检索结果-内蒙古大学图书馆

作者：李珺东北林业大学

学位级别：硕士

野生动物的盗猎,走私,非法获取、拥有与利用等违法犯罪行为是全球生物多样性的重要威胁因素。物种鉴定是野生动物保护执法的重要环节。以mt DNA为遗传标记的物种鉴定技术为全球所广泛采用。但是,物种鉴定中所采用的计算方法主要是将待... 详细信息

野生动物的盗猎,走私,非法获取、拥有与利用等违法犯罪行为是全球生物多样性的重要威胁因素。物种鉴定是野生动物保护执法的重要环节。以mt DNA为遗传标记的物种鉴定技术为全球所广泛采用。但是,物种鉴定中所采用的计算方法主要是将待测样品的序列与目标物种进行同源性比较,或者通过系统发育树的拓扑结构来得出结论。因为这些方法均不能对结论的风险或可靠性做出定量评估,更不能提供物种认定与排除的统计学依据,对于近缘物种往往难以做出可靠的结论。本研究建立了一种基于似然法的物种鉴定方法。以锦蛇属(Elaphe)6个物种的Cyt b基因片段(400bp)构建物种参照序列库,包括王锦蛇(***,n=52)、白条锦蛇(***,n=15)、日本四线锦蛇(***,n=40)、四线锦蛇(***,n=43)、班氏锦蛇(***,n=22)、棕黑锦蛇(***,n=18);分别统计每个物种43bp和75bp片段上各个碱基的频率;基于该频率,计算给定同种和异种个体属于某一物种的概率。将同种和异种所属概率数据进行-lg转换后,构建正态概率密度函数。根据该密度函数估计任意给定个体属于或不属于某一物种的概率。同时也根据概率分布,做同种和异种99%水平的置信区间估计,作为物种认定与排除的标准。结果显示,在锦蛇属的6个物种,43bp和75bp两个片段中,同种和异种的概率分布均有极为明显的分异,可以完成所有物种的准确区分与鉴定。这一方法充分考虑碱基的权重,通过群体数据来描述物种的特征,展现出物种特征性碱基的重要性;能够明确给出鉴定结论的可靠性或风险,更加符合法医鉴定的结论要求;因为在Cyt b基因序列上75bp就可以得到较高可靠性,允许测序片段更小,对检材质量要求更加宽泛。

关键词：似然法物种鉴定锦蛇属 Elaphe 细胞色素b基因

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似然法模型在病理鉴别诊断中的应用

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中国厂矿医学 1994年第3期7卷 42-44页

作者：彭锡朗武汉一冶医院

似然法模型在病理鉴别诊断中的应用武汉一冶医院彭锡朗似然法（Ｌｉｋｅｌｉｈｏｏｄ）是由英国数理统计学家Ｆｉｓｈｅｒ［ｌ］提出的一种逻辑推理方法。其基本内容是：用数理统计表达一个事物可能出现的概率。后来日本学者高桥眺正ｐ... 详细信息

似然法模型在病理鉴别诊断中的应用武汉一冶医院彭锡朗似然法（Ｌｉｋｅｌｉｈｏｏｄ）是由英国数理统计学家Ｆｉｓｈｅｒ［ｌ］提出的一种逻辑推理方法。其基本内容是：用数理统计表达一个事物可能出现的概率。后来日本学者高桥眺正ｐ’根据Ｆｉｓｈｅｒ的理论设计出一个...

关键词：病理诊断鉴别诊断似然法

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利用SNP标记进行北京地区中国荷斯坦牛亲子推断的研究

引用

畜牧兽医学报 2012年第1期43卷 44-49页

作者：郭刚周磊刘林李东张胜利刘剑锋丁向东张毅王雅春张勤张沅中国农业大学动物科技学院农业部动物遗传育种试验室北京100193 首农集团北京三元种业科技股份有限公司三元绿荷奶牛养殖中心北京100076 北京奶牛中心北京100085

本研究旨在利用SNP标记对北京地区中国荷斯坦牛群进行亲子推断,并分析场、母牛出生年月、公牛家系对系谱错误率的影响,以期为指导奶牛育种和生产管理提供依据。共选取了255个最小等位基因频率大于0.45的高多态SNPs标记,利用似然法,采用C... 详细信息

