检索结果-内蒙古大学图书馆

肿瘤 2010年第6期30卷 505-509页

作者：樊军卫唐华美严东旺王兆文王晓亮彭志海上海交通大学附属第一人民医院普外科上海200080 上海交通大学附属第一人民医院病理科上海200080

目的:应用长标签基因表达系列分析(long serialan alysis of gene expression,LongSAGE)技术定量分析结肠癌实质细胞转录组,并筛选肿瘤相关基因。方法:应用激光捕获显微切割(laser capture microdissection,LCM)、RNA提取和线性扩增方... 详细信息

目的:应用长标签基因表达系列分析(long serialan alysis of gene expression,LongSAGE)技术定量分析结肠癌实质细胞转录组,并筛选肿瘤相关基因。方法:应用激光捕获显微切割(laser capture microdissection,LCM)、RNA提取和线性扩增方法得到结肠癌实质细胞及其相应正常结肠上皮细胞的反义RNA(antisense RNA,aRNA)样品,构建LongSAGE文库;然后应用SAGE2000软件对所得序列文本进行分析,筛选肿瘤相关基因;最后采用RT-PCR方法验证该差异表达基因。结果:结肠癌细胞LongSAGE文库标签体总数为50542个,识别出基因总数为16497个。正常结肠细胞LongSAGE文库标签体总数为50124个,识别出基因总数为16417个。LongSAGE文库筛选出结肠癌差异表达基因705个(P<0.05)。转化生长因子β诱导基因(transforming growth factor β-induced gene,TGFBI)为LongSAGE文库筛选出的结肠癌相关基因,RT-PCR检测验证了其在结肠癌组织标本中表达上调。结论:LCM-LongSAGE是对结肠癌实质细胞进行定量转录组研究的可行流程。

关键词：结肠肿瘤基因表达谱序列分析,RNA 显微切割基因表达系列分析基因,TGFBI

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强大的广谱基因表达分析技术——基因表达系列分析法

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四川动物 2006年第3期25卷 653-657,637页

作者：吴志革邹方东生物资源与生态环境教育部重点实验室四川大学生命科学学院成都610064

基因表达系列分析(serial analysis of gene expression,SAGE)是一项强大的数字化分析基因组整体表达模式的技术。它的诞生为定量、全局性地分析特定细胞内的基因表达情况提供了可能。本文介绍了SAGE技术的基本原理、最新进展和应用。

关键词：基因表达系列分析原理进展应用

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基因表达系列分析的进展及其在神经肿瘤领域中的应用

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中国神经肿瘤杂志 2005年第2期3卷 148-154页

作者：胡震陈忠平中山大学肿瘤防治中心神经外科广东广州510060

随着人类基因组计划的完成,人类已经进入"后基因组"时代,以功能鉴定为目标的功能基因组学成为基因组研究的重点。基因表达分析是基因功能研究中最重要的组成部分。基因表达系列分析(serialanalysisofgeneexpression,SAGE)是... 详细信息

随着人类基因组计划的完成,人类已经进入"后基因组"时代,以功能鉴定为目标的功能基因组学成为基因组研究的重点。基因表达分析是基因功能研究中最重要的组成部分。基因表达系列分析(serialanalysisofgeneexpression,SAGE)是一种可以直接对细胞基因表达进行定量检测的实验技术。SAGE技术极具竞争力,不但能够获得特定细胞或组织基因表达谱的全貌,而且可以通过比较不同状态下的表达谱来确定某一条件下细胞表达的特定基因。本文系统地回顾了基因表达系列分析技术的进展及其在神经肿瘤领域中的应用。

关键词：基因表达系列分析中枢神经系统肿瘤

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杜氏利什曼原虫两个发育阶段基因表达系列分析文库的构建及HSP90在其阶段转变过程中的作用

杜氏利什曼原虫两个发育阶段基因表达系列分析文库的构建及HSP90...

