检索结果-内蒙古大学图书馆

中国生物化学与分子生物学报 2010年第7期26卷 637-642页

作者：端家忠张靖溥朱少侠李勇中国科学院遗传与发育生物学研究所北京100101 中国医学科学院医药生物技术研究所北京100050

RNA选择性剪接机制涉及基因表达模式的多样性、胚胎发育的调控和疾病的发展与转归.Cwf15/Cwc15蛋白家族与RNA剪接体的功能相关,其基因序列在很多物种之间是十分保守的.然而,在哺乳类,Cwf15/Cwc15基因的表达模式和生物学功能研究至今未... 详细信息

RNA选择性剪接机制涉及基因表达模式的多样性、胚胎发育的调控和疾病的发展与转归.Cwf15/Cwc15蛋白家族与RNA剪接体的功能相关,其基因序列在很多物种之间是十分保守的.然而,在哺乳类,Cwf15/Cwc15基因的表达模式和生物学功能研究至今未见实验性研究报道.本文首次报道了Cwc15家族同源基因mED1在小鼠早期胚胎发育过程中的表达规律.RT-PCR结果表明,mED1基因的转录水平从小鼠桑葚胚到器官形成期呈逐渐上升趋势;整体原位杂交结果显示mED1基因主要在小鼠6.5-dpc胚胎的ICM、8.5-dpc胚胎的神经褶衍生物和10.5-dpc的头部、鳃弓和体节中表达.说明mED1基因参与了小鼠胚胎的早期发育.此外,GFP-融合蛋白的亚细胞定位实验表明,mED1蛋白具有核定位的功能(剪接体蛋白的必要特性),验证了其核定位序列(NLS)的预测.本文是关于Cwc15家族基因的首次实验研究报道.

关键词： mED1 基因表达模式 Cwf15/Cwc15超家族小鼠胚胎发育 NLS

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水稻WRKY80转录调节蛋白基因的分离与表达模式

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中国农业科学 2013年第19期46卷 4035-4043页

作者：彭喜旭唐新科周平兰胡耀军邓小波王海华湖南科技大学生命科学学院

【目的】分离水稻WRKY80,分析其编码蛋白的序列结构特征,了解其在各器官中以及病原接种、激素处理下的表达模式,为阐明其生物学功能奠定基础。【方法】基于水稻基因组数据库注释的Locs03g63810基因的编码序列设计特异引物,用RT-PCR法从... 详细信息

【目的】分离水稻WRKY80,分析其编码蛋白的序列结构特征,了解其在各器官中以及病原接种、激素处理下的表达模式,为阐明其生物学功能奠定基础。【方法】基于水稻基因组数据库注释的Locs03g63810基因的编码序列设计特异引物,用RT-PCR法从茉莉酸甲酯(MeJA)处理的水稻叶片中克隆WRKY80 cDNA序列,运用生物信息学手段对推定的蛋白和启动子序列进行分析,用Northern杂交或实时荧光定量PCR方法研究基因的表达模式。【结果】获得了WRKY80 cDNA序列,长1 392 bp,包含1个长1 164 bp的完整开放读码框,编码387个氨基酸。WRKY80具有1个典型的WRKY保守结构域,锌指类型为C2H2,归类于WRKY第Ⅱ组;C-端为酸性结构区,且含连续的6个谷氨酰胺和8个丝氨酸,提示具有转录激活活性;预测其定位于细胞核。WRKY80与玉米和高粱等单子叶植物WRKY的氨基酸序列同一性较高。WRKY80在各器官中组成性表达,在叶、根和穗中表达丰度较高,花中次之,在茎和颖果中丰度较低,且表达具有发育阶段相关性,在成熟叶、根中的表达分别高于幼叶和幼根;受稻瘟病菌、纹枯病菌、MeJA和乙烯利诱导表达,而水杨酸对其表达无影响。其表达模式与启动子顺式元件预测分析的结果基本一致。【结论】WRKY80具有转录因子的结构特征,推测其可能通过茉莉酸/乙烯介导的信号途径参与水稻的防御反应,也可能参与发育调控。

