检索结果-内蒙古大学图书馆

姜曲海猪和苏姜猪IGF2、MUC13、PHKG1、RYR1和VRTN基因主效位点的遗传变异分析

江西农业大学学报 2019年第5期41卷 969-975页

作者：徐盼唐子雪何鑫鑫杨持刘方旭王重张亚琴赵旭庭江苏农牧科技职业学院

IGF2、MUC13、PHKG1、RYR1和VRTN基因是应用于实践生产的影响猪抗病、肉质及生长性能的基因。利用PCR扩增、Sanger测序和RFLP技术在姜曲海猪和苏姜猪核心群中检测了这5个基因的基因型。结果表明:姜曲海猪中的IGF2、VRTN基因和苏姜猪中的... 详细信息

IGF2、MUC13、PHKG1、RYR1和VRTN基因是应用于实践生产的影响猪抗病、肉质及生长性能的基因。利用PCR扩增、Sanger测序和RFLP技术在姜曲海猪和苏姜猪核心群中检测了这5个基因的基因型。结果表明:姜曲海猪中的IGF2、VRTN基因和苏姜猪中的VRTN基因的有利等位基因频率相对较低。RYR1基因的检测结果显示姜曲海猪混有外来血缘,需要进行提纯复壮。通过分子标记辅助选择和常规育种技术,苏姜猪需要经过多世代选育才能将这5个基因的有利等位基因纯合。

关键词： IGF2 MUC13 PHKG1 RYR1 VRTN 猪主效位点

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玉米株高主效位点的精细定位与候选基因挖掘

玉米株高主效位点的精细定位与候选基因挖掘

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作者：贾慧琳中国农业科学院

学位级别：硕士

玉米株高是复杂的数量性状，受多位点调控，与产量密切相关。在前期工作中，利用B73及其导入系1133B（B73为受体，Tzi8为供体的高代回交材料）构建F3:4群体定位到株高主效位点qPEH6.02 ，并借助分子标记追踪获得了主效位点目标区段的近... 详细信息

玉米株高是复杂的数量性状，受多位点调控，与产量密切相关。在前期工作中，利用B73及其导入系1133B（B73为受体，Tzi8为供体的高代回交材料）构建F3:4群体定位到株高主效位点qPEH6.02 ，并借助分子标记追踪获得了主效位点目标区段的近等基因导入系 1133BB73 和1133BTzi8。本研究利用1133BB73和1133BTzi8构建的次级分离群体对qPEH6.02开展了育种应用价值评估、精细定位和候选基因挖掘。另外，利用 B73 与 1133B 分离后代中发现的矮秆材料1133B-dawrf进行了株高主效位点qPEH6.05和qPEH8.06的初步遗传定位、育种价值评估及候选基因的挖掘相关工作。主要研究结果如下：　　1. 在实验室前期定位qPEH6.02基础上，在第6染色体97,811,789-98,783,984大约1 Mb区间内加密标记，对重组家系经过后代测验，将qPEH6.02定位到141 kb区间内。区间内共有3个基因，其中 Zm00001d036692在亲本茎尖之间表达量差异显著，推测该基因是 qPEH6.02控制株高的候选基因。对Zm00001d036692编码区在亲本中进行比对，发现6个氨基酸变异均没有引起蛋白质功能和结构的改变。对Zm00001d036692启动子进行motif分析，发现3个与赤霉素相关的响应元件。对1133BB73和1133BTzi8茎尖进行转录组分析，发现5个生长素相关基因在亲本之间显著差异表达。此外，对苗期进行赤霉素处理，结果发现Zm00001d036692在1133BTzi8中的表达量要显著高于1133BB73。因此，推测Zm00001d036692可能受赤霉素调控，影响生长素相关基因的表达进而影响株高。　　2. 利用B73和1133B-dawrf构建分离群体，在第6染色体130,893,505-161,517,571 Mb和第8染色体153,967,020-162,492,451 Mb区间内分别定位到株高位点qPEH6.05和qPEH8.06。通过对定位区间内加密标记，对重组类型进行后代测验，将qPEH6.05精细定位到501 kb的区间内，将qPEH8.06精细定位到779 kb的区间内。查找定位区间内基因功能及对基因的表达模式进行分析，发现株高主效位点 qPEH6.05 定位区间内的 Zm00001d038282 和 qPEH8.06 定位区间内的Zm00001d011705在茎尖和节间表达量较高。因此，推测Zm00001d038282和Zm00001d011705分别是qPEH6.05和qPEH8.06调控株高的候选基因。　　3. 在不同密度下开展株高主效位点的导入系及不同测交组合（同类群弱优势自交系、不同群强优势自交系）的株高和产量性状鉴定分析，对获得的3个株高位点育种应用价值进行评估。结果发现，qPEH6.02的近等基因导入系1133BTzi8与1133BB73相比，在不同种植密度下的株高增加15.17-20.40 cm，但在其弱优势和强优势杂交组合中株高分别仅增加3.87-5.03 cm和3.23-5.97 cm。同时发现，在不同种植密度下，1133BTzi8与1133BB73相比，小区产量增加10%以上，最高可增产15.00%;在其杂交组合中小区产量提高3%以上，最高可增产8.85%。对于qPEH6.05和qPEH8.06来说，导入qPEH6.05或qPEH8.06的单倍型材料均显著矮于背景为B73的材料。进行产量鉴定，发现导入系1133B-dwarf与B73相比，产量下降2%左右，在弱优势杂交组合中，导入qPEH6.05的单倍型产量下降最显著，降幅达 14%左右。在强优势杂交组合中，与背景 B73 相比，导入qPEH8.06的单倍型产量降幅最大，达 11%左右。综上所述，本研究中 3个株高主效位点为株型改良提供重要信息，为玉米育种利用提供一定的借鉴。

