检索结果-内蒙古大学图书馆

世界科学技术-中医药现代化 2023年第11期25卷 3515-3522页

作者：刘瓅莹吴巧凤成都中医药大学针灸推拿学院成都610075

单细胞多模态测序技术是近年来检测细胞类型特异性和探索基因调控细胞过程的前沿生物技术方法,根据单细胞不同组学的联合运用,可形成13种组合模式,从而形成了“多维度”、“多尺度”测序的特点。本文从针灸单细胞多模态数据库的建立、... 详细信息

单细胞多模态测序技术是近年来检测细胞类型特异性和探索基因调控细胞过程的前沿生物技术方法,根据单细胞不同组学的联合运用,可形成13种组合模式,从而形成了“多维度”、“多尺度”测序的特点。本文从针灸单细胞多模态数据库的建立、数据的预处理、预测模型的建立进行了分析,提出了具体的路径和策略。采用单细胞多模态测序技术结合传统针灸,是中医药交叉学科现代化发展的有益探索。以针灸单细胞多模态数据为驱动,建立针灸单细胞融合组学预测模型,可以推断针灸单细胞调控异质景观,将有望深度解码针灸治疗疾病的多维细胞调控机制。

关键词：针灸中医药单细胞多模态组学单细胞空间组学

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基于单细胞组学的中药现代研究:技术及思路

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中国中药杂志 2022年第15期47卷 3977-3985页

作者：杨鹏挥金丽君廖杰邵鑫程俊云李璐陆晓燕范骁辉浙江大学药学院中药科学与工程学系浙江杭州310058 组分中药国家重点实验室浙江大学交叉创新中心浙江杭州310058

单细胞组学技术是近年来发展极为迅速的新兴技术之一,可在单细胞尺度上实现多种组学信息的无偏、高通量获取。目前,单细胞组学技术凭借其强大的组织异质性解析力,已成为深入理解组织的功能结构、揭示复杂疾病过程和阐明药物作用机制的... 详细信息

单细胞组学技术是近年来发展极为迅速的新兴技术之一,可在单细胞尺度上实现多种组学信息的无偏、高通量获取。目前,单细胞组学技术凭借其强大的组织异质性解析力,已成为深入理解组织的功能结构、揭示复杂疾病过程和阐明药物作用机制的革命性工具。针对破解中药复杂性、阐明中医药理论现代科学内涵所面临的技术挑战,单细胞组学技术在发现药效物质、构建作用网络和阐明整合调节机制等方面有着巨大的应用潜力,为中医药现代研究带来了新机遇。该文简要介绍了单细胞转录组测序、空间转录组和单细胞多模态组学等代表性单细胞组学技术及其主要应用模式,并在此基础上对采用单细胞组学技术开展中药现代研究的思路和应用场景进行了展望。

关键词：单细胞组学中药现代化空间转录组单细胞多模态组学

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人脐带华通胶来源间充质干细胞及其小细胞外囊泡在组织损伤修复中的应用及精准化探索

人脐带华通胶来源间充质干细胞及其小细胞外囊泡在组织损伤修复中...

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作者：陈鹏弘福建医科大学

学位级别：博士

研究背景人脐带华通胶来源的间充质干细胞（Wharton’s jelly mesenchymal stem cells,WJ-MSCs）以其采集便捷、无创侵入及来源丰富等优势成为组织工程与再生医学中的理想种子细胞之一,在促进创面愈合、抑制瘢痕增生及促进软骨再生等领... 详细信息

