检索结果-内蒙古大学图书馆

Acta Botanica Sinica 2004年第5期46卷 578-581页

作者：邹建伟孙蒙祥杨弘远武汉大学生命科学学院植物发育生物学教育部重点实验室，武汉430072

为进一步探讨单胚RT-PCR技术的适用性，我们测试了3个特定的基因STM、MP和ASKη在拟南芥(Arabidopsis thaliana(L．)Heynh．)早期胚胎发生过程中的动态表达情况。进一步证实以该技术研究某些特定基因的表达动态是可行的。着重探讨了扩... 详细信息

为进一步探讨单胚RT-PCR技术的适用性，我们测试了3个特定的基因STM、MP和ASKη在拟南芥(Arabidopsis thaliana(L．)Heynh．)早期胚胎发生过程中的动态表达情况。进一步证实以该技术研究某些特定基因的表达动态是可行的。着重探讨了扩增产量与模板量的对应关系、基因组DNA的干扰以及DNase Ⅰ处理过程中的mRNA降解等主要技术问题。结果表明：材料制备时显微操作技术的稳定是确保单胚RT-PCR结果稳定的关键。应尽量缩短DNase Ⅰ处理时间，以避免mRNA降解。

关键词：单胚RT-PCR 基因表达模式胚胎发生拟南芥

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烤烟烟叶类黄酮合成关键酶活性及其调控基因的表达分析

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中国烟草学报 2019年第1期25卷 86-92页

作者：高娅北李成刚陈二龙张明刚孔德辉孙占伟史龙飞宋朝鹏河南农业大学烟草学院郑州450002 河南中烟工业有限责任公司河南郑州450016 河南中烟工业公司安阳卷烟厂河南安阳455000 河南省烟草公司洛阳市公司河南洛阳471000

为系统探究类黄酮在烟叶成熟期合成积累的关键点、合成相关酶及调控基因的变化规律,测定了豫烟6号、K326和ND202三个烤烟品种中部叶成熟期叶片的类黄酮含量、类黄酮合成上游的苯丙氨酸解氨酶(PAL)、肉桂酸4-羟化酶(C4H)、4-香豆酰CoA连... 详细信息

为系统探究类黄酮在烟叶成熟期合成积累的关键点、合成相关酶及调控基因的变化规律,测定了豫烟6号、K326和ND202三个烤烟品种中部叶成熟期叶片的类黄酮含量、类黄酮合成上游的苯丙氨酸解氨酶(PAL)、肉桂酸4-羟化酶(C4H)、4-香豆酰CoA连接酶(4CL)、查尔酮合成酶(CHS)和查尔酮异构酶(CHI)酶活性及其基因表达模式的变化。结果表明,三个烤烟品种烟叶类黄酮含量变化呈现先增加后降低的规律,打顶后0～30d是烟叶类黄酮合成积累的关键时期,在叶片成熟期含量达最大值;在同一生态环境及栽培管理条件下,成熟期各阶段均以豫烟6号中部叶类黄酮含量最高;测定类黄酮合成酶活性发现,PAL、CHS和CHI酶活性与烟叶类黄酮合成的相关性较大,其中CHS合成酶最大(p<0.01,r=0.88);基因表达模式研究发现,PAL、C4H、4CL2、CHS和CHI基因与烟叶类黄酮含量的积累相关性较大,其中CHS基因最大(p<0.01,r=0.96),是烟叶类黄酮合成过程中的关键基因。

关键词：烤烟类黄酮合成酶活性基因表达模式成熟期

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苦荞麦叶斑病原诱导的FtWRKY39基因克隆、表达与生化特性分析

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植物生理学报 2021年第7期57卷 1480-1490页

作者：邬清韬王海华申权田建红唐新科湖南科技大学生命科学学院湖南湘潭411201 经济作物遗传改良与综合利用湖南省重点实验室湖南湘潭411201 重金属污染生态土壤修复与安全利用湖南省高校重点实验室湖南湘潭411201

