检索结果-内蒙古大学图书馆

苗栗区农业改良场研究汇报 2021年第10期 61-79页

作者：徐培修羅時玟

本研究已建立分子监定蜂花粉来源植物之技术，以rbcL及trnH-psbA双基因条码对花粉DNA进行PCR增幅，与GenBank资料库比对序列以监定植物种类。调查2020年春季南投县名间乡西方蜜蜂蜂场收集之蜂花粉，分离出17种蜂花粉，监定出16种植物，... 详细信息

本研究已建立分子监定蜂花粉来源植物之技术，以rbcL及trnH-psbA双基因条码对花粉DNA进行PCR增幅，与GenBank资料库比对序列以监定植物种类。调查2020年春季南投县名间乡西方蜜蜂蜂场收集之蜂花粉，分离出17种蜂花粉，监定出16种植物，结果显示rbcL单条码种级监别力低，但trnH-psbA单条码即可监定出多种植物。优势粉源植物前三者为藿香蓟（Ageratum conyzoides）、山黄麻（Trema orientalis）、大花咸丰草（Bidens pilosa var. radiata），重量占比分别为21%、21%、12%。台湾植物基因条码资料库的建立，应有助於蜂花粉分子监定应用技术之基础。

关键词：基因條碼蜂花粉西方蜜蜂

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基因条码在条斑紫菜(Pyropia yezoensis)不同品系间种质鉴定中的适用性

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渔业科学进展 2016年第3期37卷 114-119页

作者：曹殿嘉严兴洪上海海洋大学水产与生命学院上海201306 上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室上海201306

为寻找适宜的条斑紫菜(Pyropia yezoensis)品系间种质分子标记鉴定法,利用4种基因条码(RUBISCO Spacer、UPA、Cox2-3和ITS-5.8S)对产自中国和日本的6个条斑紫菜品系的亲缘关系进行了分析研究。结果显示,在6个条斑紫菜品系中,上述4种基... 详细信息

为寻找适宜的条斑紫菜(Pyropia yezoensis)品系间种质分子标记鉴定法,利用4种基因条码(RUBISCO Spacer、UPA、Cox2-3和ITS-5.8S)对产自中国和日本的6个条斑紫菜品系的亲缘关系进行了分析研究。结果显示,在6个条斑紫菜品系中,上述4种基因条码的序列同源性较高,同源性为97.8%–100%,其中,RUBISCO Spacer序列的同源性为100%。UPA序列的同源性分析结果显示,在中国产的LS、B4、HT和TM18品系中,该序列完全相同,但与日本产的GT和ROS-2两个品系的序列有差异,该序列的同源性为99.2%。在6个品系中,Cox2-3和ITS-5.8S序列的同源性相对较低,分别为97.8%–99.2%和98.4%–99.8%。根据UPA、Cox2-3和ITS-5.8S基因条码通过邻接法构建的系统进化树显示,依据ITS-5.8S和UPA序列均能分别区分中国产的4个品系(LS、B4、HT和TM18)与日本产的两个品系(GT和ROS-2),分别形成两个大分支,其聚类结果与实际亲缘关系一致。但利用ITS-5.8S序列均能对中国产的4个品系和日本产的两个品系进行再区分,而利用UPA序列却无法对中国产的4个品系进行再区分,只能区分日本产的两个品系。使用Cox2-3序列则将GT、ROS-2、LS和TM18这4个品系聚成一个大分支,其聚类结果与实际亲缘关系不一致。上述结果说明,利用ITS-5.8S序列对本研究的6个条斑紫菜品系进行种质鉴定,效果最好。

关键词：条斑紫菜基因条码品系种质鉴定

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陕西秦岭非法贸易动物(兽类)基因条码构建及分子鉴定

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基因组学与应用生物学 2016年第3期35卷 568-572页