关键词：玉米株高性状主效位点精细定位育种价值评估候选基因挖掘

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青稞分蘖角度的QTL定位

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作物学报 2025年第1期51卷 260-272页

作者：杨景发余鑫莲姚有华姚晓华王蕾吴昆仑李新青海大学农林科学院/青海省作物分子育种重点实验室/青海省青稞遗传育种重点实验室/青藏高原种质资源研究与利用实验室/青海大学省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室青海西宁810016

分蘖角度是青稞株型的主要构成因素,在提高青稞产量与抗倒伏性中发挥着极为重要的作用。为解析青稞分蘖角度的遗传机制,本研究以青稞品种‘达章紫’(株型松散)和‘昆仑10号’(株型紧凑)为亲本构建的RIL群体为材料,基于高密度遗传图谱,... 详细信息

分蘖角度是青稞株型的主要构成因素,在提高青稞产量与抗倒伏性中发挥着极为重要的作用。为解析青稞分蘖角度的遗传机制,本研究以青稞品种‘达章紫’(株型松散)和‘昆仑10号’(株型紧凑)为亲本构建的RIL群体为材料,基于高密度遗传图谱,在多环境中进行青稞分蘖角度的QTL定位,并利用RIL群体衍生的剩余杂合系,对鉴定到的主效QTLqTA7H-1进行精细定位。在青稞7条染色体上共检测到9个控制分蘖角度的QTL,解释表型变异为6.41%~33.57%,其中,qTA3H-1和qTA7H-1为多环境共检测的主效QTL,平均加性效应分别为5.42°(增效)和-3.87°(减效);在减效QTL qTA7H-1初定位区间筛选到4个剩余杂合体,自交衍生F8:9近等基因系,在置信区间内加密设计14对分子标记对RHL群体极端单株进行检测,利用获得的5种交换类型单株,将qTA7H-1进一步界定在PC08(32,252,397)与PA10(41,790,765)约9.54Mb的物理区间内。本研究初步揭示调控青稞分蘖角度的遗传因子,为开展分蘖角度性状的遗传改良与分子设计育种奠定了基础。

关键词：青稞分蘖角度 QTL定位主效位点

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花后冠层温度对小麦产量的影响及几个关联SSR位点的效应分析