WRKY转录因子在植物抗病防御过程中发挥重要的调节作用。苦荞麦(Fagopyrum tataricum)叶斑病由链格孢(Alternaria alternata)、黑孢霉(Nigrospora osmanthi)引起。采用逆转录PCR方法,从接种***的苦荞麦叶RNA样品中克隆获得FtWRKY39基因... 详细信息

WRKY转录因子在植物抗病防御过程中发挥重要的调节作用。苦荞麦(Fagopyrum tataricum)叶斑病由链格孢(Alternaria alternata)、黑孢霉(Nigrospora osmanthi)引起。采用逆转录PCR方法,从接种***的苦荞麦叶RNA样品中克隆获得FtWRKY39基因的cDNA序列。FtWRKY39 cDNA长1037 bp,含有1个长为1029 bp的完整开放读码框,编码342个氨基酸。FtWRKY39具有1个典型的WRKY保守结构域,锌指类型为CCHC,归类于WRKY第Ⅲ组。FtWRKY39与苦荞麦WRKY12、藜麦(Chenopodium quinoa)WRKY41和甜菜(Beta vulgaris)WRKY41在氨基酸水平上的同源性较高,序列同一性分别为50.9%、44.6%、43.7%。原生质体瞬时表达分析表明,绝大部分的FtWRKY39定位在细胞核中,少量分布于细胞质内,与亚细胞定位预测结果一致。FtWRKY39的C端为酸性结构区,富含丝氨酸、苏氨酸磷酸化位点,提示它具有转录激活活性,酵母单杂交实验证实了这种推测。实时荧光定量PCR分析表明,FtWRKY39在根中的表达丰度最高,其次是果、花和叶,在茎中表达水平最低;Ft WRKY39受***和***以及3种重要的抗病相关激素——水杨酸(SA)、茉莉酸(JA)和乙烯(ET)显著诱导。上述结果提示,FtWRKY39具有作为转录因子的基本结构与生化特征,可能通过SA、JA/ET信号通路介导对苦荞麦叶斑病的抗性反应。

关键词：苦荞麦(Fagopyrum tataricum) 叶斑病原 WRKY基因生物信息学分析基因表达模式亚细胞定位转录激活活性

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洋葱光周期途径转录因子基因AcCOL7的克隆及功能鉴定

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园艺学报 2018年第3期45卷 493-502页

作者：盛洁杨翠翠吴小旭袁巧玲陈典张东源王勇东北农业大学园艺园林学院农业部东北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室哈尔滨150030

以洋葱品系‘SA2’为材料,克隆到1个光周期途径重要转录因子CONSTANS-like基因,命名为AcCOL7,其cDNA序列全长1 101 bp,编码366个氨基酸。多序列比对和结构域分析表明,AcCOL7蛋白包含1个B-box型锌指结构和1个CCT结构域;系统发育分析结果... 详细信息

以洋葱品系‘SA2’为材料,克隆到1个光周期途径重要转录因子CONSTANS-like基因,命名为AcCOL7,其cDNA序列全长1 101 bp,编码366个氨基酸。多序列比对和结构域分析表明,AcCOL7蛋白包含1个B-box型锌指结构和1个CCT结构域;系统发育分析结果显示它与水稻OsCOL13亲缘关系较近;实时荧光定量PCR分析显示,AcCOL7的表达量在抽薹前幼叶中最高,幼嫩花茎次之。为了解AcCOL7的功能,构建了其过表达载体,转化拟南芥co突变体。与突变体植株相比,转化株表现为早花,且突变体的其他变异性状也得到了一定程度的恢复,表明AcCOL7与拟南芥的AtCOL5具有相似的功能,即在光周期诱导开花途径中具有显著的促进开花作用。

关键词：洋葱 AcCOL7 基因表达模式拟南芥co突变体过表达载体抽薹开花

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中华猕猴桃bZIP家族成员的比较基因组学分析

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应用与环境生物学报 2020年第2期26卷 226-235页