作者：冯慧汪晓阳冯成利黄原任轶王璐陕西师范大学西安710062 陕西省动物研究所西安710032

现今秦岭珍稀野生动物非法贸易频繁发生,野生动物仅通过外表难以准确鉴定。通过构建陕西省秦岭地区羚牛、林麝、斑羚、鬣羚、金丝猴、黑熊、小麂、毛冠鹿、果子狸、豹猫、野猪、大熊猫、黄鼬、鼬獾、獾15种兽类线粒体DNA Cytb基因条码,... 详细信息

现今秦岭珍稀野生动物非法贸易频繁发生,野生动物仅通过外表难以准确鉴定。通过构建陕西省秦岭地区羚牛、林麝、斑羚、鬣羚、金丝猴、黑熊、小麂、毛冠鹿、果子狸、豹猫、野猪、大熊猫、黄鼬、鼬獾、獾15种兽类线粒体DNA Cytb基因条码,对3例来自秦岭森林公安收缴的无法鉴定的动物肌肉样品进行分子物种鉴定。利用Neighbor-joining法和非加权配对算数平方法,构建分子系统发生树,对比三种待鉴定样品样本和15种动物的Cytb序列的遗传距离和序列相似性。经分析,待鉴定样品A1与斑羚聚为一枝,序列相似性为99.4%遗传距离为0.006;待鉴定样品A2与鬣羚聚为一枝,序列相似性为98.8%遗传距离为0.012;待鉴定样品A3与黑熊聚为一枝,序列相似性最高为100%遗传距离为0.000。从而鉴定出三种物种分别为斑羚、鬣羚和黑熊。基因条码为物种鉴定和野生动物保护提供便利条件。

关键词：非法贸易动物基因条码 Cyt b 分子鉴定

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高通量二代测序基因条码技术在油料作物种类鉴别中的应用

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食品科学 2014年第24期35卷 348-352页

作者：吴亚君杨艳歌李莉王斌刘鸣畅陈颖中国检验检疫科学研究院北京100123

对高通量二代测序基因条码技术在油料作物种类鉴别中的应用进行探索。采用Ion Torrent PGMTM测序技术,分别对橄榄、花生、大豆、油葵、玉米等14种油料作物和小麦、大米的叶绿体核酮糖二磷酸羧化酶/氧化酶大亚基(ribulose-1,5-bisphospha... 详细信息

对高通量二代测序基因条码技术在油料作物种类鉴别中的应用进行探索。采用Ion Torrent PGMTM测序技术,分别对橄榄、花生、大豆、油葵、玉米等14种油料作物和小麦、大米的叶绿体核酮糖二磷酸羧化酶/氧化酶大亚基(ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit,rbc L)基因246 bp聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)产物混合物,及上述作物DNA混合液扩增得到的rbc L基因片段进行测序。结果表明,除小麦外,所有其他作物成分均获得了鉴定。其中,PCR产物混合物中每种作物成分的测序读数数量比例和该成分PCR产物在总产物中的比例接近,说明该技术可以用于定量分析。实验结果初步证实了该技术对混合样品中各作物种类鉴别的准确性,并具有检测效率、流程简便的特点,有望在未来成为食用油标识符合性查验的有力工具。

关键词：二代测序基因条码油料检测

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福建省质检院两项科技项目研究成果填补相关检测技术空白

福建省质检院两项科技项目研究成果填补相关检测技术空白

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中国质量报

作者：陈永江岱

本报讯（陈永江岱）近日，由福建省质检院承担的两项福建省市场监管局科技计划项目《基于基因条码技术鉴别保健食品中植物性原料平台的构建》《应用分子生物学法检测蜂蜜中的植物源性成分与转基因成分》顺利通过验收，研究成果均填补... 详细信息

本报讯（陈永江岱）近日，由福建省质检院承担的两项福建省市场监管局科技计划项目《基于基因条码技术鉴别保健食品中植物性原料平台的构建》《应用分子生物学法检测蜂蜜中的植物源性成分与转基因成分》顺利通过验收，研究成果均填补了目前相关产品质量检测技术的空白，为完善......

