检索结果-内蒙古大学图书馆

临床医学进展 2025年第2期15卷 590-597页

作者：纪雪莲徐绣宇重庆医科大学附属第一医院医学检验科重庆

感染性疾病是临床常见疾病,快速明确病原微生物对于指导合理治疗方案至关重要。传统的病原体检测方法耗时长、阳性率低,难以满足临床需求。宏基因组二代测序(metagenomic next-generation sequencing, mNGS)作为一种新型病原检测方法,... 详细信息

感染性疾病是临床常见疾病,快速明确病原微生物对于指导合理治疗方案至关重要。传统的病原体检测方法耗时长、阳性率低,难以满足临床需求。宏基因组二代测序(metagenomic next-generation sequencing, mNGS)作为一种新型病原检测方法,不依赖于传统的微生物培养,也不需要特异性扩增,且其检测范围广泛,可检测细菌、病毒、真菌、寄生虫、罕见病原体,甚至未知病原体,近年来,已广泛应用于临床病原学诊断。尤其是基于血浆游离DNA (cell-free DNA, cfDNA)的mNGS检测,因其采样便捷、无创性及对全身感染的反映能力,已在临床诊断中得到了广泛的关注和应用。本文综述了血浆cfDNA mNGS在感染性疾病诊断中的临床价值、研究进展及未来展望,旨在为相关研究和临床实践提供参考。Infectious diseases are common in clinical practice, and the rapid identification of causative pathogens is crucial for guiding rational treatment strategies. Conventional microbiological tests are time-consuming and have low positivity rates, making it difficult to meet clinical needs. Metagenomic next-generation sequencing (mNGS), as an emerging pathogen detection method, does not rely on conventional microbial culture or specific amplification. With its broad detection scope, mNGS can identify bacteria, viruses, fungi, parasites, rare pathogens, and even unknown pathogens. In recent years, it has been widely applied in clinical pathogen diagnosis. In particular, plasma cell-free DNA (cfDNA) mNGS has gained significant attention and widespread clinical application due to its ease of sampling, noninvasive nature, and ability to reflect systemic infections. This review summarizes the clinical value, recent advances, and future perspectives of plasma cfDNA mNGS in the diagnosis of infectious diseases, aiming to provide insights for further research and clinical practice.

关键词：宏基因组二代测序血浆游离DNA 感染

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支气管肺泡灌洗液宏基因组二代测序在儿童肺部感染病原体诊断中的价值

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国际检验医学杂志 2025年第2期46卷 157-162页

作者：王晶晶张翀甘肃中医药大学公共卫生学院甘肃兰州730050 甘肃省妇幼保健院科研中心甘肃兰州730050

目的探讨支气管肺泡灌洗液(BALF)宏基因组二代测序(mNGS)对儿童肺部感染的病原体诊断价值。方法分析2023年3月1日至2024年3月1日在甘肃省妇幼保健院住院治疗的109例肺部感染患儿的临床资料,比较患儿BALF mNGS与常规微生物学检测(CMT)结... 详细信息

目的探讨支气管肺泡灌洗液(BALF)宏基因组二代测序(mNGS)对儿童肺部感染的病原体诊断价值。方法分析2023年3月1日至2024年3月1日在甘肃省妇幼保健院住院治疗的109例肺部感染患儿的临床资料,比较患儿BALF mNGS与常规微生物学检测(CMT)结果。结果109例患儿BALF mNGS检出率(96.3%)高于CMT(66.1%),差异有统计学意义(P<0.01);BALF mNGS共检出280株病原菌,CMT共检出130株病原菌,mNGS能够检测出更多的病原体,尤其对病毒的检出率远高于CMT;在70例mNGS与CMT双阳性样本中,42例mNGS与CMT结果完全或部分匹配,匹配样本中48%为流感嗜血杆菌,19%为肺炎支原体,17%为肺炎链球菌;分析重症肺炎患儿BALF mNGS的病原菌特征发现,重症肺炎患儿的流感嗜血杆菌、副流感病毒及人偏肺病毒检出率均高于非重症肺炎患儿,差异有统计学意义(P<0.05);比较出生信息为足月正常体重儿与早产低体重儿BALF mNGS检测结果发现,早产低体重儿的铜绿假单胞杆菌mNGS检出率高于足月正常体重儿,且早产低体重有合并症患儿的铜绿假单胞杆菌mNGS检出率高于早产低体重无合并症患儿,差异均有统计学意义(P<0.05);足月正常体重儿肺炎支原体mNGS检出率高于早产低体重儿,且足月正常体重无合并症患儿的肺炎支原体mNGS检出率高于足月正常体重有合并症患儿,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论BALF mNGS对于肺部感染患儿具有较高的微生物检测阳性率,尤其对于重症感染及复杂病例,BALF mNGS是常规病原学检测的重要补充。

