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285 篇 会议

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92 篇 工学
- 29 篇 计算机科学与技术...
- 18 篇 化学工程与技术
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- 3 篇 生物工程
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- 4 篇 生态学
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1 篇 法学
1 篇 文学

主题

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6 篇 database
6 篇 alternative spli...
5 篇 machine learning
4 篇 evolution
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4 篇 algorithm
4 篇 gene regulation
4 篇 gc content
4 篇 transcriptional ...
4 篇 protein structur...

机构

23 篇 生物电子学国家重...
14 篇 山东省功能大分子...
13 篇 生物信息科学与技...
11 篇 数理与生物工程学...
10 篇 生物信息中心
8 篇 生物信息学教育部...
7 篇 生物医学工程系
7 篇 生命科学与技术学...
7 篇 生命科学学院
6 篇 生物工程与技术研...
6 篇 德州学院
6 篇 山东师范大学
5 篇 军事医学科学院放...
5 篇 计算机学院
5 篇 理论生物物理实验...
5 篇 内蒙古生物质能源...
5 篇 北京大学
5 篇 生物医学工程学院
5 篇 信息科学与工程学...
4 篇 流行病与卫生统计...

作者

13 篇 孙啸
10 篇 李霞
9 篇 王吉华
9 篇 蔡禄
7 篇 于家峰
6 篇 曹赞霞
6 篇 刘宏德
6 篇 孙之荣
5 篇 张岩
5 篇 赵秀娟
5 篇 王举
5 篇 陆祖宏
4 篇 李宗城
4 篇 应晓敏
4 篇 刘泽先
4 篇 刘洪波
4 篇 刘孟
4 篇 黄健
4 篇 胡朔枫
4 篇 刘国庆

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278 篇 英文
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Bacterial GC content variations, genome expansion and terrestrial land colonization

Bacterial GC content variations, genome expansion and terres...

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第六届全国生物信息学与系统生物学学术大会暨国际生物信息学前沿研讨会

作者：吴浩方永军于军章张中科院基因组科学与信息重点实验室北京基因组研究所中国科学院北京农业部橡胶树生物学重点实验室中国热带农业科学院儋州

Background: Although it has already been well documented that, in contrast to translation and transcription systems, DNA replication systems are not universally conserved among the three domains of life (Bacteria, Archaea, and Eukaryotes), it comes as a great surprise that even within bacteria the functional DNA polymerase Ⅲ alpha subunits (DnaE) have four different homologs, i.e., DnaE1, DnaE2, DnaE3, and PolC.

关键词： GC content HGT genome expansion metagenomics bacterial land colonization

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The regulated network of alternative splicing factors

The regulated network of alternative splicing factors

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第六届全国生物信息学与系统生物学学术大会暨国际生物信息学前沿研讨会

作者：蔡禄邢永强数理与生物工程学院内蒙古科技大学包头014010 生物工程与技术研究所内蒙古科技大学包头014010 内蒙古生物质能源化利用重点实验室内蒙古科技大学包头014010 数理与生物工程学院内蒙古科技大学包头014010 生物工程与技术研究所内蒙古科技大学包头014010

Background: Alternative splicing is pervasive in multi-exon genes of human and other organisms, and is a major contributor to the expansion of the transcriptome diversity and functional *** array data demonstrated tha... 详细信息

关键词： alternative splicing protein factor RNA element interaction

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Improvement of reconstruction of microbial community with multiple 16S rRNA regions

Improvement of reconstruction of microbial community with mu...

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第六届全国生物信息学与系统生物学学术大会暨国际生物信息学前沿研讨会

作者：王圣钦孙蓓丽陆祖宏生物电子学国家重点实验室生物科学与医学工程学院东南大学南京210096 生物电子学国家重点实验室生物科学与医学工程学院东南大学南京210096 生物医学工程系工学院北京大学北京100781

It has long been recognized that the "universal" 16S rRNA gene primers commonly used in microbial community surveys are inherently biased toward some *** our previous work, we found that genera have their own best genus-specific amplicons for genus assignment, which sometimes is not located in hyper variable regions (HVRs).

关键词： 16S rRNA High throughput sequencing Hyper-variable region

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The structural character of α-syn12 dimer in explicit water molecules by replica-exchange molecular dynamics simulation

The structural character of α-syn12 dimer in explicit water...

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第六届全国生物信息学与系统生物学学术大会暨国际生物信息学前沿研讨会

作者：曹赞霞刘磊王吉华山东省功能大分子生物物理重点实验室物理系德州学院德州253023 山东省功能大分子生物物理重点实验室物理系德州学院德州253023 信息管理学院德州学院德州253023

Background: The typical symptom of Parkinson's disease is the presence of α-synuclein aggregates in the form of β-structure that can be soluble or *** N-terminal region (residues 1-60) of α-synuclein plays a key role in the formation of α-synuclein ***, the dimerization is important for α-synuclein conformational transition and ***, it is difficult to simulate 120 residues in explicit water *** this study, we selected N-terminal 12 residues peptide of α-synuclein (α-syn12).

关键词： Parkinson's disease α-syn12 polypeptide dimer structural ensemble transformation

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Modeling Type Ⅳ pilus structure of Geobacter sulfurreducens from sparse data

Modeling Type Ⅳ pilus structure of Geobacter sulfurreducens...

