目的分析山东省人乳头瘤病毒6型(Human papillomavirus type 6,HPV6)全基因组序列谱系和变异。方法于2019年在山东省3家哨点医院采集尖锐湿疣患者肛门拭子,提取HPV6 DNA进行PCR扩增和测序,对获得的HPV6全基因组序列进行同源性、系统进...
详细信息
目的分析山东省人乳头瘤病毒6型(Human papillomavirus type 6,HPV6)全基因组序列谱系和变异。方法于2019年在山东省3家哨点医院采集尖锐湿疣患者肛门拭子,提取HPV6 DNA进行PCR扩增和测序,对获得的HPV6全基因组序列进行同源性、系统进化和变异分析。结果本研究获得8条HPV6全基因组序列,其中5条属于A谱系,3条属于B1谱系;8条HPV6序列共发生165个核苷酸变异,错义突变率为22.4%(37/165);8条序列的核苷酸同源性为98.48%-99.99%;A谱系和B1谱系的核苷酸变异数分别为109个、56个,错义突变率分别为14.7%(16/109)、37.5%(21/56);两个谱系中E6、E7和E4编码区未发生或极少发生突变。结论山东省尖锐湿疣患者HPV6流行株为A谱系和B1谱系,与全球HPV6流行谱系分布一致;A谱系比B1谱系更保守。
暂无评论