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动物毒素与人类疾病——从单一成分到组学研究,从理化性质到疾病机理,从粗毒利用到理性药物设计

Zoological Research 2010年第1期31卷 2-16页

作者：吕秋敏赖仞张云中国科学院和云南省动物模型与人类疾病机理重点实验室中国科学院昆明动物研究所云南昆明650223

为了适应环境,很多动物在长期的进化过程中演化出了丰富的毒素及相关分泌物。这些物质中包含了高活性、作用专一的蛋白和多肽。由于它们作用的特异性和专一性,成为蛋白质多肽结构与功能研究的良好模型,也成为研究人类自身生理病理机制... 详细信息

为了适应环境,很多动物在长期的进化过程中演化出了丰富的毒素及相关分泌物。这些物质中包含了高活性、作用专一的蛋白和多肽。由于它们作用的特异性和专一性,成为蛋白质多肽结构与功能研究的良好模型,也成为研究人类自身生理病理机制的工具和线索,同时也是开发临床诊断试剂和治疗药物的天然宝库。该文综述了中国科学院昆明动物研究所30多年来立足于我国丰富的有毒动物资源,对陆生有毒动物,包括蛇毒、两栖类皮肤分泌物及节肢动物唾液腺分泌物等的主要研究工作,总结了从单一成分到组学研究、从理化性质到人类疾病机理、从粗毒利用到理性药物设计等的发展历程,并对今后的研究提出一些建议。

关键词：动物毒素蛇毒两栖动物皮肤分泌物节肢动物昆虫唾液腺

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动物毒素与肾脏损害

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肾脏病与透析肾移植杂志 2009年第1期18卷 56-62页

作者：谢红浪陈惠萍南京军区南京总医院解放军肾脏病研究所南京210002

动物毒液或毒素相关的疾病是热带地区常见的疾病,每年全世界约有500万例蛇咬伤、蝎螫伤及昆虫刺伤过敏反应的病例,约10万人死亡,其中绝大部分发生在热带~([1]);我国各地每年亦有散发成群发报道.

关键词：动物毒素肾脏损伤血流动力学

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动物毒素抗肿瘤作用研究进展

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中国新药杂志 2006年第13期15卷 1044-1047页

作者：孙捷高莉单保恩河北医科大学科技总公司 2. 河北师范大学生命科学学院 3. 河北医科大学第四医院科研中心

某些动物毒素如蝎毒、蛇毒、蟾蜍毒、蜂毒、蜈蚣毒和蜘蛛毒在体内和体外对肿瘤细胞的增殖均具有抑制作用。现对动物源性毒素的抗肿瘤药理作用进行总结,为研究开发新型抗肿瘤药提供思路和方法。

关键词：动物毒素抗肿瘤活性药理作用

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动物毒素来源的抗肿瘤活性肽研究进展

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时珍国医国药 2010年第12期21卷 3338-3339页

作者：舒勇攀周慧韩玉梅重庆理工大学药学与生物工程学院重庆400050

文章在简要介绍多肽药物特点的基础上,重点对近年来从动物毒素中发现的抗肿瘤活性肽进行了总结和讨论,指出从动物毒素中获得抗肿瘤多肽已成为开发抗癌药物的重要途径,具有很好的前景,但是在物质基础、药理作用及制剂等方面还需要进一步... 详细信息

文章在简要介绍多肽药物特点的基础上,重点对近年来从动物毒素中发现的抗肿瘤活性肽进行了总结和讨论,指出从动物毒素中获得抗肿瘤多肽已成为开发抗癌药物的重要途径,具有很好的前景,但是在物质基础、药理作用及制剂等方面还需要进一步深入研究。

关键词：动物毒素抗肿瘤多肽药物开发

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生态生物化学(七):动物毒素及其防御作用

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生态学杂志 1990年第6期9卷 68-73页

作者：李绍文北京大学生物系

所有的动物在种内个体之间都需要有信息交流。营社会性生活的种类,不同个体之间必须进行频繁的信息交流才能协调彼此的活动;群居性种类也需要在觅食和御敌等方面交流信息,以保证种族的繁衍。即使是独居的种类,

关键词：生态生物化学动物毒素化学防御

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基于氨基酸组分和支持向量机的动物毒素的预测

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内蒙古大学学报（自然科学版） 2009年第4期40卷 443-448页

