检索结果-内蒙古大学图书馆

中国水稻科学 2025年第1期39卷 67-81页

作者：梁楚炎曾维王洁冰叶靖巫明明翟荣荣张小明张恒木叶胜海中国计量大学生命科学学院杭州310018 浙江省农业科学院作物与核技术利用研究所杭州310021 浙江省农业科学院病毒学与生物技术研究所杭州310021

【目的】探明浙粳99优良穂型的形成机制,为水稻穗型发育机制研究及其育种应用提供科学依据。【方法】利用EMS诱变浙粳99获得短穗小粒突变体,借助分子标记获得连锁区间,采用RNA-Seq及DNA测序确定候选基因,并利用激光共聚焦显微镜观察突... 详细信息

【目的】探明浙粳99优良穂型的形成机制,为水稻穗型发育机制研究及其育种应用提供科学依据。【方法】利用EMS诱变浙粳99获得短穗小粒突变体,借助分子标记获得连锁区间,采用RNA-Seq及DNA测序确定候选基因,并利用激光共聚焦显微镜观察突变基因的亚细胞定位。使用转录组测序的方法对该突变体的基因表达情况进行分析。【结果】Ossp3与浙粳99在株型、穗型以及粒型上均存在差异。该突变表型由候选基因Os02g0450000发生碱基插入引起。亚细胞定位结果显示该基因产物定位于细胞核。Ossp3幼穗出现329个差异表达基因(DEG),主要分布在1、3和4号染色体上,KEGG富集分析显示,这些差异表达基因主要集中在植物激素信号转导途径、MARK信号通路-植物等生物学过程。相关基因表达分析显示进化上保守的植物特异性基因OsSP3通过MAPK信号通路或与bZIP转录因子作用影响生长素、细胞分裂素含量及其对应信号途径,实现对稻穗发育的调控。【结论】优良穗型品种浙粳99 Os02g0450000基因突变会产生短穗小粒的表型,其生物学功能通过核定位实现,RNA-Seq分析表明该突变基因可能通过影响生长素与细胞分裂素信号通路协同调控稻穗的生长发育,同时很可能通过与OsbZIP47直接或间接作用调控粒型。

关键词：短穗小粒表型鉴定 RNA-Seq 转录组分析

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

水稻黑条矮缩病毒分子生物学

水稻黑条矮缩病毒分子生物学

引用

作者：张恒木浙江大学

学位级别：博士

以浙江省的水稻黑条矮缩病、河北省的小麦绿矮病和湖北省的玉米粗缩病的病毒分离物为材料，对我国3个病毒分离物进行了系列比较研究。3个病毒分离物粒子大小形态相似，且在血清学上密切相关;三者的介体、寄主相同，并引起相同的症状... 详细信息

