检索结果-内蒙古大学图书馆

中国地方病防治 2025年第2期40卷 139-141页

作者：王益莲淳安县中医院呼吸内科浙江杭州311700

目的本研究旨在探讨宏基因组二代测序(mNGS)技术在诊断鹦鹉热衣原体肺炎患者中的临床应用价值,并分析其对治疗策略调整及临床转归的影响。方法回顾性分析2020—2024年在某院通过mNGS诊断的28例鹦鹉热衣原体肺炎患者的临床资料。通过mNG... 详细信息

目的本研究旨在探讨宏基因组二代测序(mNGS)技术在诊断鹦鹉热衣原体肺炎患者中的临床应用价值,并分析其对治疗策略调整及临床转归的影响。方法回顾性分析2020—2024年在某院通过mNGS诊断的28例鹦鹉热衣原体肺炎患者的临床资料。通过mNGS检测出鹦鹉热衣原体的特异性DNA片段。研究方法包括样本采集与处理、核酸提取、去宿主处理、文库构建、高通量测序、数据分析与注释等步骤。结果28例患者中,男性18例,女性10例,平均66.45岁。22例患者有与鸟类、家禽或猫的接触史。mNGS检测结果显示,鹦鹉热衣原体为所有患者共同的病原体,部分患者还伴有其他病原体感染。在治疗方面,检测前患者已接受多种抗生素治疗。mNGS检测后,多数患者的治疗方案进行了调整,其中多西环素被广泛应用到治疗中。治疗转归方面,23例患者在调整治疗方案后病情好转,5例患者自动出院。结论mNGS技术在鹦鹉热衣原体肺炎的诊断中具有重要价值,能够为临床治疗提供精准的病原学信息,指导治疗方案的调整,从而改善患者的临床转归。

关键词：宏基因组学二代测序鹦鹉热衣原体肺炎特征疗效

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宏基因组学二代测序诊断Q热心内膜炎合并癫痫1例的临床研究

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检验医学与临床 2025年第9期22卷 1282-1284页

作者：李源张晓润宋爽陶臻南京医科大学附属南京医院/南京市第一医院感染性疾病科江苏南京210006

目的探讨宏基因组学二代测序(mNGS)在常规检测方法难以诊断的Q热心内膜炎中的应用价值。方法于该院就诊的1例感染性心内膜炎患者长期感染控制不佳,且多次血培养结果阴性,结合患者既往职业,采集血标本进行mNGS检测。以mNGS、心内膜炎和Q... 详细信息

目的探讨宏基因组学二代测序(mNGS)在常规检测方法难以诊断的Q热心内膜炎中的应用价值。方法于该院就诊的1例感染性心内膜炎患者长期感染控制不佳,且多次血培养结果阴性,结合患者既往职业,采集血标本进行mNGS检测。以mNGS、心内膜炎和Q热为关键词,对中国知网、万方数据库、PubMed数据库2020-2024年发表的文献进行文献检索。结果该患者mNGS结果显示贝纳柯克斯体552序列数,细环病毒21序列数,念珠菌5序列数,提示贝纳柯克斯体引起感染性心内膜炎可能。结合病例分析和文献复习,血培养在感染性心内膜炎患者存在一定漏诊率,规范应用mNGS可有效提升感染性心内膜炎患者病原学诊断效率。结论Q热心内膜炎是一种由贝纳柯克斯体引起的人畜共患疾病,因其血培养阴性且不被感染性心内膜炎经验性抗菌谱所覆盖,在临床诊治方面常常存在许多困难。对于常规检查无法明确病原学的感染性心内膜炎及其他感染性疾病,合理应用mNGS可以尽早明确病因,协助诊治。

关键词：宏基因组学二代测序贝纳柯克斯体心内膜炎血培养 Q热

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宏基因组学二代测序技术在输入性疟疾诊断中的应用

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中国寄生虫学与寄生虫病杂志 2019年第6期37卷 727-729页

