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- 13 篇 管理科学与工程(可...
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3 篇 经济学
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1 篇 法学
- 1 篇 法学
- 1 篇 政治学
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主题

10 篇 化学计量学
7 篇 分子动力学
6 篇 分子动力学模拟
6 篇 近红外光谱
5 篇 二阶校正
5 篇 化学信息学
5 篇 深度学习
5 篇 药物设计
5 篇 分子模拟
4 篇 自由能计算
3 篇 氢键
3 篇 交替三线性分解
3 篇 人工智能
3 篇 分子设计
3 篇 定量分析
3 篇 蛋白质
3 篇 温控近红外光谱
3 篇 mm/gbsa
3 篇 温度效应
3 篇 多元校正

机构

12 篇 湖南大学
12 篇 南开大学
7 篇 中国科学院大学
7 篇 吉林大学
6 篇 四川大学
5 篇 首都师范大学
5 篇 中山大学
4 篇 复旦大学
4 篇 华中师范大学
4 篇 浙江大学
4 篇 化学生物传感与计...
4 篇 中国科学院上海药...
3 篇 西安石油大学
3 篇 烟台大学
3 篇 陕西理工大学
3 篇 陕西省催化基础与...
3 篇 南京大学
3 篇 华东理工大学
3 篇 西北大学
2 篇 湖南工业大学

作者

12 篇 邵学广
12 篇 蔡文生
11 篇 吴海龙
10 篇 俞汝勤
5 篇 张卓勇
5 篇 陈增萍
5 篇 李梦龙
5 篇 张欣
4 篇 王童
4 篇 李华
4 篇 文志宁
3 篇 夏冬辉
3 篇 潘里
3 篇 龙婉君
3 篇 陈俊辰
3 篇 周一凡
3 篇 郁颖
3 篇 朱维良
3 篇 孙小东
3 篇 欧阳洋子

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130 篇 中文
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特异质药物不良反应数据整合及数据库构建

特异质药物不良反应数据整合及数据库构建

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2019中国化学会第十五届全国计算（机）化学学术会议

作者：文志宁柳媛郝颖异周一凡赵意如梁羽李梦龙四川大学化学学院四川大学医学大数据中心四川大学计算机学院

几乎所有的上市药物都有可能引发不良反应,其区别主要是反应程度以及发生率的差异,随着上市药物的不断增加,药物不良反应的发生率也随之上升。特异质药物不良反应(Idiosyncratic ADR, IADR)是一类特殊的不良反应,其发生率较普通不良反... 详细信息

几乎所有的上市药物都有可能引发不良反应,其区别主要是反应程度以及发生率的差异,随着上市药物的不断增加,药物不良反应的发生率也随之上升。特异质药物不良反应(Idiosyncratic ADR, IADR)是一类特殊的不良反应,其发生率较普通不良反应来说更低,但发生后对机体造成的危害更大,但由于病因不明,更难以被预测。该工作中,我们以药物引起的横纹肌溶解症为例,探索此类不良反应数据的整合与规律探索。横纹肌溶解症是一种严重的骨骼肌直接或间接损伤引起的综合征,可导致严重的并发症,如急性肾衰竭[1]。诱发横纹肌溶解症的原因有很多,药物诱导横纹肌溶解症(Drug-induced rhabdomyolysis,DIR)是横纹肌溶解症产生的主要原因之一,属于一种特异质药物不良反应,但是因为其性质特殊,所以难以进行预测[2-4]。目前对于DIR的研究并不充分,这主要是由于DIR的发病率只有十万分之一,而且已有数据分散。因此,本研究工作通过对目前已有的药物相关的DIR数据进行整合并构建了数据库[5],不仅提供与DIR相关的信息查询,这些信息包括基于药物标签信息的DIR分类方案、引发DIR的药物上市以后的监管信息,以及药物基本属性信息。还对药物诱导横纹肌溶解症的风险进行评估,并根据得分对其进行分类。本工作开发了DIRA(***/DIRA)在线数据库,为研究人员提供了一个可以查询与DIR相关的信息平台,同时提供的药物数据可为研究人员后续关于DIR的QSAR研究提供准确的数据支撑。

关键词：特异质药物不良反应药物诱导横纹肌溶解症在线数据库

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数学分离辅助HPLC-MS快速测定自然水域中九种药理活性化合物残留

