检索结果-内蒙古大学图书馆

应用化工 2021年第7期50卷 1916-1921页

作者：王越婷贾如月刘栋梁邱俊陈国伟姜姗山东科技大学安全与环境工程学院山东青岛266590 山东科技大学化学与生物工程学院山东青岛266590

综述了现阶段分子动力学模拟技术在有机蒙脱石研究领域的进展情况,指出了现有研究中存在的问题并对其应用前景进行了展望。通过总结发现当前研究所存在的问题主要是建立的蒙脱石模型较为理想化,没有充分考虑外界环境因素以及蒙脱石类质... 详细信息

综述了现阶段分子动力学模拟技术在有机蒙脱石研究领域的进展情况,指出了现有研究中存在的问题并对其应用前景进行了展望。通过总结发现当前研究所存在的问题主要是建立的蒙脱石模型较为理想化,没有充分考虑外界环境因素以及蒙脱石类质同象取代位等晶体化学特征对有机蒙脱石层间结构和性能的影响,但随着模拟细节的逐步完善和计算机运算能力的提高,相信分子动力学模拟技术必然会更加广泛、更加深入地应用于有机蒙脱石的研究当中。

关键词：分子动力学模拟技术蒙脱石有机改性应用进展

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基于分子动力学模拟技术探究乳腺癌中MYC蛋白的降解途径

基于分子动力学模拟技术探究乳腺癌中MYC蛋白的降解途径

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作者：苏琦桐大连医科大学

学位级别：硕士

1.研究背景目前,肿瘤已经成为当前医学难以解决的难题之一,而乳腺癌则是女性发病率与死亡率排名第一的恶性肿瘤。乳腺癌患者常面临各种生理、心理压力,而长期暴露于慢性压力下,患者交感神经系统过度兴奋,可导致机体内环境稳态紊乱,激活... 详细信息

