检索结果-内蒙古大学图书馆

作者：黄雷张玉波朱秀生彭艳玲孔思远张海燕 518124 广东省深圳市大鹏新区鹏飞路7号

本发明涉及生物工程领域，具体地，涉及一种基因组短片段文库的构建方法。本发明包括以下步骤：S1、细胞全基因组提取；S2、基因组片段化和产物回收纯化；S3、MNase酶切和产物回收；S4、电泳和胶回收；S5、末端修复和接头连接；S6、载... 详细信息

标准号: CN112359092B

本发明涉及生物工程领域，具体地，涉及一种基因组短片段文库的构建方法。本发明包括以下步骤：S1、细胞全基因组提取；S2、基因组片段化和产物回收纯化；S3、MNase酶切和产物回收；S4、电泳和胶回收；S5、末端修复和接头连接；S6、载体克隆与文库构建。本发明通过无序列偏好性的酶切方法富集得到的15‑50bp长度的短片段DNA文库涵盖了动物全基因组的完整信息，该方法操作简便，技术体系稳定，为调控元件基序的序列信息解析提供了便利。

关键词：产物回收全基因组酶切文库生物工程领域基因组片段短片段DNA 电泳调控元件技术体系接头连接末端修复完整信息文库构建序列信息载体克隆基因组胶回收偏好性短片富集构建基序解析细胞涵盖便利

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一种基因组短片段文库的构建方法

一种基因组短片段文库的构建方法

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作者：黄雷张玉波朱秀生彭艳玲孔思远张海燕 518124 广东省深圳市大鹏新区鹏飞路7号

标准号: CN112359092A

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鸡痘病毒282E_4株基因组2.9kbBamHI片段的序列测定与分析

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中国兽医学报 2000年第2期20卷 112-116页

作者：郭志儒金宁一王兴龙金扩世丁壮罗坤顾万钧殷震解放军军需大学军事兽医研究所吉林长春130062

对我国鸡痘病毒 ( FPV) 2 82 E4株基因组 2 .9kb Bam HI片段进行了序列测定与分析。结果表明 ,该片段全长 2 92 3 bp,A+T含量为 72 .0 8%,含 6个完整的开放读码框架 ( ORF)和 2个不完整的 ORF,最大的ORF所编码多肽的相对分子质量为 2 4 ... 详细信息

对我国鸡痘病毒 ( FPV) 2 82 E4株基因组 2 .9kb Bam HI片段进行了序列测定与分析。结果表明 ,该片段全长 2 92 3 bp,A+T含量为 72 .0 8%,含 6个完整的开放读码框架 ( ORF)和 2个不完整的 ORF,最大的ORF所编码多肽的相对分子质量为 2 4 60 0。在 2个 ORF的上游存在痘苗病毒晚期启动子的保守序列TAAAT,在 6个 ORF的下游和 2个 ORF的编码区内存在痘苗病毒早期转录终止信号 T5NT。把该片段的核苷酸序列和每个 ORF所编码的氨基酸序列分别对 EMBL核酸序列库和 SWISS-PROT蛋白质序列库进行了同源性搜索。

关键词：鸡痘病毒基因组片段序列分析 FPV载体 VV

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鸡痘病毒282E_4株基因组3.6kbBamHI片段序列测定与分析

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中国预防兽医学报 2000年第1期22卷 34-38页

作者：罗坤金宁一郭志儒王风华吴丛梅顾万均殷震解放军军需大学军事兽医研究所

本实验将我国FPV282E4 株基因组3 .6kb BamHID片段利用DNA测序仪进行了序列测定。经DNASISV3.0 分析,该片段A+ T含量为60.77 % ,内含有8 个主要的ORFS。用Goldkey V3.0 软件比较了VVP7.5 早期启动子,FPV4b 晚期启动子、L2R早/晚期启动... 详细信息

本实验将我国FPV282E4 株基因组3 .6kb BamHID片段利用DNA测序仪进行了序列测定。经DNASISV3.0 分析,该片段A+ T含量为60.77 % ,内含有8 个主要的ORFS。用Goldkey V3.0 软件比较了VVP7.5 早期启动子,FPV4b 晚期启动子、L2R早/晚期启动子和一个早/ 晚期双向启动子与各个ORF上游100bp 区域的同源性,没有发现有意义的同源序列;该片段的核苷酸序列和每个ORF所编码的氨基酸序列在EMBL核酸序列库和蛋白质序列库(Swiss_PROT) 中没有找到有意义的同源序列。