以浙江省的水稻黑条矮缩病、河北省的小麦绿矮病和湖北省的玉米粗缩病的病毒分离物为材料，对我国3个病毒分离物进行了系列比较研究。3个病毒分离物粒子大小形态相似，且在血清学上密切相关;三者的介体、寄主相同，并引起相同的症状。提纯3个病毒分离物的基因组片段，凝胶电泳显示它们相应的基因组片段之间大小极其相似，推测3个病毒分离物可能是同一种病毒。然后根据水稻黑条矮缩病毒（rice black-streaked dwarf virus，RBSDV）日本分离物的S10设计一对引物，利用RT-PCR技术，以3个中国分离物基因组片段S10 为模板，均特异扩增到预期大小的片段。克隆3个中国分离物基因组片段S10 并测定其全序列，比较分析发现：3个中国分离物基因组片段S10相应部分之间的核苷酸同源性为97.9％～98.9％，和日本RBSDV分离物基因组片段S10的相应部分核苷酸同源性为92.8％～93.1％，和意大利的玉米粗缩病毒（maize rough dwarf virus，MRDV）基因组片段S10相应部分的核苷酸同源性分别为 87.6％～88.3％，因此，3个中国分离物都应该是RBSDV，而不是MRDV;也就是说中国不同地区发生的水稻黑条矮缩病、玉米粗缩病和小麦绿矮病都是由 RBSDV引起的。紧接着在克隆基因组片段S10中间部分序列的基础上，采取了一种基于 RT-PCR技术的简便方法克隆了河北分离物基因组片段S7～S10、浙江分离物的 S7～S10以及湖北分离物的S9～S10，并测定了它们的全序列，EMBL/DDBJ /GenBank数据库的登录号分别为AJ297427（RBSDV-Zj S7）、AJ297431 （RBSDV-Zj S8）、AJ297430（RBSDV-Zj S9）、AJ297433（RBSDV-Zj S10）、 AJ297428（RBSDV-Heb S7）、AJ297432（RBSDV-Heb S8）、AJ297429 （RBSDV-Heb S9）、AJ297434（RBSDV-Heb S10）、AJ291706（RBSDV-Hub S9）、AJ291707（RBSDV-Hub S10）。3个中国RBSDV之间的同源性最高（核苷酸同源性94.0％～99.0％，氨基酸同源性96.3％～100％），与RBSDV-Jap的同源性次之（核苷酸同源性90.0％～94.9％，氨基酸同源性91.1％～98.6％），与意大利 MRDV的同源性较低（核苷酸同源性85.1％～88.1％，氨基酸同源性 85.5％～94.3％）。进一步明确了在中国发生的小麦绿矮病、玉米粗缩病、水稻黑浙江大学博士论文条矮缩病都是由RBSDV引起的。序列比较发现各个RBSDV分离物及意大利＊p V之间的核皆酸变异主要是同类碱基的转换，即OA或CT：而且大多数变异发生在密码子的第三位碱基上，不引起蛋白质水平上的变化。在氨基酸水平上，也多是同类氨基酸的替代，仅有RBSDV·Heb S7 ORFI的。161处存在一个＊缺失。3个中国分离物的S7－S10的GC含量、编码区和非编码区的长度、末端保守序列。基因组片段特异性倒转重复序列等基因组组织结构上与 RB＊＊（挪、意大利＊RD V基本一致;进一步以幻－810编码的相应蛋白质作进化树分析表明 A4mV和 RBSDV应该属于同一种病毒，而且几种 nSDV分离物和意大利MRDV所在的组中，可形成3簇，其中RBSDV中国分离物、 RB SDVJap和M ppV各形成一簇，暗示了h SDV中国分离物、g sDV刁叩。 MapV虽然有着共同的起源，但在后来的进化中可能是相互独立进行的。然后以浙江省水稻黑条矮缩病毒分离物为材料在克隆 S7术的基础上，又探索了一套简单有效的研究水稻黑条矮缩病毒未知的基因组片段的方法，首次克隆了sSDV基因组片段引－S6，并测定了全序列。这是国际上首次报道的侵染植物的斐济病毒（Fjiviruses）全基因组序列。结果表明：RBSDV基因组共29 141血组成，是至今所报道的呼肠孤病毒科中最大的基因组，至少含有13 个开放阅读框bpen reading frame，O肪人序列分析表明基因组片段S！长4501 nt，仅一个开放阅读框，编码的蛋白质具有KNA聚合酶的特征性结构域，暗示了它是RBSDV核心粒于的一种次要蛋白，即 RNA依赖性 NA聚合酶（NA depende川 NA polymerase，Rd即），与其它呼肠孤病毒的 Rd帅相比，尽管同源性很低，但在 RdRp的几个保守区域则是非常保守的;基因组片段 SZ和 S3编码的蛋白分别与FDV（竹广砌e。evipw人NL

关键词：水稻黑条矮缩病毒,玉米粗缩病毒,基因组片段,序列分析,同源性

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

水稻黑条矮缩病毒基因组片段S9的cDNA克隆和全序列分析

引用

Acta Biochimica et Biophysica Sinica 2001年第4期33卷 467-471页

作者：张恒木陈剑平程晔雷娟利薛庆中浙江大学农业与生物技术学院!杭州310029 浙江大学农业与生物技术学院浙江省农业科学院病毒学实验室!杭州310021 杭州310029

应用RT PCR技术克隆了 3个中国水稻黑条矮缩病毒 (riceblack streakeddwarfvirus,RBSDV)分离株基因组片段S9,并测定了它们的全序列。结果表明 :RBSDV浙江分离株 (RBSDV Zj)基因组片段S9全长 190 0nt(EMBL登录号为AJ2 97430 ) ,RBSDV河... 详细信息