关键词： WRKY转录因子真菌病原基因分离基因表达模式水稻

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玉米LRR-RLK基因家族鉴定和SIF亚家族表达模式分析

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玉米科学 2024年第4期32卷 19-30页

作者：孙泽丹曾世荣孙小孟王亚鹏王哲杨琴西北农林科技大学农学院/作物抗逆与高效生产全国重点实验室/农业农村部西北旱区玉米生物学与遗传育种重点实验室陕西杨凌712100

富含亮氨酸重复的类受体激酶(leucine-rich repeat receptor-like kinase,LRR-RLK)能够调节植物的生长发育、参与激素信号传导、抵御各种逆境胁迫,它是植物中已知最大的跨膜类受体蛋白激酶(receptor-like kinase,RLK)家族。SIF是LRR-RL... 详细信息

富含亮氨酸重复的类受体激酶(leucine-rich repeat receptor-like kinase,LRR-RLK)能够调节植物的生长发育、参与激素信号传导、抵御各种逆境胁迫,它是植物中已知最大的跨膜类受体蛋白激酶(receptor-like kinase,RLK)家族。SIF是LRR-RLK家族中的一个亚家族,该亚家族在拟南芥和棉花中被证明参与逆境胁迫。利用生物信息学方法对玉米B73基因组的LRR-RLK家族进行全基因组鉴定、系统进化、染色体定位和基因结构分析,基于LRR-RLK家族的分类结果,选择第Ⅰ亚家族SIF作为研究对象,分析该亚家族成员组织特异性表达以及对逆境胁迫的响应模式。结果表明,玉米LRR-RLK基因家族包含249个成员,这些LRR-RLK基因非均等地分布于玉米10条染色体上。系统进化分析可将其分为15类,各亚家族基因数量分布由1~51个不等。基于转录组数据的表达模式分析表明,玉米SIF亚家族基因在不同组织及逆境胁迫下的表达量不同,发现了多个可响应非生物胁迫(干旱胁迫、冷胁迫、热胁迫和盐胁迫)和生物胁迫(玉蜀黍平脐蠕孢、禾谷镰孢、瘤黑粉菌和蚜虫)的SIF基因。

关键词：玉米 LRR-RLK 全基因组鉴定基因表达模式

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2型糖尿病相关基因在人和食蟹猴外周血白细胞中的表达模式

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四川动物 2012年第2期31卷 185-190页

作者：季芳张艳春靳丽莎郝香芬夏机良李学家张秀娟饶军华刘晓明彭白露广东省昆虫研究所广州510260 广东蓝岛生物技术有限公司广州510555 南方医科大学广州510515

2型糖尿病(T2DM)是一种多因素相关的复杂的代谢性疾病。采用实时PCR技术了解51个T2DM相关基因mRNA在健康和糖尿病人/食蟹猴外周血白细胞中的表达模式。结果表明,与健康组相比,糖尿病猴中有34个基因表达量差异显著(P<0.05),约为66.7%... 详细信息

2型糖尿病(T2DM)是一种多因素相关的复杂的代谢性疾病。采用实时PCR技术了解51个T2DM相关基因mRNA在健康和糖尿病人/食蟹猴外周血白细胞中的表达模式。结果表明,与健康组相比,糖尿病猴中有34个基因表达量差异显著(P<0.05),约为66.7%,其中24个基因表达上调(P<0.05);而糖尿病人中有26个基因表达量差异显著(P<0.05),约为50.1%,其中16个基因表达上调(P<0.05),这些基因表达受到糖代谢、脂肪代谢、炎症等方面的影响。糖尿病人与食蟹猴样本中有18个基因都存在差异性表达(P<0.05),表达模式基本一致。因此,食蟹猴可以作为研究糖尿病的较理想的模式动物,外周血白细胞基因的表达模式可以为糖尿病早期诊断和预后评价提供重要指标。

