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3 篇 中国农业科学院生...
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作者

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7 篇 张和平
6 篇 车建美
6 篇 朱育菁
6 篇 余利岩
5 篇 冯福应
5 篇 葛慈斌
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4 篇 陈倩倩
4 篇 张玉琴
4 篇 万云洋
4 篇 陈峥
4 篇 孟和毕力格
3 篇 潘志针
3 篇 孙志宏
3 篇 方晓梅
3 篇 苏静
2 篇 王博
2 篇 胡春锦

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海南岛多种石珊瑚共附生真菌多样性及其对养殖病害菌的抗性潜力研究

海南岛多种石珊瑚共附生真菌多样性及其对养殖病害菌的抗性潜力研...

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第八届全国微生物资源学术暨国家微生物资源平台运行服务研讨会

作者：徐炜郭双双骆祝华国家海洋局第三海洋研究所厦门361005

热带珊瑚礁生态系统具有丰富的生物多样性和化学多样性,已成为现代海洋天然产物及海洋药物研究开发的热点.珊瑚代谢产物种类繁多、结构新颖,是海洋天然产物三大来源之一.其共附生微生物可能是这些代谢产物的真正产生者.珊瑚是微生物的...

热带珊瑚礁生态系统具有丰富的生物多样性和化学多样性,已成为现代海洋天然产物及海洋药物研究开发的热点.珊瑚代谢产物种类繁多、结构新颖,是海洋天然产物三大来源之一.其共附生微生物可能是这些代谢产物的真正产生者.珊瑚是微生物的一个动态组合,在珊瑚的粘液层、骨架以及组织都容纳着大量微生物,其中包括：虫黄藻,石内生的海藻,原生动物,真菌,细菌,古菌和病毒等,这些微生物在热带的营养盐缺乏海域形成了一个复杂的共生群体.但是相比于共附生细菌,真菌所受到的关注较少,但是与其它原核微生物相比,真菌相对高等,代谢能力更强,生命活动更复杂,并与海洋中动植物有着非常复杂的生态关系,孕育着许多丰富的新型活性代谢产物,人们已经充分认识到海洋真菌是一块还没有充分发掘,又有极大潜力的新领域.在我们的研究中通过对海南岛采集的10个珊瑚样品的真菌进行分离,一共获得153株真菌.通过对所有分离物进行形态鉴定和分子生物学上对ITS序列的进一步分析,可知这153株真菌可归为7个真菌纲,38个种.其中,7个纲包括5个子囊菌门纲(Eurotiomycetes,Dothideomycetes,Sordariomycetes,Leotiomycetes和Saccharomycetes)和2个担子菌门纲(Agaricomycetes和Microbotryomycetes).其中Penicillium citrinum在十个样品中都有分离到,此外还有一些真菌,例如Phialophora europaea, Curvularia lunata, Schizophyllum commune,Devriesia sp.,Microsphaeropsis arundinis, Panus lecomtei, Hortaea werneckii, Trichoderma harzianum,Trametes hirsute, Arthrinium sp.,Fusarium solani,Cadophora malorum和Aspergillus avus等的分布范围狭窄,且只从一个或两个珊瑚样品中被分离出来.选取38种真菌的代表性菌株,将其经PYG液体培养基初步发酵,发酵液进行抗菌活性初筛,有8株珊瑚共附生真菌至少对一种鱼类常见病害菌表现出抑菌活性,占菌株总数的21.62％.8株真菌分为4个属,分别为青霉属Penicillium(2株)、曲霉属Aspergillus(3株)、枝孢属Aspergillus(2株)和镰刀菌属Fusarium(1株).其中有3株对金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)表现出抑菌活性,1株对美人鱼发光杆菌(Photobacterium damselae)表现出抑菌活性性,4株对副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)具有抑菌活性,另有4株对溶藻弧菌(Hbrio alginolyticus)具有抑菌活性.