数学分离辅助HPLC-MS快速测定自然水域中九种药理活性化合物残留

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2019中国化学会第十五届全国计算（机）化学学术会议

作者：方焕吴海龙常月月欧阳洋子俞汝勤湖南大学化学生物传感与计量学国家重点实验室

药理活性化合物(Ph ACs)是环境中的一类外源性化学物质,被广泛用作人畜的治疗,由于其内在的生物活性可能会破坏水环境中的生态平衡而被列为新兴的污染物。环境中的Ph ACs主要来源于生活、畜牧业、工业及医疗污水的直接排放,且PhACs的人... 详细信息

药理活性化合物(Ph ACs)是环境中的一类外源性化学物质,被广泛用作人畜的治疗,由于其内在的生物活性可能会破坏水环境中的生态平衡而被列为新兴的污染物。环境中的Ph ACs主要来源于生活、畜牧业、工业及医疗污水的直接排放,且PhACs的人畜体内代谢率较低,而传统的生化处理也未能有效去除废水中的残留药物,导致大量未经代谢的药物直接或间接的排入到环境中。由于Ph ACs的持久性、较强的生物活性、累积性以及生物降解缓慢等特点,即使大多数Ph ACs在环境中以痕量的形式存在,也使暴露于其中的人畜、植物以及生态系统长期处于被危害和破坏的潜在危险中。传统的Ph ACs检测手段主要依靠于液液萃取、固相萃取及固相微萃取等预处理之后的高效液相色谱联用质谱法,毛细管电泳检测技术等。但这些方法通常需要复杂的样品预处理或检测灵敏度不高,耗时耗力,且传统的色谱定量要求分析物在色谱上完全分离,某些结构类似的分析物很难采用常规的方法完全分析,也无法通过改变有机相比例来使他们的色谱峰分离。针对这些问题本文提出数学分离辅助液相色谱-单级四极杆方法,在全离子无选择性的扫描模式下,同时定性定量分析自然水域中的9种Ph ACs。该方法充分利用交替三线性分解算法的"二阶优势",通过对液相色谱-质谱联用仪器产生的三维数据进行数学分离,即使在未知背景干扰存在、待分析物色谱峰分离不完全的情况下,也可以对待分析物进行准确的定量分析。

关键词：数学分离药理活性化合物 LC-MS 交替三线性分解

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三级成分分析方法分析多种扰动下的近红外光谱

三级成分分析方法分析多种扰动下的近红外光谱

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2019中国化学会第十五届全国计算（机）化学学术会议

作者：韩丽蔡文生邵学广南开大学化学学院分析科学研究中心

测量过程中的扰动往往会改变分析信号,尤其当体系中存在较多的影响因素时,定量模型的预测能力受到影响,从而导致定量分析的困难。另一方面,扰动也可以作为信息的来源,利用其对检测信号带来的变动,获取更多物质含量和结构变化信息。在温... 详细信息

测量过程中的扰动往往会改变分析信号,尤其当体系中存在较多的影响因素时,定量模型的预测能力受到影响,从而导致定量分析的困难。另一方面,扰动也可以作为信息的来源,利用其对检测信号带来的变动,获取更多物质含量和结构变化信息。在温度效应方面,本课题组建立了温度-光谱定量分析（QSTR）模型,并以此为基础预测了溶液中不同组分的浓度[1-2]。为了进一步提取温度和浓度分别对光谱的变化信息,研究了多级同时成分分析（MSCA）算法[3]对温控近红外光谱数据的分析能力[4]。MSCA方法能够在不同层次分析数据,并且分别考察数据内不同因素对光谱成分的影响。利用MSCA可增强模型解释性的特点,对水溶液的温控近红外光谱进行了解析,研究了溶质分子与水分子之间的相互作用[5]。本研究利用MSCA分层解析的特点,建立了三级MSCA方法,对p H、浓度和温度三种扰动下脯氨酸水溶液的近红外光谱进行解析,分别建立了p H间、温度间和浓度间模型。第一级模型反映了光谱随p H的变化,从模型结果中观察到了等电点处脯氨酸分子发生明显的聚集现象。利用第二级模型建立工作曲线,实现了准确的定量分析;同时该级模型结果表明,由于脯氨酸与水分子存在较强相互作用,随着脯氨酸浓度的升高,键合水的含量升高,导致本体水的含量下降。采用第三级模型得到的温度得分建立QSTR模型,实现对温度的预测;从模型中还可以看出,水团簇随着温度升高而逐渐解离,水分子中自由OH的含量增加。因此,三级MSCA为多扰动下分析信号的定量分析提供了新的方法。