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作物学报 2015年第4期41卷 548-556页

作者：张冬玲张洪娜郝晨阳王兰芬李甜张学勇农业部作物基因资源与种质创制重点实验室/中国农业科学院作物科学研究所北京100081

小麦生育期间的冠层温度,尤其是开花以后的冠层温度对植株衰老、粒重和品质等有很大影响。2012—2013和2013—2014年度,在河南新乡利用4个品种的选择导入系群体观测了冬小麦冠层温度与产量间的关系,并通过全基因组SSR标记检测相关主效... 详细信息

小麦生育期间的冠层温度,尤其是开花以后的冠层温度对植株衰老、粒重和品质等有很大影响。2012—2013和2013—2014年度,在河南新乡利用4个品种的选择导入系群体观测了冬小麦冠层温度与产量间的关系,并通过全基因组SSR标记检测相关主效基因位点,以解析其遗传机制。结果表明,冠层温度与千粒重和产量呈显著负相关;与有效穗数呈显著正相关,并随着时间的推移,相关性逐渐增大。在已报道的44个与千粒重或穗粒数相关联的SSR位点中,有9个与冠层温度显著关联,其中在6个位点上检测到优异等位变异,携带优异等位变异材料的冠层温度显著低于携带非优异等位变异材料的冠层温度。影响冠层温度的优异等位变异间存在明显的加性效应,这些位点同时也与千粒重和穗粒数呈现出显著关联。与冠层温度关联的SSR位点均与灌浆中后期旗叶的叶绿素含量相关联。由此表明,在灌浆后期良好的根系功能保证了水分和营养的正常供应,降低了冠层温度,而较低的冠层温度对叶绿素和光合起到了良好的保护作用,从而提高千粒重和增加籽粒产量。

关键词：小麦冠层温度千粒重关联分析选择导入系主效位点

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抗根肿病基因PbBa8.1的精细定位和候选基因克隆

抗根肿病基因PbBa8.1的精细定位和候选基因克隆

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作者：敦必成华中农业大学

学位级别：硕士

根肿病作为一种在全球范围内广泛存在的十字花科专性寄生病害,严重影响了我国与世界油菜产业的安全,选育根肿病抗病品种是目前防控油菜根肿病最有效的手段。实验室前期利用常规感病品种华双5号(Brassica napus,AACC,2n=38)为受体亲本,... 详细信息

根肿病作为一种在全球范围内广泛存在的十字花科专性寄生病害,严重影响了我国与世界油菜产业的安全,选育根肿病抗病品种是目前防控油菜根肿病最有效的手段。实验室前期利用常规感病品种华双5号(Brassica napus,AACC,2n=38)为受体亲本,以含有抗病位点PbBa8.1的欧洲芜菁ECD04(Brassica rapa,AA,2n=20)为供体亲本,通过杂交和多次回交,并结合分子标记辅助选择,在BC3F4代选育出我国首批抗根肿病品种华双5R(HS5R)。经鉴定,该品种对四川、湖北、安徽等地的生理小种具有优异的显性免疫抗性。实验室前期已经将PbBa8.1位点初定位在A08染色体上的1.4 Mb大小范围内,在此区段内发现3个编码NBS-LRR结构蛋白的基因(BraA08t39211E、BraA08t39212E和BraA08t39305E),然后通过同源序列法分离了其中的BraA08t39305E基因,与前人已克隆的CrrIa互为等位基因,并已通过发根农杆菌瞬时表达转化系统验证了其具有抗病功能并命名为PbBa8.1a(未发表)。本研究在此基础上,进一步缩小候选区段,拟通过精细定位旨在进一步确定PbBa8.1a是否为区间内的真正抗病基因。具体获得了如下研究结论:1.抗根肿病位点PbBa8.1的精细定位:利用实验室前期在对PbBa8.1初定位时所采用的BSA测序结果中的InDel结果信息,在区段内设计密集分子标记,并对所有标记进行了电子PCR检测和多态性分析,最终筛选出23对有良好多态性标记。随后利用这些标记结合它们在ECD04染色体上的物理位置,在BC3F4世代群体中进行了交换单株的筛选。从约7600个单株中筛选出34株相应重组交换单株,交换点分别位于A08染色体上14.1-15.3 Mb区间的不同位置。收获这34株重组单株的自交后代后,按株系分别进行室内接菌(枝江生理小种),结合表型和基因型分析最终将抗病基因所在区段缩小到JF18和JF07标记之间约847 kb的区间内。2.通过遗传解析进一步证明PbBa8.1a具较弱抗性:在抗病芜菁ECD04重测序基因组(未发表)中,PbBa8.1a(BraA08t39305E)基因位于A08染色体上11.6-16.6Mb初定位区段内,但并不属于定位的847 kb区段内。但是,本研究发现当BraA08t39211E和BraA08t39212E所在的847kb候选区域为ECD04纯合基因型,PbBa8.1a(BraA 08t39305E)基因所在的15.4-16.6 Mb区域为杂合基因型,将该交换单株自交后代室内高浓度菌接种后,对应PbBa8.1a位点为纯合感病基因型的单株侧根基本都有微小瘤子发生。由此进一步从遗传上证明了 PbBa8.1a对根肿菌具微效抗性,而BraA08t39211E和BraA08t39212E所在的847kb为主要抗病区间,并将之命名为PbBa8.1b。3.候选区段内编码NBS-LRR结构的抗性候选基因分离与生物信息学分析:根据前人克隆的仅有的两个抗根肿病基因的编码蛋白均具有NBS-LRR结构域,因此本研究运用生物信息学技术对这847 kb主效抗病候选区段分析后发现,存在两个该类型基因:BraA08t39211E和BraA08t39212E。在此基础之上,将这两个候选基因克隆,并构建了一系列相关表达载体,为后续阐明基因的抗病功能奠定了重要基础。