作者：杨磊李前忠左永春李涛内蒙古大学物理科学与技术学院理论生物物理研究室呼和浩特010021

动物毒素是一种具有非常广泛用途的生物毒素,有必要提出一种能够快速、准确预测动物毒素的理论算法.基于动物毒素蛋白质序列的二肽组分信息,提出了一种离散增量结合支持向量机的ID-SVM的算法,并使用此算法对不同序列相似性的动物毒素进... 详细信息

动物毒素是一种具有非常广泛用途的生物毒素,有必要提出一种能够快速、准确预测动物毒素的理论算法.基于动物毒素蛋白质序列的二肽组分信息,提出了一种离散增量结合支持向量机的ID-SVM的算法,并使用此算法对不同序列相似性的动物毒素进行了预测,取得了较好的结果.为了说明ID-SVM算法在预测生物毒素方面的优越性,在这里将ID-SVM算法应用到Saha和R aghava构建的细菌毒素和非毒素的数据库上,预测结果显示ID-SVM算法的预测结果高于Saha和R aghava所用算法的结果.

关键词：动物毒素离散增量支持向量机序列相似性

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转录因子结合位点和动物毒素的分析与预测

转录因子结合位点和动物毒素的分析与预测

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作者：杨磊内蒙古大学

学位级别：博士

转录因子结合位点的识别是阐明基因转录调控机制的重要环节,准确的转录因子结合位点的预测算法将有助于人们识别转录因子的目标基因,进而研究其在上游调控区中的位置对转录调控的影响。然而,目前存在的预测转录因子结合位点的算法所得... 详细信息

转录因子结合位点的识别是阐明基因转录调控机制的重要环节,准确的转录因子结合位点的预测算法将有助于人们识别转录因子的目标基因,进而研究其在上游调控区中的位置对转录调控的影响。然而,目前存在的预测转录因子结合位点的算法所得结果的特异性普遍较低,因此有必要提出一种新的有效的理论预测算法。动物毒素能直接作用于药物作用靶点,这使得动物毒素成为研究药物靶点的重要工具。动物毒素还在离子通道的研究、药物发现和杀虫剂的合成方面有广泛的应用。因此,预测动物毒素就变得非常重要,有必要提出-种能准确鉴别动物毒素的理论算法。本文以转录因子结合位点、动物毒素、神经毒素、细胞毒素、突触前神经毒素和突触后神经毒素作为研究对象,利用位置关联性打分方程(positioncorrelation scoring function, PCSF)、离散增量(increment of diversity, ID)、支持向量机(Support Vector Machine, SVM)和朴素贝叶斯分类器(Naive Bayes Classifier,NB)四类算法对它们进行了预测研究。本文的研究工作如下：首先,从转录因子结合位点数据库JASPAR选出8种实验上证实的没有冗余的转录因子结合位点数据,结合位置保守性和伪计数,构建了位置关联方程,通过定义位置关联性打分方程的最佳阈值,使得打分方程在此最佳阈值下所得结果的假阳率较低。同时为了比较打分方程在转录因子结合位点方面的预测能力,本文将打分方程与MATCHTM中所使用的位置权重矩阵进行了比较,结果显示打分方程的预测能力优于位置权重矩阵的预测能力。其次,从动物毒素数据库ATDB下载了全部的动物毒素,用Saha和Raghava工作中提供的非毒素的蛋白质序列作为负集,利用PISCES软件对动物毒素和非毒素进行序列相似性比对,构建了序列相似小于25%、40%、60%、80%和90%的数据集合。分别选取20种氨基酸组分、400种二肽组分、6种亲疏水组分、36种二肽亲疏水组分作为离散增量算法的参数,对不同序列相似性的动物毒素数据集进行了预测。结果表明：离散增量算法在以二肽组分作为参数时预测结果最好；5种不同序列相似性的动物毒素数据集的预测结果随序列相似性变化较小。为了进一步提高动物毒素的预测精度,本文对4种不同的离散增量值进行组合并作为支持向量机的输入参数,对动物毒素进行了预测,结果显示：支持向量机的预测结果优于离散增量算法的预测结果。同时本文还对神经毒素和细胞毒素进行了预测。此外,为了将支持向量机和其它的预测算法进行比较,这里将支持向量机应用到Saha和Raghava构建的神经毒素的数据库上,预测结果显示：本文所使用的支持向量机的预测结果优于Saha和Raghava所提出的算法取得的预测结果。最后,本文从Swiss-Prot数据库上下载了突触前和突触后神经毒素的蛋白质序列,参照数据库给出的注释信息,统计了突触前和突触后神经毒素的二硫键类型及其二硫键数目的分布。从ATDB和Swiss-Prot数据库上下载了突触前和突触后神经毒素的蛋白质序列,分别构建了序列相似性小于80%的数据集1和数据集2。本文采用了5种方法选取参数：(1)：蛋白质序列的二肽参数；(2)：MRMR软件提取的50个二肽参数；(3):MEME搜索到的模体特征；(4):Prosite搜索到的模体特征；(5):Interpro搜索到的模体特征。本文还对这5种参数进行了组合,一共得到了12类参数,并将这12类参数作为离散增量和朴素贝叶斯分类器的参数,在Jackknife检验下,对数据集1和2进行预测。预测结果表明：(1)：增加模体参数的预测结果好于二肽参数时的预测结果；(2)：使用模体参数和50个二肽参数时,突触前神经毒素和突触后神经毒素的预测结果最好。

