检索结果-内蒙古大学图书馆

清华大学学报（自然科学版） 2001年第9期41卷 111-114页

作者：计宏凯周晴闻芳季梁清华大学自动化系北京100084

为对真核基因的选择性剪接形式进行准确、快速、有效的研究 ,提出了一种启发式多序列比对算法。该算法借助引导树启发序列之间的两两段对段比对 ,通过建立序列相似性估计模型 ,给出了一种由序列间相同词数估计序列相似程度的方法。利用... 详细信息

为对真核基因的选择性剪接形式进行准确、快速、有效的研究 ,提出了一种启发式多序列比对算法。该算法借助引导树启发序列之间的两两段对段比对 ,通过建立序列相似性估计模型 ,给出了一种由序列间相同词数估计序列相似程度的方法。利用这种方法构造引导树 ,大大缩短了其构造时间。通过采用序列间的段对段比对 ,克服了间隙罚分问题 ,更准确地反映了真核基因的选择性剪接形式。引导树构造方法的改进和快速局部比对算法的采用 ,使得算法运行速度大大高于一般算法。

关键词：多序列比对选择性剪接基因算法引导树段对段比对

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基于基因表达调控的进化模型

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清华大学学报（自然科学版） 2002年第1期42卷 135-138页

作者：周晴计宏凯李衍达清华大学自动化系北京100084

为了研究生物进化过程中高级复杂结构的出现和不同复杂程度的各种结构并存的现象 ,建立了一个简单的进化模型。在模型中 ,考虑了基因的表达调控过程 ,借鉴了生命作为复杂系统的自组织现象 ,提出了基因突变产生的系列突变效果。在模仿生... 详细信息

为了研究生物进化过程中高级复杂结构的出现和不同复杂程度的各种结构并存的现象 ,建立了一个简单的进化模型。在模型中 ,考虑了基因的表达调控过程 ,借鉴了生命作为复杂系统的自组织现象 ,提出了基因突变产生的系列突变效果。在模仿生物的进化的实验过程中 ,出现了由简单结构向复杂结构进化的趋势。对这一过程进行了理论分析 ,将模型推广到多个物种的情况 ,并结合生物学中的现象 ,得出了结论 :生物演化过程中 ,同时存在进化与退化的趋势 ;高级复杂结构的出现是在一定的外界环境下。

关键词：进化模型自组织复杂性基因调控基因表达生物进化过程调控规律

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基于群体比较的选择性剪接和复杂疾病基因分析

基于群体比较的选择性剪接和复杂疾病基因分析

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作者：计宏凯清华大学

学位级别：硕士

基因的信息传递和功能实现是一个精巧而有序的过程,选择性剪接和复杂疾病是这个过程中两个重要的生命现象,对它们的研究将极大地增进我们对基因调控、基因网络乃至生命本质的认识.为了给选择性剪接和复杂疾病提供有效的基因分析手段,该... 详细信息

基因的信息传递和功能实现是一个精巧而有序的过程,选择性剪接和复杂疾病是这个过程中两个重要的生命现象,对它们的研究将极大地增进我们对基因调控、基因网络乃至生命本质的认识.为了给选择性剪接和复杂疾病提供有效的基因分析手段,该文以群体比较方法为基础,提出了基因选择性剪接模式快速提取算法和复杂疾病基因联合作用分析方法.在词向量分析的基础上,该文首先提出了核酸序列相似性估计模型.该模型给出了一种不基于序列比对的序列相似性比较策略,它无需计算序列的相似形式就能得到序列的相似程度,从而大大提高了序列相似程度比较的效率.利用线性规划,该文进一步将该模型推广到了序列相似性比较的一般情况,从理论上建立了基于词向量的序列分析方法和基于比对的序列分析方法之间的联系.在群体基因型比较的基础上,该文探讨了复杂疾病基因的联合作用分析问题,初步建立了考虑多个基因综合致病效果的复杂疾病有效基因组合提取和分析方法.利用该方法,该文对一个复杂疾病实例进行了分析.通过对疾病实例的分析,该文说明了复杂疾病中异质同症现象的普遍性和复杂疾病亚型分类的必要性,并对复杂疾病基因联合作用的分析策略进行了探讨.最后,该文总结了基于序列群体比较的选择性剪接模式提取算法和基于群体基因型比较的复杂疾病基因联合作用分析方法的特点,并指出相似性比较与差异比较的辩证统一、快速性与实用性的统一、部分与整体的统一是生物信息学中群体比较方法的关键.