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作者：李巧丽上海交通大学

学位级别：博士

利什曼原虫可在人体导致多种疾病,是对人体危害严重的人兽共患寄生虫病,其中最致命的是由杜氏利什曼原虫引起黑热病。杜氏利什曼原虫生活史有前鞭毛体及无鞭毛体两个时期。利什曼原虫由前鞭毛体向无鞭毛体的转变过程是一个复杂的包括形... 详细信息

利什曼原虫可在人体导致多种疾病,是对人体危害严重的人兽共患寄生虫病,其中最致命的是由杜氏利什曼原虫引起黑热病。杜氏利什曼原虫生活史有前鞭毛体及无鞭毛体两个时期。利什曼原虫由前鞭毛体向无鞭毛体的转变过程是一个复杂的包括形态学及生理学的改变。这一过程中发生的改变不仅导致前鞭毛体形态上的变化,还使其逃避了宿主巨噬细胞的杀伤存活下来。目前为止,各阶段疫苗都为利什曼原虫病的防治发挥着作用,但各阶段疫苗都存在缺陷。比如说还没找到一种或几种能激发对所有原虫产生保护免疫的抗原,疫苗的构建结构也不理想。但是,利什曼原虫在实验室很容易得到,并且一些新技术的应用都为解决这些问题提供了有效的途径和希望。研究这个过程中的基因表达谱的改变有助于我们找出与利什曼原虫阶段转变有关的一些重要基因。以前也有一些学者用双向电泳和基因芯片的方法对利什曼原虫的两个发育阶段的表达谱进行了研究。双向电泳由于技术的原因,找到的差异蛋白数量比较少;基因芯片的优点在于可以高通量的检测基因表达情况,但由于探针序列一般来自于已知基因的cDNA或EST库,只能检测已知基因,不能发现未知基因。因此,本研究以体外培养的前鞭毛体及无鞭毛体为研究对象,引入基因表达系列分析的方法,建立这两个发育阶段基因表达系列分析文库,希望为进一步的探讨其转化机制,以及转化过程与宿主的关系提供更多的线索。在以前的研究中,研究者们报道了多种利什曼原虫前鞭毛体的培养方法,简单重复文献中的培养方法没有成功得到杜氏利什曼原虫MHOM/CN/Gansu-8801种的无鞭毛体,总结后我们发现不同种的利什曼原虫其前鞭毛体的培养步骤和培养条件均有所不同。因此,在本研究中我们首先改进了杜氏利什曼原虫MHOM/CN/Gansu-8801种无外源细胞污染的无鞭毛体体外培养的方法,得到了大量的无鞭毛体供后续研究。接下来,我们应用基因表达系列分析(Serial analysis of gene expression, SAGE)的方法建立了杜氏利什曼原虫前鞭毛体及无鞭毛体两个发育阶段基因表达文库。一共获得总标签数为40,431个,在前鞭毛体文库和无鞭毛体文库中分别为20,299和20,132个标签。大约89%的基因在两个文库中均有表达,有968个基因的表达水平在两个文库之间有显著性差异。其中,326个基因在无鞭毛体文库中是表达下调的,642个基因表达上调。我们选取了两个文库中表达差异较大的标签,BLAST查找比对找到28个标签与其对应的基因,这其中包括histone 4,elongation factor 1-alpha,alpha tubulin,acidic ribosomal protein,LACK,ubiquitin-fusion protein,40S ribosomal protein S2,40S ribosomal protein S33,60S ribosomal protein l21,60S ribosomal protein L28等基因。在这其中,延长因子1-alpha和LACK基因已经用于制备多克隆抗体,做为新的抗利什曼原虫药物和疫苗研究的候选基因。而其它表达差异显著的基因也有可能成为新的药物靶标。我们用实时定量PCR的方法选取了7个基因对SAGE的结果进行了验证,结果表明实时定量PCR与SAGE所揭示的基因在杜氏利什曼原虫两个发育阶段表达变化是一致的。其次,在培养无鞭毛体的过程中,我们发现有研究报道用HSP90的特异性抑制剂葛尔德霉素(Geldanamycine, GA)可以在室温和碱性条件下诱导利什曼原虫前鞭毛体转变为无鞭毛体,而仅仅在碱性条件下提高培养温度到37℃又可以诱导前鞭毛体发生凋亡。因此,我们观测了HSP90特异性抑制剂GA在利什曼原虫前鞭毛体向无鞭毛体转化过程中的作用,在温度升高的条件下,GA抑制HSP90后会诱导前鞭毛体凋亡还是发生阶段转变?期望找到更多关于HSP90在这一转化过程中的作用的证据及其发挥作用的可能途径。结果发现,用GA处理后的细胞在光学显微镜下和扫描电镜下观察可见体积变小、细胞膜完整但出现发泡现象、染色质浓缩、边缘化,核膜裂解等典型的凋亡形态。用TUNEL原位末端标记法(TdT--mediated dUTP Nick-End Labeling)处理细胞后,在激光共聚焦显微镜下可以直观看到细胞有明显的绿色荧光的阳性凋亡信号,并随时间增加而增多。用TUNEL法经流式细胞仪检测细胞发生凋亡的情况及比例,结果显示,GA诱导杜氏利什曼原虫前鞭毛体在阶段转变过程中发生凋亡这一作用呈时间和剂量依赖性。我们用PI染色后,通过流式细胞仪分析了GA对杜氏利什曼原虫细胞周期的影响,GA处理24h后细胞阻滞于G0/G1期,伴有S期减少,并出现明显的

