检索结果-内蒙古大学图书馆

广藿香Trihelix家族PatASIL2基因克隆、亚细胞定位及表达分析

华北农学报 2025年第1期40卷 104-112页

作者：李俊仁陈秀珍吴带娣广州医科大学附属肿瘤医院广东广州510095 仲恺农业工程学院农业与生物学院广东广州510225 广州中医药大学中药学院广东广州510006

为探究广藿香Trihelix家族基因PatASIL2的序列特征、亚细胞定位及表达模式,以广藿香转录组获得的ASIL2基因序列设计特异性引物,以广藿香cDNA为模板,克隆PatASIL2基因,随后对其进行生物信息学分析;构建PatASIL2-EGFP融合蛋白表达载体并... 详细信息

为探究广藿香Trihelix家族基因PatASIL2的序列特征、亚细胞定位及表达模式,以广藿香转录组获得的ASIL2基因序列设计特异性引物,以广藿香cDNA为模板,克隆PatASIL2基因,随后对其进行生物信息学分析;构建PatASIL2-EGFP融合蛋白表达载体并转化拟南芥原生质体,检测PatASIL2的亚细胞定位;利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析PatASIL2基因在广藿香不同组织、外源茉莉酸甲酯(MeJA)喷施及非生物胁迫(盐胁迫、干旱胁迫、冷胁迫)下的表达情况。结果显示,PatASIL2含长度为1 035 bp的开放阅读框,编码344个氨基酸。PatASIL2不具有跨膜结构和信号肽,属于不稳定的亲水蛋白,含有41个丝氨酸磷酸化位点和1个Myb_DNA-bind_4保守结构域。系统进化分析显示,PatASIL2归类到Trihelix转录因子家族的SIP1亚家族,与芝麻SiASIL2同源性较高。亚细胞定位结果表明,PatASIL2为细胞核定位蛋白。qRT-PCR结果表明,PatASIL2在广藿香的嫩叶、成熟叶、老叶、根和茎中都有表达,尤其在老叶中的表达量最高;在MeJA处理后,PatASIL2基因的表达量在12~24 h显著升高;盐胁迫下,PatASIL2基因的表达量在3~24 h显著升高;在干旱胁迫下,PatASIL2基因的表达量在24 h显著升高;在冷胁迫下,PatASIL2基因在12 h表达量显著升高。

关键词：广藿香 Trihelix ASIL2 基因克隆表达模式亚细胞定位

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丹参SmIAA7基因的克隆、亚细胞定位与表达分析

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药学学报 2025年第2期60卷 514-525页

作者：黄钰莹陈颖王宝纬关范圆郑语嫣范菁王金铃胡秀华王晓晖北京中医药大学北京中医药研究院中药现代研究中心北京102488 安徽科技学院生物医学与健康学院安徽滁州233100 北京中医药大学中药学院北京102488 北京中医药大学生命科学学院北京102488

Auxin/indole-3-acetic acid(Aux/IAA)是植物中一个重要的基因家族,在生长素信号传导中扮演着关键的角色,参与了植物的生长、发育以及对逆境胁迫的响应和调节过程。本研究通过分析丹参(Salvia miltiorrhiza)不同羽状复叶的转录组数据筛... 详细信息

Auxin/indole-3-acetic acid(Aux/IAA)是植物中一个重要的基因家族,在生长素信号传导中扮演着关键的角色,参与了植物的生长、发育以及对逆境胁迫的响应和调节过程。本研究通过分析丹参(Salvia miltiorrhiza)不同羽状复叶的转录组数据筛选了潜在的与叶片发育相关的基因SmIAA7,设计特异引物成功从丹参中克隆了SmIAA7,并进行生物信息学分析、原核表达和纯化、亚细胞定位、生长素及非生物胁迫下的诱导表达分析。SmIAA7基因全长684 bp,编码227个氨基酸,蛋白分子质量25.3 kD。保守结构域分析表明SmIAA7含有超家族保守结构域Aux_IAA(pfam02309),序列分析及系统进化树结果表明SmIAA7和其他植物中的IAA7以及IAA14同源性较高,可能参与植物的生长发育并响应逆境胁迫。构建原核表达载体pET28a-SmIAA7并在大肠杆菌Rosetta(DE3)菌株中成功表达SmIAA7重组蛋白,纯化得到可溶性重组蛋白。亚细胞定位实验结果表明SmIAA7定位于植物细胞的细胞核中。实时荧光定量PCR结果表明,SmIAA7基因能够响应生长素的诱导导致表达水平升高。干旱、低温以及盐胁迫均能够显著提高SmIAA7基因的表达水平。本研究为进一步揭示SmIAA7在丹参叶片发育、信号传递及逆境防御中的作用奠定基础。

