检索结果-内蒙古大学图书馆

新乡医学院学报 2007年第3期24卷 311-314页

作者：宋向凤王辉新乡医学院免疫学教研室河南新乡453003

基因表达系列分析技术(SAGE)是基因表达定性和定量研究的一种新的有效手段。它不需要事先知道其基因序列,能同时对数千个转录体的丰度进行定量研究。近年来人们利用此技术对正常和疾病组织细胞的基因表达信息进行了广泛的研究,作者就SAG... 详细信息

基因表达系列分析技术(SAGE)是基因表达定性和定量研究的一种新的有效手段。它不需要事先知道其基因序列,能同时对数千个转录体的丰度进行定量研究。近年来人们利用此技术对正常和疾病组织细胞的基因表达信息进行了广泛的研究,作者就SAGE在消化道肿瘤研究中的应用进展作一综述。

关键词：基因表达系列分析消化道肿瘤组织细胞

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基因表达系列分析及其应用

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国外医学（分子生物学分册） 2002年第1期24卷 4-7页

作者：王钧白俊第四军医大学西京医院全军消化病研究所西安710032

基因表达系列分析 (serial analysis of gene expression,SAGE)是一种快速分析基因表达信息的技术 ,它能够直接读出任何一种类型细胞或组织的基因表达信息 ,因此是研究基因表达定性和定量的一种有效工具。近年来人们利用此技术对动植物... 详细信息

基因表达系列分析 (serial analysis of gene expression,SAGE)是一种快速分析基因表达信息的技术 ,它能够直接读出任何一种类型细胞或组织的基因表达信息 ,因此是研究基因表达定性和定量的一种有效工具。近年来人们利用此技术对动植物及人类的基因表达信息进行了广泛的研究 ,本文就 SAGE特点、方法及其应用作一简要介绍。

关键词：基因表达调控基因表达系列分析 EST 应用

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基因表达系列分析(SAGE)技术在肿瘤研究中的应用

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生命的化学 2004年第4期24卷 322-324页

作者：潘泽民潘晓琳杨磊周祖钊石河子大学医学院新疆石河子832002

基因表达系列分析 (serialanalysisofgeneexpression ,SAGE)是一项高效、快捷、低成本的研究生物基因表达水平的方法 ,广泛用于各种肿瘤的分析研究。SAGE技术对于全面分析肿瘤组织基因表达谱、寻找肿瘤特异性表达新基因、发现肿瘤组织... 详细信息

基因表达系列分析 (serialanalysisofgeneexpression ,SAGE)是一项高效、快捷、低成本的研究生物基因表达水平的方法 ,广泛用于各种肿瘤的分析研究。SAGE技术对于全面分析肿瘤组织基因表达谱、寻找肿瘤特异性表达新基因、发现肿瘤组织特异标志物和揭示肿瘤发病的分子机制发挥重要的作用。随着“肿瘤基因组解剖工程”(CGAP)的进行 ,CGAPSAGE可以通过网站分析和展示SAGE数据 ,并自动的将基因名称和SAGE转录物水平联系起来。因此 ,这为SAGE技术深入和广泛研究肿瘤提供了方便。

关键词：基因表达系列分析 SAGE 基因表达肿瘤基因表达谱

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基因表达系列分析技术的原理及应用进展

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国外医学（分子生物学分册） 2000年第5期22卷 262-265页

作者：艾国平第三军医大学全军复合伤研究所重庆400038

生物体的特性由内在基因表达决定。个体发育和疾病发生与基因选择性表达密切相关,因此,要了解生命活动和疾病发生、发展的分子机制,就必须深入了解基因表达的时空性和差异性。基因表达系列分析技术(SAGE)是新近建立的能够定性和定量研... 详细信息

生物体的特性由内在基因表达决定。个体发育和疾病发生与基因选择性表达密切相关,因此,要了解生命活动和疾病发生、发展的分子机制,就必须深入了解基因表达的时空性和差异性。基因表达系列分析技术(SAGE)是新近建立的能够定性和定量研究基因表达的有效工具,不仅可提供基因组表达丰度较完整的数量信息,而且还可帮助寻找和发现新基因。

关键词：基因表达系列分析原理 SAGE 实验流程

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基因表达系列分析(SAGE)的研究进展及其应用

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沧州师范学院学报 2004年第3期20卷 25-26页

作者：韩婧沧州师专生物系河北沧州061001

基因表达系列分析(SAGE)是一种新的基因表达分析方法,它能对特定细胞或组织中的大量转录本同时进行定量分析。SAGE可以定量分析已知基因及分析未知的基因表达情况。综述了SAGE技术的基本原理和实验流程以及近年来SAGE方法上的改进和应用。