关键词：基因表达系列分析利什曼原虫阶段转变基因表达谱热休克蛋白凋亡

来源：评论

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基因表达系列分析及在移植耐受研究中的应用进展

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国际免疫学杂志 2007年第6期30卷 381-384页

作者：王丹候桂华山东大学医学院实验核医学研究所济南250012

基因表达系列分析(SAGE)是一种能够快速、详细、准确地反映生物体内在不同的发育期及生理病理状态下基因表达水平的高效技术。SAGE 不需要已知基因序列,可以发现新的转录本,可以对组织、细胞进行基因表达的定量定性研究,在生物学及医学... 详细信息

基因表达系列分析(SAGE)是一种能够快速、详细、准确地反映生物体内在不同的发育期及生理病理状态下基因表达水平的高效技术。SAGE 不需要已知基因序列,可以发现新的转录本,可以对组织、细胞进行基因表达的定量定性研究,在生物学及医学研究中得到了广泛的应用。

关键词：基因表达系列分析移植耐受

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基因表达系列分析在肿瘤研究中的应用

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中国科技期刊数据库医药 2022年第4期 163-166页

作者：迟静滁州城市职业学院安徽滁州239000

癌症是一种引发某一组织有关众多基因表达发生改变的一种疾病,基因表达系列分析应用于癌症的研究中,令一同进行大量相关基因表达的分析变为可能。该项技术借助获取代表某一转录物特异性相关信息标签,并对标签的丰度加以定量分析,代表着... 详细信息

癌症是一种引发某一组织有关众多基因表达发生改变的一种疾病,基因表达系列分析应用于癌症的研究中,令一同进行大量相关基因表达的分析变为可能。该项技术借助获取代表某一转录物特异性相关信息标签,并对标签的丰度加以定量分析,代表着转录物相应的表达水平。基因表达系列分析不但可以检测细胞中全部的mRNA表达,并且能够发现一些潜在的未知基因,在基因表达谱的研究中具有十分显著的优势。本文综述了基因表达系列分析在肿瘤研究中的应用,从肿瘤组织基因表达谱的获取、揭示肿瘤的发生机理等方面展开论述,认为基因表达系列分析在肿瘤研究和诊断中具有重要的应用,对于人类认识肿瘤与治疗肿瘤疾病具有深远的影响。

关键词：肿瘤基因表达系列分析应用

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基因表达系列分析技术及其应用领域

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动物科学与动物医学 2004年第12期21卷 11-12页