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藻际环境中微囊藻毒素降解菌的分离和筛选

藻际环境中微囊藻毒素降解菌的分离和筛选

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第八届全国微生物资源学术暨国家微生物资源平台运行服务研讨会

作者：艾梦杰孙烨张长风余利岩张玉琴中国医学科学院医药生物技术研究所北京100050

随着湖泊富营养化程度加重,水体中蓝藻的过度繁殖导致水华现象频繁爆发,对人类的生产、生活以及生态环境造成严重危害.蓝藻水华所带来的最主要危害之一是某些蓝藻细胞产生并向水体中释放不同类型的藻毒素,其中由微囊藻(microcystis)、...

随着湖泊富营养化程度加重,水体中蓝藻的过度繁殖导致水华现象频繁爆发,对人类的生产、生活以及生态环境造成严重危害.蓝藻水华所带来的最主要危害之一是某些蓝藻细胞产生并向水体中释放不同类型的藻毒素,其中由微囊藻(microcystis)、鱼腥藻(anabaena)、束丝藻(aphanizomenon)、颤藻(oscillatoria)、念珠藻(nostoc)等产生的微囊藻毒素(Microcystins,MCs)是富营养化水体中出现频率最高、产生量最大和造成危害最严重的一类藻毒素.MCs是一类具有肝毒性的环肽类化合物,能够造成肝组织结构损伤、凋亡,在微囊藻毒素70多异构体中以微囊藻毒素MC-LR(L、R分别代表亮氨酸、精氨酸)的急性毒性最强,而且其单环多肽间隔双键结构稳定不易被破坏,单纯依靠自然条件降解十分缓慢.目前,生物降解转化去除微囊藻毒素有绿色、环保、可持续发展等优势,是主要的处理藻毒素的方法.本实验采用纯培养手段从50份蓝藻藻际环境样品中分离得到200株细菌.运用将微囊藻毒素MC-LR作为微生物生长唯一碳源的固体培养基平板筛选方法,将从蓝藻藻际环境样品中分离得到的纯培养物作为待筛选菌株,共筛选得到17株可在该微囊藻毒素无机盐平板上生长的纯菌种菌株,通过对其16S rRNA基因序列分析结果显示,分别归属于食酸菌属Acidovorax(1株)、屈曲杆菌属Ancylobacter(1株)、芽孢杆菌属Bacillus(2株)、Bosea属(2株)、发酵成对杆菌属Dyadobacter(1株)、产卟啉杆菌属Porphyrobacter(1株)、假单胞菌属Pseudomonas(3株)、根瘤菌属Rhizobium (4株)、鞘脂单胞菌属Sphingomonas(2株).其中芽孢杆菌属Bacillus、根瘤菌属Rhizobium、鞘脂单胞菌属Sphingomonas已有相关文献报道其属内菌株具有微囊藻毒素降解功能,而对食酸菌属Acidovorax、屈曲杆菌属Ancylobacter、Bosea属、发酵成对杆菌属Dyadobacter、产卟啉杆菌属Porphyrobacter属内微囊藻毒素降解菌未见报道,说明藻际环境中拥有丰富的微囊藻毒素降解功能细菌微生物资源.我们通过对该环境菌株的分离及初步筛选,为进一步研究菌株的微囊藻毒素降解能力、降解条件及降解机制奠定基础,期望得到高效降解微囊藻毒素菌株为蓝藻水华污染湖泊水域的生态治理提供菌株资源.

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武陵山地区特殊生境微生物资源研究及种质库建设

武陵山地区特殊生境微生物资源研究及种质库建设

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第八届全国微生物资源学术暨国家微生物资源平台运行服务研讨会

作者：刘祝祥贺建武刘荷程金莲杨玉婷李梦霖彭清忠陈义光吉首大学生物资源与环境科学学院湖南省吉首市416000

以湘鄂渝黔四省市交界的武陵山区特殊生态环境中的微生物资源为研究对象,用微生物生态学、分子生物学及多相分类方法,开展微生物多样性、种质保护和生态适应机制等基础研究,并开展这些特色微生物资源在医药、农林和环保领域的资源化利...

