检索结果-内蒙古大学图书馆

中国微生态学杂志 2020年第8期32卷 874-879页

作者：米阳任飞飞刘斌刘行凡孙向东郑鹏远马歇尔医学研究中心郑州大学第五附属医院河南郑州450052

目的通过分析幽门螺杆菌感染胃黏膜组织和胃癌细胞系后的差异基因变化,并在癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库和肿瘤基因芯片(Oncomine)数据库进行验证,探究幽门螺杆菌导致胃癌发生、发展的分子机制。方法分析基因表... 详细信息

目的通过分析幽门螺杆菌感染胃黏膜组织和胃癌细胞系后的差异基因变化,并在癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库和肿瘤基因芯片(Oncomine)数据库进行验证,探究幽门螺杆菌导致胃癌发生、发展的分子机制。方法分析基因表达汇编(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库幽门螺杆菌感染相关芯片集GSE5081与GSE70394,绘制维恩图查找幽门螺杆菌感染后共同上调的差异基因。对共同上调的差异基因进行功能富集分析。通过TCGA和Oncomine数据库验证差异基因在胃癌中的表达。利用Kaplan-Meier Plotter数据库和GEPIA数据库分析差异基因表达高低与胃癌患者预后是否存在相关性。结果通过差异基因筛选和维恩分析,两个芯片集共有21个共同上调差异基因。GO分析发现共同上调差异基因主要富集在对细菌来源分子的反应、趋化因子CXCR受体结合、中性粒细胞趋化作用等相关的基因功能上;KEGG通路主要富集在癌症通路、TNF信号通路、趋化因子信号通路等。STRING以及PPI数据库分析发现21个基因中PRDM1、IL10、NRP1、BIRC3、GNG13、CXCL1、CXCL2、CXCL3、CXCL8基因存在有网络关系,属于关键枢纽基因。通过TCGA和Oncomine数据库筛选及验证,发现在胃癌组织中NRP1、CXCL1、CXCL8基因明显上调,结果差异有统计学意义(TCGA数据库中,三者P值均小于0.05,Oncomine数据库中,NRP1:t=4.607,P<0.01;CXCL1:t=5.854,P<0.01;CXCL8:t=5.316,P<0.01)。在Kaplan-Meier Plotter数据库(210615-at芯片:P<0.01;210510-s-at芯片:P<0.01;212298-at芯片:P<0.01)以及GEPIA数据库(P<0.01)两个数据库中,NRP1的高表达均与胃癌的预后负相关。结论不同的数据库均显示NRP1、CXCL1、CXCL8三个基因与幽门螺杆菌感染相关,同时在胃癌中高表达,并且NRP1的高表达与胃癌的不良预后相关,这些结果为进一步探究幽门螺杆菌导致胃癌发生、发展的分子机制提供了重要基础。

关键词：幽门螺杆菌基因表达汇编数据库癌症基因组图谱数据库肿瘤基因芯片数据库胃癌

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miR-3182调控LPPR4表达并抑制成骨细胞分化成熟的研究

引用

中华老年骨科与康复电子杂志 2021年第3期7卷 176-180页

作者：唐晓琳孔霞王槐高李蓉顺德职业技术学院医药卫生学院佛山528300 东莞广东医科大学病理生理学教研室 523808

目的本文通过细胞功能学实验探讨循环miR-3182和其靶基因磷酯磷酸化酶4(LPPR4)在成骨细胞分化成熟中的调控作用。方法本文通过对GEO数据GSE63446及GSE62402分析循环MicroRNA(miRNA)和组织表达谱信使RNA(mRNA)分别在人体低水平骨密度(BMD... 详细信息

目的本文通过细胞功能学实验探讨循环miR-3182和其靶基因磷酯磷酸化酶4(LPPR4)在成骨细胞分化成熟中的调控作用。方法本文通过对GEO数据GSE63446及GSE62402分析循环MicroRNA(miRNA)和组织表达谱信使RNA(mRNA)分别在人体低水平骨密度(BMD)与高水平BMD的表达谱的差异。对差异化表达的miRNA及其潜在调控靶点在表达谱芯片数据进行调控比对。对可能调控BMD水平的LPPR4基因进行过表达和微小RNA(siRNA)干扰方法研究其对人成骨细胞hFOB1.19分化成熟的研究。结果外周循环miR-3182在低BMD人群中显著高表达,其在区分高BMD和低BMD人群有非常好的敏感性和特异性。慢病毒质粒载体介导的miR-3182高表达显著降低细胞LPPR4基因mRNA水平和蛋白水平,并抑制成骨细胞hFOB1.19矿化结节形成。LPPR4蛋白高表达显著增加人成骨细胞hFOB1.19矿化结节的形成率和分化标志物OPG表达水平。结论受miR-3182调控的LPPR4基因促进成骨细胞分化。

关键词： MicroRNA-3182 LPPR4蛋白骨密度基因表达汇编数据库

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