关键词：丹参 SmIAA7 原核表达亚细胞定位表达分析

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小麦矮腥黑粉菌g6843蛋白生物信息学分析、毒性验证及亚细胞定位

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核农学报 2025年第3期39卷 522-530页

作者：贾玉凤张滨郭笑维马骏豪刘琦高利新疆农业大学农学院/农业农村部西北荒漠绿洲农林外来入侵生物防控重点实验室(部省共建) 新疆乌鲁木齐830052 中国农业科学院植物保护研究所/植物病虫害综合治理全国重点实验室北京100193

引起小麦矮腥黑穗病的病原菌小麦矮腥黑粉菌(Tilletia controversa Kühn)是一类严重危害麦类作物的真菌。为解析小麦矮腥黑粉菌与植物互作机制,本研究基于前期全基因组测序结果,筛选出候选效应蛋白g6843,并运用生物信息学分析预测... 详细信息

引起小麦矮腥黑穗病的病原菌小麦矮腥黑粉菌(Tilletia controversa Kühn)是一类严重危害麦类作物的真菌。为解析小麦矮腥黑粉菌与植物互作机制,本研究基于前期全基因组测序结果,筛选出候选效应蛋白g6843,并运用生物信息学分析预测其生物学功能。通过农杆菌介导的烟草瞬时表达系统和激光共聚焦显微镜技术,对g6843蛋白的毒性和亚细胞定位进行功能验证。生物信息学预测结果表明,g6843基因全长为1413 bp,共编码470个氨基酸,分子量为49626.47 Da,氨基酸等电点为5.58;该蛋白是亲水性蛋白,包含23个信号肽,不存在跨膜结构,在第33~第223个氨基酸之间和第268~第466个氨基酸之间含有α/β水解酶家族蛋白功能域,属于稳定的偏酸性蛋白;其中二级结构的主要构成原件为无规卷曲,其次是α螺旋,三级结构复杂。毒性验证观察到g6843蛋白不能抑制由Bcl-2 associated X protein(BAX)凋亡蛋白引起的烟草叶片坏死。激光共聚焦显微镜观察结果显示g6843蛋白定位于细胞膜和细胞核。本研究结果为进一步研究g6843蛋白在植物与病原体相互作用中的功能提供了重要的理论依据。

关键词：小麦矮腥黑粉菌效应蛋白生物信息学分析毒性验证亚细胞定位

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金线莲ArCRC基因的克隆、亚细胞定位和表达分析

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热带亚热带植物学报 2025年第1期33卷 42-48页

作者：林江波邹晖黄惠明李和平戴艺民福建省农业科学院亚热带农业研究所福建漳州363005

为了解金线莲(Anoectochilus roxburghii) YABBY基因家族的CRABS CLAW(CRC)亚族基因在花和叶片发育中的功能,基于金线莲全长转录组数据RT-PCR克隆ArCRC基因,对其编码蛋白进行生物信息学、原核表达、亚细胞定位分析,采用qP CR技术对基因... 详细信息

为了解金线莲(Anoectochilus roxburghii) YABBY基因家族的CRABS CLAW(CRC)亚族基因在花和叶片发育中的功能,基于金线莲全长转录组数据RT-PCR克隆ArCRC基因,对其编码蛋白进行生物信息学、原核表达、亚细胞定位分析,采用qP CR技术对基因的表达模式进行分析。结果表明,金线莲ArCRC基因CDS长度为576 bp(GenBank登录号:OR394646),编码191个氨基酸,含有YABBY superfamily和HMG-box_SF superfamily保守结构域,分子量为21.514 kD,理论等电点为9.16,不稳定系数41.12,属于不稳定蛋白。系统进化分析表明,ArC RC与水稻(Oryza sativa)的OsD L和拟南芥(Arabidopsis thaliana)的AtCRC聚为一类,属于CRC亚家族,且定位在细胞核。SDS-PAGE电泳和Western blot结果表明,ArCRC基因可在大肠杆菌中成功诱导表达。qR T-PCR分析表明,ArCRC基因在花的表达量最高,其次是叶,且在叶片中脉的表达量显著高于叶片外缘,因此,推测ArCRC基因主要在花器官发育中发挥功能,同时还参与调控叶片中脉的发育。