关键词：相关检测基因成分基因条码技术鉴别植物性原料福建省

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基因条码（DNA Barcode）在海藻系统学领域中的研究应用

基因条码（DNA Barcode）在海藻系统学领域中的研究应用

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作者：赵小波中国科学院研究生院（海洋研究所）

学位级别：博士

我国海岸线漫长，拥有丰富的海藻资源。同时，我国是海藻养殖大国，海藻养殖的基础理论研究也居世界前列。我国海藻产业的进一步发展需要发掘更多的海藻种质资源，特别是我们没有认识或者已经认识但是尚未进一步研究和利用的海藻资源。... 详细信息

我国海岸线漫长，拥有丰富的海藻资源。同时，我国是海藻养殖大国，海藻养殖的基础理论研究也居世界前列。我国海藻产业的进一步发展需要发掘更多的海藻种质资源，特别是我们没有认识或者已经认识但是尚未进一步研究和利用的海藻资源。这项工作的基础是准确的对这些资源分类鉴定。但是，大型海藻其形态特征易受环境因素的影响，发生不同程度地改变；其次在物种水平上，往往形态特征差异微弱不易鉴定或容易出错。再次，我们对于一部分大型海藻的生活史还缺乏必要的了解，也加大了物种鉴定的难度。因此，如果仅仅依赖于形态学特征进行分类鉴定，即便是受过专门训练的藻类学家在工作时也会遇到不少的困难，甚至产生争议。例如龙须菜的归属问题就存在争议。不同的分类学家按照不同的形态学标准，有的将其归为江蓠属，有的认为其应该从江蓠属中划出。同样，底栖硅藻的分类鉴定也存在相类似的问题。本论文对于海藻的基因条码进行了相关的研究，以便解决这一难题。研究从三个方面入手，内容包括：(1)采集青岛海区潮间带红藻门的样品，对这些样品的COI(细胞色素C氧化酶亚基I), UPA(质体23S rRNA domain V区域)以及ITS(内转录间隔区)序列进行扩增，从中筛选合适的DNA Marker作为红藻标准的基因条码。同时，利用筛选出的基因条码初步研究青岛海区潮下带的红藻资源；(2)分析了我国几种江蓠属海藻的18S rRNA基因、cox2-3间隔区以及RUBISCO间隔区的分子序列，并结合GenBank现有的相关数据进行了分子系统学关系分析，为江蓠属的系统进化，分类提供新的佐证；(3)利用SSU序列和rbcL序列对所分离纯化的底栖硅藻进行初步的鉴定，同时结合形态学方法将样品鉴定到种一级水平。研究结果表明： (1) COI序列与UPA序列均可以区分红藻到种一级水平。其中，COI序列缺乏通用引物，但是种间种内变异度足够好；UPA序列虽然分辨率相对较低，可能不能准确的鉴定亲缘关系较近的物种，但其具有通用引物。因此，本研究提出在以后的分类鉴定中可将两种序列相结合使用，准确鉴定。而ITS序列在部分样品的扩增中发现了多态性的问题，为避免对后续的工作造成干扰，不推荐ITS序列作为红藻标准的DNA Barcode；在潮下带红藻资源调查中，发现了两种以前从未在青岛海区有过记录的大型红藻，分别为冈村蜈蚣藻和裂膜藻。同时，也发现一些具有重要经济价值藻类，例如紫菜等的野生藻床。这些都是十分宝贵的野生基因资源。 (2)江蓠属分子系统学研究中，基于cox2-3间隔区、以及RUBISCO间隔区序列构建的MP进化树较为相似，而与基于18S rRNA构建的进化树略有不同。这主要是由于18S rRNA更为保守的原因；扁江蓠与脆江蓠在三个系统树中均聚合成支，显示了它们之间具有较近的亲缘关系；龙须菜与江蓠属海藻具有较远的遗传距离，在3个进化树中，龙须菜也均位于进化树的基部，单独成支，证实龙须菜并不隶属于江蓠属，且分化相对较早。 (3)首先使用SSU序列对底栖硅藻样品作初步的鉴定，可以将样品鉴定到属或者科一级的水平，减少错误的产生；对于分离纯化四种底栖硅藻。基于扫描电镜与两个序列的比较，将其鉴定为极小舟形藻,假头舟形藻,不定舟形藻和喙头舟形藻。通过分子生物学分析，我们认为不定舟形藻与极小舟形藻存在较近的亲缘关系。