关键词：鸡痘病毒基因组片段序列测定 282E4株

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基于高密度基因芯片的福恢2165重要农艺性状分子基础解析

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四川农业大学学报 2024年第3期42卷 499-505页

作者：郑菲艳毛莹莹洪永河周鹏胡荣华张帆涛涂诗航福建省农业科学院水稻研究所福州350018 江西师范大学生命科学学院南昌330022

【目的】福恢2165作为一种表现优良的恢复系,具有株叶形态好、配合力高、抗稻瘟病和米质优等特点。因此,明确福恢2165重要农艺性状的分子基础,可以为材料改良和杂交稻育种提供参考,促进福恢2165在水稻生产中的安全应用。【方法】评价福... 详细信息

【目的】福恢2165作为一种表现优良的恢复系,具有株叶形态好、配合力高、抗稻瘟病和米质优等特点。因此,明确福恢2165重要农艺性状的分子基础,可以为材料改良和杂交稻育种提供参考,促进福恢2165在水稻生产中的安全应用。【方法】评价福恢2165对稻瘟病的抗性表现,并通过水稻全基因组芯片技术分析材料的纯合度及基因组片段来源。检测与产量、抗非生物和生物逆境、品质、生育期、育性和株型等重要农艺性状相关的功能基因。对福恢2165及其亲本进行抗病相关基因的单倍型分析。【结果】福恢2165显示出稳定的稻瘟病抗性,其基因型纯合度高,遗传背景单一。基因组片段来源分析表明,福恢2165的基因组片段更多来自于华航丝苗和蜀恢527。功能基因检测结果表明,福恢2165聚合了多个与重要农艺性状相关的调控基因。此外,单倍型分析进一步揭示了福恢2165含有丰富的抗稻瘟病相关基因资源。【结论】通过深入分析福恢2165的基因型特征和重要农艺性状相关基因,揭示了其遗传特性和抗病性的分子基础。这些结果为福恢2165的遗传改良和育种利用提供了新的理论支持和实践指导。

关键词：福恢2165 基因组片段功能基因稻瘟病基因芯片

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从云南蚕区分离BmCPV病毒株的全基因组克隆与系统发育分析

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蚕业科学 2015年第6期41卷 1036-1043页

作者：张永红唐芬芬邵榆岚朱峰白兴荣云南省农业科学院蚕桑蜜蜂研究所云南蒙自661100

家蚕质型多角体病毒（BmCPV）是家蚕中肠型脓病的病原物。从云南蚕区的病蚕样品中分离到一株BmCPV病毒分离株,提取纯化该病毒粒子的总RNA并合成cDNA,克隆病毒全基因组序列,研究该病毒分离株的基因组结构与系统进化。克隆得到该病毒10条d... 详细信息

家蚕质型多角体病毒（BmCPV）是家蚕中肠型脓病的病原物。从云南蚕区的病蚕样品中分离到一株BmCPV病毒分离株,提取纯化该病毒粒子的总RNA并合成cDNA,克隆病毒全基因组序列,研究该病毒分离株的基因组结构与系统进化。克隆得到该病毒10条dsRNA序列（S1~S10）并提交至NCBI数据库中。序列分析表明该病毒基因组序列全长24810bp,S1~S10片段序列都具有完整的ORF。BLAST比对发现克隆的该病毒基因组各片段编码区序列与已报道的1型BmCPV片段的相似度达88%以上,氨基酸序列相似度达90%以上;10条dsRNA基因组片段末端均有保守帽子结构5＇-AGUAA……GUUAGCC-3＇。基于S2片段RdRp基因的系统进化分析发现,该病毒与其他3个1型BmCPV分离株BmCPV1-Suzhou、BmCPV1-China、BmCPV1-Ⅰ聚为一支,基于S10片段polh基因的系统进化分析也表明该病毒为1型BmCPV新的分离株系。根据上述研究结果将该病毒定名为BmCPV1-Yunnan。

关键词：家蚕质型多角体病毒分离株基因组片段系统进化 RNA聚合酶基因多角体蛋白基因

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心肌重构相关基因与突变的功能研究

心肌重构相关基因与突变的功能研究

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作者：王继征中国协和医科大学

学位级别：博士

心肌重构是常见于各种心血管疾病中的重要生理病理变化，在此过程中，心脏由代偿性肥厚发展为失代偿、并最后发展为心衰。它可由各种环境因素如心肌机械张力、心肌缺血和血液荷尔蒙及细胞因子浓度改变以及多种遗传缺陷诱导发生，并通过... 详细信息