关键词：金线莲 ArCRC基因转录因子基因克隆亚细胞定位基因表达分析

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玉米黄花叶病毒运动蛋白的特征分析及其在昆虫细胞内的亚细胞定位

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江苏农业学报 2025年第1期41卷 35-40页

作者：郭思思任春梅李硕季英华王海涛程兆榜江苏省农业科学院植物保护研究所/江苏省食品质量安全重点实验室福建农林大学植物保护学院

玉米黄花叶病毒(Maize yellow mosaic virus,MaYMV)是一种具有潜在流行风险的植物病毒,然而目前关于其蛋白质的特征及亚细胞定位情况研究较少。本研究选用2022年采自江苏省的MaYMV作为研究对象,对其运动蛋白(Movement protein,MP)进行分... 详细信息

玉米黄花叶病毒(Maize yellow mosaic virus,MaYMV)是一种具有潜在流行风险的植物病毒,然而目前关于其蛋白质的特征及亚细胞定位情况研究较少。本研究选用2022年采自江苏省的MaYMV作为研究对象,对其运动蛋白(Movement protein,MP)进行分析,结果发现MP为相对分子量21 230的亲水性蛋白质,该蛋白质不含核定位信号、信号肽和跨膜区,二级结构主要呈无规则卷曲形式,且具有Luteo_Vpg功能域。利用Bacmids-MaYMV-MP-His重组穿梭质粒表达系统发现,MP定位于细胞质,进一步通过蛋白质印迹(Western-blot)法验证了MP的表达。该研究探明了MaYMV MP的特征及其亚细胞定位,有望为后续进一步分析MaYMV MP功能及其与介体蚜虫之间的相互作用奠定基础。

关键词：玉米黄花叶病毒运动蛋白亚细胞定位

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秋茄KoNAC25基因的克隆、亚细胞定位及表达分析

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广西植物 2025年

作者：杨党蒋文骏王永峰王建强董超杜照奎台州学院生命科学学院台州学院浙江省植物进化生态学与保护重点实验室台州循环经济发展有限公司浙江省水文地质工程地质大队

NAC转录因子在植物中广泛存在且为植物所特有，在调节植物生长发育、激素信号转导和逆境胁迫响应等方面发挥着重要作用。前期工作中，从红树植物秋茄(Kandelia obovata)基因组中鉴定到一个受低温诱导的NAC基因KoNAC25 (GenBank登录号PP8... 详细信息

NAC转录因子在植物中广泛存在且为植物所特有，在调节植物生长发育、激素信号转导和逆境胁迫响应等方面发挥着重要作用。前期工作中，从红树植物秋茄(Kandelia obovata)基因组中鉴定到一个受低温诱导的NAC基因KoNAC25 (GenBank登录号PP860407)。为探究KoNAC25基因是否参与秋茄盐胁迫响应，该研究通过RT-PCR技术从秋茄叶片cDNA中克隆了KoNAC25基因，并对其进行序列特征、系统进化、亚细胞定位及基因表达分析等。结果表明：（1）秋茄KoNAC25基因的开放阅读框(ORF)全长为858 bp，共编码285个氨基酸，分子量为32.9 k Da，理论等电点为8.53，为亲水性蛋白，不含信号肽且无跨膜结构。（2）序列同源比对显示，KoNAC25蛋白N端具有一个NAM超家族结构域，由五个保守的亚结构域构成，属于NAM亚家族成员。（3）系统进化树表明秋茄KoNAC25转录因子与大戟科的蓖麻(Ricinus communis)、木薯(Manihot esculenta)和橡胶树(Hevea brasiliensis)等植物亲缘关系较近。（4）亚细胞定位试验证实，KoNAC25蛋白定位于细胞核。（5）qRT-PCR分析结果表明，KoNAC25基因在叶中表达量显著高于花中，同时该基因能够被盐(NaCl)和脱落酸(abscisic acid, ABA)诱导表达上调，分别在处理12和6 h时达到峰值。综上所述，KoNAC25参与了秋茄盐胁迫响应的相关调控，该结果为进一步研究秋茄KoNAC25基因在盐胁迫下的功能及其表达调控机理提供了参考。