研究背景人脐带华通胶来源的间充质干细胞（Wharton’s jelly mesenchymal stem cells,WJ-MSCs）以其采集便捷、无创侵入及来源丰富等优势成为组织工程与再生医学中的理想种子细胞之一,在促进创面愈合、抑制瘢痕增生及促进软骨再生等领域展现出诱人的应用前景。小细胞外囊泡（Small extracellular vesicles,s EVs）作为介导MSCs治疗积极结果的重要旁分泌成分,携带有大量的生物活性物质,具有复制MSCs生物学功能的能力,被认为是天然的纳米治疗剂。因此,从治疗特性来说,MSCs及其衍生物s EVs都是炙手可热的再生医学新工具,探索基于MSCs的细胞治疗及基于MSCs衍生物的无细胞治疗在组织损伤疾病的疗效和潜在的分子机制对于临床策略的选择具有重要意义。此外,在治疗有效的基础上,我们还需考虑治疗的精准化。目前在推进MSCs的临床转化方面面临着重大挑战,如参差不齐的治疗效果及欠佳的稳定性,根本原因在于MSCs的异质性。全面表征并分离同源有效的优势功能亚群是制定MSCs精准化治疗方案的重要举措,而单细胞多模态组学为这一目标的实现提供了有力的技术支持。研究目的第一部分:基于WJ-MSCs衍生物的无细胞治疗,探索WJ-MSCs来源s EVs在骨关节炎（Osteoarthritis,OA）中的治疗作用及机制,为无细胞治疗方案提供理论依据。第二部分:基于WJ-MSCs的精准化治疗,解析体外培养的WJ-MSCs的异质性及其差异性功能来源,并剖析其在同源脐带组织的空间基因表达模式,建立具有高效促进创面修复的优势功能亚群筛选方案。研究方法第一部分:（1）采用组织块培养方法分离、培养WJ-MSCs,并通过流式细胞术检测表面标志物。（2）使用尺寸排阻色谱法提取WJ-MSCs来源的s EVs（WJMSC-s EVs）,并进行形态学、表面标志物及粒径分析。（3）体外实验:使用不同浓度的WJMSC-s EVs（1、5、10、15μg/ml）干预软骨细胞炎症模型,评估细胞增殖和迁移情况。通过与RAW264.7细胞共培养,观察WJMSC-s EVs对巨噬细胞的极化作用。（4）体内实验:前交叉韧带断裂术诱导大鼠OA模型。术后4周进行关节腔内注射治疗。分为假手术组、对照组（注射200μL PBS,每周1次,连续4周）、WJ-MSCs组（单次注射5×10～5个细胞/200μL）、WJMSC-s EVs组（注射200μL,30μg的WJMSC-s EV,每周1次,连续4周）。术后第9周收集膝关节标本,进行大体观察、micro CT扫描、病理学检查及病理学评分。（5）使用蛋白质组学及micro RNA测序进行分子机制的解析。第二部分:（1）WJ-MSCs的单细胞转录组测序:分别获取3个供者P0及P3代WJ-MSCs的单细胞悬液后进行单细胞转录组测序。绘制WJ-MSCs在不同代次、不同供者及不同亚群间的异质性图谱,并结合bulk RNA测序获取全局转录模式,全面表征基因表达变化。（2）优势功能亚群在创面修复中的功能验证:基于单细胞分群结果初步确定具有高效创面修复功能的优势亚群,选定亚群特征基因后采用流式细胞分选术进行亚群富集。体外实验采用Transwell共培养的方式比较优势功能亚群与未分选WJ-MSCs对创面愈合相关细胞增殖和迁移能力的影响;建立野生型AB品系斑马鱼皮肤创面模型,每组斑马鱼均在创面边缘皮下注射10μL的细胞（1×10～4个细胞）或PBS。在术后0,5,15和30天进行创面测量,并计算创面愈合率。（3）华通胶组织的空间转录组测序:选取与sc RNA-seq同源的2条脐带,分别在脐带母体端及胎儿端最末端制备长度3cm的组织块,采用空间转录组测序绘制脐带华通胶组织区域间及区域内的空间表达图谱,并应用SPOTlight分析实现单细胞数据与空间转录组数据的整合。研究结果第一部分:（1）P3代WJ-MSCs高表达CD44、CD73、CD105、CD90,但低表达CD34、CD45、CD19、HLA-DR。WJMSC-s EVs具有典型的圆盘形态,平均直径约69.66 nm,高表达ALIX,TSG101和CD63,但不表达Calnexin。（2）WJMSC-s EVs以浓度依赖性的方式（15μg/ml具有最佳效果）促进软骨细胞的增殖和迁移。此外,WJMSC-s EVs可促使促炎型M1巨噬细胞向抗炎型M2巨噬细胞极化。（3）WJ-MSCs和WJMSC-s EVs均能促进损伤软骨的再生,改善病理学评分,且显著上调软骨组织中II型胶原蛋白并下调MMP13及ADAMTS5蛋白的表达。（4）蛋白质组学及micro RNA测序结果均显示WJMSC-s EVs携带的分子所参与的生物学过程对OA的治疗有重要贡献。它们

关键词：人脐带华通胶来源间充质干细胞小细胞外囊泡单细胞多模态组学异质性组织修复

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