以湘鄂渝黔四省市交界的武陵山区特殊生态环境中的微生物资源为研究对象,用微生物生态学、分子生物学及多相分类方法,开展微生物多样性、种质保护和生态适应机制等基础研究,并开展这些特色微生物资源在医药、农林和环保领域的资源化利用等应用基础研究,建立相应微生物种质资源保藏库和管理系统.目前主要开展课如下工作：(1)非盐环境中嗜盐和极端耐盐菌多样性、分类学及种质保护：在国家基金项目“硇洲岛潮汐带无脊椎动物相关原核生物多样性研究”(30970007)、“非盐性土壤中嗜盐和极端耐盐原核生物多样性及分类学研究”(31460004)的支持下,开展了非盐性土壤中嗜盐和极端耐盐原核生物多样性及分类学研究,目前已经完成湖南省小溪和高望界国家级自然保护区、德夯风景名胜区森林土壤嗜盐和耐盐菌的研究.结果表明,非盐环境中存在较为丰富的嗜盐菌和耐盐菌,类群多样性较高,且存在一定数量的代表新类群(物种)的菌株(已经发表新种5个).(2)酒鬼酒酿造微生物多样性研究和产香功能微生物筛选：受酒鬼酒股份有限公司委托,对该内容进行了立项研究,目前已经完成酒鬼酒酿造环境、酒曲和发酵池窖泥的微生物多样性研究.结果表明,酒鬼酒酿造微生物多样性丰富,潜藏着一定比例的新类群(物种),较高比例菌株具有产生淀粉酶、脂酶、明胶酶和脲酶的能力,在酒鬼酒的相关酿造工艺中可能起到了重要的作用.(3)土家腊肉中耐盐或嗜盐微生物多样性及其群落结构演替规律研究：选取武陵山地区的龙山县里耶镇、永顺县塔卧乡和古丈县双溪乡的传统土家腊肉样品,采用纯培养法和免培养法双重手段研究土家腊肉加工过程中微生物群落结构、种群丰度和动态变化规律,探讨不同时期微生物代谢活动与土家腊肉发酵、成熟的关系;同时,研究未培养微生物的分离策略,建立其可培养方法,挖掘新的耐盐或嗜盐微生物类群.这一研究工作得到了同行的好评,获得了国家基金的立项资助(31260003).(4)武陵山区大型真菌多样性考察：在湖南省高校科技创新团队支持下,初步开展了武陵山区大型真菌多样性综合考察.调查结果表明,高望界国家自然保护区和小溪国家自然保护区内大型真菌物种多样性丰富.共鉴定真菌258种,分属担子菌门和子囊菌门;绝大多数具经济价值,如紫芝、红紫、美味牛肝菌、红汁乳菇、松乳菇、甜味乳菇、鸡枞菌;部分真菌是森林白腐真菌;存在一定数量的有毒真菌,主要属鹅膏菌科的真菌,共10余种.(5)建立了武陵山区微生物种质资源库：硬件包括低温菌种库40m2,常年保持干燥和2-4度低温条件;有6台超低温冰箱和4个液氮罐用于菌种和DNA的超低温冻藏.目前已经入库保藏微生物菌种及其基因组DNA共5100株,其中典型菌株210株.(6)种质资源管理系统及数据库建设：购置了高性能服务器,开发了专用数据库管理软件(生物种质资源及功能信息管理系统,软件著作权登记证号：2014SR176289);对收集的种质材料进行了初步数据化,管理网络门户系统开通(http：//***/).

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α-磷酸葡萄糖变位酶基因pgm2的过表达对马奶酒样乳杆菌ZW3胞外多糖胞外多糖产量的影响

α-磷酸葡萄糖变位酶基因pgm2的过表达对马奶酒样乳杆菌ZW3胞外多...