作者：李仁清王小梅孙玉兰吕燕宁窦相峰王全意北京市疾病预防控制中心北京市预防医学研究中心

通过对1例自非洲输入的疟疾病例血液样本进行宏基因组二代测序(mNGS)检测,探讨mNGS在实验室检测疟疾上的可行性。采集患者外周血,制备厚、薄血膜,显微镜观察疟原虫感染情况。提取患者全血样本核酸,进行疟原虫核酸实时荧光PCR检测。将提... 详细信息

通过对1例自非洲输入的疟疾病例血液样本进行宏基因组二代测序(mNGS)检测,探讨mNGS在实验室检测疟疾上的可行性。采集患者外周血,制备厚、薄血膜,显微镜观察疟原虫感染情况。提取患者全血样本核酸,进行疟原虫核酸实时荧光PCR检测。将提取的患者全血样本核酸同步构建文库,采用Illumina Miseq二代测序仪进行mNGS检测。采用Megan6软件分析测序数据及重叠群序列的BLASTn比对结果,分配模式为对齐碱基模式。镜检结果显示,患者为恶性疟原虫和三日疟原虫混合感染,其中恶性疟原虫密度≥100000/μl,三日疟原虫密度≥300/μl。实时荧光PCR检测结果显示,恶性疟原虫核酸阳性,间日疟、三日疟和卵形疟原虫核酸均为阴性。mNGS获得了271526条测序数据,其中合格序列有254674条。剔除与人类参考基因组匹配的序列后,最终得到1833条测序数据,其中非人源数据只占总合格数据的0.7%。将上述序列拼接后,获得408条100个核苷酸以上长度的重叠群数据。Megan6分析结果显示,恶性疟原虫的测序数据分别占到总对齐碱基的44.7%(29667/66374),其重叠群数据占重叠群总对齐碱基的34.5%(22885/66376),因此恶性疟原虫是最优势的病原微生物。基于测序数据和重叠群数据,该病原可溯源到恶性疟原虫标准株3D7。

关键词：恶性疟原虫混合感染输人性疟疾宏基因组学二代测序

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宏基因组学二代测序在艾滋病合并肺部感染患者中的临床应用

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中华传染病杂志 2023年第8期41卷 507-513页

作者：莫平征张忠威陈小平马智勇宋世会陈良君郭清莲张永喜熊勇邓莉平武汉大学中南医院感染科武汉430071 武汉大学中南医院检验科武汉430071

目的了解本地区艾滋病患者合并肺部机会性感染的病原谱, 并评价宏基因组学二代测序(mNGS)在艾滋病合并肺部感染患者中的临床应用。方法以2021年1月至12月在武汉大学中南医院住院的艾滋病合并肺部感染患者为研究对象, 对其支气管肺泡灌洗... 详细信息

目的了解本地区艾滋病患者合并肺部机会性感染的病原谱, 并评价宏基因组学二代测序(mNGS)在艾滋病合并肺部感染患者中的临床应用。方法以2021年1月至12月在武汉大学中南医院住院的艾滋病合并肺部感染患者为研究对象, 对其支气管肺泡灌洗液(BALF)进行mNGS和常规病原学检测。常规病原学检测方法包括涂片、培养、聚合酶链反应(PCR)和免疫层析胶体金法。统计学方法采用Fisher确切概率法。结果共纳入69例患者, 其mNGS检测结果均为阳性, 其中真菌和病毒各检测出53例次(76.8%), 细菌[不包括结核分枝杆菌(MTB)和非结核分枝杆菌(NTM)]40例次(58.0%), MTB 6例次, NTM 11例次, 其他7例次;89.9%(62/69)的患者为2种或以上病原体的混合感染。BALF的常规病原学检测中, 79.7%(55/69)的患者检出病原体阳性, 包括耶氏肺孢子菌聚合酶链反应(PCR)检测阳性42例次, BALF培养阳性16例次, MTB PCR检测阳性9例次, 隐球菌抗原阳性5例次。mNGS总检出率为100.0%(69/69), 高于常规病原学检测的79.7%(55/69), 差异有统计学意义(Fisher确切概率法, P<0.001)。mNGS检测特异度为88.4%。结合临床及2种检测方法, 前5位的病原体分别为耶氏肺孢子菌[62.3%(43/69)]、念珠菌[29.0%(20/69)]、MTB[20.3%(14/69)]、NTM和马尔尼菲篮状菌[各15.9%(11/69)]。76.8%(53/69)的患者合并病毒感染。结论本地区艾滋病患者合并肺部感染的病因以混合感染为主, 耶氏肺孢子菌为最常见的病原体。mNGS可提高艾滋病合并肺部感染患者的病原体检出率。