本研究旨在利用SNP标记对北京地区中国荷斯坦牛群进行亲子推断,并分析场、母牛出生年月、公牛家系对系谱错误率的影响,以期为指导奶牛育种和生产管理提供依据。共选取了255个最小等位基因频率大于0.45的高多态SNPs标记,利用似然法,采用Cervus3.0软件对北京地区84头荷斯坦公牛和1 927头母牛进行亲子推断研究。结果显示,试验群体平均系谱错误率为20.9%,不同的场、出生年份和月份的母牛的系谱错误率有显著差异(P<0.05),而各公牛家系间系谱错误率差异不显著(P>0.05)。结果说明,错误系谱的发生主要是由于牛场本身记录不完善造成的。在我国亟需建立利用遗传标记监测、校正系谱准确性的制度,采取措施提高系谱的准确性,加快我国荷斯坦牛遗传改良进程。

关键词：中国荷斯坦牛似然法亲子推断 SNP 系谱错误

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方向估计的神经网络计算

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电子学报 1993年第10期21卷 62-68页

作者：罗发龙李衍达清华大学自动化系北京100084

本文给出一种借助于二维神经网络构成的混合系统,用它来完成几种方向估计算法,这些算法包括:最大似然法、交替投影最大似然法、Marcos等人提出的无需特征分解的“传播算法”。利用神经网络对某些算法的快速性,该系统为实时实现目标的精... 详细信息

本文给出一种借助于二维神经网络构成的混合系统,用它来完成几种方向估计算法,这些算法包括:最大似然法、交替投影最大似然法、Marcos等人提出的无需特征分解的“传播算法”。利用神经网络对某些算法的快速性,该系统为实时实现目标的精确定位提供了一条新的、有效的途径。

关键词：神经网络方向估计似然法计算

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基于元音共振峰的跨语言司法语音比对研究

引用

外国语 2019年第1期42卷 61-71页

作者：钟彩顺江西师范大学江西南昌330022

语音比对是司法语音鉴定的一种重要技术手段,但目前仅有单语语音比对。本研究通过语音实验,探讨基于元音共振峰的跨语言语音比对的有效性。结果显示,50%以上的受试可通过似然率进行有效识别。根据似然比对数的损耗度,/i/_f_2,//_f_1和... 详细信息

语音比对是司法语音鉴定的一种重要技术手段,但目前仅有单语语音比对。本研究通过语音实验,探讨基于元音共振峰的跨语言语音比对的有效性。结果显示,50%以上的受试可通过似然率进行有效识别。根据似然比对数的损耗度,/i/_f_2,//_f_1和/u/_f_1三个特征符合似然法语音比对的效度要求。在参照组语言选择上,/i/_f_2和//_f_1既可用汉语,也可用英语,但/u/_f_1只有用英语才有效。受试群体的汉英语音相似度对跨语言语音比对有影响,但无显著关联。本研究最后探讨了如何就变量选用、参照选择及实际应用等方面进一步深化跨语言司法语音比对的研究。

关键词：司法语音比对共振峰似然法

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F_2群体动态性状基因定位的极大似然分析

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东北林业大学学报 2006年第1期34卷 72-77页

作者：高会江孙华陈学辉杨润清徐士忠东北农业大学哈尔滨市产品质量监督检验所上海交通大学 Dept. of Botany & PlantScience University of CaliforniaRiversideCA92521

把表型值随着时间(生命时期、年龄、胎次等)或其他可以量化的因素(生理状态、生产水平、代谢率和环境条件等)变化的性状称为动态性状。受动物遗传育种中用来估计动态性状育种值的随机回归测定日模型思想的启发,将关于时间(测定日期)的Le... 详细信息

把表型值随着时间(生命时期、年龄、胎次等)或其他可以量化的因素(生理状态、生产水平、代谢率和环境条件等)变化的性状称为动态性状。受动物遗传育种中用来估计动态性状育种值的随机回归测定日模型思想的启发,将关于时间(测定日期)的Legendre多项式镶嵌在遗传模型的每个遗传效应中,以刻画QTL对动态性状变化过程的作用,从而建立起动态性状基因定位的数学模型。以F2遗传设计群体为例,论述了动态性状基因定位分析的基本原理,推导了QTL效应大小和位置的极大似然法估计过程。选择3次Legendre多项式为子模型,采用MonteCarlo方法模拟F2设计群体,研究抽样群体大小和测定日密度对不同遗传力QTL检测效力的影响。利用正交设计安排因素试验组合,分析模拟试验结果表明:高遗传力的要比低遗传力的QTL在检测时需要较少个体数和测定日抽样;但不论QTL的遗传力多大,300以上的群体大小和5%以上的测定日密度都可以保证足够高的检测效力。

关键词：动态性状基因定位 Legendre多项式似然法模拟

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SNP标记用于新疆5个绵羊品种亲子鉴定准确性的研究

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中国科技论文 2017年第24期12卷 2867-2872页