关键词：基因表达系列分析 SAGE标签应用

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基因表达系列分析技术在植物基因表达中的研究进展

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中国麻业科学 2009年第4期31卷 233-237页

作者：杨学刘丽艳关凤芝李柱刚吴广文王珣路颖陈浩黑龙江省农业科学院经济作物研究所黑龙江哈尔滨150086 黑龙江省农业科学院生物技术研究所黑龙江哈尔滨150086

基因表达系列分析(Serial analysis of gene expression,SAGE)是一种研究真核细胞表达基因信息的高通量检测技术,它能对细胞内所有表达基因进行定性与定量分析。SAGE技术在植物方面的应用相对较少,但在植物抗病性研究中的应用近几年发... 详细信息

基因表达系列分析(Serial analysis of gene expression,SAGE)是一种研究真核细胞表达基因信息的高通量检测技术,它能对细胞内所有表达基因进行定性与定量分析。SAGE技术在植物方面的应用相对较少,但在植物抗病性研究中的应用近几年发展很快。综述介绍了SAGE技术的原理与操作、实施的方法与步骤、SAGE技术的主要优点及在植物基因表达分析中的应用。明确SAGE的优势与它的缺陷,在实际应用中加以完善及采取必要的辅助方案,这样就可以构建较完美的设计思想。

关键词：基因表达系列分析植物基因 SAGE数据库克隆

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基因表达系列分析技术研究进展

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医学分子生物学杂志 2004年第3期1卷 168-171页

作者：王怡王海平王全立军事医学科学院野战输血研究所北京市100850

基因表达系列分析技术(SAGE)是一种新的基因表达分析技术,它可以大量获取全基因组范围基因表达的类别并量化分析。由于其克服了基因丰度的影响,SAGE在新基因的发现中具有独特的优点。同时,SAGE技术被成功应用于特异组织或细胞的转录组... 详细信息

基因表达系列分析技术(SAGE)是一种新的基因表达分析技术,它可以大量获取全基因组范围基因表达的类别并量化分析。由于其克服了基因丰度的影响,SAGE在新基因的发现中具有独特的优点。同时,SAGE技术被成功应用于特异组织或细胞的转录组研究、mRNA群体间的全局化比较以及差异表达基因染色体分布的分析。文章主要述及了SAGE技术的原理、特点及其在应用上的最新进展。

关键词：基因表达系列分析新基因表达谱

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系统性红斑狼疮外周血单个核细胞基因表达系列分析文库的构建及初步分析

系统性红斑狼疮外周血单个核细胞基因表达系列分析文库的构建及初...

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作者：黄睿华中科技大学

学位级别：硕士

第一部分系统性红斑狼疮外周血单个核细胞基因表达系列分析文库的构建目的:构建系统性红斑狼疮外周血单个核细胞基因表达系列分析(serial analysis of gene expression,SAGE)文库方法:采集3个家族性系统性红斑狼疮患者外周血各5ml,混... 详细信息

第一部分系统性红斑狼疮外周血单个核细胞基因表达系列分析文库的构建目的:构建系统性红斑狼疮外周血单个核细胞基因表达系列分析(serial analysis of gene expression,SAGE)文库方法:采集3个家族性系统性红斑狼疮患者外周血各5ml,混合在一起提取单个核细胞。采用三处改良的SAGE技术构建SAGE文库,三处改良分别为1)用交联有oligo(dT)25的磁珠直接抽提mRNA,并在同一反应管内进行双链cDNA的合成和NlaⅢ酶切,避免了原始SAGE方法中两次酚/氯仿抽提、乙醇沉淀造成的DNA损失。2)进行二次PCR扩增。即在第一次100bp标签扩增纯化后,再行一次短循环数的PCR扩增,以获得足量的纯度相对较高的100bp标签。3)利用零背景的pZErO?-1质粒进行克隆,提高了效率。随机挑选237个转化菌克隆进行菌落PCR鉴定,以了解重组体是否转入转化菌及插入片段的大小。对部分阳性克隆进行测序,验证插入片段是否符合SAGE标签排列方式。结果:从3个家族性红斑狼疮患者外周血各5ml中共分离出1.6×106个单个核细胞。初步构建的SAGE文库已获得600个克隆,随机取237个克隆进行菌落PCR分析,其中216个克隆中质粒插入片段大于250bp,占91%。每个重组体中插入标签为数十个不等,以10-40个标签为多。对部分克隆测序证实插入的串联体序列为数百个碱基以CATG间隔,两个CATG之间约有20个碱基,其碱基序列排列方式符合SAGE标签排列。结论:对SAGE技术进行了改良,使之可应用于含RNA量少的组织或细胞。应用改良SAGE的技术成功构建了系统性红斑狼疮外周血单个核细胞SAGE文库,可了解系统性红斑狼疮外周血单个核细胞基因表达谱,并为筛选系统性红斑狼疮患者差异表达基因奠定了基础。第二部分系统性红斑狼疮外周血单个核细胞基因表达系列分析文库的初步分析目的:研究系统性红斑狼疮外周血单个核细胞基因表达模式。方法:构建系统性红斑狼疮外周血单个核细胞基因表达系列分析文库完成后,随机选取98个克隆进行大规模标签(tag)测序,得到的98个测序文件用SAGE 2000 V 4.5软件分析其标签表达的特点。登陆http://***/SAGEmap网站,下载人类SAGE标签参考数据库,将初步获得的标签序列与人类SAGE标签参考数据库相比较,得到系统性红斑狼疮外周血单个核细胞的SAGE标签对应的基因信息。登陆http://***/SAGEmap网站,将系统性红斑狼疮外周血单个核细胞SAGE文库中表达丰度位于前30的单配对标签提交查询,获得相对应的基因信息。结果:对98个克隆进行测序,获得1814个SAGE标签,由1286个序列不同的独立标签组成。这些标签中,单拷贝占86.6%,2-19拷贝占13%,仅0.2%的标签多于20拷贝。能与已知基因相配的标签占68.4%,其中41.1%能与多个基因匹配;31.6%的标签不能和已知基因配对,它们可能代表新基因。表达丰度为前三十的基因多为核糖体基因、参与细胞基本代谢的基因。结论:本研究勾画出SLE PBMCs基因表达概貌。更多标签的测序可获得完整的系统性红斑狼疮外周血单个核细胞基因表达谱,构建正常人外周血单个核细胞SAGE文库后,通过对比分析正常人和SLE患者的SAGE文库的生物学信息,将有助于筛选系统性红斑狼疮的差异表达基因。

