检索结果-内蒙古大学图书馆

作者：彼得·F·厄特尔杰拉尔德·W·高夫瓦尼塔·帕马克里斯托弗·J·A·林萨拉·M·沃尔科特英国米德尔塞克斯

本发明涉及在治疗和预防人类乳头状瘤病毒感染以及与其相关的症状和疾病中有用的方法和组合物。具体地，本发明涉及编码人乳头状瘤病毒(HPV)氨基酸序列的多核苷酸序列，其中所述多核苷酸序列中的密码子使用模式与高表达的哺乳动物基因... 详细信息

标准号: CN1262665C

本发明涉及在治疗和预防人类乳头状瘤病毒感染以及与其相关的症状和疾病中有用的方法和组合物。具体地，本发明涉及编码人乳头状瘤病毒(HPV)氨基酸序列的多核苷酸序列，其中所述多核苷酸序列中的密码子使用模式与高表达的哺乳动物基因的密码子使用模式相似。

关键词：密码子使用多核苷酸人类乳头状瘤病毒感染哺乳动物基因乳头状瘤病毒氨基酸序列治疗和预防组合物疾病

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hBmp4在甲醇酵母中的分泌表达及hBmp4全序列优化对其表达的影响

hBmp4在甲醇酵母中的分泌表达及hBmp4全序列优化对其表达的影响

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作者：蔡燕惠福建师范大学

学位级别：硕士

骨形态发生蛋白（Bone Morphogenetic Proteins,BMPs）是一类蛋白质生长因子,属于细胞外的糖基化的蛋白二聚体,C’末端具有较高同源性。骨形态发生蛋白4（BMP4）又称骨形态发生蛋白2B,具有高效骨诱导活性,可促进骨、软骨,牙本质等硬组... 详细信息

骨形态发生蛋白（Bone Morphogenetic Proteins,BMPs）是一类蛋白质生长因子,属于细胞外的糖基化的蛋白二聚体,C’末端具有较高同源性。骨形态发生蛋白4（BMP4）又称骨形态发生蛋白2B,具有高效骨诱导活性,可促进骨、软骨,牙本质等硬组织的形成及缺损的修复。BMP4除了诱导成骨作用之外,还具有广泛的生物学活性。研究证实,hBMP4对胚胎、肢芽以及心、眼、肾、神经等组织器官的发育也有重要的调节作用。本研究尝试建立".hBmp4成熟片段在毕赤酵母（Pichiapastoris）中的表达技术。主要研究工作包括:将表达hBmp4成熟片段的载体质粒pPIC9k-hBmp4/dm转化酵母宿主菌株,PCR鉴定基因整合后,摇瓶培养,甲醇诱导表达并用点杂交来快速筛选高表达菌株;以这一表达载体为基础,依据酵母密码子使用偏好性,AT含量分析,结合软件RNAstructure（Version 4.0）预测mRNA二级结构,将hBmp4成熟片段内.Pichia pastoris使用低频密码子突变为使用频率较高的同义密码予以期实现高效表达。表达产物经SDS-PAGE和WESTERN-BLOT分析表明rhBMP4的分子量为 26KD,在原有13KD的分子上带有一定程度的糖基化,不存在同二聚体形式的产物;WESTERN-BLOT证实表达产物具有良好的抗原性和特异性:对不同诱导条件的观察表明:以pH6.0的培养基,保持以终浓度为0.5%的甲醇进行诱导,调整诱导前菌体生物量在OD600=10左右,诱导4d表达量达到最高;利用蛋白质Bradford总蛋白定量,结合EUSA对目的蛋白rhBMP4:进行定量,表达上清中特异性蛋白的表达量达到17.731mg/L,占总蛋白含量的22.115%;hBmp4成熟片段全序列优化后,单拷贝菌株的表达量与对应拷贝数的未优化序列相比提高了3倍。

关键词：人骨形态发生蛋白4 毕赤酵母表达密码子使用优化

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高肩金线鲃（Sinocyclocheilus altishoulderus）与滇池金线鲃（Sinocyclocheilus grahami）线粒体DNA全序列比较分析

高肩金线鲃（Sinocyclocheilus altishoulderus）与滇池金线鲃（S...

