而当DNMT3A2表达沉默后,EpCAM基因启动子上CpG岛的甲基化率为20%,二者甲基化率改变约为2.9倍,表明DNMT3A2能够通过DNA甲基化方式抑制EpCAM的表达。干扰G9a,SUV39H1后,与对照相比,EpCAM表达量上调,提示EpCAM可能受组蛋白甲基化酶的调控。在后续的实验中,将进一步分析DNMT3A2对于EpCAM的调控是否通过协同G9a,SUV39H1,增加EpCAM的甲基化水平和H3K9me水平抑制其表达。
关键词:
DNMT3A
G9a
SUV39H1
EpCAM
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玉米紫色叶鞘基因PSH的精细定位及其候选基因的确定
玉米紫色叶鞘基因PSH的精细定位及其候选基因的确定
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江苏省遗传学会第九次会员代表大会暨学术研讨会
作者:
杜灿灿
杨泽峰
徐辰武
扬州大学江苏省作物遗传生理重点实验室/教育部功能基因组学重点实验室
色素的沉积、分布和浓淡在各种玉米间的变化对玉米功能基因组研究、
遗传
育种应用等方面具有重要价值。紫色叶鞘(purple leaf sheath,PSH)是玉米中比较常见的与色素相关的性状。玉米紫色植株花色苷色素能延缓衰老,而紫色叶鞘又是指导玉...
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色素的沉积、分布和浓淡在各种玉米间的变化对玉米功能基因组研究、
遗传
育种应用等方面具有重要价值。紫色叶鞘(purple leaf sheath,PSH)是玉米中比较常见的与色素相关的性状。玉米紫色植株花色苷色素能延缓衰老,而紫色叶鞘又是指导玉米育种的重要形态标记,利用它可以更加直观的对关联的特殊性状进行选择和
遗传
研究。随着对紫色叶鞘色的深入研究,还可以进一步完善色素合成的生理机制。因此,紫色叶鞘基因的精细定位具有十分重要的理论意义和实用价值。本研究利用DH1M、T877杂交分别构建一个F2群体和一个包含208个系的重组自交系群体,对其进行
遗传
分析和基因定位。结果显示,F2群体中紫色叶鞘植株与绿色叶鞘植株的分离比符合3:1的孟德尔分离比。同时,RIL群体中紫色叶鞘家系与绿色叶鞘家系的分离比符合1:1,这说明紫色叶鞘由一个显性核基因PSH控制。利用基因芯片对亲本和190株F2单株进行SNP分型,初步将PSH定位在10号染色体的SNP标记SYN17666附近,并将该SNP转化成CAPS标记进行验证。此外,本研究还通过全基因组重测序进行混合分组分析快速定位PSH,将其定位在10号染色体128-139Mb范围内,进一步快速验证了我们的精细定位结果。在此基础上,利用MaizeGDB上公布的标记及新开发的Indel标记对98株F2单株和76个RIL进行基因分型,进一步将PSH基因定位在Indel标记Indel02A和Indel01C之间大约304Kb内。通过基因注释预测该范围内含有11个基因,其中基因5(GRMZM5G822829)与花青素相关。经过序列分析,基因5的同原序列在水稻与拟南芥中都编码假定的bHLH型调控因子。
关键词:
玉米
紫色叶鞘
花青素
图位克隆
全基因组重测序
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与西风小麦抗小麦黄花叶病主效QTL ***-5A.1紧密连锁的SNP分子标记开发
与西风小麦抗小麦黄花叶病主效QTL ***-5A.1紧密连锁的SNP分子标...
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江苏省遗传学会第九次会员代表大会暨学术研讨会
作者:
代渴丽
刘洋洋
别同德
肖进
王海燕
王秀娥
南京农业大学细胞遗传研究所作物遗传与种质创新国家重点实验室
小麦黄花叶病(Wheat yellow mosaic,WYM)是由小麦黄花叶病毒(Wheat yellowmosaicbymovirus,WYMV)引起的一种土传病毒病害,发掘和利用抗WYMV基因资源是控制该病害的主要途径。本实验室前期研究发现,"西风小麦"高抗黄花叶病,利...