作者：王悦覃锡忠贺三刚李文蓉贾振红刘明军新疆大学信息科学与工程学院乌鲁木齐830046 新疆畜牧科学院乌鲁木齐830011

探讨单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)标记用于新疆不同绵羊品种间亲子鉴定的准确性。新研究参照国际绵羊基因组学协会(International Sheep Genomics Consortium,ISGC)推荐的88个常染色体SNP构成的标记组合,计算其... 详细信息

探讨单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)标记用于新疆不同绵羊品种间亲子鉴定的准确性。新研究参照国际绵羊基因组学协会(International Sheep Genomics Consortium,ISGC)推荐的88个常染色体SNP构成的标记组合,计算其累积排除概率(cumulative probability of exclusion,CPE)并由此估计鉴定所需标记数量,用似然法验证鉴定的准确性。在新疆5个绵羊品种中,该标记组合的CPE随最小等位基因频率(minor allele frequency,MAF)的增大而增大,且MAF≥0.3时,CPE增加显著。当CPE随SNP数量的增加达到99.9%时,需要约50~60个SNP;当SNP数量达到ISGC推荐的88个时,CPE超过99.98%。似然法鉴定验证绵羊群体亲子关系的结果与系谱记录完全一致,置信度超过99%。研究证实了ISGC推荐的SNP标记组合在新疆绵羊品种中亲子鉴定准确性较高,为基于SNP标记估计不同绵羊品种间亲子关系的研究提供了理论依据。

关键词：生物信息学单核苷酸亲子鉴定绵羊品种排除概率似然法

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正负电子物理的研究

正负电子物理的研究

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作者：杜书先中国科学院研究生院；中国科学院高能物理研究所

学位级别：博士

报告主要包括两部分内容:\n (1) BESⅢ粲偶素物理的研究。基于BESⅢ实验的模拟、重建和分析框架BOSS，产生粲偶素衰变的蒙特卡罗样本，开展了物理分析与研究。ψ(2S)→π+π-J/ψ，J/ψ→l+l-是ψ(2S)的重要衰变过程之一。利用该过... 详细信息

报告主要包括两部分内容:\n (1) BESⅢ粲偶素物理的研究。基于BESⅢ实验的模拟、重建和分析框架BOSS，产生粲偶素衰变的蒙特卡罗样本，开展了物理分析与研究。ψ(2S)→π+π-J/ψ，J/ψ→l+l-是ψ(2S)的重要衰变过程之一。利用该过程，研究了低动量的π粒子的重建效率和粒子鉴别效率。考虑到该过程分支比比较大、统计误差小的特点，研究了利用它来确定ψ(2S)样本事例总数的方法。此外，由于BESⅢ电磁量能器具有优良的能量分辨性能，单举光子谱将是BESⅢ研究粲偶素衰变的一个重要方法。利用该方法对ψ(2S)的辐射衰变进行了研究。它的优点是可以测量粲偶素辐射衰变过程的绝对分支比。\n (2)国际直线对撞机(ILC)上LDC实验的粒子鉴别。ILC是正在设计中的下一代高能物理加速器。将运行在ILC上的探测器LDC正在设计之中。研究了LDC上的粒子鉴别性能。e+e-→HZ，Z→l+l-过程是寻找Higgs粒子的理想过程，轻子对的鉴别是该项物理分析的关键。利用似然法得到了接近99％的粒子鉴别效率。

关键词：粲偶素衰变单举光子谱国际直线对撞机粒子鉴别似然法

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应用微卫星确定中国西门塔尔牛亲缘关系

应用微卫星确定中国西门塔尔牛亲缘关系

引用

作者：贺建宁中国农业科学院

学位级别：硕士

本研究的目的是通过检测中国西门塔尔牛的微卫星基因座,分析其遗传多态性,初步建立一套适合于本品种牛的亲缘关系鉴定体系,并利用此技术体系对实验群体牛进行亲缘关系的确定。本实验通过检测内蒙古乌拉盖地区1626头中国西门塔尔牛的12... 详细信息

