检索结果-内蒙古大学图书馆

微生物学报 2008年第5期48卷 577-582页

作者：苏勇姚文朱伟云南京农业大学消化道微生物研究室南京210095

[目的]对分离自猪肠道的乳酸杆菌S1菌株进行鉴定,并比较该菌株与同种的001T菌株的基因差异.[方法]对S1菌株进行16S rRNA基因序列分析和种特异PCR检测,并且对S1菌株和Lactobacillus sobrius 001T进行代表性差异分析(Representational dif... 详细信息

[目的]对分离自猪肠道的乳酸杆菌S1菌株进行鉴定,并比较该菌株与同种的001T菌株的基因差异.[方法]对S1菌株进行16S rRNA基因序列分析和种特异PCR检测,并且对S1菌株和Lactobacillus sobrius 001T进行代表性差异分析(Representational difference analysis,RDA).[结果]16S rRNA基因序列分析表明,与S1菌株最相似的已知菌为***.变性梯度凝胶电泳分析显示,仔猪空、回肠细菌图谱中有一与S1菌株有相同迁移位置的优势条带,克隆、测序鉴定表明,与该条带相匹配的16S rRNA基因克隆(Clone S)的最相似已知菌也为***.16S rRNA基因系统进化分析表明,S1菌株与Clone S和*** 16S rRNA基因序列同源性分别为99.8%和99.6%.***特异性引物也可以扩增S1株菌的16S rRNA基因的特定片段.因此S1菌株可被确定为***对菌株S1和同种的猪源*** 001T菌株的基因差异进行分析,未发现这两株菌的基因组差异.[结论]猪肠道乳杆酸菌S1菌株属于***,其与猪源L sobrius 001T菌株为相似菌株.

关键词： Lactobacillus sobrius 代表性差异分析猪肠道乳酸杆菌

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代表性差异分析技术与疾病基因的克隆

引用

生理科学进展 1999年第3期30卷 271-274页

作者：杨林袁爱力李勇吕有勇第一军医大学全军消化研究所广州510515 北京医科大学临床肿瘤学院北京100034

本文结合代表性差异分析的技术原理和方法 ,介绍了近年来该方法在肿瘤基因克隆、新病原体的筛查和多态相关标志物的分离等方面的应用 ,并提出了存在的问题和今后的展望。

关键词：代表性差异分析基因克隆疾病基因

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小菜蛾对杀螟丹抗性相关序列的代表性差异分析

引用

华北农学报 2003年第2期18卷 14-16页

作者：程罗根陈之浩张晓飞李忠英南京师范大学生命科学学院江苏南京210097 贵州省农业科学院植保所贵州贵阳550006

采用代表性差异分析方法 ,以小菜蛾的敏感品系作为驱赶扩增子 ,抗杀螟丹近等基因系作为检测扩增子 ,通过 3轮消减杂交得到大小为 15 0～ 30 0bp的差异片段 ,经亚克隆测序并与GenBank等数据库同源比较 ,发现其中一个亚克隆序列与P4 5 0... 详细信息

采用代表性差异分析方法 ,以小菜蛾的敏感品系作为驱赶扩增子 ,抗杀螟丹近等基因系作为检测扩增子 ,通过 3轮消减杂交得到大小为 15 0～ 30 0bp的差异片段 ,经亚克隆测序并与GenBank等数据库同源比较 ,发现其中一个亚克隆序列与P4 5 0基因有部分同源性 ,其余亚克隆与已知基因序列的同源性较低 ,判断这些序列可能是新基因的片段。

关键词：小菜蛾杀螟丹抗性相关序列代表性差异分析亚克隆测序

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代表性差异分析法在基因克隆中的应用及其发展

引用

国外医学（遗传学分册） 1998年第2期21卷 81-87页

作者：湛凤凰李桂源湖南医科大学肿瘤研究所

分离特异性基因的研究是分子生物学研究的前沿课题。目前代表性差异分析法通过制备扩增子，消减杂交和动力性富集，使捕获靶基因的研究更加高效和完善。在此基础上，又发展了抑制性消减杂交、ｃＤＮＡ代表性差异分析法、ＭＳ－代表性差... 详细信息