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小麦黄花叶病(Wheat yellow mosaic,WYM)是由小麦黄花叶病毒(Wheat yellowmosaicbymovirus,WYMV)引起的一种土传病毒病害,发掘和利用抗WYMV基因资源是控制该病害的主要途径。本实验室前期研究发现,"西风小麦"高抗黄花叶病,利用"西风小麦"和感病小麦品种"镇9523"构建的重组自交系群体,定位了一个抗小麦黄花叶病的主效QTL ***-5A.1,位于5A染色体长臂的标记Xwmc415.1-5EST-440之间0.1cM的范围,将这两侧翼标记所对应的核苷酸序列与短柄草及水稻全基因组进行BLAST比对,在共线性区域共预测58个编码基因,功能注释发现其中5个可能与抗病防卫反应相关。本研究对其中一个半胱氨酸蛋白酶(Cysteineproteinase,CP)基因TaCP进行了克隆,通过比较该基因在西风小麦和镇9523中的差异,开发了1个SNP标记(Taplcp-R)。该标记在抗病亲本西风小麦中能扩增出大小约230bp的目的条带,在感病亲本镇9523中则不能扩增出目标条带。为了验证该SNP标记Taplcp-R的有效性,利用此标记对WYMV抗性已知的42个品种组成的小麦品种群体进行分子标记分析,结果表明,在10个抗WYMV品种中可检测到***-5A.1位点,在所有11个感WYMV品种中均扩增出和感病品种‘镇9523’一致的感病带型。进一步利用该标记对211个抗性已知的育种中间材料进行分析,结果发现36个抗病材料中能扩增目标条带,而感病材料都不能扩增目标条带;在不能扩增目标条带的抗病材料中,54个材料携带来自2DL的抗性位点。本研究开发的SNP标记在小麦品种群体中能够对***-5A.1位点进行有效地鉴定,可用于抗WYMV分子标记辅助育种。
关键词:
小麦
黄花叶病
半胱氨酸蛋白酶
SNP标记
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水稻芒长QTL qAn4.1的精细定位研究
水稻芒长QTL qAn4.1的精细定位研究
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江苏省遗传学会第九次会员代表大会暨学术研讨会
作者:
魏伟
王刘军
陶亚军
缪军
周勇
梁国华
水稻芒性状是一个重要的驯化相关性状,是由多基因控制的数量性状,
遗传
基础复杂,易受环境影响。虽然已有较多报道对控制水稻芒性状基因和QTL进行了初步定位,但对芒基因进行精细定位和克隆的只有An-1,仍不能充分了解芒形成机理和水稻驯化...
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水稻芒性状是一个重要的驯化相关性状,是由多基因控制的数量性状,
遗传
基础复杂,易受环境影响。虽然已有较多报道对控制水稻芒性状基因和QTL进行了初步定位,但对芒基因进行精细定位和克隆的只有An-1,仍不能充分了解芒形成机理和水稻驯化过程。本研究从一套以籼稻品种9311为受体、粳稻品种日本晴为供体构建的128个染色体片段代换系中,发现了一个芒长较轮回亲本9311显著增长的代换系C12061。为了解释其表型变化的
遗传
基础,我们将代换系C12061与9311回交并自交,获得F2/F3分离群体,用于鉴定控制水稻芒增长的主效QTL,并完成其
遗传
分析和精细定位。代换系供体亲本日本晴表现为无芒,受体亲本9311表现为部分短小顶芒,代换系C12061表现出芒长的变异,我们推测可能是由于日本晴代换片段的插入导致。C12061表现为长芒,其平均芒长为4.5cm,9311表现为短芒,其平均芒长为0.6cm。衍生分离群体表现出芒长的分离,
遗传
分析表明,芒长的分离比符合3:1的单个孟德尔因子分离规律(χ=1.52<χ=3.84),表明芒长的分离受单个主效QTL控制,我们将其命名为qAn4.1,长芒对短芒为显性。根据代换系的重测序结果,利用17对覆盖代换片段的多态性标记对C12061和9311进行多态性筛选,并通过
遗传
连锁分析,初步将控制芒长的QTL定位于第4染色体标记RM17182和RM17305之间,物理距离约为2.3Mb的区段内。为了进一步精细定位q An4.1,在标记RM17182和RM17305之间区段不同的BAC克隆上共发展了21对有多态性的Indel和CAPs标记。利用F3分离群体的1615个隐性单株,最终将qAn4.1定位在标记S4-364和caps-1之间,物理距离约为55.6kb。根据NCBI网站上公布的预测信息可以知道,在这个55.6kb的区间范围内共有5个候选基因(Os04g0517900,Os04g0518000,Os04g0518100,Os04g0518200,Os04g0518400),这为最终克隆目标基因奠定了基础。
关键词:
水稻
芒长
QTL
遗传
分析
精细定位
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粳稻愈伤组织的生理结构与诱导特性的研究
粳稻愈伤组织的生理结构与诱导特性的研究
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江苏省遗传学会第九次会员代表大会暨学术研讨会
作者:
魏晓东
李霞
江苏省农业科学院粮食作物研究所国家水稻改良中心南京分中心
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江苏省
近年来育成的17个优质高产水稻品种作为研究对象,以成熟胚作为外植体,选用M8为基本培养基,选择不同激素配比进行愈伤组织诱导的比较研究,并对出于率较高(宁9213)和较低(南粳41)的品种在不同培养基中的出愈率、愈伤组织状...
