检索结果-内蒙古大学图书馆

作者：王宁中国协和医科大学

学位级别：博士

HSP90是热激蛋白家族(HSP)的主要成员之一，它在细胞中呈高组成性表达，热激和其他应激条件可以进一步诱导其表达。HSP90作为分子伴侣广泛参与细胞的信号转导、激素应答及细胞周期调控过程，对细胞在生理、病理及应激条件下的生存发挥... 详细信息

HSP90是热激蛋白家族(HSP)的主要成员之一，它在细胞中呈高组成性表达，热激和其他应激条件可以进一步诱导其表达。HSP90作为分子伴侣广泛参与细胞的信号转导、激素应答及细胞周期调控过程，对细胞在生理、病理及应激条件下的生存发挥了重要作用。因此研究HSP90蛋白基因表达调控机制具有重要的生物学意义。热休克蛋白的表达调控是一个极为复杂的过程，包括染色质水平的活化、特异性转录诱导因子--热休克因子(HSF)的活化、热休克蛋白mRNA稳定性的增加、热休克蛋白与活化的热休克因子结合，反馈抑制形成，从而使体内HSP的表达量与所处的环境相适应。这是一个极为精细的调控过程，对其机制的阐明将为真核基因表达调控的研究建立一个良好的模型。热休克蛋白家族的成员多达数十个，但它们的表达调控机制却有很多的共同点，特别是它们的转录调控，具有基本相似的模式，这也是热休克蛋白保守性的一个重要表现。热休克蛋白基因的启动子区通常包括介导基础转录的一系列反式因子SP1、CAAT结合蛋白和ATF等的结合序列，在它们的5’上游是介导应激条件下转录活化的数个热休克元件。这些顺式元件的共同作用保证了HSP在正常和应激状态下充分发挥其功能。 Wu于1980年在研究活化染色体的结构改变以及活化染色体对基因表达调控作用的影响过程中，首次在果蝇的hsp70基因上发现了多个DNaseI高敏感位点。Michael于1981年研究了果蝇hsp22,hsp23,hsp26,hsp28基因座5’端的DNaseI高敏感位点。1992年Kullum和Schedl进一步证实果蝇的hsp70基因的一个DNaseI高敏感位点scs具有隔离子样的功能。1995年Zhao等发现并鉴定出与此scs位点相互结合并发挥隔离子作用的结合蛋白BEAF。从染色质水平研究基因的表达调控机制，能够真实可靠的反映体内自然状态下基因调控的机制。为了从染色质水平了解hsp90β基因的调控情况，我们对Jurkat细胞中人hsp90β基因远端的DNaseI高敏感位点进行了分析。 ***细胞中hsp90β基因远端的DNaseI高敏感位点的研究参照本实验室刘秉胜博士对hsp90β基因DNaseI高敏感位点研究的实验结果，

关键词：结合蛋白隔离子 hsp90 DNaseI 基因组片段初步研究

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水稻瘤矮病毒部分基因组片段的克隆及序列分析

水稻瘤矮病毒部分基因组片段的克隆及序列分析

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作者：范国成福建农林大学

学位级别：硕士

本文完成了水稻瘤矮病毒(Rice gall dwarf virus，RGDV)中国广东信宜分离物(RGDV-C)部分基因组片段的克隆及其全序列测定，并首次报道了S12片段的全序列。根据水稻瘤矮病毒泰国分离物(RGDV-T)的末端及保守序列设计引物，利用RT-PCR技术... 详细信息

