检索结果-内蒙古大学图书馆

人类学学报 2005年第3期24卷 221-231页

作者：薛付忠王洁贞郭亦寿胡平山东大学公共卫生学院流行病学与医学统计学研究所济南250012 山东大学医学院医学遗传学研究所济南250012

目的:探讨基因频率矩阵的中心化(或均值化)协方差阵主成分分析方法在人类群体遗传结构研究中的适用性和合理性。方法:从基因频率矩阵的结构特征入手,分析中心化、均值化协方差阵主成分分析与标准化相关阵主成分分析在特征根、特征向量... 详细信息

目的:探讨基因频率矩阵的中心化(或均值化)协方差阵主成分分析方法在人类群体遗传结构研究中的适用性和合理性。方法:从基因频率矩阵的结构特征入手,分析中心化、均值化协方差阵主成分分析与标准化相关阵主成分分析在特征根、特征向量以及降维效果等方面的差异,并通过实例比较不同方法在解释群体遗传结构特征上合理性。结果:中心化(或均值化)协方差阵的主成分不仅反映了基因变异程度的“方差信息量权”,而且反映了基因间相互影响程度的“相关信息量权”;标准化相关阵的主成分反映的仅是“相关信息量权”,不包括“方差信息量权”。通过比较中国26个汉族人群HLA-A基因座中心化协方差阵和标准化相关阵2种主成分分析结果,证实中心化协方差阵主成分分析方法在特征根与特征向量、保留主成分的个数和对主成分的群体遗传学解释的合理性等方面均优于标准化相关阵主成分分析方法。结论:在对群体遗传结构进行主成分分析时,应使用中心化(或均值化)变换消除基因频率矩阵中量级的影响,然后在用其协方差阵提取主成分。

关键词：人类群体遗传结构主成分分析中心化(或均值化)协方差阵 HLA-A

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

人类群体遗传结构的图论主成分分析方法

引用

中国卫生统计 2006年第1期23卷 19-23页

作者：薛付忠王洁贞郭亦寿胡平王振光山东大学公共卫生学院流行病学与医学统计学研究所 250012 山东大学医学院医学遗传学研究所 250012 山东大学第二医院 250033

目的提出基因频率矩阵的图论主成分分析方法,探讨该法在人类群体遗传结构研究中的应用。方法从分析基因频率矩阵的结构特征入手,将主成分分析与图论中的最小生成树有机结合,构建人类群体遗传结构的图论主成分模型,并以中国26个汉族人群H... 详细信息

目的提出基因频率矩阵的图论主成分分析方法,探讨该法在人类群体遗传结构研究中的应用。方法从分析基因频率矩阵的结构特征入手,将主成分分析与图论中的最小生成树有机结合,构建人类群体遗传结构的图论主成分模型,并以中国26个汉族人群HLA-A基因座遗传结构分析为例,验证图论主成分分析的科学性和适用性。结果图论主成分分析的基本步骤可概括为:①对中心化基因频率的协方差矩阵进行主成分分析;②按图论原理求过m维空间n个点的最小生成树;③利用求“颈”法分割最小生成树;④将最小生成树整合到二维主成分散点图中构建图论主成分分类图。根据此步骤,对中国26个汉族人群HLA-A基因座遗传结构进行了图论主成分分析,分析结果符合中华民族源与流的客观规律。结论图论主成分分类图既可显示各群体的遗传结构特性,又可利用最小生成树的链接关系揭示各群体间的内在联系;图论主成分分析是分析人类群体遗传结构的一种较好方法。

关键词：人类群体遗传结构图论主成分分析 HLA-A

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

人类群体遗传结构的双标图模型及其应用

引用

科技导报 2006年第5期24卷 16-24页

作者：薛付忠王洁贞郭亦寿胡平山东大学公共卫生学院流行病学与医学统计学研究所济南250012 山东大学医学院医学遗传学研究所济南250012

提出了分析人类群体遗传结构的PPG双标图模型的基本原理及其应用。PPG双标图根据人类群体遗传学的基本原理,利用矩阵奇异值分解技术,将多维基因频率矩阵近似为一个能够用双标图表示的二维矩阵,从而实现了人类群体遗传结构的图形化和可... 详细信息