分离特异性基因的研究是分子生物学研究的前沿课题。目前代表性差异分析法通过制备扩增子，消减杂交和动力性富集，使捕获靶基因的研究更加高效和完善。在此基础上，又发展了抑制性消减杂交、ｃＤＮＡ代表性差异分析法、ＭＳ－代表性差异分析法及ＭＳ－代表性差异分析法－ＷＥＥＣ。本文仅对这些方法的特点及其在肿瘤、基因表达、遗传性分析及致病因子的研究方面进行论述。

关键词：基因克隆 RDA 代表性差异分析分子生物学

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代表性差异分析和消减杂交差异显示分析方法在克隆差异基因方面的灵敏度比较

引用

肿瘤研究与临床 2010年第2期22卷 84-88页

作者：郭榕李勇青岛市胸科医院结核科 266043 北京大学临床肿瘤学院北京肿瘤医院暨北京市肿瘤防治研究所恶性肿瘤发病机制及转化研究教育部重点实验室

目的建立目的基因差异信息标量化的配对研究体系，比较经典的代表性差异分析（RDA）方法和消减杂交差异显示分析（SHDD）方法在克隆差异基因方面的灵敏度。方法以人类乳头瘤病毒（HPV）DNA为模板行PCR扩增获得376bp和869bp两个片段，作... 详细信息

目的建立目的基因差异信息标量化的配对研究体系，比较经典的代表性差异分析（RDA）方法和消减杂交差异显示分析（SHDD）方法在克隆差异基因方面的灵敏度。方法以人类乳头瘤病毒（HPV）DNA为模板行PCR扩增获得376bp和869bp两个片段，作为差异目的基因掺入人血基因组DNA，获得5组目的基因拷贝数呈梯度差异的配对研究体系，比较RDA和SHDD方法的检测灵敏度。结果应用RDA方法可克隆得到上调6倍的376bp片段和上调8倍的869bp的HPV片段，而应用SHDD方法可克隆到上调4倍的两种差异片段。结论SHDD方法由于采用了两样本差异产物问的双向均衡消减杂交，避免了经典RDA方法不均衡消减杂交导致的差异信息的丢失，在克隆较弱的差异信息，尤其是较长差异信息方面，显著优于经典RDA方法。

关键词：代表性差异分析消减杂交差异显示分析基因组 DNA 人乳头瘤病毒

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代表性差异分析技术及其应用

引用

生物技术通讯 1998年第3期9卷 236-238页

作者：王宏李春海军事医学科学院肿瘤分子生物学研究中心北京100850

同一物种不同基因组的表达存在着差别,这些差别有的是通过遗传获得的,有的是某些病原引起的。代表性差异分析技术(representational difference analy-sis,RDA)正是这样一种分析DNA序列差别的有效方法,它能同时分析与某些疾病表型密切... 详细信息

同一物种不同基因组的表达存在着差别,这些差别有的是通过遗传获得的,有的是某些病原引起的。代表性差异分析技术(representational difference analy-sis,RDA)正是这样一种分析DNA序列差别的有效方法,它能同时分析与某些疾病表型密切相关的基因变化或某些感兴趣的定点基因克隆。分子生物学技术不断进步的今天。

关键词：代表性差异分析消减杂交差异显示技术多态性基因组DNA 基因克隆寡核苷酸分子生物学技术动力学 DNA序列

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甲基化CpG岛扩增联合代表性差异分析方法在筛查人非小细胞肺癌组织中高甲基化修饰序列的应用

引用

中国全科医学 2012年第6期15卷 644-648页

作者：李勇郭榕宁金鹰北京大学临床肿瘤学院北京肿瘤医院暨北京市肿瘤防治研究所恶性肿瘤发病机制及转化研究教育部重点实验室北京市100142 北京大学第一医院老年科北京科洛恩转化医学研究所北京市102200

目的探讨甲基化CpG岛扩增联合代表性差异分析(MCA/RDA)方法在筛查人非小细胞肺癌(NSCLC)组织中高甲基化修饰序列的应用。方法以92对NSCLC和癌旁对照组织DNA为研究对象,应用MCA/RDA方法筛查肺癌组织DNA中高甲基化修饰的CpG岛序列。应用... 详细信息