1.研究背景目前,肿瘤已经成为当前医学难以解决的难题之一,而乳腺癌则是女性发病率与死亡率排名第一的恶性肿瘤。乳腺癌患者常面临各种生理、心理压力,而长期暴露于慢性压力下,患者交感神经系统过度兴奋,可导致机体内环境稳态紊乱,激活下丘脑-垂体-肾上腺(HPA)轴,促进儿茶酚胺类激素过度分泌进而影响肿瘤进展。肿瘤干细胞是肿瘤组织中一小群具有自我更新、无限增殖及多项分化潜能并能够激活和重构肿瘤组织表型的肿瘤细胞。肿瘤干性标志物是研究肿瘤干细胞的重要靶点,MYC蛋白作为最早发现的肿瘤干性因子之一,研究其在肿瘤中的表达及具体作用机制,有利于为肿瘤患者提供新的临床诊疗方案。分子动力学是以物理,数学和化学为基础,依靠牛顿力学来模拟分子体系的运动,从不同状态的分子体系构成的系统中抽取样本,从而计算体系的构型积分,并以构型积分的结果为基础进一步计算体系的热力学量和其他宏观性质的综合性的模拟方法。利用分子动力学模拟技术能够帮助我们认识生物大分子结构与功能之间的联系,探索分子间的相互作用,以便于更准确的理解分子结构和功能之间的内在关联。2.研究方法(1)(1)通过实时定量PCR实验证明肾上腺素处理后乳腺癌细胞(MDA-MB-231,MCF-7)MYC基因m RNA含量变化;(2)利用Western blot实验检测加入肾上腺素后乳腺癌细胞(MDA-MB-231,MCF-7)MYC蛋白表达水平;(3)利用Western blot实验检测肾上腺素及放线菌酮处理后乳腺癌细胞(MDA-MB-231,MCF-7)MYC蛋白水平变化;(4)利用Western blot实验检测肾上腺素及蛋白酶体抑制剂MG132处理后乳腺癌细胞(MDA-MB-231,MCF-7)MYC蛋白表达水平变化;(5)泛素化实验检测肾上腺素及蛋白酶体抑制剂MG132处理后HEK293T细胞MYC蛋白泛素化水平变化。(2)(1)使用Western blot实验检测不同质粒转染及加肾上腺素处理后,乳腺癌细胞(MDA-MB-231)MYC蛋白表达水平;(2)利用Western blot实验检验敲低USP28后,乳腺癌细胞(MDA-MB-231)中USP28及MYC的蛋白表达水平;(3)利用Western blot实验验证敲低USP28后加肾上腺素处理,乳腺癌细胞(MDA-MB-231)中USP28及MYC的蛋白表达水平;(4)利用Western blot实验检验过表达USP28蛋白后加肾上腺素处理,乳腺癌细胞(MDA-MB-231)中USP28及MYC的蛋白表达水平;(5)泛素化检测敲低USP28蛋白同时加入肾上腺素处理后,HEK293T细胞中MYC蛋白泛素化水平变化。(3)(1)免疫共沉淀实验验证USP28蛋白与MYC蛋白结合情况;(2)分子动力学模拟实验检测MYC蛋白与USP28蛋白结合位点;(3)泛素化实验检验HEK293T细胞中,转染野生型与突变型USP28蛋白后,加入肾上腺素处理后MYC蛋白泛素化水平变化情况。(4)(1)利用Western blot实验检测患者正常组织及肿瘤组织USP28蛋白及MYC蛋白表达水平;(2)免疫组化实验检测乳腺癌患者肾上腺素分泌高低两组患者组织中USP28及MYC的蛋白表达水平;(3)分析USP28蛋白与MYC蛋白表达量与患者预后的相关性。3.研究结果(1)(1)实时定量PCR结果显示,肾上腺素并不影响MYC基因RNA水平;(2)根据Western blot结果,肾上腺素促进乳腺癌细胞MYC蛋白的表达;(3)结合Western blot结果,肾上腺素能显著延长MYC蛋白的半衰期;(4)根据Western blot结果,MG132显著增强MYC蛋白表达,而肾上腺素不能影响MG132对MYC蛋白的作用;(5)泛素化实验结果显示,MG132显著增强MYC蛋白的泛素化水平,而肾上腺素能够逆转MG132引起的MYC蛋白泛素化增强现象。(2)(1)根据Western blot结果,肾上腺素稳定MYC蛋白水平是通过去泛素化酶USP28;(2)根据Western blot结果,去泛素化酶USP28的敲低可导致MYC蛋白表达降低;(3)根据Western blot结果,去泛素化酶USP28的敲低可逆转肾上腺素对MYC蛋白表达的促进作用;(4)根据Western blot结果,过表达去泛素化酶USP28可模拟肾上腺素对MYC蛋白表达的促进作用;(5)泛素化实验结果显示肾上腺素能够减弱由敲低去泛素化酶引起的泛素化水平升高的现象。(3)(1)免疫共沉淀实验现象表明,去泛素化酶USP28能够与MYC蛋白结合;(2)分子动力学模拟实验表明去泛素化酶USP28的催化中心能够与MYC蛋白结合;(3)泛素化实验结果显示高表达突变型USP28不能模拟高表达野生型USP28促进MYC蛋白的去泛素化

关键词：乳腺癌去泛素化酶USP28 MYC 分子动力学模拟技术

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基于分子动力学模拟的超低温SiO_(2)材料开裂影响因素分析

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材料科学与工程学报 2022年第4期40卷 593-600页

作者：吕世明沈才华郭丹陈伟李雪松唐凯保利长大海外工程有限公司广东广州510623 河海大学岩土力学与堤坝工程教育部重点实验室江苏南京210098

本研究针对岩石主要成分SiO_(2)的常见分子结构,运用LAMMPS分子动力学软件构建了SiO_(2)预制裂纹试样微观尺度下裂纹扩展分析数值模拟模型,分析了不同加载速率、力加载方式、不同温度下力加载及模型厚度条件下的裂纹扩展规律,揭示了超... 详细信息