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第八届全国微生物资源学术暨国家微生物资源平台运行服务研讨会

作者：耿伟涛崔月倩邢竹青王艳萍食品营养与安全教育部重点实验室天津科技大学食品工程与生物技术学院天津300457

马奶酒样乳杆菌ZW3分离自西藏Kefir粒中,前期研究表明,该菌株在优化的MRS培养基中胞外多糖产量可达1600mg/L,并且产生的胞外多糖具有良好的理化性质,是一株具有潜在应用价值的菌株.前期对该菌株的全基因组测序及基因组数据分析表明,该...

马奶酒样乳杆菌ZW3分离自西藏Kefir粒中,前期研究表明,该菌株在优化的MRS培养基中胞外多糖产量可达1600mg/L,并且产生的胞外多糖具有良好的理化性质,是一株具有潜在应用价值的菌株.前期对该菌株的全基因组测序及基因组数据分析表明,该菌株染色体大小为2.11 Mb,并含有一段14.4 kb的胞外多糖合成相关的基因簇,编码了17个多糖合成相关基因.另外,其染色体中还编码了多个胞外多糖合成代谢的关键酶的基因,例如pgm2,galE, galK等.其中pgm2所编码的静磷酸葡萄糖变位酶在该菌株的细胞内负责将6-磷酸葡萄糖转化为1-磷酸葡萄糖,而1-磷酸葡萄糖是果糖和葡萄糖等物质进入胞外多糖合成的关键步骤,因此该酶在胞外多糖合成过程中发挥着重要作用.本研究以马奶酒样乳杆菌ZW3基因组DNA为模板,根据基因组数据设计引物对α-磷酸葡萄糖变位酶基因pgm2进行了扩增.随后将pgm2基因克隆到大肠杆菌表达载体pET30a上,并转化大肠杆菌进行表达,利用SDS-PAGE进行蛋白表达的验证.随后,将该基因克隆到乳酸菌表达载体pMG36e中,并对转化DNA浓度、复苏培养基、转化电压等转化条件进行了优化,提高转化效率,随后将重组质粒转化至马奶酒样乳杆菌ZW3中.选择目的转化子,提取质粒并对目的基因测序进行验证,结果表明本研究成功构建了α-磷酸葡萄糖变位酶过表达的重组菌株.对野生型和过表达菌株的生长曲线进行对比,结果表明,相对于野生型过表达菌株生长速率较为缓慢,在64h进入稳定期,但两者总体生物量差别不大.随后,提取两株菌株的总蛋白进行SDS-PAGE分析,在过表达菌株中叶磷酸变位酶的表达量明显提高.接着,又对两菌株的胞外多糖的产量进行了测定,在产量达到最高的56h时,过表达菌株的胞外多糖产量比野生型增加了20.16％.本研究表明α-磷酸葡糖变位酶的过表达在马奶酒样乳杆菌ZW3中对胞外多糖合成起到了一定的促进作用.

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不同植被类型对黄河三角洲土壤细菌多样性和群落结构的影响

不同植被类型对黄河三角洲土壤细菌多样性和群落结构的影响

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第八届全国微生物资源学术暨国家微生物资源平台运行服务研讨会

作者：位光山李明聪赵庚星高峥山东农业大学生命科学学院山东泰安271018 山东农业大学资源与环境学院山东泰安271018

黄河三角洲由黄河沉积物沉降形成,受渤海海水影响,高盐碱是该地区土壤的特性,经多年土壤改良,该地区部分土壤已开始种植小麦、棉花、水稻等农作物.微生物在土壤改良和作物增产过程中发挥重要作用,但目前关于盐碱地土壤微生物群落与植被...