关键词：近红外光谱三级同时成分分析定量分析扰动

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中药材信息平台的建立与应用

中药材信息平台的建立与应用

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2019中国化学会第十五届全国计算（机）化学学术会议

作者：蒋舒仰徐雯丽胡静李佳姚建华中科院能量调控材料重点实验室中国科学院上海有机化学研究所

中药是中国传统文化的瑰宝,人们已认识到她对人类健康的重要作用。为了使中药在保障人类健康方面进一步发挥重要作用,除了发展中医药理论,还应该注重利用现代技术,充分利用中药材资源,开发出更多可用于保障人类健康和生活质量的药物。在... 详细信息

中药是中国传统文化的瑰宝,人们已认识到她对人类健康的重要作用。为了使中药在保障人类健康方面进一步发挥重要作用,除了发展中医药理论,还应该注重利用现代技术,充分利用中药材资源,开发出更多可用于保障人类健康和生活质量的药物。在此,我们将介绍具有知识产权的中药材信息平台的建立方法,以及该平台的应用实例。如图1所示,该平台主要由三大部分组成:数据库系统、知识库系统和预测系统。与此对应,建立该平台主要采用了三种方法,即基于数据、基于逻辑和基于原理。数据库系统包含了中药材数据库、疾病受体数据库、化合物性质数据库等;知识库系统包含了化合物代谢、性质(毒性、活性等)知识库;预测系统主要包含了化合物毒性、活性和代谢等预测系统[1]。该平台已在药物、农药创制和中药材领域的已得到实际应用。在此,我们将介绍该平台在提高药物设计精准度方面的应用过程和实例。中药材数据库系统是集传统中药材信息和成分化合物的化学信息为一体的信息查询系统(如图2所示)。利用中药材数据库系统,可获得具有某种特定功能的药材,同时,可获得该药材的成分化合物及其相关信息。根据化合物的生物活性选取用于进一步优化的化合物。利用平台中的预测系统,预测优化后的化合物的活性、毒性、各类性质以及与对应受体的作用等等。根据预测结果,确定对应的新药研发方案。这样的研发策略有利于保证药物研发的精准性。

关键词：中药材信息平台预测系统成分化合物

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基于液相色谱-质谱联用的代谢组学数据分析新方法

基于液相色谱-质谱联用的代谢组学数据分析新方法

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2019中国化学会第十五届全国计算（机）化学学术会议

作者：卢红梅纪宏超张志敏中南大学化学化工学院

液相色谱-质谱联用技术已成为代谢组学分析的主要工具,尤其近十年来,随着色谱、质谱技术的高速发展,研究人员可以快速从复杂的生物样本中获得大量代谢组学数据,但如何从这些数据中挖掘生物信息,仍是目前亟需解决的问题。其中,代谢物的... 详细信息

液相色谱-质谱联用技术已成为代谢组学分析的主要工具,尤其近十年来,随着色谱、质谱技术的高速发展,研究人员可以快速从复杂的生物样本中获得大量代谢组学数据,但如何从这些数据中挖掘生物信息,仍是目前亟需解决的问题。其中,代谢物的定量和定性是代谢组学研究的基础,直接决定了后续结论的可靠性。本研究针对液相色谱-质谱联用高通量、高分辨率的特点,分别对非靶标代谢物定量、靶标代谢物定量以及基于串联质谱的代谢物定性提出一系列新方法:1.采用K均值聚类的方法,从非靶标代谢组学数据中提取每种代谢物的纯离子色谱,从而实现对每种代谢物的准确定量[1]。纯离子色谱策略的优势,在于从复杂的二维数据中提取属于单一离子的色谱轮廓,消除干扰离子和噪声影响,并以此为基础,提出了一套包括特征提取、特征对齐、数据后处理和模式识别的代谢组学分析框架。与传统方法对比,本方法能从原始数据中提取更多的代谢物特征,且定量结果更为准确。2.针对靶标代谢组学的特点,提出了具有针对性的靶标代谢组学可视化分析工具,使用户可以针对每一个代谢物动态调整参数并实时反馈分析结果[2]。其优势在于避免了传统分析工具只能设置全局参数,从而导致某些靶标代谢物不能准确定量的不足。传统的非靶标分析工具和现有靶标分析工具相比,本方法对靶标代谢物定量分析具有更好的准确性和易用性。3.基于于生物代谢系统中,代谢物之间呈现的结构相似性,提出了基于串联质谱和深度学习的代谢物相似度打分方法,并以此为依据对未知物进行结构定性[3]。在不使用任何其他先验信息的条件下,本方法即达到或超过同类算法的定性准确度。