关键词：基因分析群体比较选择性剪接复杂疾病生物信息学

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两种肝细胞特异转录因子的生物信息学分析

两种肝细胞特异转录因子的生物信息学分析

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第九次全国生物物理大会学术会议

作者：孙应飞樊晓丹胡驰峰计宏凯李岭李衍达清华大学自动化系信息处理研究所清华大学自动化系信息处理研究所清华大学自动化系信息处理研究所清华大学自动化系信息处理研究所清华大学自动化系信息处理研究所清华大学自动化系信息处理研究所

乙型肝炎病毒(HBV)是一种严重危害人类健康的嗜肝性DNA病毒,根据测定的HBV基因组序列分析,HBV(ENⅡ)是病毒基因组中重要的功能元件,它对HBV肝细胞特异的基因表达起着重要的调控作用。近几年来,多种对ENⅡ功能起调控作用的肝细胞特异转... 详细信息

乙型肝炎病毒(HBV)是一种严重危害人类健康的嗜肝性DNA病毒,根据测定的HBV基因组序列分析,HBV(ENⅡ)是病毒基因组中重要的功能元件,它对HBV肝细胞特异的基因表达起着重要的调控作用。近几年来,多种对ENⅡ功能起调控作用的肝细胞特异转录因子相继被鉴定,它们包括HNF1、HNF3、HNF4和hb1f等。其中人核受体NR5A2(hb1f)全基因组序列的测定和对其结构的深入分析,对研究揭示此类转录因子的表达规律和生理功能具有重要意义。

关键词：肝细胞特异转录因子二级结构预测生物信息学分析

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偏执型精神分裂症易感基因组合的研究－复杂疾病研究策略的探索

偏执型精神分裂症易感基因组合的研究－复杂疾病研究策略的探索

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作者：沈岩计宏凯原岩波于雅琴许琪孙向青沈渔邨鞠桂芝中国医学科学院基础医学研究所

2001年1月1日-2005年2月28日,由国家科技攻关计划、国家“863”高新技术发展规划和国家重点基础研究发展规划“973”等项目资助,进行了研究。精神分裂症是最常见的精神疾患之一,也是一个由多个微效基因共同决定的复杂疾病,其遗传度高达8... 详细信息

标准号: 0602150039

2001年1月1日-2005年2月28日,由国家科技攻关计划、国家“863”高新技术发展规划和国家重点基础研究发展规划“973”等项目资助,进行了研究。精神分裂症是最常见的精神疾患之一,也是一个由多个微效基因共同决定的复杂疾病,其遗传度高达80%,环境因素在发病过程中的影响相对较小,因此一直被认为是研究复杂疾病遗传因素的理想模型。多年来,通过传统的全基因组扫描和候选基因策略,有关精神分裂症易感基因方面的研究积累了大量资料,但因其临床分型复杂,不同类型患者的遗传学数据会互相干扰,同时,该症也是一种异质性很高的疾病,同一种表型可能是不同基因发生的变异,容易导致假阴性的结果。一、结果：临床医学、分子遗传学和信息科学等结合,通过跨学科交叉合作,以偏执型精神分裂症为模板,提出一种研究复杂疾病易感基因的策略。在83例散发偏执型精神分裂症患者和108例对照中,筛检了多巴胺代谢通路上23个代谢酶基因的85个单核苷酸多态性(SNPs),所得SNPs数据均分别经过传统的单基因分析方法和自建的多基因联合作用分析方法的处理,所得的阳性基因型组合,还在95个偏执型精神分裂症的核心家系中进行了重复验证,最终发现儿茶酚-O-甲基转移酶(COMT)和醛脱氢酶3B1(ALDH3B1)基因的联合作用,是中国北方汉族人群中偏执型精神分裂症发病的主要遗传因素。该项工作的主要特点是：严格采集临床样本、应用基于通路的大规模SNP系统筛查、开发了多基因联合作用分析的计算方法,并在不同类型阳性患者群中进行验证。二、推广应用：论文摘要在网上公布后,美国、欧洲的专家,来到课题组,探讨开展相关合作研究事宜。《Molecular Psychiatry》杂志认为该研究策略将对今后复杂疾病的研究起重要的推动作用。还有认为该研究“通过提出一种全新解读基因联合作用的方法,来解决复杂疾病的遗传复杂型”。论文参加国际、国内的学术大会5次,各种学术交流14次,为复杂疾病易感基因的研究提供了系统的研究策略和方法,对于开发偏执型精神分裂症的早期诊断、早期干预技术具有重要应用价值,也对今后复杂疾病的研究起到重要的推动作用。2003年12月26日,“用于预测偏执型精神分裂症易感性试剂盒及所用引物”,申请中国发明专利,专利申请号：200310122497.6。2003年6月16日,“精神分裂症易感基因-KPNB3基因及应用”,申请中国发明专利,专利申请号： 031012497.6。2004年9月23日,“一个与精神分裂症密切相关联的易感基因”,申请中国发明专利,专利申请号：200410011137.3。“精神分裂症易感基因UFD1L/CDC45L位点”,申请中国发明专利,专利申请号：200410010790.8。“一个与精神分裂症密切相关联的易感基因”,申请中国发明专利,专利申请号：200410011107.2等共5个发明专利。