提出了分析人类群体遗传结构的PPG双标图模型的基本原理及其应用。PPG双标图根据人类群体遗传学的基本原理,利用矩阵奇异值分解技术,将多维基因频率矩阵近似为一个能够用双标图表示的二维矩阵,从而实现了人类群体遗传结构的图形化和可视化直观分析。它与聚类分析、主成分分析、对应分析等传统多元统计分析方法相比,具有明显的优越性。PPG双标图通过其几何性质,反映了其丰富的群体遗传学含义;更重要的是,在基因频率矩阵前2项奇异值的累计贡献率足够大的前提下,利用双标图,以辅助线为补充,可以实现人类群体遗传结构的可视化直观定量分析:①比较各群体之间的遗传距离,划分群体类型;②比较各基因的变异性大小;③分析各基因之间的相关性;④比较某基因对各亚群体遗传结构的相对贡献;⑤比较任意2个亚群体遗传结构的差异;⑥分析任意2个基因的差异及其对各亚群体变异性的贡献;⑦分析群体与基因的交互作用及其对群体亚分的贡献。因此,PPG双标图值得在人类群体遗传结构分析中推广应用,但PPG双标图也存在一定的局限性。

关键词：人类群体遗传结构 PPG双标图模型 HLA-A基因座汉族群体

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

人类群体遗传结构的图论多维尺度分析方法

引用

预防医学论坛 2007年第1期13卷 1-5页

作者：李春田薛付忠王洁贞郭亦寿胡平山东省平邑县卫生防疫站山东平邑273300 山东大学公共卫生学院流行病学与医学统计学研究所山东济南250012 山东大学医学院医学遗传学研究所山东济南250012

[目的]提出基因频率矩阵的图论多维尺度分析方法,探讨该法在人类群体遗传结构研究中的应用。[方法]从分析基因频率矩阵的结构特征入手,将增强多维尺度分析与图论中的最小生成树有机结合,构建人类群体遗传结构的图论多维尺度模型,并以中... 详细信息

[目的]提出基因频率矩阵的图论多维尺度分析方法,探讨该法在人类群体遗传结构研究中的应用。[方法]从分析基因频率矩阵的结构特征入手,将增强多维尺度分析与图论中的最小生成树有机结合,构建人类群体遗传结构的图论多维尺度模型,并以中国26个汉族人群HLA-A基因座遗传结构分析为例,验证图论多维尺度分析的科学性和适用性。[结果]图论多维尺度分析的基本步骤可概括为:①对中心化基因频率矩阵进行增强多维尺度分析;②按图论原理求过m维空间n个点的最小生成树;③利用求“颈”法分割最小生成树;④将最小生成树整合到增强多维尺度散点图中构建图论多维尺度分类图。根据此步骤,对中国26个汉族人群HLA-A基因座遗传结构进行了图论多维尺度分析,分析结果符合中华民族源与流的客观规律。[结论]图论多维尺度分类图既可显示各群体的遗传结构特性,又可利用最小生成树的连接关系揭示各群体间的内在联系;图论多维尺度分析是分析人类群体遗传结构的一种理想方法。

关键词：人类群体遗传结构图论多维尺度分析 HLA—A

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

人类群体遗传空间结构对应分析中的“蹄型效应”及其遗传学解释

引用

遗传 2005年第6期27卷 972-979页

作者：薛付忠王洁贞郭亦寿胡平山东大学公共卫生学院流行病学与医学统计学研究所济南250012 山东大学医学院医学遗传学研究所济南250012

探讨了人类群体遗传结构对应分析中“蹄型效应”的产生机制及其遗传学解释。从分析基因频率矩阵的结构特点入手,以实例验证和比较了对应分析中散点图的结构特征。发现当基因频率矩阵的结构不同时,其对应分析中散点图的分布模式不同;当... 详细信息