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作者：王琳云南大学

学位级别：硕士

本研究对高肩金线鲃和滇池金线鲃线粒体DNA全序列进行了测定，统计了线粒体DNA的碱基组成、密码子使用频率，模拟tRNA的二级结构，分析两个物种之间的共同点与差异，并将金线鲃线粒体DNA与鲤(Cyprinuscarpio)、鲫(Carassiusauratusaurat... 详细信息

本研究对高肩金线鲃和滇池金线鲃线粒体DNA全序列进行了测定，统计了线粒体DNA的碱基组成、密码子使用频率，模拟tRNA的二级结构，分析两个物种之间的共同点与差异，并将金线鲃线粒体DNA与鲤(Cyprinuscarpio)、鲫(Carassiusauratusauratus)、鸡(Gallusgallus)和人(Homosapiens)的进行比较，得出以下结果：　　1.高肩金线鲃线粒体基因组总长度为16586bp，滇池金线鲃线粒体总长度为16585bp，它们的长度与鲤科其他鱼类相似。　　2.2种金线鲃的线粒体DNA和其他脊椎动物的一样包含13个蛋白质编码基因，2个rRNA基因、22个tRNA基因和一个主要的非编码区(控制区)。　　3.高肩金线鲃和滇池金线鲃之间的遗传距离为9.67％±0.0027。　　4.在密码子的使用频率上，两个物种有基本相同的偏倚模式，并且和已经研究的其他脊椎动物相同。2种金线鲃蛋白质编码基因起始密码子均相同，终止密码子除ATP8的以外，其他的都相同。　　5.高肩金线鲃和滇池金线鲃线粒体基因中的D-loop区、ND基因、ATP基因和Cytb基因的变异较高，COX基因、rRNA基因和tRNA基因的变异相对较低。

关键词：高肩金线鲃滇池金线鲃线粒体全序列密码子使用碱基组成

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线粒体和核基因密码子的若干统计特征及其关联

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生命科学研究 2005年第2期9卷 110-117,128页

作者：袁哲明王智张永生吉洪湖欧阳芳文迪彪湖南农业大学生物安全科技学院中国湖南长沙410128 湖南文理学院生命科学系中国湖南常德415000

基于归1000密码子使用频次,从垂直和水平两个方向比较研究了不同进化阶层生物线粒体基因和核基因密码子使用的若干统计特征及其关联.结果表明:线粒体基因密码子多样性、相对分子质量和相对π电子共振能低于相应核基因且变异较大;不同进... 详细信息

基于归1000密码子使用频次,从垂直和水平两个方向比较研究了不同进化阶层生物线粒体基因和核基因密码子使用的若干统计特征及其关联.结果表明:线粒体基因密码子多样性、相对分子质量和相对π电子共振能低于相应核基因且变异较大;不同进化阶层生物线粒体基因和核基因归1000密码子的相对π电子共振能呈极显著负相关且两者之和接近定值;真菌-真菌线粒体、植物-植物线粒体、无脊椎动物-无脊椎动物线粒体的密码子使用频次匹配较好;线粒体基因AU含量、密码子第三位碱基AU3s含量高于相应核基因;给出了密码子各位点碱基含量随进化以及在线粒体-核间的变化规律.由于线粒体环境不如核环境稳定,线粒体基因密码子的多个统计特征较核基因在不同进化阶层生物间变异较大,但二者在归1000密码子相对π电子共振能等若干特征方面仍存在明显关联.