关键词：甘蓝型油菜根肿病精细定位 PbBa8.1 NBS-LRR基因主效位点微效位点

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大豆种子大小性状全基因组关联分析及候选基因挖掘

大豆种子大小性状全基因组关联分析及候选基因挖掘

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陕西省植物学会2024年学术研讨会

作者：张普杨植雅贾世豪陈国梁李楠楠曹永策延安大学生命科学学院/陕西省红枣重点实验室

大豆种子大小性状,包括种子的长度(SL)、宽度(SW)和厚度(ST)是影响种子重量、产量及籽粒用途的关键外观参数。这些性状属于典型的数量性状,采用传统的育种方法难以进行改良。但目前大豆种子长度、种子宽度和种子厚度性状的分子机制尚未... 详细信息

大豆种子大小性状,包括种子的长度(SL)、宽度(SW)和厚度(ST)是影响种子重量、产量及籽粒用途的关键外观参数。这些性状属于典型的数量性状,采用传统的育种方法难以进行改良。但目前大豆种子长度、种子宽度和种子厚度性状的分子机制尚未明确,可用于分子育种的重要遗传位点(QTL)和基因也较少。为此,本研究使用281份大豆种质在多个生长环境中对大豆种子长度、宽度和厚度性状进行评估,利用多种全基因组关联分析(GWAS)模型解析这些性状的QTN构成,并结合基因注释信息和表型极端种质的籽粒不同发育时期转录组测序数据进行了候选基因挖掘。结果显示,共有2个、7个和3个控制SL、SW和ST的QTN能够在两种GWAS分析模型和不同环境中同时检测到。这些稳定的QTN位于10个连锁不平衡区块内,单个区块的基因组大小在20～440kb之间,可作为控制大豆种子大小性状的主要位点。进一步结合基因功能注释和转录组测序数据,在主要位点中预测了Glyma.05G038000、Glyma.05G244100、Glyma.05G246900、Glyma.07G070200、Glyma.11G010000、Glyma.11G012400、Glyma.17G165500、Glyma.17G166500和Glyma.20G012600是调控种子大小的候选基因。综上所述,本研究结果为大豆种子大小性状的标记辅助育种和基因功能研究提供了有价值的信息。

关键词：大豆种子大小全基因组关联分析(GWAS) 稳定QTL 主效位点候选基因

来源：评论

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