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第六届全国生物信息学与系统生物学学术大会暨国际生物信息学前沿研讨会

作者：肖可孙啸生物电子学国家重点实验室生物科学与医学工程学院东南大学南京210096

Background: Microbial nanowires are conductive protein appendages which facilitate long-range extracellular electron transfer (EET).Different species of Geobacter and Shewanella have been found transfer electrons along their nanowires, which might be used for bioremediation of toxic metals or generation of electricity in microbial fuel ***, studies have suggested that these different species have different mechanisms for EET along their conductive *** sulfurreducens nanowires, which are comprised of pili, have been reported for its metal-like conductivity attributed to overlapping pi-pi orbitals of aromatic amino *** of the subunit structure which is determined with solution state NMR spectroscopy and a stepping stone model proposed before, the pilus structure of *** and the details of mechanism of electron transfer along the pili still remain unknown.

关键词： Geobacter sulfurreducens Pilus assembly structure modeling

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Optimization of Multi-Level Protein Sequence Database Search Strategy

Optimization of Multi-Level Protein Sequence Database Search...

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第六届全国生物信息学与系统生物学学术大会暨国际生物信息学前沿研讨会

作者：余庆常乘吴松锋马洁朱云平舒坤贤生物信息学研究所重庆邮电大学重庆400065 蛋白质组学国家重点实验室北京蛋白质组研究中心北京102206 蛋白质组学国家重点实验室北京蛋白质组研究中心北京102206 生物信息学研究所重庆邮电大学重庆400065

Background:In recent years, mass spectrometry-based shotgun proteomics has become the major method for large-scale protein ***, it's estimated that at least 70% spectra in MSdata cannot be successfully *** the search space is one of the most common ways to improve the efficiency for protein ***, the expanding database may not contribute to improve the accuracy and sensitivity of peptide *** alleviate this issue, we introduced the multi-level protein sequence database search strategy and proved this strategy can identify more results using a universal standard proteins set.

关键词： shotgun proteomics protein sequence database quality control method peptide identification

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The Study of Conformational Transition Characteristics of Intrinsically Disordered FlgM Protein of Hyperthermophile in Different Temperature

The Study of Conformational Transition Characteristics of In...

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第六届全国生物信息学与系统生物学学术大会暨国际生物信息学前沿研讨会

作者：朱玉风曹赞霞王吉华山东省功能大分子生物物理重点实验室物理系德州学院德州253023 物理与电子科学学院山东师范大学济南250014 山东省功能大分子生物物理重点实验室物理系德州学院德州253023

Background: The homologous FlgM proteins have varieties of disordered degree and temperature adaptability, and the disordered degree is related with high temperature *** is one of the strategies naturally for adaptation to high temperature that the disordered degree is converted from a fully disordered state to a semidisordered *** thermophile aquifex aeolicus FlgM protein (AAFlgM) is intrinsically disordered proteins, and also semidisordered *** remains unknown how the conformation transitions along with temperature at atomic-level.

关键词： the thermophile aquifex aeolicus FlgM protein molecular dynamics simulation temperature intrinsically disordered protein

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Classfication of disordered/ordered regions of the intrinsically disordered proteins based on multi-site sequence features

Classfication of disordered/ordered regions of the intrinsic...

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第六届全国生物信息学与系统生物学学术大会暨国际生物信息学前沿研讨会

作者：武恩斯于家峰王吉华山东省功能大分子生物物理重点实验室德州学院生物物理研究所德州253023 德州学院物理与电子信息学院德州253023 山东师范大学生命科学学院济南250014 山东省功能大分子生物物理重点实验室德州学院生物物理研究所德州253023 德州学院物理与电子信息学院德州253023

Background: Intrinsically disordered proteins (IDPs) are a kind of widespread protein that lack of stable three-dimensional structure, although they carry important biological *** of the flexible structure, it is difficult to experimentally study *** computational prediction of IDPs have been one of the most important topics of bioinformatics.

关键词： Intrinsically disordered proteins sequence complexity sequence analysis

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ThermoMatch: genome-wide oligonucleotide binding sites prediction based on thermodynamics

ThermoMatch: genome-wide oligonucleotide binding sites predi...

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第六届全国生物信息学与系统生物学学术大会暨国际生物信息学前沿研讨会

作者：刘哲言卢一鸣闵波单光宇屈武斌张成岗北京放射与辐射医学研究所蛋白质组学国家重点实验室军事医学科学院北京100850 生命科学学院安徽医科大学合肥230032 北京放射与辐射医学研究所蛋白质组学国家重点实验室军事医学科学院北京100850

Determination of oligonucleotide binding sites is crucial for nucleotide hybridization based molecular biological technology, such as *** sequence similarity method such as BLAST was adopted by most software, it doesn... 详细信息

关键词： Thermodynamics ThermoMatch BLAST PCR

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Using Imputation Method with reference panel reconstruction to Improve Whole Exome Sequencing analysis

Using Imputation Method with reference panel reconstruction ...

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第六届全国生物信息学与系统生物学学术大会暨国际生物信息学前沿研讨会

作者：裴智勇李雪楠周家蓬桂小柯陈禹保生物计算事业部北京市计算中心北京科学技术研究院北京100094 北京基因组研究所中国科学院北京100101 生物计算事业部北京市计算中心北京科学技术研究院北京100094

Background: With the advances of Next Generation Sequencing technology, the application of bioinformatics to solve genomics problem become a focus of recent *** accumulation of human genetic variation data make it feasible to utilize computational method to improve the analysis, such as using imputation to improve the performance in Whole Exome Sequencing (WES) analysis.

关键词： Bioinformatics Imputation Whole exome sequencing 1000 Genomes Project Reference panel

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