应用RT PCR技术克隆了 3个中国水稻黑条矮缩病毒 (riceblack streakeddwarfvirus,RBSDV)分离株基因组片段S9,并测定了它们的全序列。结果表明 :RBSDV浙江分离株 (RBSDV Zj)基因组片段S9全长 190 0nt(EMBL登录号为AJ2 97430 ) ,RBSDV河北分离株 (RBSDV Heb)基因组片段S9全长 1898nt(EMBL登录号为AJ2 9742 9) ,湖北分离株S9全长 190 0nt(EMBL登录号为AJ2 9170 6 )。 3个分离株S9均含有两个开放阅读框(ORF) ,分别编码约 40kD和 2 4kD的多肽。3个中国分离株之间的核苷酸同源性高达 98.5 %～ 98.8% ,与日本分离株S9的核苷酸同源性均为 89.9%～ 90 .2 % ,而与意大利MRDVS8同源性仅为 85 .3%～ 86 .4%。我们发现ORF2十分保守 ,4个RBSDV分离株S9的ORF2同源性高达为 97.6 %～ 10 0 % ,与意大利MRDVS8的ORF2同源性也高达 94.3%。

关键词：水稻黑条矮缩病毒基因组片段S9 序列分析

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

棉纤维细胞发育过程中纤维素的生物合成

引用

棉花学报 2003年第3期15卷 174-179页

作者：武耀廷张恒木刘进元清华大学生物科学与技术系北京100084

棉纤维是由胚珠外珠被表皮细胞在受精前后经分化突起、伸长和细胞壁增厚而形成。棉花纤维单细胞发育同步性和次生壁形成期纤维素大量合成的特点已成为研究纤维素生物合成和细胞发育分子机制的模式植物之一。棉纤维中次生壁纤维素发育的... 详细信息

棉纤维是由胚珠外珠被表皮细胞在受精前后经分化突起、伸长和细胞壁增厚而形成。棉花纤维单细胞发育同步性和次生壁形成期纤维素大量合成的特点已成为研究纤维素生物合成和细胞发育分子机制的模式植物之一。棉纤维中次生壁纤维素发育的时间、合成的速率和沉淀的类型极大地影响着棉花纤维长度和纤维强度,阐明棉纤维细胞纤维素生物合成的机制,将有助于推动棉纤维产量与品质改良的分子工程。本文主要介绍了棉纤维不同发育阶段纤维素合成的特点,纤维素合成的场所、底物,碳代谢模型,基因表达与调控的研究进展。

关键词：棉纤维细胞发育纤维素生物合成发育阶段基因表达底物碳代谢模型

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

蜘蛛牵引丝蛋白的特性及其分子工程

引用

自然科学进展 2005年第6期15卷 641-647页

作者：张恒木刘进元清华大学生物科学与技术系分子生物学实验室及教育部蛋白质科学重点实验室北京100084

蜘蛛牵引丝是由蜘蛛主壶腹腺产生的一种具有高度重复结构的蛋白质纤维,它将高抗张强度和高弹性奇妙地结合于一体,是自然界强度最高的纤维.基因解析揭示出牵引丝至少存在两种高度重复的蛋白组分,每种蛋白的重复单元都显示出富丙氨酸区和... 详细信息

蜘蛛牵引丝是由蜘蛛主壶腹腺产生的一种具有高度重复结构的蛋白质纤维,它将高抗张强度和高弹性奇妙地结合于一体,是自然界强度最高的纤维.基因解析揭示出牵引丝至少存在两种高度重复的蛋白组分,每种蛋白的重复单元都显示出富丙氨酸区和富甘氨酸区交替的模块结构特征,采用分子工程技术不仅可以生产出具有天然牵引丝蛋白特性的重组蜘蛛丝蛋白,也可为研究牵引丝蛋白的模块结构与功能特性之间的关系开辟道路,文中结合我们的研究综述了牵引丝蛋白的模块结构及其分子工程的研究进展,并就其未来发展进行展望,

关键词：分子工程模块结构蛋白质纤维蜘蛛丝蛋白牵引丝重复结构抗张强度蛋白组分蛋白特性工程技术结构特征研究进展研究综述功能特性高弹性自然界甘氨酸丙氨酸高度

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

水稻黑条矮缩病毒基因组片段S7的cDNA克隆及全序列分析

引用

微生物学报 2002年第2期42卷 200-207页

作者：张恒木陈剑平雷娟利程晔薛庆中浙江省农业科学院病毒学实验室杭州310021 浙江大学农业与生物技术学院杭州310029

应用RT PCR技术克隆了 2个水稻黑条矮缩病毒 (riceblack streakeddwarfvirus,RBS DV)中国分离物 ,即浙江分离物和河北分离物的基因组片段S7,并测定了他们的全序列。结果表明 :RBSDV浙江分离物 (RBSDV Zj)基因组片段S7全长 2 1 93nts(EMB... 详细信息

