检索结果-内蒙古大学图书馆

宇航材料工艺 2025年第1期55卷 29-36页

作者：杨沛文张东杨小平李刚北京化工大学有机无机复合材料国家重点实验室北京100029 航天材料及工艺研究所北京100076

基于双马树脂固化反应机理,采用动态原位固化程序分别开发了双马预聚与交联模拟程序,以两步法构建了耐高温双马树脂的分子动力学(MD)模型,并对其模型结构、热机械性能与树脂刚度进行了预测。双马树脂在预聚和交联过程的固化反应转化率... 详细信息

基于双马树脂固化反应机理,采用动态原位固化程序分别开发了双马预聚与交联模拟程序,以两步法构建了耐高温双马树脂的分子动力学(MD)模型,并对其模型结构、热机械性能与树脂刚度进行了预测。双马树脂在预聚和交联过程的固化反应转化率以及固化模型密度均与实际值基本吻合,证明了动态原位固化程序实现了实验过程的固化反应;同时,从树脂前驱体到预聚体再到交联模型的模拟固化过程中,树脂模型从高黏性液体状态逐渐向高密度网络结构的固体聚合物状态转变,验证了固化程序的合理性;基于双马树脂固化模型的密度、体积变化率和弹性刚度矩阵预测的玻璃化转变温度和杨氏模量与实验结果接近,证实了此双马树脂模型的可靠性及对双马树脂体系的适配性。

关键词：耐高温双马分子动力学模拟动态原位固化程序转化率玻璃化转变温度杨氏模量

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基于虚拟筛选和分子动力学模拟发现新型ProX配体

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食品与发酵工业 2025年第8期51卷 8-12页

作者：许文静孙蓉周贤轩合肥工业大学食品与生物工程学院安徽合肥230009

大肠杆菌的ProX蛋白能够结合甘氨酸甜菜碱,协助细胞抵抗外界环境的渗透胁迫。为了解大肠杆菌的渗透调控机制,开发新的天然细菌渗透调节剂,该实验旨在寻找能与ProX结构域结合的潜在配体。该研究采用高通量虚拟筛选和分子对接技术在MedChe... 详细信息

大肠杆菌的ProX蛋白能够结合甘氨酸甜菜碱,协助细胞抵抗外界环境的渗透胁迫。为了解大肠杆菌的渗透调控机制,开发新的天然细菌渗透调节剂,该实验旨在寻找能与ProX结构域结合的潜在配体。该研究采用高通量虚拟筛选和分子对接技术在MedChemExpress的天然化合物库中筛选出潜在配体化合物,并通过分子力学-广义波恩表面积计算和100 ns分子动力学模拟验证可信度。结果显示,D-荞麦碱通过氢键和疏水相互作用与ProX活性位点的关键残基(如GLY141、GLU20、ILE17、TRP140、TRP188和TYR186)之间存在强烈的相互作用,且D-荞麦碱-ProX复合物的柔性对接得分(-12.266 kcal/mol)和吉布斯结合自由能(-40.05 kcal/mol)均优于甘氨酸甜菜碱-ProX复合物的柔性对接得分(-12.194 kcal/mol)和吉布斯结合自由能(-35.31 kcal/mol)。研究结果表明,D-荞麦碱与ProX蛋白结构域形成的复合物具有极高稳定性,具有作为新型渗透调节剂的潜力,这项研究为新型渗透调节抑制剂或相容性溶质的设计和研发提供了新的思路和方法。

关键词： ProX D-荞麦碱渗透调控虚拟筛选分子动力学模拟

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纳米尺度下水液滴撞击固体表面润湿性行为的分子动力学模拟

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原子与分子物理学报 2025年第2期42卷 91-97页

作者：王美婷祁影霞陶杰陈曦杨宇水张蕾刘妮杨果成上海理工大学能源与动力工程学院上海200093 上海海立集团股份有限公司上海201206

本文采用分子动力学方法研究纳米尺度下水液滴碰撞铜壁面的润湿过程,水滴温度和固液作用强度对润湿性行为的影响以及直径为4.67 nm球形液滴在273 K-353 K温区、固液作用强度在1-3范围内,水滴的润湿行为和平衡接触角与温度、固液作用强... 详细信息

本文采用分子动力学方法研究纳米尺度下水液滴碰撞铜壁面的润湿过程,水滴温度和固液作用强度对润湿性行为的影响以及直径为4.67 nm球形液滴在273 K-353 K温区、固液作用强度在1-3范围内,水滴的润湿行为和平衡接触角与温度、固液作用强度之间的变化关系.研究结果显示:液滴在不同润湿性壁面上会产生明显不同的润湿演化特性.模拟结果表明对于亲水材料,由于壁面附近水分子所受的势能束缚随温度升高而增强,平衡接触角则相应减小;对于疏水材料,由于随温度的升高分子之间增加的势能大于固液之间增加的势能而表现出平衡接触角随着温度升高而增大的趋势.因此,针对其材料亲水性能,可以通过改变温度影响其润湿行为,从而提高传热、传质和自清洁性能.