关键词：偏执型精神分裂症遗传因素易感基因组合

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生物芯片分析结果判读中存在的若干问题及解决思路

生物芯片分析结果判读中存在的若干问题及解决思路

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第九次全国生物物理大会学术会议

作者：李岭孙向青计宏凯胡驰峰樊晓丹孙应飞李衍达清华大学生物信息研究所清华大学模式识别与人工智能国家重点实验室清华大学生物信息研究所清华大学模式识别与人工智能国家重点实验室清华大学生物信息研究所清华大学模式识别与人工智能国家重点实验室清华大学生物信息研究所清华大学模式识别与人工智能国家重点实验室清华大学生物信息研究所清华大学模式识别与人工智能国家重点实验室清华大学生物信息研究所清华大学模式识别与人工智能国家重点实验室清华大学生物信息研究所清华大学模式识别与人工智能国家重点实验室

＜正＞生物信息学方法已经成为基因表达芯片检测与分析所不可或缺的手段。在对消化道肿瘤的基因表达芯片进行分析的过程中,我们遇到了一些在理论与实际方面或许具有普遍性的问题,总结如下。

关键词：

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用于预测偏执型精神分裂症易感性的试剂盒及所用引物

用于预测偏执型精神分裂症易感性的试剂盒及所用引物

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作者：许琪沈岩计宏凯季梁原岩波沈渔邨 100005北京市东城区东单三条5号

本发明涉及用于预测偏执型精神分裂症易感性的试剂盒及所用引物。更具体地,本发明涉及利用精神分裂症易感基因COMT、ALDH、ADH和MAO的六个单核苷酸多态性(SNP)位点组合,设计的预测偏执型精神分裂症易感性的试剂盒和引物。本发明还涉及C...

标准号: CN1635142

本发明涉及用于预测偏执型精神分裂症易感性的试剂盒及所用引物。更具体地,本发明涉及利用精神分裂症易感基因COMT、ALDH、ADH和MAO的六个单核苷酸多态性(SNP)位点组合,设计的预测偏执型精神分裂症易感性的试剂盒和引物。本发明还涉及COMT、ALDH、ADH和MAO四个基因在制备预测偏执型精神分裂症易感性的诊断剂中的应用。

关键词：

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用于预测偏执型精神分裂症易感性的试剂盒及所用引物

用于预测偏执型精神分裂症易感性的试剂盒及所用引物

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作者：许琪沈岩计宏凯季梁原岩波沈渔邨 100005 北京市东城区东单三条5号

本发明涉及用于预测偏执型精神分裂症易感性的试剂盒及所用引物。更具体地，本发明涉及利用精神分裂症易感基因COMT、ALDH、ADH和MAO的六个单核苷酸多态性(SNP)位点组合，设计的预测偏执型精神分裂症易感性的试剂盒和引物。本发明还涉及... 详细信息