探讨了人类群体遗传结构对应分析中“蹄型效应”的产生机制及其遗传学解释。从分析基因频率矩阵的结构特点入手,以实例验证和比较了对应分析中散点图的结构特征。发现当基因频率矩阵的结构不同时,其对应分析中散点图的分布模式不同;当基因频率矩阵中存在稀有基因时,其对应分析的散点图则呈现明显的“蹄型效应”。“蹄型效应”经常会歪曲潜在遗传结构的真实形态,其产生主要是因为对应分析中的χ2距离不相似测度高估了稀有基因的作用。在人类群体遗传结构对应分析中,当出现“蹄型效应”效应时,需认真分析基因频率矩阵的结构,寻找“蹄型效应”产生原因并给出合理的遗传学解释,以免做出错误结论。

关键词：人类群体遗传结构对应分析蹄型效应

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

人类群体遗传空间结构对应分析中的“蹄型效应”及其校正方法

引用

中国卫生统计 2006年第3期23卷 194-198页

作者：薛付忠王洁贞郭亦寿胡平山东大学公共卫生学院流行病学与医学统计学研究所 250012 山东大学医学院医学遗传学研究所 250012

目的探讨人类群体遗传结构对应分析中“蹄型效应”的产生机制、遗传学解释及其校正方法。方法从分析基因频率矩阵的结构特点入手,以实例分析展示对应分析散点图中的“蹄型效应”,解释其原因,用除趋势对应分析对其进行校正,观察校正效果... 详细信息

目的探讨人类群体遗传结构对应分析中“蹄型效应”的产生机制、遗传学解释及其校正方法。方法从分析基因频率矩阵的结构特点入手,以实例分析展示对应分析散点图中的“蹄型效应”,解释其原因,用除趋势对应分析对其进行校正,观察校正效果。结果当基因频率矩阵中存在稀有基因时,其对应分析的散点图常呈现明显的“蹄型效应”。“蹄型效应”经常会歪曲潜在遗传结构的真实形态,其产生的主要原因是对应分析中的χ2距离不相似测度高估了稀有基因的作用,除趋势对应分析对“蹄型效应”有明显的校正作用。结论在人类群体遗传结构对应分析中,当出现“蹄型效应”时,需认真分析基因频率矩阵的结构,寻找“蹄型效应”产生原因并给出合理的遗传学解释,以免做出错误结论,并可用除趋势对应分析方法校正“蹄型效应”。

关键词：人类群体遗传结构对应分析蹄型效应除趋势对应分析

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

卫生统计

引用

中国医学文摘（卫生学分册） 2007年第5期24卷 319-320,F0003,F0004页

用数据挖掘技术实现多因素实验设计；微阵列数据的多重比较；人类群体遗传结构的图论主成分分析方法；水平型数据结构与垂直型数据结构占用存储空间的比较；卫生统计年报中住院资料推测人群死因构成及水平的可行性分析；结构方程模型原... 详细信息

用数据挖掘技术实现多因素实验设计；微阵列数据的多重比较；人类群体遗传结构的图论主成分分析方法；水平型数据结构与垂直型数据结构占用存储空间的比较；卫生统计年报中住院资料推测人群死因构成及水平的可行性分析；结构方程模型原理及其应用注意事项；Cox模型影响点识别诊断统计量的模拟研究；

关键词：卫生统计水平型数据结构人类群体遗传结构主成分分析方法垂直型数据结构数据挖掘技术结构方程模型微阵列数据

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：

通借通还

建议与咨询 留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

请选择保存的检索档案： 新增检索档案 确定 取消

请选择收藏分类： 新增自定义分类 确定 取消

通借通还

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：