作者：于丰源蒋礼玲贾举庆张真真陈思佳牛向丽王明雪黄胜雄三江源生态与高原农牧业国家重点实验室/青海大学农林科学院作物育种栽培研究所/农业农村部作物基因资源与种质创新青海科学观测试验站/国家作物种质复份库西宁810016 合肥工业大学食品与生物工程学院合肥230009 山西农业大学农学院太谷030801

bZIP转录因子调控着植物的生长发育和逆境胁迫应答,是植物中一类重要的转录因子.基于系统的生物信息学方法,鉴定得到79个中华猕猴桃bZIP转录因子,进化分析结果揭示中华猕猴桃bZIP家族成员在J、K、L三个分组中出现了成员的缺失.中华猕猴... 详细信息

bZIP转录因子调控着植物的生长发育和逆境胁迫应答,是植物中一类重要的转录因子.基于系统的生物信息学方法,鉴定得到79个中华猕猴桃bZIP转录因子,进化分析结果揭示中华猕猴桃bZIP家族成员在J、K、L三个分组中出现了成员的缺失.中华猕猴桃bZIP家族成员的bZIP保守域主要由碱性结构域和亮氨酸拉链结构域组成,其亮氨酸拉链结构域的第4、5肽段的第7位的亮氨酸残基存在一定程度的变异.bZIP保守域之外,在中华猕猴桃的18个bZIP家族成员中,还发现包括bZIP_C保守域在内的8种其他类型的保守域,集中分布在A、C、D和G组bZIP成员中.通过与葡萄和番茄bZIP同源基因的比较,阐明中华猕猴桃基因组的两次三倍倍增是其bZIP基因数目增加的主要原因.中华猕猴桃不同发育时期果实的转录组揭示了参与调控果实成熟的57个bZIP基因的表达水平.本研究阐明了中华猕猴桃bZIP家族成员的进化特征、保守域组成、家族成员数目扩增的主要原因,提供了涉及果实发育的优良候选基因.(图6表2参28)

关键词： bZIP 中华猕猴桃系统进化比较基因组学分析基因表达模式

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响应镉胁迫的水稻WRKY15转录因子基因的分离与表达特征

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中国水稻科学 2018年第2期32卷 103-110页

作者：彭喜旭白宁宁王海华湖南科技大学生命科学学院湖南湘潭411201 重金属污染土壤生态修复与安全利用湖南省高校重点实验室湖南湘潭411201

【目的】镉(Cd)是一种对植物生长发育和人类健康均具有很强毒害效应的重金属元素。WRKY转录因子在抗逆生理过程中起重要的调节作用。为了研究WRKY基因在镉胁迫响应和抗性反应中的作用,【方法】基于基因注释,采用RT-PCR策略从一氧化氮(NO... 详细信息

【目的】镉(Cd)是一种对植物生长发育和人类健康均具有很强毒害效应的重金属元素。WRKY转录因子在抗逆生理过程中起重要的调节作用。为了研究WRKY基因在镉胁迫响应和抗性反应中的作用,【方法】基于基因注释,采用RT-PCR策略从一氧化氮(NO)处理的水稻叶片中分离完整的Os WRKY15编码序列,运用生物信息学软件分析其编码蛋白的结构特征,采用q RT-PCR分析其基因的空间(器官)特异性及诱导表达模式;运用酵母单杂交方法检测其转录激活活性。【结果】克隆了Os WRKY15 c DNA序列,长988 bp,包含一个长825 bp的完整开放读码框,编码274个氨基酸。Os WRKY15具有1个典型的WRKY保守结构域,锌指类型为C2HC,归类于WRKY第3组;拥有一个核定位信号,因此推测为一种核蛋白。酵母单杂交分析表明,它具有转录激活活性。Os WRKY15在根中的表达丰度最高,其次是叶和茎,在颖果、花和干种子中的表达丰度较低;受Cd、NO和脱落酸(ABA)快速且显著诱导,且在根中被诱导的程度比叶中大,而水杨酸、茉莉酸和乙烯对其表达无明显影响。【结论】Os WRKY15是一个具有功能的核蛋白,推测其可能通过NO、ABA介导的信号途径参与水稻对Cd胁迫的抗性反应。

关键词： WRKY转录因子镉基因分离基因表达模式水稻

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菠菜PSY基因家族的鉴定与表达分析

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生物技术通报 2023年第12期39卷 169-178页