关键词：获得性免疫缺陷综合征 HIV 宏基因组学二代测序病原学检测肺部感染疾病谱

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宏基因组学二代测序对脊柱感染患者病原学诊断的价值

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中华传染病杂志 2023年第3期41卷 208-213页

作者：张东梅占伟丽靳慧鸣彭真丁帅杨栋强康艳红康月花尚佳肖二辉河南大学人民医院河南省人民医院感染科郑州450003 河南大学人民医院河南省人民医院脊柱脊髓外科郑州450003

目的探讨宏基因组学二代测序(mNGS)对脊柱感染患者病原学诊断价值的效能,为及时诊治提供参考。方法纳入2020年1月至2022年7月河南省人民医院感染科收治的40例疑似脊柱感染患者,回顾性分析患者的病灶组织培养、组织病理学检查、组织mNGS... 详细信息

目的探讨宏基因组学二代测序(mNGS)对脊柱感染患者病原学诊断价值的效能,为及时诊治提供参考。方法纳入2020年1月至2022年7月河南省人民医院感染科收治的40例疑似脊柱感染患者,回顾性分析患者的病灶组织培养、组织病理学检查、组织mNGS检测结果。以临床诊断病例为标准,分为脊柱感染组(28例)和非脊柱感染组(12例)。比较mNGS和组织培养两种检测方法对脊柱感染患者病原体检出的阳性率、灵敏度和特异度。统计学分析采用配对χ2检验。结果40例患者中,男23例,女17例。mNGS检测阳性率高于组织培养阳性率[75.0%(30/40)比12.5%(5/40)],差异有统计学意义(χ2=0.08,P<0.001)。以临床诊断病例为标准,mNGS对脊柱感染诊断的灵敏度高于组织培养(82.1%比17.9%),差异有统计学意义(χ2=0.02,P<0.001),而其特异度与组织培养相比(33.3%比100.0%),差异无统计学意义(P>0.05)。结论mNGS在脊柱感染患者的病原学诊断中具有较高的病原体检出率和灵敏度,可为脊柱感染患者的诊治提供临床指导。

关键词：脊柱感染宏基因组学二代测序病原微生物诊断价值

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宏基因组学二代测序在5例鹦鹉热衣原体感染患者诊断中的临床应用

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中华传染病杂志 2023年第8期41卷 514-516页

作者：崔曼曼仇亚莉薛源王亚娟徐天敏常州市第三人民医院感染科常州213000 常州市第三人民医院呼吸科常州213000 常州市第三人民医院科教科常州213000 探因医学科技(浙江)有限公司医学研发部台州317317

目的探讨宏基因组学二代测序(mNGS)对鹦鹉热衣原体(***)感染患者病原学诊断的应用价值。方法回顾性分析2020年12月至2021年12月常州市第三人民医院收治的5例***感染患者的临床资料, 包括基本资料、mNGS和影像学检查结果、治疗和预后。结... 详细信息

目的探讨宏基因组学二代测序(mNGS)对鹦鹉热衣原体(***)感染患者病原学诊断的应用价值。方法回顾性分析2020年12月至2021年12月常州市第三人民医院收治的5例***感染患者的临床资料, 包括基本资料、mNGS和影像学检查结果、治疗和预后。结果 5例患者均有鸽子或禽类接触史, 临床表现为高热、干咳、乏力等, 计算机断层成像表现为单侧肺有片状炎症渗出和实变。4例患者的支气管肺泡灌洗液(BALF)mNGS DNA和RNA均检测出***序列, 1例患者只在DNA中检测出***序列。5例患者经过以多西环素为主的抗感染治疗后病情好转出院。结论 ***感染患者的临床表现、影像学检查无特异性, 可应用mNGS提高鹦鹉热衣原体感染诊断的准确性, 减少漏诊及误诊, 改善患者总体预后。