关键词： 2型糖尿病基因表达模式白细胞人类食蟹猴

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松墨天牛肌球蛋白轻链2基因的鉴定及表达模式

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华北农学报 2015年第3期30卷 25-30页

作者：吴华俊蔡紫玲罗淋淋林同华南农业大学林学院广东广州510640

为阐明松墨天牛肌肉收缩机理和相关基因表达模式,用构建c DNA文库方法,从松墨天牛c DNA中克隆到松墨天牛肌球蛋白轻链2基因,命名为Ma MLC-2（Gen Bank：KM371003）。该基因c DNA为882 bp,其中开放阅读框（ORF）为618 bp,编码205个氨基酸... 详细信息

为阐明松墨天牛肌肉收缩机理和相关基因表达模式,用构建c DNA文库方法,从松墨天牛c DNA中克隆到松墨天牛肌球蛋白轻链2基因,命名为Ma MLC-2（Gen Bank：KM371003）。该基因c DNA为882 bp,其中开放阅读框（ORF）为618 bp,编码205个氨基酸,推测的蛋白等电点为4.66,分子量为22.26 k Da。Ma MLC-2的氨基酸序列与赤拟谷盗同源性最高,为96%,与东方蝼蛄等8种昆虫同源性为85%-88%。松墨天牛与赤拟谷盗处在系统发育树的同一分支上。Ma MLC-2属于亲水性氨基酸,存在2个EF-hand结构域,长度均为29个氨基酸,其中第1个EF-hand结构域含有Ca2＋结合位点。SWISS-MODEL预测结果显示,Ma MLC-2有2个螺旋-环-螺旋结构。用RT-q PCR分析了Ma MLC-2基因的相对表达量,结果显示：蛹和幼虫的表达量高于成虫;成虫中足表达量最高,腹部表达量最低,各部位均有表达,且有显著差异（P〈0.05）。

关键词：松墨天牛肌球蛋白轻链2 基因表达模式 RT-q PCR

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小菜蛾热休克蛋白基因的鉴定及其表达模式分析

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昆虫学报 2013年第5期56卷 457-464页

作者：夏晓峰林海兰郑丹丹杨广尤民生福建农林大学应用生态研究所福州350002 农业部闽台作物有害生物综合治理重点实验室福州350002 福州市疾病预防控制中心福州350004

热休克蛋白(heat shock protein,HSP)在昆虫应对外界胁迫刺激时起着重要作用。为了系统研究小菜蛾Plutella xylostella HSP基因家族,根据家蚕的HSP蛋白序列,采用本地Blast程序对小菜蛾全基因组数据库进行同源序列检索,从小菜蛾基因组数... 详细信息

热休克蛋白(heat shock protein,HSP)在昆虫应对外界胁迫刺激时起着重要作用。为了系统研究小菜蛾Plutella xylostella HSP基因家族,根据家蚕的HSP蛋白序列,采用本地Blast程序对小菜蛾全基因组数据库进行同源序列检索,从小菜蛾基因组数据库中鉴定了25个HSP基因,包括2个HSP90、8个HSP70和15个sHSP(small heat shock protein,sHSP)基因。小菜蛾、家蚕Bombyx mori、黑腹果蝇Drosophila melanogaster和赤拟谷盗Tribolium castaneum的HSP系统进化分析显示,昆虫的小分子量热休克蛋白sHSP具有很强的种属特异性,HSP70家族的保守性比sHSP强。小菜蛾HSP基因表达模式分析显示,与敏感品系对比,抗性品系(抗毒死蜱和抗氟虫氰品系)中HSP基因具有不同的表达模式。小菜蛾1,2和3龄幼虫HSP基因表达模式较为接近,而与4龄幼虫中的表达模式相差较大;4龄幼虫和蛹中的表达模式相近;雌成虫和雄成虫中的表达模式显著不同,与果蝇精子形成有关的两个热休克蛋白HSP23和HSP27基因[分别为CCG003980.1(Px23.5)和CCG005412.2(Px27.5)],在小菜蛾雄成虫中的表达量显著高于雌成虫。研究结果表明小菜蛾HSP基因不仅在杀虫剂抗性、发育分化,甚至在生殖上均可能起着重要的作用。本研究为深入研究小菜蛾HSP与生长发育、抗逆行为的相互关系奠定了基础。