目的探讨甲基化CpG岛扩增联合代表性差异分析(MCA/RDA)方法在筛查人非小细胞肺癌(NSCLC)组织中高甲基化修饰序列的应用。方法以92对NSCLC和癌旁对照组织DNA为研究对象,应用MCA/RDA方法筛查肺癌组织DNA中高甲基化修饰的CpG岛序列。应用反转录聚合酶链反应(RT-PCR)和甲基化特异性PCR(methylation-sensitive PCR,MSP)技术,分析胰岛素样生长因子结合蛋白(IGFBP-4)基因启动子区CpG岛的甲基化修饰与基因表达的相关性。结果获得5个经Slot Blot验证在肺癌组织中高甲基化修饰的CpG岛序列(IGFBP-4、KLK10、ADAM23、GADD45G和DUOX1)。甲基化抑制剂5-aza-2'-deoxycytidine处理NSCLC细胞可明显上调IGFBP-4基因的表达。在41例(44.6%)癌组织中检测到IGFBP-4表达水平显著低于癌旁对照组织。47例(51.1%)癌组织检测到IGFBP-4高甲基化显著高于癌旁组织的检出率(16.3%,15/92;P<0.001)。IGFBP-4高甲基化与基因表达呈负相关(r=-0.396,P<0.001)。IGFBP-4高甲基化与TNM分期(P=0.013)和淋巴结转移(P=0.022)相关。结论应用MCA/RDA方法筛查到5个在NSCLC组织中高甲基化修饰的CpG岛序列,并证实IGFBP-4启动子区CpG岛的高甲基化可能通过抑制基因的表达参与了NSCLC的发生。

关键词：癌,非小细胞肺甲基化CpG岛扩增代表性差异分析胰岛素样生长因子结合蛋白质4

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一种基因克隆的新策略—cDNA的代表性差异分析法

引用

国外医学（遗传学分册） 1998年第3期21卷 113-116页

作者：杨林袁爱力李勇吕有勇第一军医大学全军消化研究所北京医科大学临床肿瘤学院

ｃＤＮＡ的代表性差异分析法是近年发展起来并逐步得到广泛应用的一项基因克隆新策略。它以基因组代表性差异分析法为技术基础，并吸取了差异显示法的优点，具有灵敏、高效及假阳性率低等特点。在肿瘤基因克隆、病因分析和病源筛选、发... 详细信息

ｃＤＮＡ的代表性差异分析法是近年发展起来并逐步得到广泛应用的一项基因克隆新策略。它以基因组代表性差异分析法为技术基础，并吸取了差异显示法的优点，具有灵敏、高效及假阳性率低等特点。在肿瘤基因克隆、病因分析和病源筛选、发育的基因调控以及不同细胞因子和受体对基因表达的调控等方面的应用，已日益引起人们的重视。

关键词：基因克隆 cDNA 代表性差异分析

来源：评论

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对代表性差异分析(RDA)方法的改进

对代表性差异分析(RDA)方法的改进

引用

中国生物化学与分子生物学会第八届会员代表大会暨全国学术会议

作者：方孝东黄薇张帆林栖凤李冠一海南大学生物科学技术研究所海南大学生物科学技术研究所海南大学生物科学技术研究所海南大学生物科学技术研究所海南大学生物科学技术研究所

代表性差异分析(Representational Difference Analysis,RDA)是一种分离两个DNA群体之间差异DNA片段的非常有效的方法.该技术最突出的优点在于通过差减杂交与PCR的巧妙结合,实现了对靶序列的差减杂交富集和“动力学”富集,从而可以使靶... 详细信息

代表性差异分析(Representational Difference Analysis,RDA)是一种分离两个DNA群体之间差异DNA片段的非常有效的方法.该技术最突出的优点在于通过差减杂交与PCR的巧妙结合,实现了对靶序列的差减杂交富集和“动力学”富集,从而可以使靶序列在三轮杂交后被富集百万倍以上,具有很高的灵敏度.目前,该技术已在差异表达基因的克隆、缺失片段的分离、外源片段的检测、多态性位点探针的制备等领域的研究中得到了十分广泛的应用.

关键词：代表性差异分析 RDA 差减杂交

来源：评论

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代表性差异性分析一种分析复杂但高度相关基因组间差异性的方法

引用

国外医学（寄生虫病分册） 1998年第3期25卷 113-116页

作者：王轶詹希美中山医科大学寄生虫学教研室

本文介绍了一种新方法——代表性差异性分析,它是一种有效地发现复杂基因间差异的方法,已被广泛地应用于肿瘤、微生物、寄生虫等领域,如克隆肿瘤的缺失基因,新的致病基因的发现。它不需要基因图谱即可快速分离出相关的多态性标记物。

关键词：代表性差异分析多态性标记物基因组

来源：评论

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