本文完成了水稻瘤矮病毒(Rice gall dwarf virus，RGDV)中国广东信宜分离物(RGDV-C)部分基因组片段的克隆及其全序列测定，并首次报道了S12片段的全序列。根据水稻瘤矮病毒泰国分离物(RGDV-T)的末端及保守序列设计引物，利用RT-PCR技术，以RGDV-C基因组dsRNA为模板，扩增获得RGDV-C的S2(AY556484)、S3(AY559408)、S8(AY216767)、S9(AY556483)、S10(AY559406)和S11(为AY559407)的全序列。序列比较表明RGDV-C与RGDV-T相应片段的核苷酸和氨基酸同源性分别为91.9％-98.1％和96.6％-98.7％，它们之间核苷酸变异主要是同类碱基的转换，即G-A或C-T；而且大多数变异发生在密码子的第三位碱基上，不引起蛋白质水平上的变化。在氨基酸水平上，也多是同类氨基酸的替代，仅有RGDV-C S11片段编码的aa211处存在一个Leu却失。RGDV-C与RGDV-T相应片段的GC含量、编码区和非编码区的长度、末端保守序列、基因组片段特异反向重复序列等基因组组织结构上基本一致；进一步以其编码的外层衣壳蛋白在同属内作系统进化以及病毒粒体被严格限制于薄壁细胞、致瘤特性分析显示，RGDV与WTV比RGDV与RDV具有更大的相似性。在完成RGDV-C已知基因组片段同源克隆的基础上，采用了一种克隆dsRNA病毒未知基因组片段的新方法——单引物扩增技术，首次克隆了RGDV基因组S12片段，并测定了全序列。这是国际上首次报道RGDV S12片段的全序列。结果表明：RGDV基因组S12片段全长共有853bp，存在RGDV所具有的特征末端保守序列(5'GG—UGAU 3')，序列中有多个反向重复序列。与WTV和RDV各分离物基因组S12片段的全序列相比，核苷酸同源性约为50％。计算机分析表明，该片段可能含有二个开放阅读框(ORF)，是RGDV所完成全序列测定的片段中唯一采用多顺反子策略进行编码的基因片段。最后，结合多种软件对以上序列进行生物信息学分析。在保守结构域分析时表明，植物呼肠孤病毒属中，S8片段编码的主要外层衣壳蛋白具有相同的保守结构域；RGDV S10片段编码的36kDa蛋白，RDV S9片段编码的Pns9蛋白，WTV S11片段编码的P9蛋白也具有相同的保守结构域；RGDV S11片段编码的Pns11蛋白(40kDa)与WTV、RDV S10片段编码的Pns11、Pns10等非结构蛋白不但具有相同的保守结构域，而且还与抗菌素整合酶家族具有一部分福建农林大学硕士学位论文相同的保守结构域，具有该保守结构域的抗菌素整合酶家族成员可对DNA底物进行一系列的交错剪接，在无需外界提供能量的条件下，通过酪氨酸酶促反应，将该蛋白共价结合到DNA链上。对RGDVsg片段编码的PnSg蛋白分析表明，该蛋白与包柔氏螺旋体菌依赖ATp的C扣蛋白水解酶有21 .8%的氨基酸序列同源性。

关键词：水稻瘤矮病毒基因组片段序列分析同源性保守结构域

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单引物法同时克隆RDV基因组片段S11、S12及其序列分析

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贵州农业科学 2005年第6期33卷 27-29页

作者：章松柏吴祖建段永平谢联辉林奇英农药生物化学教育部重点实验室福建农林大学

水稻矮缩病毒(Rice dwarf wrus,RDV)6个地方分离物基因组的lO%SDS-PAGE电泳图谱显示:松溪分离物基因片段S11、S12相对迁移速率明显不同。运用单引物法同时克隆该分离物的基因组片段S11、s12,并测定它们的全序列,结果表明s11、S12全长分... 详细信息

水稻矮缩病毒(Rice dwarf wrus,RDV)6个地方分离物基因组的lO%SDS-PAGE电泳图谱显示:松溪分离物基因片段S11、S12相对迁移速率明显不同。运用单引物法同时克隆该分离物的基因组片段S11、s12,并测定它们的全序列,结果表明s11、S12全长分别是1036bp、l066bp,基因结构和报道的RDV福州分离物基本一致,但分别突变了34、24个碱基,同源性分别为97.01%、97.86%。同时单引物法也为dsRNA病毒基因组的克隆提供了一种方法。

关键词：单引物扩增水稻矮缩病毒(RDV) 基因组片段

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水稻黑条矮缩病毒基因组片段6编码一个非结构蛋白

水稻黑条矮缩病毒基因组片段6编码一个非结构蛋白

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中国植物病理学会2005年学术年会暨植物病理学报创刊50周年纪念会

作者：方守国李大伟韩成贵于嘉林中国农业大学农业生物技术国家重点实验室和植物病理学系中国农业大学农业生物技术国家重点实验室和植物病理学系中国农业大学农业生物技术国家重点实验室和植物病理学系中国农业大学农业生物技术国家重点实验室和植物病理学系

水稻黑条矮缩病毒(Rice black-streaked dwarfvirus,RBSDV)属于呼肠孤病毒科 (Reoviridae),斐济病毒属(Fijivirus)。RBSDV基因组由10条线性的双链(ds) RNA组成(S1-S10),其中S6只含一个ORF,编码一个由792个氨基酸组成的分子量约为89．6 kDa的蛋白。本文利用pGEX-KG载体在大肠杆菌中表达了 RBSDV基因组片段6(S6)编码的蛋白(P6),经谷胱苷肽亲和层析柱纯化后免

关键词：水稻黑条矮缩病毒非结构蛋白 RBSDV 基因组片段

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我国禽痘病毒野毒和疫苗株基因组中已整合进禽网状内皮组织增生病病毒基因组片段

我国禽痘病毒野毒和疫苗株基因组中已整合进禽网状内皮组织增生病...