关键词：色谱质谱代谢组学

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高维主成分分析应用于尿素扰动下温敏聚合物相变机理的研究

高维主成分分析应用于尿素扰动下温敏聚合物相变机理的研究

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2019中国化学会第十五届全国计算（机）化学学术会议

作者：马标蔡文生邵学广南开大学化学学院分析科学研究中心

温敏聚合物是一种可溶性的刺激响应型智能高分子材料,被广泛应用于药物释放、组织工程等生命科学领域[1]。尿素扰动下高分子的温敏性能会发生改变,但尿素影响聚合物相变行为的机理究竟是与聚合物直接作用还是通过改变水团簇结构间接作... 详细信息

温敏聚合物是一种可溶性的刺激响应型智能高分子材料,被广泛应用于药物释放、组织工程等生命科学领域[1]。尿素扰动下高分子的温敏性能会发生改变,但尿素影响聚合物相变行为的机理究竟是与聚合物直接作用还是通过改变水团簇结构间接作用尚不明确。本课题组利用温控近红外光谱结合高维主成分分析的方法[2]对多因素扰动下聚甲基丙烯酸N,N-二甲基氨基乙酯(PDMAEMA)尿素水溶液相变过程中聚合物、尿素和水相互作用进行研究。结果表明:尿素加入后,PDMAEMA的较低临界溶解温度(LCST)升高,尿素对其聚集成球起到阻碍作用。PDMAEMA松散的中间态[3]消失,并出现了尿素与PDMAEMA相互作用的特征吸收峰。PDMAEMA疏水基团仍被含有两个氢键结构(S2)的水包围但其数量明显降低,表明尿素的加入会使水团簇重排并减少聚合物周围S2结构水团簇的数量。因此,尿素与PDMAEMA之间的直接相互作用阻碍了PDMAEMA成球相变过程。随温度由30o C升高至32o C,尿素与PDMAEMA的相互作用显著增加,聚合物周围S2结构的水团簇缓慢减少,表明尿素逐渐取代水与PDMAEMA上羰基形成氢键;32 oC后继续升温,与PDMAEMA作用的尿素光谱强度缓慢增加,S2结构的水分子显著减少,此时可能是与亲水基团形成氢键的尿素逐渐饱和,尿素与PDMAEMA侧链疏水基团作用使其脱水逐渐聚集。尿素与PDMAEMA直接相互作用可能既包含氢键也包含与疏水基团的分子间作用。另外,从分析水的角度出发可以直接观察到水团簇的变化,为理解尿素改变聚合物相变行为的机理提供了更为直观的证据。

关键词：近红外光谱温度效应高维主成分分析温敏型智能高分子

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基于经验模态分解的权重多尺度支持向量回归用于调和油定量分析

基于经验模态分解的权重多尺度支持向量回归用于调和油定量分析

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2019中国化学会第十五届全国计算（机）化学学术会议

作者：武新燕卞希慧林恩宋健谭小耀天津工业大学省部共建分离膜与膜过程国家重点实验室化学与化工学院

食用调和油因含有多种植物油的营养成分而广受消费者青睐。但是,由于食用油组成复杂,使得定量分析调和油中各组分油的含量困难[1]。紫外可见光谱分析是一种经济、简单的光谱分析技术,但使用该技术分析食用油成分时往往采用溶剂稀释的办... 详细信息