心肌重构是常见于各种心血管疾病中的重要生理病理变化，在此过程中，心脏由代偿性肥厚发展为失代偿、并最后发展为心衰。它可由各种环境因素如心肌机械张力、心肌缺血和血液荷尔蒙及细胞因子浓度改变以及多种遗传缺陷诱导发生，并通过改变内源性基因的表达和蛋白功能实现。因此我们希望能够通过研究Lamin A／C基因Glu82Lys致扩张型心肌病突变以及在小鼠中敲除CARP和CARK基因的表达，探讨心肌肥厚的发生机制。 Lamin A／C基因Glu82Lys突变是我们实验室发现的一个致扩张型心肌病恶性突变，在本文第一部分工作中，我们体外构建了该基因的突变体，通过转染HEK293细胞，对改突变导致心肌扩张的机理进行了研究。我们的实验结果显示，Glu82Lys突变改变了Lamin A／C蛋白及其相互作用蛋白emerin在细胞核膜的正常定位，由原来的主要分布于细胞核膜改变为弥散分布于整个核区。突变蛋白的表达使得细胞核膜的正常结构被破坏，细胞膜变得脆弱易碎。同时染色质异质化程度增加，染色质凝集异常。在双氧水诱导刺激下，Lamin A／C基因Glu82Lys突变增加细胞凋亡发生率。 CARP和CARK基因是我院从主动脉心脏文库中克隆的两个新基因。前期研究结果显示CARP基因可以抑制细胞增殖，诱导细胞凋亡。在培养的新生大鼠心肌细胞中高表达可以抑制肾上腺素诱发的心肌细胞肥厚。提示CARP可能是心肌肥厚的抑制因子。CARK基因特异表达于心肌组织，它的人类同源基因TNNI3K可与肌钙蛋白Ⅰ相互作用，提示它可能参与调节心肌细胞收缩功能。我们早前的研究结果表明，在小鼠心脏中高表达CARK可以促进心肌肥厚发生，提示CARK是心脏特异的心肌肥厚相关基因。本文第二部分工作旨在通过建立这两个基因的基因敲除小鼠模型，研究它们在心血管系统的发生、发育和正常功能维持中所起的作用，以及与心肌重构的关系。我们构建了两个基因的基因敲除载体，转染小鼠ES细胞后，筛选得到了它们的阳性重组克隆。将重组ES细胞注射入小鼠囊胚后，得到了这两个基因的嵌合体小鼠。由于学制所限，目前该部分工作尚远未完成，因此，本文第二部分仅仅是该课题的一个阶段性小结。

关键词： HEK 培养皿基因敲除载体扩张型心肌病基因组片段相关基因心肌重构功能研究

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缺陷型基因组病毒的产生及作用

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中国兽医杂志 2018年第6期54卷 89-92页

作者：霍彩云邢海云唐玉玲郭晓桐杨光辉李颖鑫王书扬胡艳欣中国农业大学动物医学院北京海淀100193 中国奶业协会北京海淀100193

缺陷型基因组（Defective Interfering viruses,DI）病毒是指含有不完整的基因组片段的病毒粒子,这些病毒粒子可以有效地干扰完整具有感染性的子代病毒粒子的产生。DI病毒最早发现于流感病毒中,Von Magnus在鸡胚中增殖流感病毒时观察到... 详细信息

缺陷型基因组（Defective Interfering viruses,DI）病毒是指含有不完整的基因组片段的病毒粒子,这些病毒粒子可以有效地干扰完整具有感染性的子代病毒粒子的产生。DI病毒最早发现于流感病毒中,Von Magnus在鸡胚中增殖流感病毒时观察到使用过高MOI的病毒接种,得到的新一代病毒的滴度反而下降（[1]）。

关键词：基因组片段病毒粒子缺陷型流感病毒感染性接种鸡胚滴度

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构建Ar与Cc亚基因组导入的甘蓝型油菜（Brassica napus）导入系群体

构建Ar与Cc亚基因组导入的甘蓝型油菜（Brassica napus）导入系群...