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江苏省
近年来育成的17个优质高产水稻品种作为研究对象,以成熟胚作为外植体,选用M8为基本培养基,选择不同激素配比进行愈伤组织诱导的比较研究,并对出于率较高(宁9213)和较低(南粳41)的品种在不同培养基中的出愈率、愈伤组织状态、愈伤细胞的结构及其蛋白组分差异进行了比较分析。初步研究结果显示:供试粳稻在不同激素组合类别中,愈伤诱导率高低顺序为:2,4-D+KT> 2,4-D+6-BA>2, 4-D+KT+6-BA。宁9213在两种培养基中(2,4-D 2mg·L-1+0.3mg·L-16-BA和2,4-D 2mg·L-1+0.3mg·L-1KT)愈伤的诱导率都显著的高于南粳41,二者在添加KT的培养基中的诱导率高于单独添加6-BA培养基中的愈伤诱导率,但其添加了KT和6-BA两种培养基的愈伤组织超微结构差异不大,均表现细胞间排列较紧凑,细胞质浓厚,具有大的细胞核和核仁,核膜完整,具有较多的线粒体和较少的质体。而南粳41则在添加了KT的培养基中愈伤细胞处于活跃状态,而在添加了6-BA中细胞处于衰老状态。蛋白质组分结果显示,宁9213缺失了59kD蛋白,而南粳41缺失了70kD蛋白,但是不同培养基诱导对两者愈伤组织的蛋白组分影响不大。结论:粳稻间成熟胚出愈率不同主要是由于不同基因型品种成熟胚对外源激素敏感程度存在差异,从而引起其愈伤组织细胞生理功能、衰老速度以及特异蛋白表达的差异。本研究结果将有助于揭示水稻成熟胚愈伤诱导的规律,并加快水稻基因改良的进程。
关键词:
粳稻
愈伤组织
诱导特性
细胞结构
蛋白组分
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玉米谷氨酰胺合成酶基因Gln1-3和Gln1-4的序列变异及其与产量相关性状的关联分析
玉米谷氨酰胺合成酶基因Gln1-3和Gln1-4的序列变异及其与产量相关...
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江苏省遗传学会第九次会员代表大会暨学术研讨会
作者:
郑瑶
杨泽峰
徐辰武
扬州大学江苏省作物遗传生理重点实验室/教育部功能基因组学重点实验室
Gln1-3和Gln1-4基因是玉米谷氨酰胺合成酶(GS)基因家族的重要成员,编码穗部与茎秆同工酶,与籽粒产量和籽粒大小紧密相关。本研究以87份变异丰富的优良玉米自交系为试验群体,基于NimbleGen目标序列捕获平台技术,对基因Gln1-3和Gln1-4...
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Gln1-3和Gln1-4基因是玉米谷氨酰胺合成酶(GS)基因家族的重要成员,编码穗部与茎秆同工酶,与籽粒产量和籽粒大小紧密相关。本研究以87份变异丰富的优良玉米自交系为试验群体,基于NimbleGen目标序列捕获平台技术,对基因Gln1-3和Gln1-4进行了目标序列重测序,并进行多态性分析,结果发现:基因Gln1-3共检测到136个SNP和95个Indel,其中编码区有7个SNP;基因Gln1-4共检测到158个SNP和69个Indel,其中编码区有20个SNP。尽管基因Gln1-3和Gln1-4编码区的变异频率远低于内含子区段,但编码区的SNP仍将两个基因分别划分为7个和19个单倍型。Gln1-3和Gln1-4基因的多态性位点之间处于高度的连锁不平衡,其连锁不平衡随物理距离的增加而迅速衰减。在此基础上,结合三亚和青岛的产量相关性状的测定数据,本研究进行了候选基因关联,筛选出与产量相关的优异等位变异位点。其中Gln1-3基因编码区共检测到3个多态性位点与产量性状显著关联:SNP14(C/T)与粒厚显著关联,贡献率6.81%;SNP4(A/C)与穗重显著关联,贡献率7.71%;SNP49(C/A)与粒长、粒重、穗重显著关联,对穗重的贡献率最大为8.44%。Gln1-4基因编码区在两个环境中共检测到8个与产量性状显著关联的多态性位点:利用三亚表型数据关联到5个位点,分别与粒长、粒宽、穗粗和秃顶长显著关联,利用青岛表型数据关联到5个位点,分别与轴粗、穗粗、秃顶长、粒长、穗行数和粒宽显著关联,其中,位点SNP50(T/C)为非同义突变,引起氨基酸的改变(P/L),在两个环境中均与粒长达到了显著关联,贡献率分别为5.44%和6.25%。
关键词:
玉米
产量性状
Gln1-3
Gln1-4
序列变异
关联分析
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