食用调和油因含有多种植物油的营养成分而广受消费者青睐。但是,由于食用油组成复杂,使得定量分析调和油中各组分油的含量困难[1]。紫外可见光谱分析是一种经济、简单的光谱分析技术,但使用该技术分析食用油成分时往往采用溶剂稀释的办法,不仅污染样品,而且大大降低了分析速度。本研究尝试采用紫外可见光谱直接扫描调和油光谱,再结合多元校正技术探讨调和油定量分析的可行性。支持向量回归(SVR)作为一种常用的多元校正方法,泛化能力强,在处理小样本和高维非线性问题具有明显优势[2]。然而复杂样品的光谱信号是多组分信号的叠加,如果将原始光谱进行分解,建模再预测,可能会得到更好的预测结果。为充分利用蕴藏在光谱中的信息,本研究引入经验模态分解(EMD)[3]方法,提出了一种基于经验模态分解的权重多尺度支持向量回归建模方法,并用于二元和三元调和油的定量分析。该方法首先将训练集和预测集的光谱分别采用EMD分解为一定数量的本征模函数(IMF)以及一个残余项r,然后对所得到的IMF分量及其残余项r分别构建预SVR模型,通过加权平均方法将多个预测结果集成得到最终预测结果,具体过程如图1所示。其中模型权重为交叉验证均方根误差4次方的倒数。结果表明,通过调整EMD的分解次数,EMD-SVR方法可以得到优于SVR及PLS方法的预测效果。

关键词：经验模态分解集成建模定量分析食用油紫外可见光谱

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氮化硼纳米片层的脱盐性能分子模拟研究

氮化硼纳米片层的脱盐性能分子模拟研究

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2019中国化学会第十五届全国计算（机）化学学术会议

作者：张静陈晨张丽浙江理工大学化学系

海水淡化是解决淡水资源短缺问题的有效途径之一。常用的反渗透膜虽有制造成本低、能耗低的优点,但亦存在易污染、易氧化、易磨损等缺点[1],因此研发具有高通量高截留的新材料已成为膜技术发展的重要趋势。氮化硼因具有无毒、抗氧化、... 详细信息

海水淡化是解决淡水资源短缺问题的有效途径之一。常用的反渗透膜虽有制造成本低、能耗低的优点,但亦存在易污染、易氧化、易磨损等缺点[1],因此研发具有高通量高截留的新材料已成为膜技术发展的重要趋势。氮化硼因具有无毒、抗氧化、耐酸耐碱等优点而被广泛研究。2019年,Zhang等人[2]采用分子动力学模拟的方法研究了经-COO--COOH–NH2–NH3+四种官能团修饰后BNNT（8,8）的脱盐性能。目前对二维纳米氮化硼膜在海水淡化领域方面的应用研究较缺乏。本工作首先构建了层层堆叠的氮化硼纳米片的脱盐模型,通过分子动力学模拟探讨了压力、层间距、功能化修饰（-COOH和-NH2）对氮化硼（BN）纳米片脱盐性能的影响。研究结果表明水分子通过经官能团修饰后的层层堆叠的氮化硼体系,水通量明显下降,截留率上升,这是因为水分子及离子经-COOH和-NH2修饰BN纳米片的空间位阻增加且降低BN片层之间有效层间距。此外对于所有BN体系,水通量均随BN纳米片层间距的增加呈先下降后上升的趋势,且体系层间距为1.1nm时水通量最低（Fig1.a）。这是因为当体系层间距为1.1nm时水分子间形成的氢键个数最多（Fig1.b）、氢键寿命最长,离子在水分子链之间来回穿梭（Fig1.c）,从而破坏水分子链间的氢键网络;另外水分子穿过1.1nm的层间距BN纳米膜体系时,水分子之间摩擦力最大,从而导致水分子在该体系中的通量最低。本文主要揭示了层间距、官能团等因素对二维纳米氮化硼膜脱盐的影响,为实验上膜的制备提供一定的理论指导和借鉴意义。

关键词：分子动力学模拟氮化硼纳米片层间距氨基羧基

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基于化学信息学的智能化现场激光诱导击穿光谱理论与方法集成

基于化学信息学的智能化现场激光诱导击穿光谱理论与方法集成

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2019中国化学会第十五届全国计算（机）化学学术会议

作者：李华张天龙汤宏胜闫春华阮方琦陈婷婷西北大学化学与材料科学学院西安石油大学化学化工学院

本研究从智能化现场激光诱导击穿光谱(Laser induced breakdown spectroscopy, LIBS)分析的化学信息学理论和方法的实际需要出发,开展了现场LIBS分析检测新理论和新方法的研究。在传统偏最小二乘法、支持向量机以及人工神经网络等化学... 详细信息