关键词：润湿性接触角分子动力学模拟纳米液滴

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官能团修饰对石墨烯/石蜡复合相变材料热导率影响的分子动力学模拟研究

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化工新型材料 2025年第2期53卷 163-169页

作者：吴学红韦新郎旭峰刘梦瑶郑州轻工业大学郑州450000

石蜡(PA)作为相变储能的储能介质因导热系数低限制了其在工业领域的应用,重点探究不同功能化石墨烯与石蜡共掺对复合相变材料(CPCM)热导率及玻璃化转变温度的影响,建立了纯十八烷体系模型、未功能化石墨烯(GN)以及分别接枝羟基(—OH)、... 详细信息

石蜡(PA)作为相变储能的储能介质因导热系数低限制了其在工业领域的应用,重点探究不同功能化石墨烯与石蜡共掺对复合相变材料(CPCM)热导率及玻璃化转变温度的影响,建立了纯十八烷体系模型、未功能化石墨烯(GN)以及分别接枝羟基(—OH)、氨基(—NH_(2))和羧基(—COOH)官能团的石蜡/功能化石墨烯复合体系模型。使用非平衡分子动力学方法得出了材料的热导率、玻璃化转变温度。通过计算体系结构参数,从均方位移、径向分布函数分子层面阐释了材料热力学性能增强的内在机理。结果表明:各项石蜡复合相变材料体系热性能均有不同幅度的提升,其中PA/GN-NH_(2)在热力学性能上较其他掺杂体系提升最为明显,其热导率较掺杂前提升了69.19%、玻璃化转变温度提升了2.3%;从均方位移(MSD)可以看出,GN的引入提高了玻璃化转变温度,增强了体系的稳定性,尤其以GN-NH_(2)最为明显,玻璃化温度达到307K,从径向分布函数看出,添加GN可以显著改变烷烃分子有序度,改善热输运效果。所得结果可为复合相变材料的掺杂设计、性能调控提供理论支持。

关键词：复合相变材料功能化石墨烯热导率分子动力学模拟

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透骨消痛胶囊异病同治关节炎:网络药理学、分子对接及分子动力学模拟分析

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中国组织工程研究 2025年第24期29卷 5093-5101页

作者：林亦欣王文义雷晓庆马德尊黄艳峰付长龙叶锦霞福建中医药大学中西医结合研究院福建省福州市350122 福建中医药大学科技创新与转化中心福建省福州市350122 福建省中西医结合老年性疾病重点实验室福建省福州市350122

背景:课题组前期研究发现透骨消痛胶囊在临床上不仅可用于治疗骨关节炎,对类风湿性关节炎及痛风性关节炎也有较好的疗效,但目前对其“异病同治”3种骨关节疾病的具体作用机制尚不清楚。目的:通过整合网络药理学、分子对接技术及分子动... 详细信息