本研究针对岩石主要成分SiO_(2)的常见分子结构,运用LAMMPS分子动力学软件构建了SiO_(2)预制裂纹试样微观尺度下裂纹扩展分析数值模拟模型,分析了不同加载速率、力加载方式、不同温度下力加载及模型厚度条件下的裂纹扩展规律,揭示了超低温下固体材料裂纹起裂扩展的微观影响因素及其规律。研究发现:加载速率变化会引起裂纹扩展路径变化,但不同加载速率下总体势能、动能、区域平均应力以及总体温度的变化规律基本相似;不同温度下力加载,裂纹总长和裂纹平均扩展速率随温度的增加而增加。分子动力学模拟技术能有效反映微观环境对固体介质裂纹扩展的影响规律,为探究岩石类等建筑材料的脆性破坏机理研究提供了新途径。

关键词：分子动力学模拟技术微裂纹扩展脆性破坏 SiO_(2)

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纳米相关技术在页岩油气赋存与流动性评价中的初步应用

纳米相关技术在页岩油气赋存与流动性评价中的初步应用

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第一届全国纳米地球科学学术研讨会暨中国地质学会纳米地质专业委员会成立大会

作者：卢双舫薛海涛李俊乾王森田善思靳亚康薛庆忠刘学峰中国石油大学(华东)非常规油气研究院山东省"致密(页岩)油气勘探开发"2011协同创新中心

泥页岩中蕴含着丰富的油气资源,但由于泥页岩致密、吸附能力强,加上微纳米级孔喉主导,油气在其中的渗流能力极低.吸附及微-纳米孔、喉效应所导致的复杂的流-固作用,使速度滑移、表面力、静电力等在常规宏观-介观尺度的流动中可以忽略不... 详细信息

泥页岩中蕴含着丰富的油气资源,但由于泥页岩致密、吸附能力强,加上微纳米级孔喉主导,油气在其中的渗流能力极低.吸附及微-纳米孔、喉效应所导致的复杂的流-固作用,使速度滑移、表面力、静电力等在常规宏观-介观尺度的流动中可以忽略不计的作用突出体现出来,使其中的渗流不能用达西流等常规的流体力学理论来解释和表征.本文应用分子动力学模拟技术，模拟计算了甲烷及液态烃类在石墨烯(代表有机质)及页岩代表性组成上的吸附特征、渗流特性及影响因素，结果表明液态烷烃在有机质中主要为多层吸附，每个吸附层的厚度约为0.48nm，但吸附层的数目受孔隙大小和流体组分影响。由此可以计算出吸附量占总量的比例。

关键词：泥页岩油气勘探分子动力学模拟技术流动性评价

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上海应物所等研究揭示锂离子嵌入碳纳米管束的精细过程

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化工新型材料 2011年第4期39卷 142-142页

中科院上海应用物理研究所物理生物学实验室宋波和方海平采用最新的量子分子动力学模拟技术，研究了锂离子嵌入碳纳米管束及其在碳纳米管束中扩散的动态行为。

关键词：锂离子嵌入纳米管束上海分子动力学模拟技术物理研究所碳动态行为实验室

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单晶铜表面划擦过程模拟

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应用科技 2003年第10期30卷 49-51页

作者：程东胡理琳严志军严立大连海事大学轮机工程学院辽宁大连116026 青岛远洋船员学院机电系山东青岛266071

应用分子动力学模拟技术模拟刚性针尖在单晶铜表面的划擦过程,探讨在微观领域材料的摩擦磨损特性,为进一步探讨纳米摩擦模拟技术及微观领域材料特性奠定基础.模拟结果表明,在材料微观划擦机理中,针尖的摩擦阻力来自于基体表面位错的堆积... 详细信息

应用分子动力学模拟技术模拟刚性针尖在单晶铜表面的划擦过程,探讨在微观领域材料的摩擦磨损特性,为进一步探讨纳米摩擦模拟技术及微观领域材料特性奠定基础.模拟结果表明,在材料微观划擦机理中,针尖的摩擦阻力来自于基体表面位错的堆积,同时,位错在基体中的传播速度对摩擦阻力也有影响.

关键词：分子动力学模拟技术单晶铜摩擦阻力磨损特性划擦过程位错计算机模拟

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