黄河三角洲由黄河沉积物沉降形成,受渤海海水影响,高盐碱是该地区土壤的特性,经多年土壤改良,该地区部分土壤已开始种植小麦、棉花、水稻等农作物.微生物在土壤改良和作物增产过程中发挥重要作用,但目前关于盐碱地土壤微生物群落与植被类型、环境因子等之间的关系还不明确.我们采集了黄河三角洲不同地区不同植被类型(小麦、棉花、水稻、碱蓬、光板地)的非根际土壤样品,测定了其理化因子,并用二代测序研究其细菌群落结构,以期揭示植被类型、环境因子与微生物之间的关系.基于OTU的多样性结果表明细菌α-多样性在不同植被类型土壤间存在差异,麦田(Shannon index=6.76±0.23,n=6)和棉田(Shannon index=6.78±0.25,n=7)中细菌多样性最高,其次为稻田(Shannon index=6.62±0.17,n=6)、碱蓬地(Shannon index=5.96±0.50,n=5),而在无植被覆盖的光板地中多样性最低(Shannonindex=4.67±0.72,n=3);ANOVA分析表明有植被覆盖的土壤细菌多样性显著高于无植被覆盖的光板地(P＜0.01,n=27),表明植被类型影响土壤细菌α-多样性.Pearson分析表明,地理位置(经纬度)对细菌α-多样性无显著影响;但盐度(电导率)、pH、氨氮、有效硫、总磷含量等环境因子与细菌α-多样性显著相关(P＜0.05或0.01,n=27).以上结果表明,黄河三角洲细菌α-多样性共同受植被类型和理化因子的影响,与地理位置关系不大.在黄河三角洲不同土壤样品中共发现43个细菌门(或候选门),其中至少在一个样品中相对丰度大于1％的优势门有18个,在各样品中相对丰度较高的细菌门有Proteobacteria、Chloroflexi、Bacteroidetes、Actinobacteria、Acidobacteria、Firmicutes和itrospirae等;优势纲有29个,其中Gammaproteobacteria、Alphaproteobacteria、Anaerolineae、Actinobacteria、 Acidobacteria、Deltaproteobacteria、Betaproteobacteria、Cytophagia和Gemmatimonadetes等在各样品中含量丰富.基于weighted和unweighted UniFrac PCoA分析结果发现,除麦田和棉田外,细菌群落结构能按样品类型被较好地分开,表明麦田和棉田土壤的细菌群落组成更相似;进一步的ANOSIM分析也表明麦田和棉田细菌群落组成差异不显著(P＞0.05,n=27),而与其他样品之间的群落组成差异显著(P＜0.05或0.01,n=27),这表明植被类型是影响细菌群落结构因素之一.通过Mantel test分析结果表明,该地区细菌群落结构对地理位置变化不敏感,而与盐度、pH、湿度和营养物质含量(铵态氮、硝态氮、有效硫、总磷)等显著相关(P＜0.05或0.01,n=27).综上,土壤理化因子是黄河三角洲土壤细菌群落的主要影响因素,其次是植被类型,地理位置对土壤细菌群落的影响不显著.本研究揭示了黄河三角洲不同植被类型土壤中的细菌群落结构、多样性及其与植被类型、环境因子和地理位置之间的相互关系,为该地区微生物资源开发、盐碱地土壤微生物改良及生态环境保护提供一定的理论基础.

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蜘蛛抱蛋属(Aspidistra)植物内生细菌的多样性及其抗菌活性筛选

蜘蛛抱蛋属(Aspidistra)植物内生细菌的多样性及其抗菌活性筛选

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第八届全国微生物资源学术暨国家微生物资源平台运行服务研讨会

作者：方晓梅张玉琴魏玉珍郭宝林余利岩国家微生物资源平台药学微生物资源子平台/中国药学微生物菌种保藏管理中心中国医学科学院/北京协和医学院医药生物技术研究所北京100050 中国医学科学院&北京协和医学院药用植物研究所北京100193

[目的]研究蜘蛛抱蛋属(Aspidistra)内生细菌的多样性,探索药用植物内生细菌在药用活性产物方面的开发潜力,以期发现具有抗菌活性的次级代谢产物.[方法]对新鲜的蜘蛛抱蛋植物进行表面消毒,采用5种分离培养基分离内生细菌;根据菌落形态特... 详细信息