关键词：基因条码红藻江蓠属底栖硅藻硅藻培养

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基于线粒体细胞色素C氧化酶Ⅰ基因序列的细胞种属鉴别及细胞交叉污染分析

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微生物学免疫学进展 2019年第4期47卷 44-47页

作者：王革王云瑾王名强陈汉泉马超兰州生物制品研究所有限责任公司质量检定室甘肃省疫苗工程技术研究中心

目的建立一种快速、简便、敏感和特异的基于线粒体细胞色素C氧化酶I(cytochrome C oxidase subunit I,CoI)基因序列的细胞基质检测方法,用于细胞种属鉴别和不同种属间的细胞交叉污染分析。方法①提取非洲绿猴肾细胞(Vero细胞)、狗肾细胞... 详细信息

目的建立一种快速、简便、敏感和特异的基于线粒体细胞色素C氧化酶I(cytochrome C oxidase subunit I,CoI)基因序列的细胞基质检测方法,用于细胞种属鉴别和不同种属间的细胞交叉污染分析。方法①提取非洲绿猴肾细胞(Vero细胞)、狗肾细胞(MDCK细胞)和牛肾细胞(MDBK细胞)基因组DNA,以PCR扩增相应细胞的线粒体CoI基因保守区的基因条码序列,将扩增产物经琼脂糖凝胶电泳检测其基因片段的大小,并与文献报道的来源于ATCC相应细胞系线粒体CoI基因保守区的基因条码序列片段大小进行对比,以确定细胞的种属类别;②用Vero细胞、MDCK细胞和MDBK细胞的线粒体CoI基因保守区的基因的特异性引物分别与相应细胞和其他不同种属的细胞的基因组DNA进行PCR扩增,检测方法的特异性;用不同浓度的细胞基因组DNA与相应细胞的线粒体CoI基因保守区的基因的特异性引物进行PCR扩增,检测方法的灵敏度;③以不同种属细胞的线粒体CoI基因保守区的基因的特异性引物分别与多种细胞混合液提取的细胞基因组DNA进行PCR扩增,检测细胞间的交叉污染。结果 Vero细胞、MDCK细胞及MDBK细胞线粒体CoI基因保守序列中的基因条码序列片段大小,与来源于ATCC相应细胞系线粒体CoI基因保守序列中的基因条码序列片段大小相符。该方法具备较好的特异性,检测灵敏度为1.0 ng/μL,不同种属间细胞的交叉污染可被检出。结论该方法可有效地判断细胞的种属来源,亦可用于不同种属间细胞交叉污染的分析。

关键词：线粒体细胞色素C氧化酶Ⅰ 基因条码细胞基质种属鉴别交叉污染

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16S rRNA和COI基因条形码在12种观赏鱼种类鉴定中的应用

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福建农业学报 2016年第12期31卷 1267-1272页

作者：陈信忠郭书林龚艳清袁芳许奕宸杨俊萍厦门出入境检验检疫局福建厦门361026

应用通用引物测定观赏鱼市场上价值较高的红尾金龙鱼、黄尾龙鱼、青龙鱼、珍珠龙鱼、银龙鱼、神仙鱼、非洲珠宝鱼、接吻鱼、珍珠毛足鲈、蓝钻石孔雀、孔雀鱼、锦鲤等12种观赏鱼的16SrRNA基因和COI基因部分序列。应用DNA序列分析软件,对... 详细信息