关键词：基因表达系列分析系统性红斑狼疮外周血单个核细胞红斑狼疮系统性

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基于多分类支持向量机的基因表达系列分析

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生物信息学 2010年第4期8卷 356-358,363页

作者：苏洪全朱义胜姜玉梅大连海事大学信息科学技术学院大连116026 齐齐哈尔市第二十九中学黑龙江齐齐哈尔161000

基因表达系列分析(Serial analysis of gene expression,SAGE)是一种基因表达数据,反映了细胞内的动态变化。模式识别和可视化方法是分析SAGE数据的基本工具,但是由于缺乏描述数据的统计特性,传统的聚类分析技术不适用于SAGE数据的分析... 详细信息

基因表达系列分析(Serial analysis of gene expression,SAGE)是一种基因表达数据,反映了细胞内的动态变化。模式识别和可视化方法是分析SAGE数据的基本工具,但是由于缺乏描述数据的统计特性,传统的聚类分析技术不适用于SAGE数据的分析。本文提出了一种基于多分类和支持向量机的SAGE数据的分析法。经过对模拟数据和人类癌症SAGE数据的分析,基于径向基核函数的多分类支持向量机算法"一对一"(one-against-one,OAO)算法提供了比PoissonC和PoissonS更好的分类结果。

关键词：基因表达系列分析多分类支持向量机核函数

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系统性红斑狼疮外周血单个核细胞基因表达系列分析文库的初步解析

系统性红斑狼疮外周血单个核细胞基因表达系列分析文库的初步解析

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全国自身免疫性疾病专题研讨会暨第十一次全国风湿病学学术年会

作者：李守新黄睿李新建王晓慧刘雯江薇沈寿引雷小妹刘晓城何培根武汉同济医院风湿科武汉同济医院风湿科武汉同济医院风湿科武汉同济医院风湿科武汉同济医院风湿科武汉同济医院风湿科武汉同济医院风湿科武汉同济医院风湿科武汉同济医院风湿科武汉同济医院风湿科

目的:研究系统性红斑狼疮(SLE)外周血单个核细胞(PBMCs)基因表达模式。方法:构建SLE PB- MCs基因表达系列分析(serial analysis of gene expression,SAGE)文库完成后,大规模标签(tag)测序,并利用SAGE 2000 V 4．5软件分析。结果:文库测... 详细信息

目的:研究系统性红斑狼疮(SLE)外周血单个核细胞(PBMCs)基因表达模式。方法:构建SLE PB- MCs基因表达系列分析(serial analysis of gene expression,SAGE)文库完成后,大规模标签(tag)测序,并利用SAGE 2000 V 4．5软件分析。结果:文库测序共1814个SAGE tag,由1286序列不同的tag组成。这些tag中,单拷贝占86．6％,2-19拷贝占13％,仅0．2％的tag多于20拷贝。能与已知表达序列相

关键词：系统性红斑狼疮外周血单个核细胞基因表达系列分析

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