关键词：转录因子结合位点动物毒素模体特征离散增量朴素贝叶斯分类器

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转录组和蛋白质组在动物毒素研究中的应用

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药物生物技术 2018年第4期25卷 340-344页

作者：曹园高美风孔毅中国药科大学生命科学与技术学院江苏南京210009

动物毒素因其结构新颖、生物活性强等特点一直以来都是研究的热点,是药物开发和临床应用等多领域重要的资源。随着转录组测序技术的快速发展和成本降低,使得转录组学研究更加深入,生物质谱技术的不断更新和完善,蛋白质组学研究进入了新... 详细信息

动物毒素因其结构新颖、生物活性强等特点一直以来都是研究的热点,是药物开发和临床应用等多领域重要的资源。随着转录组测序技术的快速发展和成本降低,使得转录组学研究更加深入,生物质谱技术的不断更新和完善,蛋白质组学研究进入了新的高度。动物毒素的研究最初是通过分离单一组分进行结构和功能分析,而如今将转录组测序分析和基于质谱的蛋白质组学技术联合运用到动物毒素的研究中,并通过数据库搜索软件实现质谱数据到蛋白的鉴定,使得动物毒素的研究进入了新的发展阶段,在动物毒素蛋白鉴定,新活性蛋白发现,进化分析等多方面发挥了重要作用。文章综述了近年来通过转录组学和蛋白质组学联用在多种动物毒素研究中的具体应用。

关键词：转录组测序技术蛋白质组生物质谱动物毒素蛋白鉴定

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动物毒素的应用

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生物学通报 1984年第6期 10-12页

作者：钱锐中国科学院昆明动物研究所

从海洋到陆地,从单细胞动物(硬皮鞭毛虫)到哺乳动物(鸭咀兽、地鼠)都广泛分布着多种多样的有毒动物,其中仅海洋动物就达一千多种(刺丝虫70种,腹足类85种,棘皮动物80种,刺毒鱼类220种、毒鱼类500种),毒蛇250种(蝰科、海蛇科、眼镜蛇科和... 详细信息

从海洋到陆地,从单细胞动物(硬皮鞭毛虫)到哺乳动物(鸭咀兽、地鼠)都广泛分布着多种多样的有毒动物,其中仅海洋动物就达一千多种(刺丝虫70种,腹足类85种,棘皮动物80种,刺毒鱼类220种、毒鱼类500种),毒蛇250种(蝰科、海蛇科、眼镜蛇科和响尾蛇科),膜翅目700多种(蚂蚁、蜜蜂、黄蜂和胡蜂)。动物毒素的化学结构也是多种多样的,从普通的碳氢化合物(乙醛、酮、脂)、杂环化合物(酚、苯醌),到广泛存在的多肽和蛋白质。既有低分子量、对热稳定的蛇毒、蝎子毒,又有分子量在百万以上、对热不稳定的鱼毒蛋白,还有生物源氨基(蟾蜍毒)、生物碱(火蚁毒、马陆素、蝾

关键词：动物毒素化学结构组份超微结构河豚毒人工合成线粒体粒线体分子生物学蛇毒毒液眼镜蛇新药黑寡妇

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动物毒素主要成分及其功能的研究现状

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安徽农学通报 2008年第14期14卷 143-144,150页

作者：姜鹤宋育泽李伟万杰医学院组胚教研室山东淄博255213

本文综述了现代特种动物中几种常见动物毒素的主要成分及功能。

关键词：动物毒素蛇毒蝎毒特种动物养殖综述

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