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中国畜牧兽医学会2004年学术年会暨第五届全国畜牧兽医青年科技工作者学术研讨会

作者：丁家波崔治中于立娟孙淑红姜世金山东农业大学动物科技学院(山东泰安)

将国内5个不同生产厂家来源的禽痘弱毒疫苗株和1株禽痘野毒株在鸡胚成纤维细胞(CEF)上连续传5代,用禽网状内皮组织增生病病毒(reticuloendotheliosis virus,REV)特异性的单克隆抗体,进行间接免疫荧光试验(IFA),均检测不到传染性REV.但以... 详细信息

将国内5个不同生产厂家来源的禽痘弱毒疫苗株和1株禽痘野毒株在鸡胚成纤维细胞(CEF)上连续传5代,用禽网状内皮组织增生病病毒(reticuloendotheliosis virus,REV)特异性的单克隆抗体,进行间接免疫荧光试验(IFA),均检测不到传染性REV.但以6株禽痘病毒(FPV)感染的第2代和第5代细胞基因组提取物为模板,通过PCR均能扩增出REV的长末端重复序列(LTR)和囊膜蛋白(env)基因片段.用特异性核酸探针作分子斑点杂交(Dot blot),结果显示所扩增的PCR条带为特异的REV-LTR和REV-env基因片段.实验结果表明,国内的一些痘病毒疫苗和野毒株基因组中,已稳定地整合进了REV的基因组成分.

关键词：禽痘病毒网状内皮增生病病毒疫苗株基因组片段病毒重组

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山东地区玉米粗缩病病原基因组片段S6的克隆及序列分析

山东地区玉米粗缩病病原基因组片段S6的克隆及序列分析

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中国作物学会50周年庆祝会暨2011年学术年会

作者：赵传志李爱芹朱妍妍夏晗李长生王兴军山东省农业科学院高新技术研究中心山东省作物与畜禽品种改良生物技术重点实验室农业部黄淮海作物遗传改良与生物技术重点开放实验室

玉米粗缩病是我国玉米生产中危害性最大的一种病害。严重时可造成大幅度减产甚至绝收,是一种毁灭性病害。最近几年玉米粗缩病在北方冀、鲁、陕、晋、辽、津等省市暴发成灾,其中山东地区尤为严重。历史上对在我国玉米粗缩病病原究竟是玉... 详细信息

玉米粗缩病是我国玉米生产中危害性最大的一种病害。严重时可造成大幅度减产甚至绝收,是一种毁灭性病害。最近几年玉米粗缩病在北方冀、鲁、陕、晋、辽、津等省市暴发成灾,其中山东地区尤为严重。历史上对在我国玉米粗缩病病原究竟是玉米粗缩病毒(Maize rough dwarf virus,MRDV)还是水稻黑条矮缩病毒(Rice Black-streaked Dwarf Virus,RBSDV)存在争论。近年来在我国大部分地区

关键词：玉米粗缩病玉米粗缩病毒水稻黑条矮缩病毒山东地区克隆及序列分析基因组片段

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中国水稻瘤矮病毒基因组片段S3,S8-S11克隆及其序列分析

中国水稻瘤矮病毒基因组片段S3,S8-S11克隆及其序列分析

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第三次全国植物病毒和病毒防治学术研讨会

作者：范国成吴祖建林奇英谢联辉福建农林大学植物病毒研究所福建农林大学植物病毒研究所福建农林大学植物病毒研究所福建农林大学植物病毒研究所

由水稻瘤矮病毒(Rice gall dwarf virus,RGDV)引起的水稻瘤矮病1980年首次在泰国发现,随后在马来西亚、中国的广东也有报道。近年来,广西和福建的云霄、诏安已有零星分布。据我们2002年的田间现场调查,该病在广东的茂名市普遍发生,发病... 详细信息