背景:课题组前期研究发现透骨消痛胶囊在临床上不仅可用于治疗骨关节炎,对类风湿性关节炎及痛风性关节炎也有较好的疗效,但目前对其“异病同治”3种骨关节疾病的具体作用机制尚不清楚。目的:通过整合网络药理学、分子对接技术及分子动力学模拟探讨透骨消痛胶囊“异病同治”骨关节炎、类风湿性关节炎及痛风性关节炎的作用及机制。方法:通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)、Swiss Target Prediction数据库检索透骨消痛胶囊活性化学成分及其对应的靶点;借助GeneCards和OMIM数据库获得骨关节炎、类风湿性关节炎及痛风性关节炎的疾病基因;使用Cytoscape3.7.2软件构建药物-成分-疾病-靶点网络图及蛋白互作网络,利用Daivd数据库进行GO分析和KEGG通路富集分析;使用CB-DOCK2网站进行分子对接模拟,并使用GROMACS2020.6软件进行分子动力学模拟。结果与结论:(1)筛选出透骨消痛胶囊活性成分50个,潜在靶点184个,与3种骨关节疾病的交集靶点29个;(2)根据交集靶点的GO富集分析发现透骨消痛胶囊治疗3种骨关节疾病的关键基因功能为细胞对脂多糖的反应、炎症反应、细胞外基质、蛋白质结合、锌离子结合等;(3)KEGG分析关键通路为白细胞介素17信号通路、肿瘤坏死因子信号通路、NOD样受体和Toll样受体信号通路;(4)根据PPI网络确定6个核心靶点(白细胞介素6、白细胞介素1β、前列腺素内过氧化物合酶1、前列腺素内过氧化物合酶2、细胞色素P4501A2、C-X-C趋化因子配体8);(5)分子对接结果证实(+)-儿茶素、β-谷甾醇、山奈酚、杨梅酮、川芎内酯等具有良好的构效关系,分子动力学模拟进一步证实CYP1A2与川芎内酯能稳定结合,佐证了网络药理学及分子对接结果。提示透骨消痛胶囊可能通过作用于白细胞介素1β、前列腺素内过氧化物合酶1、前列腺素内过氧化物合酶2、CYP1A2等靶点,调控白细胞介素17信号通路、肿瘤坏死因子信号通路等对骨关节炎、类风湿性关节炎及痛风性关节炎发挥“异病同治”的作用。

关键词：透骨消痛胶囊异病同治骨关节炎类风湿性关节炎痛风性关节炎整合药理学分子对接技术分子动力学模拟工程化组织构建

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基于分子动力学模拟的氧化石墨烯改性沥青界面力学性能研究

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武汉科技大学学报 2025年

作者：黄立新苏广厦罗伟伦广西大学土木建筑工程学院广西大学工程防灾与结构安全教育部重点实验室

本文采用分子动力学模拟方法，研究了氧化石墨烯改性沥青的界面力学性能。首先搭建氧化石墨烯沥青复合材料模型，然后通过界面的模拟拉拔实验，计算得到氧化石墨烯改性沥青的界面力学性能，探讨了温度、氧化率、石墨烯氧化类型及拉拔速... 详细信息

本文采用分子动力学模拟方法，研究了氧化石墨烯改性沥青的界面力学性能。首先搭建氧化石墨烯沥青复合材料模型，然后通过界面的模拟拉拔实验，计算得到氧化石墨烯改性沥青的界面力学性能，探讨了温度、氧化率、石墨烯氧化类型及拉拔速率对界面力学性能的影响。结果表明，当温度低于玻璃化转换温度时，界面应力最大值随温度升高而增大，当温度超过玻璃化转换温度后，界面应力最大值随温度升高而减小，温度对氧化石墨烯改性沥青界面力学性能具有较大影响。当氧化率从0逐步增加到10%时，界面应力最大值不断增大，对界面的黏结性能有促进作用。当氧化率从10%逐步增加到30%时，界面应力最大值不断减小，导致界面黏结性能下降。在氧化率不变的情况下，界面应力最大值随着羧基占比增加而减小，羟基和羧基两种含氧官能团的比例对界面黏结性能有较大影响。随着拉拔速率提高，界面应力最大值增加，拉拔速率对界面黏结性能也有影响。

关键词：分子动力学模拟氧化石墨烯沥青复合材料界面力学性能黏结性能

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分子动力学模拟辅助材料科学基础教学探索

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江西化工 2025年第1期41卷 106-109,113页

作者：徐燕卢晓于昊杜惠平杨泽山东科技大学储能技术学院山东青岛266590

材料科学基础是进行材料设计、制备及开发的基础,也是从事材料学研究的必备知识。本文针对材料科学基础课程的教学现状,结合计算机辅助材料学研究的前期基础,尝试将分子动力学模拟应用到材料科学基础教学过程中。首先,分析了材料科学基... 详细信息

材料科学基础是进行材料设计、制备及开发的基础,也是从事材料学研究的必备知识。本文针对材料科学基础课程的教学现状,结合计算机辅助材料学研究的前期基础,尝试将分子动力学模拟应用到材料科学基础教学过程中。首先,分析了材料科学基础教学过程中存在的问题并对分子动力学模拟进行了概述;然后详细阐述了如何利用分子动力学模拟辅助材料科学基础课程的教学过程,包括原子结构分布可视化辅助晶体结构学习、分子模拟轨迹辅助基本理论讲解以及通过模拟纳米材料在能源领域的应用,拓宽学生视野三个方面。这一方法将促进材料科学基础教学过程的现代化,并为其他相关学科提供新的教学策略。