关键词：线粒体基因核基因密码子使用关联

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粳稻叶绿体基因组的密码子用法

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作物学报 2004年第12期30卷 1220-1224页

作者：刘庆坡薛庆中浙江大学农业与生物技术学院农学系浙江杭州310029

基因组密码子使用受多种因素的影响 ,本试验通过对应分析探讨了若干重要因子对粳稻品种“日本晴”叶绿体全基因组序列密码子用法的效应。结果指出 ,在影响最大的第一条向量轴上 ,基因的位置坐标与该基因的表达水平(CAI)和GC3s极显著相关... 详细信息

基因组密码子使用受多种因素的影响 ,本试验通过对应分析探讨了若干重要因子对粳稻品种“日本晴”叶绿体全基因组序列密码子用法的效应。结果指出 ,在影响最大的第一条向量轴上 ,基因的位置坐标与该基因的表达水平(CAI)和GC3s极显著相关 (r =0 785 和 - 0 80 4 ) ,而CAI与GC3s高度负相关 (r =- 0 917 ) ;说明基因表达水平的高低是影响密码子使用的主要因素 ,并且高表达的基因强烈偏好使用以T或A结尾的密码子。基因编码区碱基组成的影响力远不及基因的表达水平 ,G +C含量与ENC、CAI以及第一条向量轴上基因位置坐标的相关系数分别为0 344 、- 0 4 2 2 和 - 0 4 2 1 ;相关性测验和方差分析均表明基因长度对密码子的使用影响不大 ,估计与那些编码未知功能的ORFs的存在有关 ;复制转录对密码子的使用没有明显的选择。将高表达优越密码子分析法和高频密码子分析法相结合 ,确定了TGT和GAA等 12个密码子为叶绿体基因组的主要偏爱密码子。

关键词：水稻叶绿体基因组密码子使用对应分析基因表达水平 G+C含量

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叶绿体matK基因在原始陆生植物的演化

叶绿体matK基因在原始陆生植物的演化

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作者：庄树岚国立台湾大学

学位级别：硕士

高等植物叶绿体trnKUUU基因的内插子属于第二类内插子，其中包含一段开读框，因其序列及结构和酵母菌粒线体的maturase相似，故称之为matK，matK是叶绿体中唯一具有去除内插子弁鄋涤穧]，只有较高等的轮藻和陆生植物的叶绿体trnK基因才... 详细信息

高等植物叶绿体trnKUUU基因的内插子属于第二类内插子，其中包含一段开读框，因其序列及结构和酵母菌粒线体的maturase相似，故称之为matK，matK是叶绿体中唯一具有去除内插子弁鄋涤穧]，只有较高等的轮藻和陆生植物的叶绿体trnK基因才有内插子和trnK5’-matK-trnK3’的结构，其他绿藻叶绿体的trnK并没有matK开读框、也没有第二类内插子。叶绿体trnK5’-matK-trnK3’的结构在高等植物相当一致，但先前研究发现两个matK脱离trnK而存在的例子，像是叶绿体严重退化的寄生植物Epifagus virginiana及因叶绿体基因重组而导致trnK外显子丢失的铁线蕨，它们的matK仍然具有完整的开读框，显示了matK的确十分重要而不可缺失，藓苔类和松叶蕨也被证实具有trnK5’-matK-trnK3’的结构，但是在角藓中却发现其matK是伪基因。本论文监定原始陆生植物其他未被检视的重要类群中叶绿体matK基因的存在，结果发现瓶尔小草、过山龙、生根卷柏都有trnK5’-matK-trnK3’的结构，以RT-PCR侦测matK表现时，瓶尔小草和过山龙都有侦测到讯号，但生根卷柏却没有，显示matK的表现在原始陆生植物似乎不是那么一致。利用PCR的侦测并未能在水韭、木贼、观音座莲、紫萁、海金沙、芒萁等物种中放大出trnK或matK的片段。但是利用点式杂合反应则发现这些物种可能有matK序列的存在，显示这些序列可能因变异太大而无法以PCR方式放大。故有关蕨类叶绿体matK的存在与否仍有待进一步研究。以叶绿体matK核苷酸序列进行谱系分析，结果显示部分裸子植物(松柏、银杏、苏铁)和被子植物形成姊妹群，两者再和麻黄类植物形成姊妹群。邻近连接法和贝叶氏导出氏分析结果将松叶蕨、瓶尔小草，和生根卷柏的matK序列一起形成一个单源群，同属石松类的过山龙与生根卷柏序列并未形成姐妹群。高度简约分析则显示过山龙和其他的拟蕨共同形成一个单源群，本论文的结果和前人研究不同，推测是原始陆生植物之matK演化速率太快、造成谱系分析长枝吸引的作用。此外，密码子使用分析的结果证实matK符合叶绿体平均密码子使用情形，且密码子使用偏移的情形和维持基因组内GC含量比例有关，因为密码子的使用和演化筛选压力及基因组核苷酸的组成有关，故密码子使用状况也反应了系群的演化关系。

