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AND代表“并且”；OR代表“或者”；NOT代表“不包含”；(注意必须大写,运算符两边需空一格)

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范例一：(K=图书馆学 OR K=情报学) AND A=范并思 AND Y=1982-2016
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文献类型

1 篇 学位论文

馆藏范围

1 篇 电子文献
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日期分布

学科分类号

1 篇 农学
- 1 篇 农业资源与环境

主题

1 篇 dna条形码数据库
1 篇 传统方法比对
1 篇 生物监测
1 篇 环境dna宏条形码
1 篇 太湖大型底栖动物

机构

1 篇 南京大学

作者

1 篇 金珂

语言

1 篇 中文

检索条件"主题词=太湖大型底栖动物"

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详细简洁

排序：

太湖大型底栖动物环境DNA宏条形码快速监测技术应用研究

太湖大型底栖动物环境DNA宏条形码快速监测技术应用研究

引用

作者：金珂南京大学

学位级别：硕士

全球生物多样性的下降是21世纪人类共同面对的最严峻挑战之一,对地球的生态健康和生态系统服务功能都产生了重大影响,加强对生态系统生物多样性的监测与评估有重要的意义和价值。淡水生态系统作为全球生态系统的重要组成部分,近年来由... 详细信息

全球生物多样性的下降是21世纪人类共同面对的最严峻挑战之一,对地球的生态健康和生态系统服务功能都产生了重大影响,加强对生态系统生物多样性的监测与评估有重要的意义和价值。淡水生态系统作为全球生态系统的重要组成部分,近年来由于人类活动而遭破坏,影响人类的可持续发展。大型底栖动物作为淡水生态系统食物网的核心物种,对人类活动干扰胁迫和气候变化等反应灵敏,对于生态系统健康具有指示意义,是淡水生态系统监测和评估的主要目标类群之一。传统的底栖动物多样性监测方法依赖于对底栖物种的形态学鉴定,效率较低、精准性差,严重阻碍了大规模、高频次监测的开展。随着下一代测序技术（NGS）的发展,环境DNA宏条形码技术为监测底栖动物提供了新方法,有望显著提升水生生态系统生物监测和生态健康评估水平。为建立适合我国的环境DNA底栖动物快速监测和生态健康评估技术体系,尚存在以下技术难题:1)缺乏本土物种条形码参考数据库,限制了物种识别的可靠性;2)规范化的底栖动物环境宏条形码监测方法尚未建立,实际监测中缺乏技术依据;3)环境DNA宏条形码技术监测尚未在流域尺度下开展实践应用,其有效性和可靠性亟需检验。针对以上技术难题,本研究拟建立一套适合太湖流域本土底栖动物的环境DNA宏条形码监测方法,主要目标包括:1)建立太湖流域本土底栖动物DNA条形码数据库:基于底栖动物DNA条形码研究中最常用的COI基因,利用太湖流域本土底栖动物样本,在形态学鉴定的基础上,对物种DNA条形码进行扩增与测序,建立包含多种规范化信息在内的太湖流域本土物种条形码数据库。2)建立太湖底栖动物环境DNA监测标准化方法:基于已被初步证明具有应用潜力的酒精浸提法,确定具体的操作方法、实验参数等,将监测结果与形态学结果比较,验证进一步应用于监测的可行性。3)环境DNA宏条形码用于太湖流域底栖动物的大规模生物监测和生态评价:利用环境DNA宏条形码技术监测整个太湖流域的底栖动物多样性,与传统的形态学监测结果比对,确定两种方法在物种识别和生态健康评价中的一致性。通过大规模实践验证环境DNA宏条形码快速监测的有效性和可靠性,实现快速、便捷、高通量监测,推动水生生物监测的业务化开展,使生物监测在生态环境管理中的作用得以充分体现,为管理决策提供技术支撑。本研究的主要结果与结论是:1)建立了太湖流域本土底栖动物DNA条形码数据库,获得共计58种太湖流域底栖动物的105条特征条形码序列,其中40个物种条形码为国内首次记录。数据库涵盖了摇蚊科、软体动物、寡毛纲动物等主要指示物种,包括霍甫水丝蚓、河蚬、前突摇蚊等太湖流域最常见的优势物种。2)确定了底栖动物环境DNA酒精浸提法的样品采集、前处理及提取的流程和相关参数,实现了环境DNA方法的标准化。环境DNA方法可以识别出颤蚓科、摇蚊科、田螺科、蚬科等太湖流域最常见的指示底栖动物类群,以及仙女虫科、纹石蛾科等形态学未能检出的类群,识别结果能够代表形态学检出物种数和生物量的约50%,证明了其用于底栖物种识别的可行性。3)利用环境DNA宏条形码技术在太湖流域共77个点位进行了两轮大型底栖动物多样性监测,与同步进行的形态学监测结果比对。研究发现环境DNA方法能检出更多的底栖动物物种,在科、属、种水平检出的分类单元数分别是形态学的106%和132%和155%,对寡毛纲动物具有更高的分辨率。环境DNA方法能够很好地识别形态学优势物种,检出的科和属能够代表形态学结果中绝大多数（90%以上）的生物量和个体数,以及大部分（60%以上）的物种数。两种方法对同一物种的检出频次显著相关（R2>0.7,p<0.0001）,总体检出一致率高达72%。4)利用环境DNA宏条形码监测结果进行生态健康评价,计算的底栖动物完整性指数B-IBI与形态学方法显著相关（R2=0.3312,p<0.0001）,可以区分生态健康等级的优劣,绝大多数（94%）点位生态等级划分误差在1级以内,且在流域底栖动物完整性空间格局的描绘上高度重合。综上所述,本研究初步建立了太湖本土底栖动物条形码数据库,对底栖动物环境DNA宏条形码监测流程进行了规范化,通过在流域尺度上的应用证明了环境DNA宏条形码技术用于底栖动物生物监测和生态评价的有效性和可靠性。本研究的结果将有助于未来底栖动物环境DNA宏条形码监测的方案设计,为环境DNA宏条形码快速监测技术的相关研究和业务化运行提供重要的参考案例,并有助于发展形成一套完整、科学、便捷、可行的底栖动物监测技术体系,为环境管理部门提供技术支持。

关键词：环境DNA宏条形码 DNA条形码数据库太湖大型底栖动物生物监测传统方法比对

来源：评论

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