应用通用引物测定观赏鱼市场上价值较高的红尾金龙鱼、黄尾龙鱼、青龙鱼、珍珠龙鱼、银龙鱼、神仙鱼、非洲珠宝鱼、接吻鱼、珍珠毛足鲈、蓝钻石孔雀、孔雀鱼、锦鲤等12种观赏鱼的16SrRNA基因和COI基因部分序列。应用DNA序列分析软件,对这些基因进行同源性比较和系统发育分析。通过GenBank中的核酸BLAST和BOLD SYSTEMS数据库对这些基因序列进行比对,结果表明16SrRNA基因和COI基因可以在物种水平作为基因条码对亚洲龙鱼、珍珠龙鱼、银龙鱼和神仙鱼等观赏鱼进行准确的鉴别,而且应用COI基因构建的系统发育树比16SrRNA基因更加接近现有的鱼类分类体系。但对形态十分相似的慈鲷等观赏鱼,以及红尾金龙鱼、黄尾龙鱼、青龙鱼等同一个物种不同品系的观赏鱼依靠16SrRNA基因或COI基因都无法准确鉴定,需要研究进化速度更快的DNA基因条码。

关键词：基因条码观赏鱼物种鉴定 16S rRNA COI

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七彩神仙鱼和神仙鱼的DNA条形码研究

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检验检疫学刊 2016年第6期26卷 1-6页

作者：陈信忠袁芳许奕宸郭书林龚艳清杨俊萍厦门出入境检验检疫局福建厦门361026 集美大学水产学院

应用通用引物测定了观赏鱼市场上具有较高价值的7个品系七彩神仙鱼和3个品系神仙鱼的16S r RNA基因和CO I基因部分序列,并应用DNA序列分析软件,对这些基因进行了同源性比较和系统发育分析。通过Gen Bank中的核酸BLAST和BOLD SYSTEMS数... 详细信息

应用通用引物测定了观赏鱼市场上具有较高价值的7个品系七彩神仙鱼和3个品系神仙鱼的16S r RNA基因和CO I基因部分序列,并应用DNA序列分析软件,对这些基因进行了同源性比较和系统发育分析。通过Gen Bank中的核酸BLAST和BOLD SYSTEMS数据库对这些基因序列进行比对,结果表明16S r RNA基因和CO I基因可以在物种水平对神仙鱼进行准确鉴定,但对七彩神仙鱼只能进行有限度的鉴别。由于不同品系的七彩神仙鱼或神仙鱼,尽管其体色和斑纹具有明显差异,但16S r RNA基因和CO I基因序列高度相似。因此,对这些观赏鱼依靠16S r RNA基因或CO I基因都无法准确鉴定,需要研究进化速度更快的DNA基因条码。

关键词：基因条码七彩神仙鱼神仙鱼物种鉴定 16S r RNA CO I

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DNA条形码技术在花黄斑蜂鉴定中的应用

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中国农学通报 2015年第32期31卷 22-25页

作者：杨明禄肖丽韩旭陈立强塔里木大学植物科学学院新疆阿拉尔843300 新疆生产建设兵团塔里木畜牧科技重点实验室新疆阿拉尔843300 塔里木大学动物科学学院新疆阿拉尔843300

为鉴定新疆阿拉尔苜蓿田的一种主要传粉昆虫,通过利用基因条码技术与形态特征分析,采用动物基因组DNA小量抽提试剂盒提取虫体基因组总DNA的方法,以鳞翅目通用引物扩增其线粒体细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因片段,切胶纯化后以试剂盒进... 详细信息

为鉴定新疆阿拉尔苜蓿田的一种主要传粉昆虫,通过利用基因条码技术与形态特征分析,采用动物基因组DNA小量抽提试剂盒提取虫体基因组总DNA的方法,以鳞翅目通用引物扩增其线粒体细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因片段,切胶纯化后以试剂盒进行T-载体克隆,挑取阳性克隆送公司测序,获得序列在BOLD数据库中进行分子鉴定;同时根据形态特征进行常规鉴定。结果显示该基因片段序列与吉尔吉斯斯坦的2个黄斑蜂属未鉴定种虫标本相似度最高(99%以上),其次是希腊与俄罗斯的花黄斑蜂(Anthidium florentinum)标本相似度(96%以上),与其他切叶蜂标本序列相似度较低;形态学观察也发现与花黄斑蜂形态描述一致。因此,认定苜蓿田中这种常见黄斑切叶蜂为花黄斑蜂。

关键词：花黄斑蜂 CO I基因基因条码

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