关键词：宏基因组二代测序常规微生物学检测支气管肺泡灌洗液肺部感染

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肺泡灌洗液快速现场评价联合宏基因组二代测序在重症肺炎患者中的应用价值

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临床误诊误治 2025年第1期38卷 45-49页

作者：刘亚萌李冠英刘翠朱劲松张胜利梁希军沧州市人民医院呼吸内科河北沧州061000

目的探讨肺泡灌洗液快速现场评价(ROSE)联合宏基因组二代测序(mNGS)在重症肺炎患者中的应用价值。方法筛选2021年10月至2024年4月治疗的94例重症肺炎患者进行前瞻性研究,随机分为对照组(常规病原学检查)47例与观察组(ROSE联合mNGS技术... 详细信息

目的探讨肺泡灌洗液快速现场评价(ROSE)联合宏基因组二代测序(mNGS)在重症肺炎患者中的应用价值。方法筛选2021年10月至2024年4月治疗的94例重症肺炎患者进行前瞻性研究,随机分为对照组(常规病原学检查)47例与观察组(ROSE联合mNGS技术进行病原学检查)47例,均给予抗生素治疗。记录2组肺泡灌洗液有效病原体检出率、抗生素应用情况、发热时间、机械通气时间、住重症监护室时间,比较2组入院第1、4、7天临床肺部感染评分(CPIS)以及血清C反应蛋白(CRP)、降钙素原(PCT)水平。结果观察组肺泡灌洗液有效病原体检出率为97.87%(46/47),高于对照组的59.57%(28/47,P<0.05),且观察组可检出病毒及不常见病原体(如鹦鹉热衣原体、结核分枝杆菌、堪萨斯分枝杆菌)。与对照组比较,观察组抗生素使用时间、发热时间、机械通气时间、住重症监护室时间均较短,抗生素使用种类及调整频次较少(P<0.05)。2组入院第4、7天CPIS及血清CRP、PCT水平均较入院第1天降低,且随着治疗时间的增加而降低(P<0.05);与对照组比较,观察组入院第4、7天CPIS及外周血CRP、PCT水平均降低(P<0.05)。结论ROSE联合mNGS技术在重症肺炎患者中有较高的应用价值,可提高病原学检出率,及时明确病原体,从而快速指导临床精准治疗。

关键词：重症肺炎快速现场评价宏基因组二代测序病原体肺泡灌洗液临床肺部感染评分 C反应蛋白降钙素原

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应用宏基因组二代测序技术分析肺部感染患者下呼吸道病原谱

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热带医学杂志 2025年第2期25卷 245-249页

作者：奚斌孟晓张露张毛为陈碧徐州医科大学附属医院呼吸与危重症医学科江苏徐州221000

目的应用宏基因组二代测序(mNGS)技术探究不同严重程度的肺部感染患者下呼吸道感染病原谱,以指导临床诊断及治疗。方法选取2020年7月-2022年6月就诊于徐州医科大学附属医院呼吸与危重症医学科的肺部感染患者,根据是否符合重症肺炎诊断... 详细信息

目的应用宏基因组二代测序(mNGS)技术探究不同严重程度的肺部感染患者下呼吸道感染病原谱,以指导临床诊断及治疗。方法选取2020年7月-2022年6月就诊于徐州医科大学附属医院呼吸与危重症医学科的肺部感染患者,根据是否符合重症肺炎诊断标准将患者分为重症感染组与非重症感染组,应用常规微生物检测和mNGS技术检测患者的肺泡灌洗液,回顾性分析所有患者的下呼吸道病原谱特征。结果共纳入206例患者,mNGS检测阳性率91.75%(189/206)远远高于常规微生物检测方法的26.21%(54/206),差异有统计学意义(χ^(2)=3.960,P=0.047)。病原体分布中人类疱疹病毒4型检出率最高,占37.57%(71/189),重症感染患者与非重症感染患者具有不同的病原体分布趋势。在混合感染的164例患者中,主要类型为细菌+真菌+病毒,占48.78%(80/164)。重症感染组中细菌+真菌+病毒混合感染的发生率明显高于非重症感染组,差异有统计学意义(χ^(2)=5.170,P<0.05),其预测重症肺部感染的曲线下面积为0.76。结论mNGS技术可在病程早期全面鉴定肺部感染病原体,并且对于混合感染的鉴定具有很大优势,为改善培养条件和制定抗生素方案提供信息,因此可用于肺部混合感染的准确诊断和个体化治疗。

