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  • 1 篇 工学
    • 1 篇 计算机科学与技术...

主题

  • 1 篇 并行计算
  • 1 篇 序列库
  • 1 篇 加速blast算法
  • 1 篇 高性能编程

机构

  • 1 篇 中国科学院基因组...
  • 1 篇 中国科学院研究生...
  • 1 篇 香港浸会大学
  • 1 篇 浪潮集团高效能服...

作者

  • 1 篇 谢海波
  • 1 篇 张清
  • 1 篇 褚晓文
  • 1 篇 万宁
  • 1 篇 赵开勇
  • 1 篇 于军

语言

  • 1 篇 中文
检索条件"主题词=加速BLAST算法"
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使用GPU加速blast算法初探
使用GPU加速BLAST算法初探
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2009年全国理论计算机科学学术年会
作者： 万宁 谢海波 张清 赵开勇 褚晓文 于军 中国科学院基因组科学及信息重点实验室 北京100029 中国科学院研究生院 北京100049 浪潮集团高效能服务器和存储技术国家重点实验室 北京100085 浪潮集团高效能服务器和存储技术国家重点实验室 北京100085 香港浸会大学计算机系 香港 香港浸会大学计算机系 香港 中国科学院基因组科学及信息重点实验室 北京100029
应用GPU通用高性能编程技术实现了一种加速blast算法的新方法。blast是目前最常用的用于生物序列查询比对的算法和软件包,其处理速度受到串行化执行和磁盘I/O等因素的影响。本文通过实验分析了blast软件包中的典型程序blastN的运行热点... 详细信息
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