标准号: CN1635142A

本发明涉及用于预测偏执型精神分裂症易感性的试剂盒及所用引物。更具体地，本发明涉及利用精神分裂症易感基因COMT、ALDH、ADH和MAO的六个单核苷酸多态性(SNP)位点组合，设计的预测偏执型精神分裂症易感性的试剂盒和引物。本发明还涉及COMT、ALDH、ADH和MAO四个基因在制备预测偏执型精神分裂症易感性的诊断剂中的应用。

关键词：偏执型精神分裂症感性试剂盒引物精神分裂症单核苷酸多态性基因诊断剂

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多巴胺代谢通路上的SNP型组合与偏执型精神分裂症的系统关联分析——一种研究复杂疾病的新策略

多巴胺代谢通路上的SNP型组合与偏执型精神分裂症的系统关联分析...

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第二届全国分子流行病学学术会议

作者：许琪计宏凯黄颖孙向青季梁李衍达原岩波舒良于欣沈渔邨于雅琴贾彦斌鞠桂芝刘树铮史杰萍张伯玉邹柯陶玉斌王艳萍强伯勤吴冠芸沈岩中国医学科学院中国协和医科大学基础医学研究所医学分子生物学国家重点实验室清华大学生物信息学研究所北京大学精神卫生研究所吉林大学基因组医学研究中心

目的：以偏执型精神分裂症为模板，提出一种研究复杂疾病易感基因的新策略．方法：分析步骤：在80例散发偏执型精神分裂症患者和108例对照中，共筛检了多巴胺代谢通路上的18个代谢酶基因的52个SNPs，所得SNPs数据均分别经过传统的... 详细信息

目的：以偏执型精神分裂症为模板，提出一种研究复杂疾病易感基因的新策略．方法：分析步骤：在80例散发偏执型精神分裂症患者和108例对照中，共筛检了多巴胺代谢通路上的18个代谢酶基因的52个SNPs，所得SNPs数据均分别经过传统的统计学方法和自创的多位点联合作用分析方法(PESCP和PEDE)的处理．验证步骤：对分析步骤中所得到的阳性SNPs位点，在95个偏执型精神分裂症的核心家系中进行了重复筛检，并用上述两种方法对数据进行了再次处理分析．结果：在分析步骤中，共筛检到4个主要与疾病的易感性相关的SNPs型，共涉及7个阳性SNPs位点。在验证步骤中，使用传统统计学分析方法没有检出阳性位点，而使用多位点联合作用分析方法除一种组合外，其余阳性结果均再次被检出，其中COMT和ALDH基因的组合最具显著性。同时我们提出并建立了研究复杂疾病的系统研究策略．结论：对于多基因疾病的易感基因研究，多位点联合作用分析比单位点分析更加灵敏和特异。在不同人群中对结果进行验证，对于复杂疾病的研究是必要的．

关键词：精神分裂症易感基因多巴胺复杂疾病

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一种CJM从业人员风水除尘净化设施

一种CJM从业人员风水除尘净化设施

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作者：范军任宝恒田计宏宋作文王恩王辉凯熊林栗荣洁范伟山田培邱海兵 046031 山西省长治市潞州区故县王庄煤矿掘二二队

本实用新型公开了一种CJM从业人员风水除尘净化设施，主要涉及除尘净化领域。包括底板，所述底板上设有固定框，所述固定框上设有凹字形的风管，所述风管上设有多个出风孔，所述风管上连接有第一阀门，所述第一阀门与气源连接。本实用... 详细信息

标准号: CN212703414U

本实用新型公开了一种CJM从业人员风水除尘净化设施，主要涉及除尘净化领域。包括底板，所述底板上设有固定框，所述固定框上设有凹字形的风管，所述风管上设有多个出风孔，所述风管上连接有第一阀门，所述第一阀门与气源连接。本实用新型的有益效果在于：可以有效降低粉尘携带，防止粉尘二次飞扬，做到了从业人员职业病防治理念，有效解决了上下班途中及更衣厅的环境卫生，为从业人员提供了一个舒畅的上下班及更衣环境。

关键词：风管底板本实用新型除尘净化更衣固定框阀门粉尘职业病防治有效解决凹字形出风孔环境卫生气源携带

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