作者：任丽乔舒婷葛晨辉魏梓桐徐晨曦上海师范大学生命科学学院上海200234 上海师范大学植物种质资源开发协同创新中心上海200234

八氢番茄红素合成酶(phytoene synthase,PSY)是植物类胡萝卜素合成途径中的第一个限速酶,对植物的生长发育具有重要作用。为了解菠菜(Spinacia oleracea L.)中PSY基因家族功能,本研究通过生物信息学方法对菠菜PSY基因家族成员的数目、... 详细信息

八氢番茄红素合成酶(phytoene synthase,PSY)是植物类胡萝卜素合成途径中的第一个限速酶,对植物的生长发育具有重要作用。为了解菠菜(Spinacia oleracea L.)中PSY基因家族功能,本研究通过生物信息学方法对菠菜PSY基因家族成员的数目、结构、启动子元件、氨基酸特性和基因进化等进行鉴定分析,并利用实时荧光定量PCR技术(RT-qPCR)分析其在菠菜组织中及响应红蓝光比例变化的表达模式,同时测定R1B3(红光∶蓝光=1∶3)和R3B1(红光∶蓝光=3∶1)处理后菠菜总类胡萝卜素含量,进行SoPSYs基因表达量与总类胡萝卜素含量变化的相关性分析。结果显示,菠菜共有4个PSY基因,含有SQS_PSY保守结构域,SoPSY蛋白为亲水性蛋白。菠菜PSY1、PSY2和苋科的甜菜进化关系较近,PSY3、PSY4与番茄PSY3有较近的亲缘关系。菠菜PSY基因启动子序列上存在多种光响应和植物激素相关元件。SoPSY基因具有组织表达特异性,SoPSY1、SoPSY2、SoPSY3仅在叶片中表达,SoPSY4主要在根中表达。菠菜类胡萝卜素含量在R1B3和R3B1处理后均下降。不同基因型菠菜中,各SoPSY基因响应红蓝光比例变化的表达模式具有差异性,其中SoPSY1的表达在栽培类型菠菜中无显著变化,SoPSY2的表达模式在两种类型菠菜中相反,SoPSY3在野生型与栽培型菠菜中表达模式一致,且这3个基因的相对表达水平与总类胡萝卜素含量变化密切相关。本研究为深入了解PSY基因在菠菜中的生物学功能,以及响应红蓝光比例变化的调控机理奠定了基础。

关键词： PSY 菠菜基因家族鉴定基因表达模式红蓝光类胡萝卜素相关性分析

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烤烟成熟期烟叶木质素合成关键酶基因的转录分析

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中国烟草学报 2019年第3期25卷 43-51页

作者：高娅北孙曙光王胜雷陈二龙杨晓亮孙占伟宋朝鹏河南农业大学烟草学院河南郑州450002 湖北中烟工业有限责任公司湖北武汉430040 福建省烟草公司福建福州350003 河南中烟工业有限责任公司河南郑州450016

木质素对烟叶抗性形成具有重要意义,但含量过高会降低卷烟产品品质。为系统探究木质素在烟叶成熟期合成积累的关键点及调控基因的变化规律,本研究以 K326 为试验材料,测定烤烟中部叶成熟期叶片硬度、组织结构、木质素含量及相关合成酶... 详细信息

木质素对烟叶抗性形成具有重要意义,但含量过高会降低卷烟产品品质。为系统探究木质素在烟叶成熟期合成积累的关键点及调控基因的变化规律,本研究以 K326 为试验材料,测定烤烟中部叶成熟期叶片硬度、组织结构、木质素含量及相关合成酶基因的表达模式。结果表明,成熟期是烤烟木质素合成积累的重要时期,在整个成熟期后烟叶木质素含量和硬度呈现先增加后降低的变化规律,在打顶后 30 天,木质素含量和烟叶硬度达到最大值;烟叶成熟期木质素合成酶相关基因的 qRT-PCR 表达分析表明:PAL、C4H、4CL1、CCR1、CCoAOMT5、COMT1、CAD2、PAO1 和 F5H1 基因表达规律与木质素变化规律较为一致,呈现先增加后降低的变化趋势,且在打顶后 30 天,表达量达到峰值。其中 PAL、C4H、CCR1、CAD2 和 PAO1 基因对烟叶木质素合成积累的贡献较大(p<0.01,r=0.93, 0.90, 0.91, 0.90, 0.89;P=0.24, 0.19, 0.16, 0.17, 0.19),是烟叶木质素合成积累过程中的关键调控基因。