应用RT PCR技术克隆了 2个水稻黑条矮缩病毒 (riceblack streakeddwarfvirus,RBS DV)中国分离物 ,即浙江分离物和河北分离物的基因组片段S7,并测定了他们的全序列。结果表明 :RBSDV浙江分离物 (RBSDV Zj)基因组片段S7全长 2 1 93nts(EMBL登录号为AJ2 9742 7) ,RBSDV河北分离物基因组片段S7全长 2 1 90nts(EMBL登录号为AJ2 9742 8) ,二者均含有两个开放阅读框 (openreadingframe,ORF) ,分别编码约 41kD和 3 6kD多肽 ,2个中国分离物核苷酸同源性高达 99% ,相应的ORF编码的多肽同源性分别为 1 0 0 %和 94 4% ,与日本RBSDV基因组片段S7核苷酸同源性为 93 4%和 93 8% ,相应ORF编码的多肽同源性分别为98 1 % (ORF1 )、96 5 %和 97 8% (ORF2 ) ,与意大利MRDVS6核苷酸同源性为 85 1 %和85 3 % ,相应多肽同源性分别为 92 3 % (ORF1 )、85 5 %和 86 8% (ORF2 )。

关键词：水稻黑条矮缩病毒基因组片段S7 序列分析 cDNA克隆

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

一个水稻小热休克蛋白基因的克隆和鉴定

引用

中国水稻科学 2016年第6期30卷 587-592页

作者：项聪英蔡年俊李静羊健陈剑平张恒木浙江师范大学化学与生命科学学院浙江金华321004 浙江省农业科学院病毒学与生物技术研究所杭州310021

小分子热休克蛋白(SHSP)广泛存在于各类生物体中且在生物发育和逆境响应过程中发挥重要作用。我们克隆了一个水稻小热休克蛋白基因(OsSHSP17.6),序列分析表明该基因编码区为477bp,可编码一个含158个氨基酸的多肽,分子量约17.6kD。序列... 详细信息

小分子热休克蛋白(SHSP)广泛存在于各类生物体中且在生物发育和逆境响应过程中发挥重要作用。我们克隆了一个水稻小热休克蛋白基因(OsSHSP17.6),序列分析表明该基因编码区为477bp,可编码一个含158个氨基酸的多肽,分子量约17.6kD。序列分析显示该类SHSP在不同的植物中是保守的,在分类上隶属于CI类。实时定量RT-PCR分析显示热激处理可显著增强该基因的转录;Western blotting分析显示该蛋白大小与预期一致,且其含量在热激处理时大幅度增加。这些结果一致表明OsSHSP17.6可能参与了水稻热应激反应,这为进一步鉴定OsSHSP17.6的功能提供了基础。

关键词：小热休克蛋白热激处理表达模式

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

白背飞虱酵母双杂交cDNA文库的构建

引用

浙江农业学报 2017年第12期29卷 2060-2067页

作者：薛进李静羊健唐彦梁瑶陈剑平张恒木植物病虫害生物学与防控湖南省重点实验室湖南农业大学植物保护学院病毒研究所湖南长沙410128 浙江省农业科学院病毒学与生物技术研究所浙江杭州310021 湖南农业大学东方科技学院湖南长沙410128

白背飞虱(Sogatella furcifera Horváth)作为一种迁飞性害虫,不仅自身危害水稻,而且以持久性方式传播南方水稻黑条矮缩病毒(Southern rice black-streaked dwarf virus,SRBSDV)。为了研究白背飞虱与SRBSDV之间的相互作用,需要构建... 详细信息