关键词：秋茄 NAC25基因基因克隆亚细胞定位表达模式

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小麦光腥黑粉菌效应蛋白g2164的生物信息学分析、亚细胞定位及毒性验证

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江苏农业科学 2025年

作者：常璐方正武高利长江大学农学院新疆农业科学院植物保护研究所/农业部西北荒漠绿洲作物有害生物综合治理重点实验室中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害综合治理全国重点实验室

为了初步探究小麦光腥黑粉菌(Tilletia foetida)入侵小麦的侵染机制,从小麦光腥黑粉菌在入侵宿主时所分泌的效应蛋白入手,在小麦光腥黑粉菌的转录组数据测序结果中筛选出了含有特殊结构的效应蛋白g2164。由于病原真菌的效应蛋白随着寄... 详细信息

为了初步探究小麦光腥黑粉菌(Tilletia foetida)入侵小麦的侵染机制,从小麦光腥黑粉菌在入侵宿主时所分泌的效应蛋白入手,在小麦光腥黑粉菌的转录组数据测序结果中筛选出了含有特殊结构的效应蛋白g2164。由于病原真菌的效应蛋白随着寄主的不同,所表现出的基序以及结构域随之不同,具有很强的特异性,因此,为了解小麦光腥黑粉菌基因g2164所编码的效应蛋白的生物学功能,本试验通过聚合酶链式反应技术获得g2164基因cDNA的全长序列,对其进行生物信息学分析解析该蛋白理化性质,通过毒性验证试验验证其蛋白毒性,进行亚细胞定位试验对该基因功能行使区域进行定位分析。生物信息学分析结果显示,g2164基因全长1 365 bp,共编码454个氨基酸,相对分子质量51 964.70,理论等电点为9.22;具有典型的BgIC家族结构域;其蛋白的不稳定系数为33.64,平均亲水性系数为-0.531,是一种亲水性稳定的蛋白;使用重组法,将g2164基因整合到pBin-GFP载体和pGR-107载体上,再将它们转到根癌农杆菌Agrobacterium tumefaciens GV3101中,使用本氏烟草进行亚细胞定位试验,结果显示,g2164在细胞核和细胞膜上定位;毒性验证试验表明,该基因不具备抑制细胞坏死的活性。

关键词：小麦光腥黑粉菌 g2164 生物信息学分析亚细胞定位毒性验证

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马铃薯StSTOP1基因的克隆、亚细胞定位及基因家族成员鉴定

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种子 2025年第03期 1-9+16页

作者：黄美菁吕春娜康嘉慧周一帆赵酏浛王芳青海大学农林科学院青海省农林科学院青藏高原种质资源研究与利用实验室青海省农林科学院青海省马铃薯育种重点实验室青海大学青藏高原生物技术教育部重点实验室

为了探究StSTOP基因家族成员在马铃薯中的作用，对其进行生物信息学分析以及亚细胞定位检测。结果显示，筛选到的36个StSTOP基因家族成员在11条染色体上均有分布，蛋白长度在143～736个氨基酸之间，蛋白质分子量为16 451.97～75 366.80 ... 详细信息

为了探究StSTOP基因家族成员在马铃薯中的作用，对其进行生物信息学分析以及亚细胞定位检测。结果显示，筛选到的36个StSTOP基因家族成员在11条染色体上均有分布，蛋白长度在143～736个氨基酸之间，蛋白质分子量为16 451.97～75 366.80 Da,等电点为5.75～9.47,亚细胞定位预测大部分位于细胞核中。系统进化树分析显示，StSTOP和***1亲缘关系最近。顺式启动子作用元件预测分析表明，含有大量与环境、激素和生长发育等相关的顺式作用元件。共线性分析表明，不同物种中的StSTOP基因存在一定同源性。亚细胞定位结果显示，StSTOP1基因定位在细胞核。