关键词：烤烟木质素基因表达模式成熟期

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甘草AQPs基因家族的鉴定及表达分析

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草业科学 2022年第10期39卷 2127-2144页

作者：张亚丽王楠张岗何懿菡颜永刚高静陕西中医药大学药学院陕西西安712046 陕西中医药大学陕西中药资源产业化省部共建协同创新中心/秦药特色资源研究与开发国家重点实验室(培育) 陕西咸阳712083

水通道蛋白(AQPs)定位于质膜,在调控植物水分平衡中具有重要意义。甘草(Glycyrrhiza uralensis)是常用大宗药材,多生长于干旱环境,水分平衡对其生长影响极大。为了解AQPs在甘草中的作用,本研究以生物信息学方法对甘草水通道蛋白基因(GuA... 详细信息

水通道蛋白(AQPs)定位于质膜,在调控植物水分平衡中具有重要意义。甘草(Glycyrrhiza uralensis)是常用大宗药材,多生长于干旱环境,水分平衡对其生长影响极大。为了解AQPs在甘草中的作用,本研究以生物信息学方法对甘草水通道蛋白基因(GuAQPs)家族成员进行分析,结合转录组数据和qRT-PCR分析GuAQPs在非生物胁迫下的表达情况。结果表明,甘草基因家族中共有43个GuAQPs基因,主要分为PIPs、TIPs、NIPs和SIPs 4个亚家族,均含有MIP结构域和NAP基序、Ar/R过滤器及Froger位点,二级结构以无规则卷曲为主。GuAQPs基因启动子区含有响应激素、逆境的顺式作用元件。qRT-PCR结果显示GuTIP2;3在干旱处理或ABA处理后叶和根中都显著上调表达(P <0.05);GuSIP1;4和GuNIP6;1在盐胁迫后叶和根中都显著上调表达(P <0.05),而施加盐胁迫后GuTIP4;1在根中显著下调表达(P <0.05);低温处理下GuNIP6;1和GuSIP1;2在根和叶中都显著下调表达(P <0.05)。通过甘草全基因组中的水通道蛋白基因的鉴定和表达分析,初步了解不同逆境胁迫对甘草AQPs的影响,为进一步研究甘草生长发育的分子机理提供理论基础。

关键词：药用植物水通道蛋白生物信息学系统进化分析非生物胁迫激素处理基因表达模式

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杨树PtROP家族基因的表达分析与功能预测

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林业科学研究 2017年第1期30卷 1-9页

作者：李煜张进王丽娟卢孟柱林木遗传育种国家重点实验室中国林业科学研究院林业研究所北京100091 国家林业局林木培育重点实验室中国林业科学研究院林业研究所北京100091

[目的]为探究ROP基因在林木中的功能。[方法]本研究以杨树为模式,在全基因组水平上对ROP基因的家族成员、基因结构、保守结构域、氨基酸序列相似性及表达模式进行了分析。[结果]显示,杨树PtROP基因家族包含13个成员,不同成员间在进化上... 详细信息

[目的]为探究ROP基因在林木中的功能。[方法]本研究以杨树为模式,在全基因组水平上对ROP基因的家族成员、基因结构、保守结构域、氨基酸序列相似性及表达模式进行了分析。[结果]显示,杨树PtROP基因家族包含13个成员,不同成员间在进化上相对保守,均存在与GTP结合与水解相关的结构域。这些基因在不同组织、不同胁迫条件下的表达具有明显差异,说明它们参与不同的生物学过程。通过构建功能基因网络(functional gene network for poplar)发现PtROP基因主要参与了信号转导过程。[结论]杨树PtROP基因家族包含13个成员参与不同的生物学过程,可能主要参与了信号转导过程。

关键词：杨树 ROP 基因家族基因表达模式

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