由水稻瘤矮病毒(Rice gall dwarf virus,RGDV)引起的水稻瘤矮病1980年首次在泰国发现,随后在马来西亚、中国的广东也有报道。近年来,广西和福建的云霄、诏安已有零星分布。据我们2002年的田间现场调查,该病在广东的茂名市普遍发生,发病率一般在1%～5%,重者30%以上,且有进一步蔓延的趋势。因此进一步从基因组水平上研究RGDV,可以为深入探讨各个基因的功能奠定基础,为病毒的防治提供理论依据。

关键词：水稻瘤矮病毒氨基酸组成 S3,S8-S11 分离物基因组片段序列分析

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中国妇女子宫颈癌组织中人乳头瘤病毒亚基因组片段的检测(论著摘要)

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中国医学科学院学报 1990年第2期 136-136页

作者：司静懿罗文李昆韩日才张卫宋国兴赵维敏刘世德贾丽萍陈莲凤中国医学科学院基础医学研究所中国医学科学院基础医学研究所北京

作者曾以32P标记各型人乳头瘤病毒(HPV)DNA为探针,检测了中国妇女宫颈癌活检组织中的病毒相关序列.发现HPV-16型与中国妇女宫颈癌的发生有高度相关.为进一步确定HPV-16全基因组中与宫颈癌发生更为密切关系的亚基因组片段,因此,本实验将H... 详细信息

作者曾以32P标记各型人乳头瘤病毒(HPV)DNA为探针,检测了中国妇女宫颈癌活检组织中的病毒相关序列.发现HPV-16型与中国妇女宫颈癌的发生有高度相关.为进一步确定HPV-16全基因组中与宫颈癌发生更为密切关系的亚基因组片段,因此,本实验将HPV-16型基因组经pst 1内切酶消化.HPV-16型基因组是一长为7.9 Kb的共价闭环双链DNA分子,其编码区可分为早期基因(Egene)及晚

关键词：人乳头瘤病毒宫颈癌 HPV 基因组片段中华人民共和国

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用轮状病毒基因组片段九cDNA杂交法鉴定人轮状病毒血清型

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国外医学(微生物学分册) 1990年第4期 185-185页

作者：葛永红

A群人轮状病毒(HRV)是导致婴、幼儿腹泻的一种重要的病原体,属呼肠孤病毒科,基因组含11个双链RNA片段。虽然不同血清型的病毒基因组的同源性可达75%,但用基因组片段九cDNA克隆作探针的斑点杂交法仍能特异性地区分出不同血清型。

关键词：基因组片段血清型血清变种 cDNA 人轮状病毒

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基于片段重叠群的含有重复基因的双面基因组片段填充方法和装置

基于片段重叠群的含有重复基因的双面基因组片段填充方法和装置

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作者：柳楠李胜华朱永琦崔晓宇李晓峰任燕卞忠勇李洋 250101 山东省济南市历城区凤鸣路1000号山东建筑大学

本发明公开了一种基于片段重叠群的含有重复基因的双面基因组片段填充方法及装置。该方法主要包括以下步骤：计算获得缺失基因集合；对最大缺失基因串分类，将基因元素分为三种类型：n‑Type‑1串、n‑Type‑2串和n‑Type‑3串，其中n为缺失... 详细信息

标准号: CN113889186A

本发明公开了一种基于片段重叠群的含有重复基因的双面基因组片段填充方法及装置。该方法主要包括以下步骤：计算获得缺失基因集合；对最大缺失基因串分类，将基因元素分为三种类型：n‑Type‑1串、n‑Type‑2串和n‑Type‑3串，其中n为缺失基因串的长度；对最大缺失基因串与重复基因的关系分类，将基因元素与重复基因的关系分为三种类型：无相关、半相关和相关，无相关是指插入串与重复基因不相邻且插入位置与重复基因无涉及，半相关是指插入串与重复基因不相邻且插入位置可能会与重复基因有涉及关系，有无涉及插入位置替代，相关是指插入与重复基因相邻或插入位置与重复基因完全涉及；搜索无相关和半相关类型的插入串，执行无相关和半相关串插入算法；对相关类型串构造辅助图，利用回溯算法和最大匹配算法进行插入。该填充方法填充速度快，效率高。本发明基于片段重叠群进行基因组填充，能够提高填充准确率和完备率，更具有一般性和实用性。

关键词：重复基因填充插入位置缺失基因重叠群算法最大匹配算法基因组片段关系分类辅助图基因组基因准确率回溯集合搜索分类替代

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