作者：廉慧锋马兴元山西出入境检验检疫局山西太原030024 华东理工大学生物工程学院上海200237

基因表达系列分析(serial analysis gene express,SAGE)是近几年发展起来的一种快速分析基因表达信息的技术.它通过快速而详细地分析成千上万个EST(expressed sequenced tags)来寻找出表达丰度不同的SAGE标签序列,从而接近完整地获得基... 详细信息

基因表达系列分析(serial analysis gene express,SAGE)是近几年发展起来的一种快速分析基因表达信息的技术.它通过快速而详细地分析成千上万个EST(expressed sequenced tags)来寻找出表达丰度不同的SAGE标签序列,从而接近完整地获得基因组表达信息.它不但能快速、详细地同时分析成千上万个基因转录子的丰富信息,还能发现新基因,因此是基因表达定性和定量研究的一种有效工具,为了解正常作用机制、肿瘤发病机制、信号分子调控机制等提供了基础工具.近年来,通过此技术对动植物及人类众多组织、细胞的基因表达情况进行了分析研究.

关键词：基因表达系列分析基因组表达 SAGE 新基因丰度 EST 基因转录定量研究快速发现

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基因表达系列分析研究进展

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四川食品与发酵 2006年第3期42卷 11-14页

作者：张蜀艳李政成都市工业学校四川大学生命学院

由于基因组计划的进展,基因组学的研究已从结构基因组学转向功能基因组学。作为一种新的研究基因表达的有效工具,基因表达系列分析(SerialAnalysisofGene,SAGE)技术能同时对大量的转录物进行定性和定量分析。本文介绍了SAGE的工作原理... 详细信息

由于基因组计划的进展,基因组学的研究已从结构基因组学转向功能基因组学。作为一种新的研究基因表达的有效工具,基因表达系列分析(SerialAnalysisofGene,SAGE)技术能同时对大量的转录物进行定性和定量分析。本文介绍了SAGE的工作原理和实验路线,以及最新的技术进展和应用。

关键词：基因表达系列分析 SAGE标签染色体图谱

来源：评论

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基因表达系列分析技术在消化道肿瘤研究中的应用

引用

新乡医学院学报 2007年第3期24卷 311-314页

作者：宋向凤王辉新乡医学院免疫学教研室河南新乡453003

基因表达系列分析技术(SAGE)是基因表达定性和定量研究的一种新的有效手段。它不需要事先知道其基因序列,能同时对数千个转录体的丰度进行定量研究。近年来人们利用此技术对正常和疾病组织细胞的基因表达信息进行了广泛的研究,作者就SAG... 详细信息

基因表达系列分析技术(SAGE)是基因表达定性和定量研究的一种新的有效手段。它不需要事先知道其基因序列,能同时对数千个转录体的丰度进行定量研究。近年来人们利用此技术对正常和疾病组织细胞的基因表达信息进行了广泛的研究,作者就SAGE在消化道肿瘤研究中的应用进展作一综述。

关键词：基因表达系列分析消化道肿瘤组织细胞

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基因表达系列分析及其应用

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国外医学（分子生物学分册） 2002年第1期24卷 4-7页

作者：王钧白俊第四军医大学西京医院全军消化病研究所西安710032

基因表达系列分析 (serial analysis of gene expression,SAGE)是一种快速分析基因表达信息的技术 ,它能够直接读出任何一种类型细胞或组织的基因表达信息 ,因此是研究基因表达定性和定量的一种有效工具。近年来人们利用此技术对动植物... 详细信息

基因表达系列分析 (serial analysis of gene expression,SAGE)是一种快速分析基因表达信息的技术 ,它能够直接读出任何一种类型细胞或组织的基因表达信息 ,因此是研究基因表达定性和定量的一种有效工具。近年来人们利用此技术对动植物及人类的基因表达信息进行了广泛的研究 ,本文就 SAGE特点、方法及其应用作一简要介绍。

关键词：基因表达调控基因表达系列分析 EST 应用

来源：评论

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