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作者：史永弟华中农业大学

学位级别：硕士

本课题组已通过大规模的种间杂交、分子标记辅助选择、多代自交，选育出了系谱各异的第三代新型甘蓝型油菜(ArArCcCc)自交系，它们导入了大量的白菜型油菜Ar和埃塞俄比亚芥Cc亚基因组片段，具有丰富的表型变异，并与常规甘蓝型油菜（***... 详细信息

本课题组已通过大规模的种间杂交、分子标记辅助选择、多代自交，选育出了系谱各异的第三代新型甘蓝型油菜(ArArCcCc)自交系，它们导入了大量的白菜型油菜Ar和埃塞俄比亚芥Cc亚基因组片段，具有丰富的表型变异，并与常规甘蓝型油菜（***，AnAnCnCn）杂交后可以产生较强的亚基因组间杂种优势。本课题在此基础上，拟通过一次杂交和多轮回交，将第三代新型甘蓝型油菜自交系的基因组片段，导入到常规甘蓝型油菜的遗传背景中，从而建立起新型甘蓝型油菜的导入系群体，为开展进一步的遗传研究提供试验材料。\n 为了在硕士生研究阶段（三年时间的四个年度）构建出需五轮交配才能形成的导入系群体，本研究采取了边交配、边研究、边选择，同时辅以夏繁的策略，构建春性、冬性导入系群体。具体构建过程如下:\n 第一年(2013.7-2013.12)，新型甘蓝型油菜与常规甘蓝型春油菜杂交得到F1，评估其田间杂种优势，并用5对SSR引物从48个F1植株中鉴定出46个真杂种。\n 第二年(2014.1-2014.12)，低世代回交群体(BC1F1和BC2F1)的构建，以及用6对SSR引物从354个BC1F1植株中鉴定出260个真杂种。我们用3，067个SNP标记分析了特异性外源Ar/Cc的含量、遗传距离，同时进行产量试验评估，最终确定了2个新型甘蓝型油菜（13R066和13R113）用于构建春油菜导入系群体。\n 第三年(2015.1-2015.12)，对BC2F1群体进行基因型分析发现新型甘蓝型油菜的导入是覆盖全基因组的，同时完成了对BC3F1群体的构建。\n 第四年(2016.1-2016.6)，构建了以常规甘蓝型春油菜为轮回亲本的BC4F1群体与BC3F2群体。\n 经过1次杂交、4轮回交（或3轮回交1次自交），已构建出两个春油菜导入系群体:13R066-BC4F1和13R113-BC3F2。\n 冬油菜导入系群体的构建与春油菜同期进行。由于冬油菜的冬性较强需要较长时间的低温才能通过春花，所以冬油菜导入系群体的构建比春油菜导入系群体的构建晚一个世代。经过1次杂交、3轮回交（或2轮回交1次自交），初步构建出两个冬油菜导入系群体:13R143-BC3F1和13R172-BC2F2。\n 我们通过筛选出农艺性状优良并含有大量外源亚基因组导入的新型甘蓝型油菜自交系，与常规的春、冬性甘蓝型油菜杂交，并以常规甘蓝型油菜为轮回亲本，多次回交，通过分子标记辅助选择，创建出了包含有不同Ar、Cc亚基因组片段导入的春、冬性甘蓝型油菜导入系群体，为进一步解析外源亚基因组片段导入对甘蓝型油菜基因组结构及其表型变异所产生的深刻影响，提供了重要的研究材料。

关键词：甘蓝型油菜分子标记导入系群体基因组片段

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片段的序列测定与分析

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科学通报 1999年第17期44卷 1826-1831页

作者：金宁一郭志儒罗坤石毅殷震解放军农牧大学军事兽医研究所长春130062

对经亚克隆后的鸡痘病毒 (fowlpoxvirus,FPV) 2 82E4株 7.3kbBamHⅠ片段 ,用ABI377DNA测序仪荧光标记法进行了序列测定 ,并应用DNAsis软件同GenBank中已知的FPV序列和痘苗病毒 (vacciniavirus,VV)Copenhagen株的全序列进行了同源性比较 ... 详细信息

对经亚克隆后的鸡痘病毒 (fowlpoxvirus,FPV) 2 82E4株 7.3kbBamHⅠ片段 ,用ABI377DNA测序仪荧光标记法进行了序列测定 ,并应用DNAsis软件同GenBank中已知的FPV序列和痘苗病毒 (vacciniavirus,VV)Copenhagen株的全序列进行了同源性比较 ,发现与鸡痘病毒MunichHP 438株 1 1 .2kbBamHⅠ片段的序列同源 .此外 ,对所测序列的开放读码框架 (openreadingframes,ORFs)所编码的氨基酸序列同上述VV株中所有ORF的氨基酸序列进行了同源性比较 ,并对各ORF编码蛋白的信号肽。

关键词：鸡痘病毒基因组片段序列分析开放读码框架

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