关键词：小菜蛾热休克蛋白比较基因组杀虫剂抗性基因表达模式

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棉花蔗糖合成酶基因家族在纤维发育期时空表达模式分析

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棉花学报 2015年第4期27卷 317-328页

作者：黄圣何鹏田莉莉俞嘉宁陕西师范大学生命科学学院陕西西安710119

蔗糖合成酶（Sucrose Synthase）是调控植物糖类代谢的关键酶之一,在植物生长发育及渗透调节过程中起着重要的作用。该酶为多基因家族,各成员在植物不同组织及不同发育阶段发挥不同的作用。陆地棉（Gossypium hirsutum）中有15个Sus成员... 详细信息

蔗糖合成酶（Sucrose Synthase）是调控植物糖类代谢的关键酶之一,在植物生长发育及渗透调节过程中起着重要的作用。该酶为多基因家族,各成员在植物不同组织及不同发育阶段发挥不同的作用。陆地棉（Gossypium hirsutum）中有15个Sus成员,本研究利用转录组高通量测序及实时定量PCR技术,检测了该基因家族的表达模式。结果表明,Gh Sus1D、Gh Sus3A、Gh Sus3D和Gh Sus6D在起始期（0~3 DPA）大量表达;GhSus7D在10 DPA的纤维中表达量快速增加,达到同期突变体胚珠的4.7倍;Gh Sus1A、Gh Sus5D在纤维伸长期（5~15 DPA）表达量显著高于胚珠,分别在10 DPA、15 DPA时达到峰值;Gh Sus3A、Gh Sus3D、和Gh Sus6D在纤维发育（15 DPA）时表达量重新上升,且在20 DPA时仍处于较高表达水平。Sus基因家族组织表达模式分析表明,它们在陆地棉品种徐州142野生型和突变体中的组织表达模式基本相同,根、茎、叶、花中没有显著差异。但不同Sus基因具有不同的组织表达特异性。

关键词：棉花纤维棉花基因表达模式蔗糖合成酶

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毛白杨FAD基因家族鉴定与表达模式分析

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分子植物育种 2022年

作者：金兄莲安进宝祁得胜乔枫姜迪杜少波戢爽谢惠春青海师范大学青海省青藏高原生物多样性形成机制与综合利用重点实验室青海省青藏高原药用动植物资源重点实验室青海省玉树藏族自治州江西林场

脂肪酸去饱和酶(fatty acid desaturase， FAD)基因家族在植物生物膜的抗逆过程中起着重要的调控作用。为了解FADs在毛白杨生长发育过程中的作用，本研究基于生物信息学的分析方法鉴定并分析了毛白杨FAD基因家族。结果表明32个PtFADs不... 详细信息

脂肪酸去饱和酶(fatty acid desaturase， FAD)基因家族在植物生物膜的抗逆过程中起着重要的调控作用。为了解FADs在毛白杨生长发育过程中的作用，本研究基于生物信息学的分析方法鉴定并分析了毛白杨FAD基因家族。结果表明32个PtFADs不均匀分布于10条染色体上。系统发育分析显示，PtFAD基因家族分为6个亚家族，且基因结构与功能结构域高度保守。启动子上游区域的顺式作用元件分析发现，PtFAD主要参与了毛白杨生长发育过程中的应激反应过程。此外，组织特异性表达模式显示，32个PtFAD基因广泛表达于木质部、根部、嫩叶及成熟叶中，而PtFAD基因家族在愈伤组织诱导及不定芽诱导中呈现低表达的趋势，且PtFAD16的表达模式一直表现为高表达，表明了其在毛白杨生长发育过程中的重要作用。综上所述，本研究为系统了解PtFAD基因家族提供了依据，也为毛白杨FAD基因功能特性的深入研究提供了理论基础。

关键词：毛白杨 FAD基因家族系统进化基因表达模式生物信息学分析

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甜菜BvHKT6基因的克隆及表达模式分析

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分子植物育种 2022年第13期20卷 4234-4242页