[目的]研究蜘蛛抱蛋属(Aspidistra)内生细菌的多样性,探索药用植物内生细菌在药用活性产物方面的开发潜力,以期发现具有抗菌活性的次级代谢产物.[方法]对新鲜的蜘蛛抱蛋植物进行表面消毒,采用5种分离培养基分离内生细菌;根据菌落形态特征选择代表性菌株测定16S rRNA基因序列,构建系统进化树分析内生细菌的多样性;使用耻垢分枝杆菌(Mycobacterium smegmatis ATCC700044),水稻白叶枯菌(Xanthomonas oryzae PXO99A),白色念珠菌(Candida albicans ATCC 100231),肺炎雷伯菌(Klebsiella pneumoniae ATCC 700603)和耐药粪肠球菌HH22 (Enterococcus faecalis HH22)5种检定菌对分离菌株的液体发酵粗提品进行抑菌活性筛选.[结果]从植物组织中分离得到了322株内生细菌,根据形态初步排重,得到260株植物内生细菌;70个代表菌株分属于3门,10目,17科,23属;43株内生细菌的发酵粗提品具有抑菌活性,初筛阳性率为16.5％.[结论]该研究显示,蜘蛛抱蛋植物组织中存在着种类多样的内生细菌,它们是抗菌生物活性次级代谢产物的有效来源之一.

关键词：蜘蛛抱蛋内生菌多样性抑菌活性

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A genetic role for macrophage migration inhibitory factor (MIF) in Epinephelus awoara infected with Vibrio parah aemolyticus

A genetic role for macrophage migration inhibitory factor (M...

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第八届全国微生物资源学术暨国家微生物资源平台运行服务研讨会

作者：徐晓津覃映雪罗罡集美大学水产学院福建省海洋渔业资源与生态环境重点实验室福建厦门361021

Macrophage migration inhibitory factor (MIF) is a key proinflammatory cytokine in immuno-inflammatory *** the first time,we examined the expression of MIF in Epinephelus awoara (***).MIF expressions have been detected in head kidney,spleen,liver,brain,intestine,gill,heart,stomach,and muscle of *** infected with *** mRNA levels observed in infected groupers were higher than those in healthy ***,TNF-α,and IL-1 tissue levels have been measured by ELISA.A significant increase in MIF,TNF-α,and IL-1 tissue levels have been found in the treatment groups compared with those in ***,TNF-α and IL-1 tissue levels in spleen,head kidney,intestine,and liver of *** during the challenge trial with *** were significantly higher than those in controls *** was evidence that functions of MIF in a positive feedback loop with TNF-α,and IL-1 that could perpetuate the inflammatory process in grouper infected with *** conclusion,these results indicated that MIF was related to pathogen-induced immune response.

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Prediction and characterization of protein-protein interaction network in Bacillus licheniformis WX-02

Prediction and characterization of protein-protein interacti...

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第八届全国微生物资源学术暨国家微生物资源平台运行服务研讨会

作者： Yi-Chao Han Jia-Ming Song Long Wang Cheng-Cheng Shu Jing Guo Ling-Ling Chen 武汉生物技术研究院武汉430073

In this study,we constructed a protein-protein interaction (PPI) network of *** strain WX-02 with interolog method and domain-based method,which contained 15,864 edges and 2,448 *** computationally predicted networks have relatively low coverage and high false-positive rate,our prediction was confirmed from three perspectives: local structural features,functional similarities and transcriptional *** analysis of the COG heat map showed that protein interactions in *** WX-02 mainly occurred in the same functional *** incorporating the transcriptome data,we found that the topological properties of the PPI network were robust under normal and high salt *** addition,267 different protein complexes were identified and 117 poorly characterized proteins were annotated with certain functions based on the PPI ***,the sub-network showed that a hub protein CcpA jointed directly or indirectly many proteins related to γ-PGA synthesis and regulation,such as PgsB,GltA,GltB,ProB,Pro J,YcgM and two signal transduction systems ComP-ComA and ***,CcpA might play an important role in the regulation of γ-PGA *** study therefore will facilitate the understanding of the complex cellular behaviors and mechanisms of γ-PGA synthesis in *** WX-02.

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