本研究从智能化现场激光诱导击穿光谱(Laser induced breakdown spectroscopy, LIBS)分析的化学信息学理论和方法的实际需要出发,开展了现场LIBS分析检测新理论和新方法的研究。在传统偏最小二乘法、支持向量机以及人工神经网络等化学信息学方法的基础上,发展了小波神经网络、最小二乘支持向量机、随机森林、N最近邻法、极限学习机等一系列机器学习算法,重点研究了混合变量选择策略的预测能力提升策略,建立了系列性能优良且易于实现的现场LIBS分析智能化测量方法和技术;以无需标样的自由定标法为基础,提出了基于内参考线的自吸收效应校正方法,并通过引入一个标样借助全局优化算法实现了等离子体温度的准确求解,一定程度上实现了少标样或无标样的定量分析;在此基础上,将所发展现场LIBS分析的化学信息学方法进行功能化和模块化集成,并建立了LIBS分析的基本型和专属型数据库,研发了集数据预处理、定性分析、定量分析与数据库等为一体的LIBS测量学方法和软件系统,同时开发了冶金和地质专属型LIBS分析软件,具有较好的安全性和兼容性。上述开发的分析软件已经成功应用于科技部重大仪器设备专项的十余种台式机、便携式和手持式样机的LIBS分析测量,操作简便,运行稳定,得到了用户的好评。本研究以多元校正和多元分辨方法为核心,融合其它必需的化学信息学策略,进一步提高了LIBS现场测量及分析应用中的可行性与可靠性,为开发具有自主知识产权的LIBS在线分析仪器提供了理论基础与技术保障。

关键词：激光诱导击穿光谱化学信息学智能化分析现场分析

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功能性含能离子化合物高通量筛选

功能性含能离子化合物高通量筛选

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2019中国化学会第十五届全国计算（机）化学学术会议

作者：夏冬辉郝亮刘洋魏佳李华陕西理工大学化学与环境科学学院陕西省催化基础与应用重点实验室陕西理工大学数学与计算机科学学院西北大学化学与材料科学学院西安石油大学化学化工学院

绿色高能低感的高能量密度材料一直是含能材料领域的研究热点之一。21世纪以来,含能离子化合物以其独特且优越的物性性质而备受关注,并逐渐成为一种新型含能材料体系,在推进剂、炸药、含能杀菌剂等领域具有良好的应用前景。通过调控含... 详细信息

绿色高能低感的高能量密度材料一直是含能材料领域的研究热点之一。21世纪以来,含能离子化合物以其独特且优越的物性性质而备受关注,并逐渐成为一种新型含能材料体系,在推进剂、炸药、含能杀菌剂等领域具有良好的应用前景。通过调控含能离子化合物阴阳离子结构及组合,可得到数量庞大的候选物,同时含能离子化合物的合成和性能测试危险性高、周期长、成本高,因此计算机辅助分子设计方法是功能性含能离子化合物设计和发现的重要手段。我们在功能性含能离子化合物高通量筛选方面开展了以下工作:(1)建立了含能离子化合物基础数据库,包括分子结构、晶体结构、物质性质、合成路线、标准生成焓等实验数据和热力学参数量化计算数据;(2)开发了基于密度泛函(DFT)和体积热力学(VBT)方法的含能离子化合物爆轰性能预估程序,关键之处是实现了自动批量化等键反应设计,优化了基于密度泛函的密度估计方程,提高了密度估计的准确性,实现了基于DFT和VBT的含能离子化合物的高通量虚拟筛选;(3)开发了基于定量结构性能关系(QSPR)的含能离子化合物物性预估程序,通过集成各种机器学习方法,发展了含能离子化合物的密度、临界温度、感度、爆轰性能、点火延迟时间、杀菌活性等性能的QSPR模型,并开发了结构生成器,实现了基于QSPR的含能离子化合物的高通量虚拟筛选。目前我们正在进行基于机器学习的含能离子化合物合成路线设计工作,以期实现功能性含能离子化合物高通量筛选方法和平台。

关键词：含能离子化合物高通量虚拟筛选机器学习

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