作者：李宁宁魏磊李国龙张少英内蒙古农业大学农学院呼和浩特010019

为调查甜菜高亲和性 K~+转运蛋白基因的功能,本研究从自育高糖型甜菜(‘BS02’)中分离了高亲和性 K~+转运蛋白基因,命名为 Bv HKT6。该基因包含有 1 620 bp 的开放阅读框,编码 539 个氨基酸,蛋白分子量 60.11 k D,理论等电点 9.24。生... 详细信息

为调查甜菜高亲和性 K~+转运蛋白基因的功能,本研究从自育高糖型甜菜(‘BS02’)中分离了高亲和性 K~+转运蛋白基因,命名为 Bv HKT6。该基因包含有 1 620 bp 的开放阅读框,编码 539 个氨基酸,蛋白分子量 60.11 k D,理论等电点 9.24。生物信息学分析显示该基因编码的蛋白定位于细胞质膜,含有 8 个跨膜结构域及 4 个空隙结构域,具有 HKTs 超家族中特有的 Trk H 和 Trk G 保守结构域;该蛋白属于 HKTs 家族中的亚家族Ⅰ,并且与藜科植物如藜麦、菠菜 HKTs 的亲缘关系较近。定量 PCR 结果表明 Bv HKT6 基因能够被Na Cl、KCl 和 ABA 等诱导表达,且分别在 400 mmol/L Na Cl、200 mmol/L KCl、20 mmol/L ABA 处理下在根和叶中的表达量达到最大值。此外,在不同浓度 Na Cl 处理下,Bv HKT6 基因在根中的表达量明显高于在叶中的表达量,而在不同浓度 KCl 和 ABA 处理下,正好与之相反,表明该基因在响应不同胁迫时具有明显的组织特异性。以上研究结果为解析甜菜离子转运分子机制提供理论基础,同时为高糖甜菜的耐盐遗传改良提供候选基因。

关键词：甜菜(Beta vulgaris) BvHKT6 基因表达模式盐胁迫

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铁皮石斛糖苷水解酶GH3基因家族鉴定及表达模式分析

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浙江农业学报 2024年第4期36卷 790-799页

作者：李亚萍金福来黄宗贵张涛段晓婧姜武陶正明陈家栋浙江省亚热带作物研究所浙江温州325005 温州市金福来农业科技有限公司浙江温州325005 温州市种子站浙江温州325052 温州市农业技术推广中心浙江温州325052

利用生物信息学方法对铁皮石斛GH3基因家族成员进行筛选、鉴定,对其基因结构、蛋白理化性质、亚细胞定位、系统进化、蛋白质二级结构及跨膜预测、基序及染色体定位进行分析,同时分析GH3基因家族在不同组织以及低磷与正常磷水平下的表达... 详细信息

利用生物信息学方法对铁皮石斛GH3基因家族成员进行筛选、鉴定,对其基因结构、蛋白理化性质、亚细胞定位、系统进化、蛋白质二级结构及跨膜预测、基序及染色体定位进行分析,同时分析GH3基因家族在不同组织以及低磷与正常磷水平下的表达模式。在铁皮石斛全基因组中筛选得到13个GH3家族基因,其中一个基因存在可变剪切,表达为14个GH3蛋白。GH3基因家族蛋白可分为3个亚家族,各亚家族中不同基因相对保守;各成员均含有内含子与外显子,内含子相位在0~2,13个基因分布在8染色体上。GH3基因家族在铁皮石斛的8个组织中均有表达,其中白根和花蕾表达量高,茎和唇瓣低,推测GH3基因家族可能参与铁皮石斛根系生长以及开花现蕾。低磷与正常磷水平表达结果表明,低磷水平下叶中基因LOC 110110392、LOC 110100144表达上调,根中基因LOC 110095762、LOC 110107269表达上调。该研究对铁皮石斛糖苷水解酶GH3基因家族成员生物信息学、在不同组织以及正常磷与低磷条件下的表达水平进行研究分析,筛选响应低磷信号的糖苷水解酶基因,为后期研究糖苷水解酶参与低磷条件下铁皮石斛多糖代谢调节机制提供研究基础。

关键词：铁皮石斛糖苷水解酶GH3 生物信息学分析基因表达模式

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