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1 篇 家系关联性遗传统...
1 篇 单核苷酸多态性
1 篇 细胞程序性死亡受...
1 篇 慢性乙型肝炎病毒
1 篇 基因关联分析

机构

1 篇 安徽医科大学

作者

1 篇 吕峰

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1 篇 中文

检索条件"主题词=家系关联性遗传统计分析"

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详细简洁

排序：

PD-1基因多态性与慢性HBV感染家系的遗传易感性研究

PD-1基因多态性与慢性HBV感染家系的遗传易感性研究

引用

作者：吕峰安徽医科大学

学位级别：硕士

背景慢性乙型肝炎病毒（HBV）感染一直是我国重要的公共卫生问题之一,严重危害人民健康。探讨慢性HBV感染易感性的机理,始终是乙型肝炎研究者们关注和研究的热点。HBV感染后,机体对病毒的清除能力以及疾病的进展和不同临床转归,除了与... 详细信息

背景慢性乙型肝炎病毒（HBV）感染一直是我国重要的公共卫生问题之一,严重危害人民健康。探讨慢性HBV感染易感性的机理,始终是乙型肝炎研究者们关注和研究的热点。HBV感染后,机体对病毒的清除能力以及疾病的进展和不同临床转归,除了与免疫因素、病毒因素和环境因素有关外,在很大程度上取决于个体间基因组的差异。从宿主遗传易感性的角度,来探讨慢性HBV感染易感性的机理,为将其作为生物标志物来预测HBV感染的发生、发展和结局提供了可能性。而以生物学功能相关基因作为侯选基因进行关联研究,是当前感染性疾病遗传易感性研究的主要策略。分子免疫学研究提示细胞程序性死亡受体-1（PD-1）及其配体（PD-L）通路能削弱、限制和/或终止T细胞和APC等细胞的活化及效应功能,在慢性HBV感染的发病机制中发挥了重要作用。本实验旨在探讨PD-1基因单核苷酸多态性（SNP）与中国汉族人群慢性HBV感染家系的遗传易感性。方法采用聚合酶链反应和限制性酶切片段长度多态性（PCR-RFLP）方法检测人类2号染色体长臂3区7带（2q37.3） PD-1基因多态性,并应用家系内关联性分析（FBAT）方法,首次分析256个中国汉族慢性HBV感染核心家系的PD-1基因的2个SNPs及单倍型与慢性HBV感染家系的遗传易感性。结果（1）通过对256个核心家系的流行病学调查,收集了包括539例慢性HBV感染者和353例未感染的家庭成员的一般流行病学资料和DNA血样,并对所有人员进行基因型的检测,筛查这些SNP在中国人群的频率。在539名患者中分别分析PD-1.1 G>A和PD-1.2 G>A两位点的基因型频率,PD-1.1 G>A,AA,AG和GG基因型的频率分别是16.6%,63.7%和19.7%,A和G等位基因的频率分别是48.4%和51.6%。PD-1.2 G>A,AA,AG和GG基因型的频率分别是22.8%,59.8%和17.4%,A和G等位基因的频率分别是52.7%和47.3%。两位点的基因频率分布经过χ2检验均符合Hardy-Weinberg平衡定律（PD-1.1,χ2 = 3.032,P = 0.082;PD-1.2,χ2 = 0.25,P = 0.616）;（2）对单位点采用家系内关联性分析软件FBAT分析显示,PD-1基因1.1和1.2位点单位点多态性与慢性HBV感染的遗传易感无显著的相关性（P > 0.05）。等位基因A和G与慢性HBV感染的遗传易感也无显著的相关性,其中在附加遗传模型[（PD-1.1,Z = -0.265,P = 0.790993;Z = 0.265,P = 0.790993依次）;（PD-1.2,Z = 0.640,P = 0.522127;Z = -0.640,P = 0.522127依次）,显性遗传模型[（PD-1.1,Z = -0.617,P = 0.537018;Z = -0.193,P = 0.846892依次）;（PD-1.2,Z = -0.080,P = 0.936343;Z = -1.001,P = 0.316939依次）]和隐性遗传模型[（PD-1.1,Z = 0.193,P = 0.846892;Z = 0.617,P = 0.537018依次）;（PD-1.2,Z = 1.001,P = 0.316939;Z = 0.080,P = 0.936343依次）]中的P值均大于0.05,显示无优势等位基因A或G从杂合的父母传递给患病子女。（3）传统的传递不平衡检验（TDT）和同胞对传递不平衡检验（SDT）分析显示无优势等位基因A或G从杂合的父母传递给患病子女（P = 0.688880,P = 1.000000依次）。（4）256个核心家系的单倍型分析通过单倍型的构建,显示在中国汉族人群中存在以下四种单倍型结构: PD-1.1A/PD-1.2A （46.3%） ,PD-1.1G/PD-1.2G（45.4%）,PD-1.1G/ PD-1.2A （4.7%）和PD-1.1A/PD-1.2G （3.5%）,但是FBAT单倍型分析结果显示无优势单倍型传递给患病子女或者患病同胞,在附加遗传模型,显性遗传模型和隐性遗传模型中的P值均大于0.05,显示传递的单倍型与慢性HBV感染的遗传易感无显著的相关性。结论PD-1基因1.1和1.2位点基因多态性与慢性HBV感染家系的遗传易感无相关性,该基因可能不能作为遗传标志来预测慢性HBV感染的发生。

关键词：细胞程序性死亡受体-1 单核苷酸多态性慢性乙型肝炎病毒基因关联分析家系关联性遗传统计分析

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