关键词：鹦鹉衣原体宏基因组学二代测序肺部感染

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宏基因组学二代测序在脓毒症伴有免疫低下患者中的临床价值

宏基因组学二代测序在脓毒症伴有免疫低下患者中的临床价值

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作者：程正安徽医科大学

学位级别：硕士

目的:脓毒症严重威胁着人民群众的生命健康,尤其是在免疫低下的患者中,因此早期诊断和针对性的治疗非常重要。宏基因组学二代测序技术(metagenomic next-generation sequencing,m NGS)与传统的病原诊断方法相比具有显著的优势。本研究... 详细信息

目的:脓毒症严重威胁着人民群众的生命健康,尤其是在免疫低下的患者中,因此早期诊断和针对性的治疗非常重要。宏基因组学二代测序技术(metagenomic next-generation sequencing,m NGS)与传统的病原诊断方法相比具有显著的优势。本研究探讨了宏基因组学二代测序技术在脓毒症伴免疫低下患者病原诊断方面的临床价值。方法:本研究选取了从2020年7月1日至2021年9月30日入住安徽医科大学第一附属医院急诊重症监护病房(emergency intensive care unit,EICU)的脓毒症患者,根据免疫状态将其分为免疫正常和免疫低下组,同时送检宏基因组学二代测序和传统病原学检测。比较两种方法的病原体检出率,同时研究免疫正常和免疫低下组在病原谱方面的差异。结果:共90名患者完成研究,其中免疫正常组60人,免疫低下组30人。入组的所有患者中宏基因组学二代测序的阳性率为85.55%,传统检测阳性率为55.55%,两者存在统计学差异。且无论在免疫正常组还是免疫低下组,送检宏基因组学二代测序的阳性率均高于传统检测组。痰标本和肺泡灌洗液标本的阳性率均高于血标本。免疫低下组以耶氏肺孢子菌、巨细胞病毒感染更为常见。结论:宏基因组学二代测序技术对于脓毒症患者病原体检测性能优于传统检测手段,尤其对于免疫低下患者。耶氏肺孢子菌及巨细胞病毒感染在免疫低下患者中更常见。

关键词：脓毒症感染免疫低下宏基因组学二代测序耶氏肺孢子菌

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宏基因组学二代测序辅助诊断抗γ干扰素自身抗体阳性的马尔尼菲篮状菌病合并非结核分枝杆菌感染1例

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中华传染病杂志 2023年第3期41卷 216-219页

作者：黄莹尚果果马玉燕李思彤纪元复旦大学附属中山医院厦门医院病理科厦门361000 复旦大学附属中山医院病理科上海2200032 复旦大学附属中山医院感染病科上海200032

马尔尼菲篮状菌(TM)是一种免疫缺陷人群易感的侵袭性真菌,常见于人类免疫缺陷病毒(HIV)感染者,然而近年来HIV阴性人群TM感染呈上升趋势,其中抗γ干扰素自身抗体的存在被认为是HIV阴性人群TM感染的重要危险因素。本例HIV阴性且正电子发... 详细信息