关键词：宏基因组二代测序常规微生物检测肺部感染病原谱

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宏基因组二代测序技术在淋巴结结核诊断中的应用价值

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浙江临床医学 2025年第3期27卷 427-428页

作者：林婷俞跃辉罗佳磊颜心怡黄向韵张莹杨高怡浙江中医药大学第四临床医学院杭州师范大学浙江省医疗诊断数字技术重点实验室杭州市红十字会医院西湖大学医学院附属杭州市第一人民医院

目的探讨宏基因组二代测序（mNGS）在淋巴结结核诊断中的应用价值。方法选取2022年10月至2023年7月颈部淋巴结肿大并疑似淋巴结结核患者80例，在超声引导下对肿大淋巴结进行穿刺，对组织分别进行培养、Xpert检测，mNGS，以病理诊断为... 详细信息

目的探讨宏基因组二代测序（mNGS）在淋巴结结核诊断中的应用价值。方法选取2022年10月至2023年7月颈部淋巴结肿大并疑似淋巴结结核患者80例，在超声引导下对肿大淋巴结进行穿刺，对组织分别进行培养、Xpert检测，mNGS，以病理诊断为金标准，比较三种检测方法的敏感度、特异度、阴性预测值、阳性预测值。结果根据临床诊断标准明确感染为淋巴结结核61例，非淋巴结结核15例，诊断不明4例。以临床诊断结果为标准，mNGS、常规培养和Xpert检测诊断淋巴结结核的敏感度分别为86.9%、39.3%、62.2%，阴性预测值分别为65.2%、28.8%、39.4%，阳性预测值及特异性均为100%。mNGS敏感度高于Xpert检测和培养（P<0.05）。结论相比于传统病原体检测方式，mNGS诊断淋巴结结核敏感度更高，能检测到其他潜在病原微生物。mNGS对淋巴结结核疑似病例快速诊断具有潜在有效性。

关键词：淋巴结结核宏基因组二代测序

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宏基因组二代测序在血液系统疾病合并感染中的应用价值

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药物生物技术 2025年第1期 44-49页

作者：高静郝淼旺及月茹严学倩陈怡肖方李瑗春空军军医大学第二附属医院血液内科

研究宏基因组二代测序（mNGS）技术在血液系统疾病合并感染中病原学诊断的价值。收集2021年1月至2022年6月空军军医大学第二附属医院血液内科收治的135例血液系统疾病合并感染患者临床基本资料，同时采集患者的标本（包括外周血、痰液... 详细信息

研究宏基因组二代测序（mNGS）技术在血液系统疾病合并感染中病原学诊断的价值。收集2021年1月至2022年6月空军军医大学第二附属医院血液内科收治的135例血液系统疾病合并感染患者临床基本资料，同时采集患者的标本（包括外周血、痰液、肺泡灌洗液及其他体液）同步进行mNGS和常规微生物培养，比较两者的检验效能。本次研究对象中，男性84例，女性51例，中位年龄为53岁，平均年龄（49.1±18.1）岁；疾病分布为急性白血病66例，非霍奇金淋巴瘤32例，多发性骨髓瘤13例，再生障碍性贫血9例，其他疾病15例。合并化疗110例，合并粒细胞缺乏症112例，合并骨髓移植26例，共取材标本为135份同时送检。mNGS检测病原体阳性率为74.81%,常规检测阳性率为39.26%,差异具有统计学意义（P<0.01）;mNGS诊断混合感染的阳性率为57.43%,常规检测为15.09%,差异具有统计学意义（χ2=25.434,P<0.01）;mNGS检测外周血阳性率为70.42%（50/71）,肺泡灌洗液阳性率87.18%（34/39）,痰液阳性率68.75%（11/16）,其他体液阳性率66.67%（6/9）,根据χ2检验结果，肺泡灌洗液检测阳性率高于外周血检测，且两者比较有统计学意义（χ2=3.916,P=0.048）,其他样本比较P>0.05,阳性率之间无明显统计学意义；mNGS诊断混合感染的阳性率比常规微生物培养方法更高（57.43%vs 15.09%）,差异具有统计学意义（χ2=25.434,P<0.01）;mNGS检测灵敏度为90.57%,特异性35.37%。mNGS在血液系统疾病合并感染的病原学诊断中具有重要的临床价值和良好的应用前景。

关键词：宏基因组二代测序血液系统疾病单一感染混合感染细菌真菌病毒

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宏基因组二代测序在儿童血液肿瘤合并感染中的应用

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中国当代儿科杂志 2023年第7期25卷 718-725页