关键词：马铃薯 StSTOP1基因生物信息学分析亚细胞定位

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巴西橡胶树HbbHLH48基因克隆与亚细胞定位分析

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热带作物学报 2025年第3期46卷 534-543页

作者：范晓康樊松乐刘明洋郭冰冰杨洪代龙军张宇王立丰农业农村部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室/省部共建国家重点实验室培育基地-海南省热带作物栽培生理学重点实验室/中国热带农业科学院橡胶研究所海南海口571101 海南大学三亚南繁研究院海南三亚572024 海南大学热带农林学院海南儋州571737

植物bHLH转录因子是乙烯和茉莉酸激素信号转导的关键环节之一,在橡胶树胶乳产量形成和排胶过程中起到重要调控作用。本研究从橡胶树热研73397叶片中克隆了1个bHLH转录因子基因,命名为HbbHLH48(GenBank号:PQ303617),编码区全长1128bp,编... 详细信息

植物bHLH转录因子是乙烯和茉莉酸激素信号转导的关键环节之一,在橡胶树胶乳产量形成和排胶过程中起到重要调控作用。本研究从橡胶树热研73397叶片中克隆了1个bHLH转录因子基因,命名为HbbHLH48(GenBank号:PQ303617),编码区全长1128bp,编码375个氨基酸。其编码蛋白与拟南芥AtbHLH48相似度最高属于XVII亚组。生物信息学分析表明,HbbHLH48含有bHLH_SF superfamily结构域,不含跨膜结构域和信号肽。表达分析发现HbbHLH48在花、叶片和胶乳中的表达量高于根和茎中的表达量。在割胶树中,机械伤害处理使其表达下调。茉莉酸甲酯、水杨酸和乙烯利处理后,HbbHLH48先显著上调表达而后下调表达,赤霉素处理的表达模式与其相反。亚细胞定位分析显示HbbHLH48定位在细胞核中。综上,HbbHLH48是植物bHLH转录因子家族的一员,其在橡胶树中可能参与赤霉素过程中进而调控开花过程和胶乳合成过程,为进一步深入研究其功能奠定基础。

关键词：巴西橡胶树 HbbHLH48 克隆表达分析亚细胞定位

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龙眼DlAGO7基因克隆与亚细胞定位及表达分析

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分子植物育种 2025年第2期23卷 380-386页

作者：陈荣珠王小平林美珍赖钟雄漳州卫生职业学院药学院漳州363000 福建农林大学园艺植物生物工程研究所福州350002

Argonaute7(AGO7)在植物叶和花发育过程中发挥着重要的调控作用,而AGO7蛋白如何参与调控龙眼体胚的发育却未见报道。为了深入研究龙眼AGO7基因的功能与调控作用,本研究基于龙眼基因组数据库,采用RT-PCR法克隆龙眼DlAGO7基因,对其进行生... 详细信息

Argonaute7(AGO7)在植物叶和花发育过程中发挥着重要的调控作用,而AGO7蛋白如何参与调控龙眼体胚的发育却未见报道。为了深入研究龙眼AGO7基因的功能与调控作用,本研究基于龙眼基因组数据库,采用RT-PCR法克隆龙眼DlAGO7基因,对其进行生物信息学分析,构建瞬时融合表达载体,明确其亚细胞定位,最后,利用实时荧光定量仪检测其在龙眼体胚不同阶段的相对表达情况。克隆获得DlAGO7的CDS序列为3060 bp,编码1019个氨基酸;所编码氨基酸序列含有PAZ和Piwi高度保守结构域;blastp序列比对分析表明,DlAGO7蛋白与其他植物的AGO7蛋白具有高度同源性;系统进化发育树分析显示,DlAGO7蛋白与甜橙AGO7蛋白亲缘关系最近,与单子叶植物玉米和水稻的亲缘关系最远;由亚细胞定位研究可知,龙眼DlAGO7基因为核定位基因;RT-qPCR分析表明,DlAGO7在龙眼球形胚阶段显著表达;克隆获得DlAGO7基因的5′端上游启动子序列长度为1746 bp,启动子分析共预测出9类顺式作用元件。由此推测,DlAGO7基因可能在龙眼球形胚阶段发挥着重要的调控作用,该基因主要在细胞核中发挥作用。以上研究结果可为龙眼的分子育种提供理论基础。

关键词：龙眼体胚发生 AGO7基因启动子序列亚细胞定位

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