关键词：材料科学基础教学分子动力学模拟教学策略教学现代化

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基于分子动力学模拟的老化沥青再生机理研究

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重庆交通大学学报(自然科学版) 2025年第3期44卷 26-32页

作者：乔建刚张帅泽河北工业大学土木与交通学院天津300401

利用分子动力学软件Materials Studio构建老化和未老化的12组分沥青分子模型,以研究在不同模拟温度、老化程度和再生剂掺量下老化沥青的再生机理,并通过沥青动力黏度试验对分子动力学模拟结果进行验证。结果表明:随着温度提升,扩散系数... 详细信息

利用分子动力学软件Materials Studio构建老化和未老化的12组分沥青分子模型,以研究在不同模拟温度、老化程度和再生剂掺量下老化沥青的再生机理,并通过沥青动力黏度试验对分子动力学模拟结果进行验证。结果表明:随着温度提升,扩散系数对温度的敏感性降低,增速变缓;再生剂对老化沥青模型扩散系数提升幅度影响大,再生剂在老化沥青中的扩散速度更快;随着再生剂掺量的增加,老化沥青模型扩散系数的增幅减小,当掺量达到10%后扩散系数基本不再升高;老化沥青动力黏度随再生剂掺量的增加而减小,表明沥青流动性增加,扩散性能提升,这与纳微观尺度分子动力学模拟结果一致。

关键词：道路工程分子动力学模拟老化沥青再生剂扩散系数

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脂质颗粒分子动力学模拟及其体外构建研究进展

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粮食与油脂 2025年第1期38卷 12-16页

作者：马学婧王淇贾荣盛任敬媛王悦宁曲欣蕊沧州师范学院生命科学系河北沧州061001

介绍了脂质颗粒的分子动力学模型及其在脂滴研究中的应用,总结了脂质颗粒的体外构建方法,论述了脂质颗粒在生物医学和食品工业领域中的应用现状,以期为脂质颗粒的进一步研究和应用提供理论参考。

关键词：脂质颗粒分子动力学模拟体外构建食品开发

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基于网络药理学、分子动力学模拟和体外实验验证探讨骨方颗粒治疗骨质疏松症作用机制

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中国中医药信息杂志 2025年第3期32卷 42-50页

作者：陈小晴黄杨玲李姗姗梁春波宫云昭陈巍辽宁中医药大学辽宁沈阳110847 辽宁中医药大学附属第二医院辽宁沈阳110034 北部战区总医院辽宁沈阳110016

目的通过网络药理学、分子动力学模拟和体外实验验证,探讨骨方颗粒治疗骨质疏松症的潜在靶点和作用机制。方法通过TCMSP数据库和文献获取骨方颗粒的有效成分,利用SwissTargetPrediction数据库预测相关靶点。通过蛋白相互作用网络分析和... 详细信息

目的通过网络药理学、分子动力学模拟和体外实验验证,探讨骨方颗粒治疗骨质疏松症的潜在靶点和作用机制。方法通过TCMSP数据库和文献获取骨方颗粒的有效成分,利用SwissTargetPrediction数据库预测相关靶点。通过蛋白相互作用网络分析和机器学习模型筛选药物核心靶点,绘制独立验证数据集的受试者工作特征曲线以评估模型的预测性能。使用基因集富集分析核心靶点的表达和通路。应用分子动力学模拟分析化合物-靶点复合物的结构稳定性和相互作用。采用CCK-8法筛选药物的非细胞毒性浓度,以低、中、高浓度含药血清分别处理RAW264.7细胞,通过TRAP染色法计数破骨细胞,qRT-PCR和Western blot检测相关基因和蛋白表达。结果通过网络药理学分析获得骨方颗粒潜在有效成分251个、相关靶点1078个,其中核心靶点SRC和TNF的高表达主要与破骨细胞分化、MAPK信号通路和PI3K/Akt信号通路相关。分子动力学模拟显示,核心活性成分Glabridin与SRC、TNF靶蛋白具有较强的稳定性及相互作用。骨方颗粒各浓度组TRAP染色阳性细胞数量较RANKL组明显减少(P<0.01,P<0.001);骨方颗粒含药血清可显著降低NFATc1、CTSK、SRC、TNF-αmRNA表达,并显著下调NFATc1、CTSK、p-SRC、TNF-α蛋白表达(P<0.05,P<0.01,P<0.001)。结论骨方颗粒可能通过下调NFATc1、CTSK、p-SRC、TNF-α表达抑制破骨细胞分化,从而减缓骨质疏松症的病理进程。

关键词：骨质疏松症骨方颗粒网络药理学分子动力学模拟破骨细胞

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