作者：钟珊杨明华中南大学湘雅三医院儿科/湖南省儿童肿瘤性疾病临床医学研究中心湖南长沙410013

目的探讨宏基因组二代测序(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)技术在血液肿瘤患儿感染性疾病病原体诊断中的应用价值。方法回顾性分析2020年6月—2022年7月于中南大学湘雅三医院收治的因感染行微生物培养及mNGS的43例血液... 详细信息

目的探讨宏基因组二代测序(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)技术在血液肿瘤患儿感染性疾病病原体诊断中的应用价值。方法回顾性分析2020年6月—2022年7月于中南大学湘雅三医院收治的因感染行微生物培养及mNGS的43例血液肿瘤疾病患儿的临床资料及病原学检测结果,比较mNGS与微生物培养法病原体检出率的差异及病原学特征。结果43例患儿共采集54份标本送检,mNGS的病原体总检出率(80%,43/54)高于微生物培养法(30%,16/54),差异有统计学意义(P<0.001)。mNGS最常检出的感染类型为病毒感染,其次是真菌合并病毒感染;微生物培养最常见的感染类型为细菌感染,其次为真菌感染。mNGS真菌检出率(33%,18/54)高于微生物培养法(6%,3/54),差异有统计学意义(P<0.001)。mNGS与微生物培养法对2种或2种以上病原体感染的检出率(48%vs9%)和2类或2类以上病原体感染检出率(33%vs2%)的比较差异均有统计学意义(均P<0.05)。mNGS在外周血中最常检出的细菌、真菌分别为铜绿假单胞菌、热带念珠菌;在支气管肺泡灌洗液中最常检出的细菌、真菌为肺炎链球菌、耶氏肺孢子菌。35%(15/43)的患儿根据mNGS结果调整治疗并获益。结论mNGS比微生物培养法有更高的检出率,且对混合感染、真菌感染有明显优势,可作为微生物培养法的有益补充。

关键词：血液肿瘤疾病宏基因组二代测序感染病原学检测儿童

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宏基因组二代测序在重症急性胰腺炎疑似感染病原学诊断中的应用价值

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中华消化外科杂志 2024年第5期23卷 720-725页

作者：洪晓悦林嘉晏李嘉荣宁彩虹孙泽芳刘柏岐陈璐朱帅黄耿文申鼎成中南大学湘雅医院胰腺外科疝与腹壁外科长沙410008

目的探讨宏基因组二代测序(mNGS)在重症急性胰腺炎(SAP)疑似感染病原学诊断中的应用价值。方法采用前瞻性研究方法。选取2023年5―9月中南大学湘雅医院收治的25例SAP疑似感染患者的临床资料。患者均采集双上肢静脉血行mNGS和常规病原学... 详细信息

目的探讨宏基因组二代测序(mNGS)在重症急性胰腺炎(SAP)疑似感染病原学诊断中的应用价值。方法采用前瞻性研究方法。选取2023年5―9月中南大学湘雅医院收治的25例SAP疑似感染患者的临床资料。患者均采集双上肢静脉血行mNGS和常规病原学培养检测。观察指标:(1)入组患者情况。(2)mNGS与常规病原学培养检测诊断效能的比较。(3)外周血病原学检测结果与胰周积液培养检测结果。(4)检测时间与费用。正态分布的计量资料以x±s表示,组间比较采用独立样本t检验。偏态分布的计量资料以M(Q1,Q3)表示。计数资料以绝对数或百分比表示,组间比较采用χ^(2)检验。结果(1)入组患者情况。筛选出符合条件的患者25例;男18例,女7例;年龄为48(40,59)岁;住院时间为30(20,50)d。25例患者病因包括高脂血症性胰腺炎14例、胆源性胰腺炎8例、酒精性胰腺炎1例、其他2例。25例患者中,感染性胰腺坏死(IPN)17例(死亡7例),无菌性胰腺坏死8例(均未死亡)。(2)mNGS与常规病原学培养检测诊断效能的比较。mNGS和常规病原学培养检测诊断SAP疑似感染的阳性率分别为72.0%(18/25)和32.0%(8/25),两者比较,差异有统计学意义(χ^(2)=8.01,P<0.05)。mNGS和常规病原学培养检测诊断IPN的灵敏度分别为94.1%(16/17)和35.3%(6/17),阴性预测值分别为85.7%(6/7)和35.3%(6/17),两者灵敏度和阴性预测值比较,差异均有统计学意义(χ^(2)=12.88,5.04,P<0.05);mNGS和常规病原学培养检测诊断IPN的特异度分别为75.0%(6/8)和75.0%(6/8),阳性预测值分别为88.9%(16/18)和75.0%(6/8),两者比较,差异均无统计学意义(χ^(2)=0,0.82,P>0.05)。(3)外周血病原学检测结果与胰周积液培养检测结果。17例IPN患者中,mNGS检测出病原菌36株,常规病原学培养检测出病原菌6株。17例IPN患者中,16例mNGS检测病原学结果为阳性,其中13例与胰周积液培养检测病原学结果相符,两者相符率为76.5%(13/17);6例常规病原学培养检测结果为阳性,与胰周积液培养检测结果相符率为35.3%(6/17)。(4)检测时间与费用。mNGS检测时间为(43±17)h,常规病原学培养检测时间为(111±36)h,两者比较,差异有统计学意义(t=9.31,P<0.05)。mNGS检测费用为(2267±0)元/例,占住院费用(133759±120744)元的1.7%;常规病原学培养检测费用为(240±0)元/例,占住院费用的0.2%。结论mNGS对SAP疑似感染的早期病原学诊断具有重要价值,且时效性高。