本研究的目的是通过检测中国西门塔尔牛的微卫星基因座,分析其遗传多态性,初步建立一套适合于本品种牛的亲缘关系鉴定体系,并利用此技术体系对实验群体牛进行亲缘关系的确定。本实验通过检测内蒙古乌拉盖地区1626头中国西门塔尔牛的12个微卫星基因座,分析了它们的遗传多态性和在亲子鉴定中的应用价值,并利用所建立的方法体系,通过排除法和似然法对实验群体牛的亲缘关系进行鉴定。得到的主要结果如下: 1.所筛选的12个微卫星基因座的杂合度、多态信息含量、等位基因的平均值分别为:0.735、0.705、12.42,多态信息含量均大于0.5,期望杂合度与观测杂合度之差为0.003～0.097之间,差值较小。说明此12个标记均为高度多态基因座,且在群体中均匀分布,适用于家畜的遗传分析和个体鉴定。 2.统计各微卫星基因座的等位基因频率,计算三种不同情况下的累积排除概率为0.9979、0.9999、0.99999,均达到0.99以上,说明此标记组合在亲子鉴定中具有较高的使用价值。 3.本研究初步确定了用于中国西门塔尔牛亲子鉴定的12个微卫星基因座:ETH10、BM2113、BM1824、ETH225、TGLA126、TGLA122、INRA032、SPS115、INRA037、CSSM66、TGLA53、HAUT27。 4.应用此12个微卫星基因座鉴定体系对1626头内蒙古乌拉盖地区的中国西门塔尔牛进行了亲子鉴定。结合排除法和似然法,最终本研究为406头子代找到了它们的亲生父亲,386头找到了它们的亲生母亲,确定了80个亲子对,鉴定的置信度均在80%以上,可为以后的育种工作提供准确的基础资料。

关键词：微卫星排除法似然法亲缘关系鉴定中国西门塔尔牛

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SNP用于新疆绵羊亲子鉴定的生物信息学方法研究

SNP用于新疆绵羊亲子鉴定的生物信息学方法研究

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作者：王悦新疆大学

学位级别：硕士

近年来,畜禽群体育种技术的不断发展使得我国绵羊业取得了极大的进步。但与发达国家相比,我国绵羊产业仍处于初级阶段,绵羊遗传评估技术的滞后更是制约我国绵羊业发展的一个重要问题。错误的系谱记录会在很大程度上降低绵羊遗传评估的... 详细信息

近年来,畜禽群体育种技术的不断发展使得我国绵羊业取得了极大的进步。但与发达国家相比,我国绵羊产业仍处于初级阶段,绵羊遗传评估技术的滞后更是制约我国绵羊业发展的一个重要问题。错误的系谱记录会在很大程度上降低绵羊遗传评估的准确性,进而减缓绵羊群体的遗传进展。为了降低错误系谱对遗传育种造成的负面影响并节约鉴定成本,建立精确完善的系谱已迫在眉睫。而准确的系谱记录信息除了严格的生产管理制度外,更依赖于绵羊个体间亲缘关系的确认。据此,本文研究内容由以下两部分组成:1.验证SNP标记用于新疆不同地方绵羊品种间亲子鉴定的准确性并寻找影响鉴定准确性的主要因素。研究依据国际绵羊基因组学协会（International Sheep Genomics Consortium,ISGC）推荐的SNP标记组合,通过累积非父排除概率（CPE）衡量SNP标记的亲子鉴定效力,由此确定该组合在新疆绵羊品种之间的亲子鉴定准确性,最后利用改进后的似然法验证系谱鉴定结果。结果表明,由ISGC推荐的SNP标记组合在新疆部分绵羊品种间的亲子鉴定准确性可以达到99.9%以上,绵羊个体间亲子关系的分配结果与已有系谱一致。另外研究确定最小等位基因频率（MAF）和SNP标记数量为影响亲子鉴定准确性的主要指标。2.提出一套用于新疆地方绵羊品种亲子鉴定的SNP标记选择优化方案。研究结合新疆地方绵羊品种遗传特性,在对50K中密度SNP芯片质量控制、编码基础上利用蒙特卡罗模拟算法实现SNP标记基因型填充;然后利用主成分分析（PCA）大规模过滤冗余标记,得到候选信息SNP标记组合;再基于贪婪算法,同时结合MAF、标记间的连锁不平衡程度r2和遗传距离各遗传多样性指标作进一步筛选,得到最优信息SNP标记组合;最后通过CPE衡量最优信息SNP标记组合的亲子鉴定效力,并与ISGC公布的SNP标记组合、随机筛选同等数量的SNP标记组合的亲子鉴定效力进行对比。同时,本文还对比了筛选前后SNP标记组合的遗传多样性差异,并通过NJ法构建了新疆13个绵羊品种的系统发育进化树。实验结果表明,本文采取的优化方法得到的132个SNP构成的标记组合相比其他两种标记组合具有更高的亲子鉴定效力,CPE可以达到99.99%以上,并且大大降低了原本鉴定所需标记数量,具有较好的遗传多样性。另外,通过发育树发现该套SNP标记组合还能有效区分不同绵羊品种间亲缘关系的远近。

关键词： SNP标记亲子鉴定效力似然法 PCA 贪婪算法

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