白背飞虱(Sogatella furcifera Horváth)作为一种迁飞性害虫,不仅自身危害水稻,而且以持久性方式传播南方水稻黑条矮缩病毒(Southern rice black-streaked dwarf virus,SRBSDV)。为了研究白背飞虱与SRBSDV之间的相互作用,需要构建一个高质量的酵母筛选文库,试验利用Gateway技术构建了白背飞虱cDNA酵母表达文库,检测分析显示,白背飞虱初级文库库容量约为1.72×10~7CFU,cDNA插入片段主要分布在500~2 000 bp,重组率约为95.8%;次级文库库容量约为1.73×10~7CFU,cDNA插入片段主要分布在400~2 000bp,重组率为100%;Y187酵母菌株的白背飞虱酵母双杂交cDNA文库库容量约5.09×10~7CFU,插入片段大小在750~2 000 bp,重组率100%,再随机挑选36个单克隆进行测序分析,所得结果与Gen Bank数据库比对显示36个克隆中含有22个不同的基因,长度在750~2 000 bp,这些分析表明,该文库可以用于酵母双杂交的后续筛选,为研究白背飞虱与SRBSDV之间的互作奠定了基础。

关键词：白背飞虱南方水稻黑条矮缩病毒(SRBSDV) Gateway技术酵母双杂交 cDNA文库

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

水稻瘤矮病毒P12蛋白抗血清制备及其应用

引用

植物保护学报 2013年第5期40卷 413-417页

作者：孟媛辛星羊健张恒木王建明陈剑平浙江师范大学化学与生命科学学院金华321004 山西农业大学农学院植物病理系太谷030801 浙江省农业科学院病毒学与生物技术研究所浙江省植物有害生物防控国家重点实验室培育基地农业部植物保护与生物技术重点开放实验室浙江省植物病毒重点开放实验室杭州310021

为了进一步研究水稻瘤矮病毒(Rice gall dwarf virus,RGDV)P12的功能,将RGDV-GX P12编码区亚克隆至原核表达载体,并导入大肠杆菌诱导表达;重组的P12融合蛋白经Ni-NTA His·Bind Resins纯化后用于免疫小鼠制备抗血清,并进行Western b... 详细信息

为了进一步研究水稻瘤矮病毒(Rice gall dwarf virus,RGDV)P12的功能,将RGDV-GX P12编码区亚克隆至原核表达载体,并导入大肠杆菌诱导表达;重组的P12融合蛋白经Ni-NTA His·Bind Resins纯化后用于免疫小鼠制备抗血清,并进行Western blotting分析。结果显示,约41 kD大小的RGDV P12融合蛋白可在大肠杆菌中高效表达;利用该重组蛋白所制备的抗血清可特异地与融合表达和非融合的P12蛋白发生强烈的免疫学反应。利用该特异性抗血清在病毒粒子样品中检测不到P12蛋白,而在病株总蛋白样品中可检测到1条与预期大小一致的明显条带,表明RGDV P12是一种非结构蛋白。

关键词：水稻瘤矮病毒 P12 原核表达抗血清

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

水稻黑条矮缩病毒基因组片段S10的cDNA克隆及全序列分析

引用

中国水稻科学 2002年第1期16卷 24-28页

作者：张恒木陈剑平薛庆中雷娟利浙江大学农业与生物技术学院浙江省农业科学院病毒学实验室浙江杭州310021 浙江省农业科学院病毒学实验室

基于 RT- PCR策略克隆了水稻黑条矮缩病毒 (rice black- streaked dwarf virus,RBSDV)浙江分离株基因组 S10 ,并测定了它的全序列。结果表明 ,水稻黑条矮缩病毒浙江分离物 (RBSDV- Zj)基因组片段 S10全长 180 1nt(EMBL登录号为AJ2 97433... 详细信息

基于 RT- PCR策略克隆了水稻黑条矮缩病毒 (rice black- streaked dwarf virus,RBSDV)浙江分离株基因组 S10 ,并测定了它的全序列。结果表明 ,水稻黑条矮缩病毒浙江分离物 (RBSDV- Zj)基因组片段 S10全长 180 1nt(EMBL登录号为AJ2 97433) ,仅含有一个大的开放阅读框 (open reading frame,ORF) ,编码一个 6 3.1k D的多肽 ,与日本的水稻黑条矮缩病毒基因组片段 S10在核苷酸和氨基酸水平上同源性分别为 93.8%和 96 .2 %;与意大利玉米粗缩病毒 (maize rough dwarfvirus,MRDV)的基因组片段 S10在核苷酸和氨基酸水平上的同源性分别为 87.7%和 92 .0 %,推测它们是同一病毒的不同地理小种。

关键词：水稻黑条矮缩病毒基因线片段序列分析 cDNA克隆

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：

通借通还

建议与咨询 留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

请选择保存的检索档案： 新增检索档案 确定 取消

请选择收藏分类： 新增自定义分类 确定 取消

通借通还

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：