关键词：重症急性胰腺炎感染性胰腺坏死宏基因组二代测序诊断治疗

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宏基因组二代测序技术在抗生素使用后的早产儿败血症中的应用

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中国当代儿科杂志 2024年第5期26卷 456-460页

作者：娄春艳刘玉宁张宣郭艳艳张磊河南省人民医院/郑州大学人民医院新生儿科河南郑州450003

目的探讨宏基因组二代测序(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)在抗生素使用后早产儿败血症病原学诊断中的价值。方法回顾性分析河南省人民医院收治的45例早产儿败血症患儿的病例资料,所有患儿均给予抗生素治疗≥3d以上,且... 详细信息

目的探讨宏基因组二代测序(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)在抗生素使用后早产儿败血症病原学诊断中的价值。方法回顾性分析河南省人民医院收治的45例早产儿败血症患儿的病例资料,所有患儿均给予抗生素治疗≥3d以上,且均进行了血培养及血mNGS检测,比较血培养及血mNGS检测对病原体检出率的差异。结果血mNGS检出病原阳性率高于血培养阳性率(44%vs 4%,P<0.001)。血mNGS检出病原体28株,其中细菌23株,真菌4株,细小脲原体1株。血培养检出近平滑假丝酵母菌及肺炎克雷伯杆菌各1例。抗生素使用时长>10 d组血mNGS阳性率高于血培养阳性率(40%vs 3%,P<0.001);抗生素使用时长≤10 d组血mNGS阳性率也高于血培养阳性率(53%vs7%,P=0.020)。有13例患儿依据血mNGS检测结果调整了治疗方案,治疗有效率为85%(11/13)。结论抗生素使用后的早产儿败血症中血mNGS检测病原阳性率高于血培养,且不受抗生素使用时长的影响,提示当临床高度怀疑存在病原微生物感染而血培养无法检出病原时可考虑行mNGS检测以明确病原。

关键词：败血症宏基因组二代测序抗生素血培养早产儿

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宏基因组二代测序在实体器官移植感染防控中的应用

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器官移植 2024年第2期15卷 289-296页

作者：满霖李小杉王文静钱婷熊敏杨航陈静瑜吴波南京医科大学无锡医学中心无锡市人民医院南京医科大学附属无锡人民医院肺移植中心江苏无锡214023 南通大学附属江阴医院重症医学科

器官移植已成为多种终末期疾病的有效治疗手段,但器官移植受者术后需长期服用免疫抑制药,导致免疫功能低下,使得细菌、病毒和真菌感染的发生率相对较高。以病原学培养、免疫学检测和聚合酶链反应为代表的传统微生物检测方法被广泛用于... 详细信息

器官移植已成为多种终末期疾病的有效治疗手段,但器官移植受者术后需长期服用免疫抑制药,导致免疫功能低下,使得细菌、病毒和真菌感染的发生率相对较高。以病原学培养、免疫学检测和聚合酶链反应为代表的传统微生物检测方法被广泛用于感染检测,但存在耗时长、需预先假定病原体等问题。宏基因组二代测序由于具有病原体检出率高、对病原谱检测全面的优点,近年来被广泛应用于器官移植领域的感染防控。本文就宏基因组二代测序技术在实体器官移植感染防控上的应用现状进行综述,以期对移植相关感染的诊断和治疗提供参考。

关键词：器官移植宏基因组二代测序免疫抑制肺部感染供者来源性感染感染防控病原学检测聚合酶链反应(PCR)

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