马尔尼菲篮状菌(TM)是一种免疫缺陷人群易感的侵袭性真菌,常见于人类免疫缺陷病毒(HIV)感染者,然而近年来HIV阴性人群TM感染呈上升趋势,其中抗γ干扰素自身抗体的存在被认为是HIV阴性人群TM感染的重要危险因素。本例HIV阴性且正电子发射计算机断层成像(PET-CT)检查结果考虑感染性病变并累及全身多处淋巴结及骨骼的患者,主要表现为咳嗽咳痰、骨关节疼痛、淋巴结肿大、胸壁肿块及手部皮损改变,多处活检组织样本的宏基因组学二代测序(mNGS)检出TM序列,且病原体培养及病理检查结果确诊TM感染,予抗真菌治疗后病情好转。维持治疗期间出现新发淋巴结肿大,完善病原体检测提示存在非结核分枝杆菌合并感染,外周血抗γ干扰素自身抗体阳性,经及时调整抗感染方案后患者症状改善。经mNGS检测活检组织石蜡样本发现TM序列。本病例提示HIV阴性的TM感染患者需注意存在隐匿免疫缺陷因素或混合感染的可能,mNGS在病原学早期诊断中有较大优势,且石蜡组织样本在mNGS中应用有一定的可行性。

关键词：抗γ干扰素自身抗体马尔尼菲篮状菌病非结核分枝杆菌 HIV阴性宏基因组学二代测序

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聚合酶链式反应与宏基因组学二代测序技术在创伤性骨感染诊断中的应用进展

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中华创伤骨科杂志 2024年第12期26卷 1094-1099页

作者：杨仲涛张堃任程王超锋许毅博张聪明刘德印沈二栋范茂强马腾西安医学院研工部西安710068 西安交通大学附属红会医院骨创伤医院严重多发伤病区西安710054

创伤相关性骨感染是创伤患者手术后严重的感染性疾病之一,具有发生率高、致病微生物复杂、治疗困难、预后差等特点。因此,如何在早期、准确地鉴定出致病微生物和相关抗菌药物的敏感性对手术成功及局部和全身抗生素支持治疗至关重要。传... 详细信息

创伤相关性骨感染是创伤患者手术后严重的感染性疾病之一,具有发生率高、致病微生物复杂、治疗困难、预后差等特点。因此,如何在早期、准确地鉴定出致病微生物和相关抗菌药物的敏感性对手术成功及局部和全身抗生素支持治疗至关重要。传统的检测手段存在项目复杂、指标众多、速度慢、阳性率低、无法检测罕见致病微生物等缺点,因此急需更好的检测手段来确定骨感染的病原微生物。近年来,聚合酶链式反应(PCR)和宏基因组学二代测序(mNGS)技术因准确、快速、高效,且具有较传统培养更广泛的病原微生物检测范围等优势,已用于临床多种感染性疾病的诊断。PCR和mNGS技术也可以作为有效诊断创伤相关性骨感染的工具,本文就PCR和mNGS技术在创伤相关性骨感染诊断应用中的优势、不足、发展方向及指导意义进行综述。

关键词：骨疾病,感染性创伤和损伤诊断聚合酶链反应宏基因组学二代测序

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脑脊液宏基因组学二代测序协助诊断成人重型流行性乙型脑炎1例

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中华神经科杂志 2024年第8期57卷 890-893页

作者：杨佳莉金钧李东蓉俞喆珺杨新静苏州大学附属第一医院重症医学科苏州215006

流行性乙型脑炎病毒感染后临床表现往往为急性脑炎,病原学诊断是常见的诊断方法,但临床上病毒检测、分离比较困难,检出病原体种类比较局限。宏基因组学二代测序(mNGS)是一种快速精准的分子诊断方法,可提高病原微生物的检出率及检出种类... 详细信息

流行性乙型脑炎病毒感染后临床表现往往为急性脑炎,病原学诊断是常见的诊断方法,但临床上病毒检测、分离比较困难,检出病原体种类比较局限。宏基因组学二代测序(mNGS)是一种快速精准的分子诊断方法,可提高病原微生物的检出率及检出种类,可检测到中枢神经系统感染中不常见的病原体。文中报道1例27岁男性患者,以恶心呕吐、高热、意识障碍及多器官功能衰竭为主要临床表现,临床考虑流行性乙型脑炎,但缺乏病原学证据,遂行脑脊液mNGS检测出乙型脑炎病毒,大大提高了流行性乙型脑炎病毒诊断的精准性。

关键词：脑炎,病毒性脑炎病毒,日本脑脊液宏基因组学二代测序

来源：评论

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