关键词：叶绿体 trnK matK 第二类内插子瓶尔小草卷柏密码子使用石松

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修正非齐次马尔可夫模型应用的研究

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生物信息学 2004年第2期2卷 27-28页

作者：韩乐华南理工大学应用数学系广东广州510640

修正非齐次模型是在齐次模型和非齐次模型基础上提出的适用于蛋白质编码区的马尔可夫模型。此模型可以用来分析生物物种进化和基因突变,模型中的马尔可夫度与序列进化水平相关联,转移矩阵与基因突变相关联。本文通过比较7类不同物种-1... 详细信息

修正非齐次模型是在齐次模型和非齐次模型基础上提出的适用于蛋白质编码区的马尔可夫模型。此模型可以用来分析生物物种进化和基因突变,模型中的马尔可夫度与序列进化水平相关联,转移矩阵与基因突变相关联。本文通过比较7类不同物种-1度马尔可夫链的含量,验证了生物物种进化反映在密码子使用上的特征;通过密码子位点间转移矩阵的计算,分析了基因突变在密码子不同位点上发生的可能性。

关键词：密码子使用马尔可夫度转移矩阵基因突变

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转基因微藻的研究进展

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江苏化工 2004年第5期32卷 15-18页

作者：冯一军刘均洪青岛科技大学化工学院山东青岛266042

介绍了有效核转化微藻的方法和策略,以及微藻中密码子使用存在偏爱性,指出微藻作为绿色细胞已用来生产具有特殊价值的代谢物和外源蛋白质,转基因微藻在生物工程上已得到应用。

关键词：微藻转基因密码子使用

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不用比较的基因组分析

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世界科学 2004年第6期 28-28页

作者：李伟

2004年4月29日的杂志发表了一篇论文,描述了一种检测蛋白质的选择压力的新方法,其新颖之处在于:它可以只以一种单一基因组为研究对象,而不用(传统方法)比较核苷酸序列.

2004年4月29日的<自然>杂志发表了一篇论文,描述了一种检测蛋白质的选择压力的新方法,其新颖之处在于:它可以只以一种单一基因组为研究对象,而不用(传统方法)比较核苷酸序列.

关键词：基因组染色体组核苷酸序列密码子使用普罗特

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人骨形态发生蛋白4,7在毕赤酵母中的表达

人骨形态发生蛋白4,7在毕赤酵母中的表达

引用

华东六省一市生物化学与分子生物学会2003年学术交流会

作者：陈凌陈雅娟蔡燕惠张彦定福建师范大学生物工程学院福建师范大学生物工程学院福建师范大学生物工程学院福建师范大学生物工程学院

骨形态发生蛋白(Bone Morphogenetic Protein,BMP)是一类具有广泛生物学活性的糖蛋白短肽分子。到目前为止,在哺乳动物(包括人类)中,已发现BMP家族成员至少有16种,它们在发育过程中的作用不尽相同。已有的研究表明,在发育过程中,BMP4及B... 详细信息

骨形态发生蛋白(Bone Morphogenetic Protein,BMP)是一类具有广泛生物学活性的糖蛋白短肽分子。到目前为止,在哺乳动物(包括人类)中,已发现BMP家族成员至少有16种,它们在发育过程中的作用不尽相同。已有的研究表明,在发育过程中,BMP4及BMP7具有很强的促使细胞组织分化形成骨组织的作用。hBMP4成熟肽由116个氨基酸组成,hBMP7成熟肽由139个氨基酸组成。二者均有7个Cys,除各自形成三个链内二硫键外,两个成熟肽单体还能通过一个链间二硫键形成同种或异种二聚体。BMP4,7在成体中对

关键词：毕赤酵母氨基酸组成成熟肽高拷贝转化子密码子使用糖基化修饰毕赤酵母表达载体重组质粒骨形态发生蛋白

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