检索结果-内蒙古大学图书馆

中华地方病学杂志 2013年第6期32卷 599-601页

作者：朱俊洁王鹏李伟宋志忠云南学院公共卫生学院流行病学与卫生统计学云南省地方病防治所云南省鼠疫防控技术重点实验室大理671000 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所鼠疫室

目的对云南省鼠疫菌株进行基因分型，探究云南各型菌株之间的内在联系。方法选取云南家鼠、野鼠及玉龙鼠疫菌共171株进行试验，采用鼠疫菌基因组23个差异片段（DFR）进行分型，并运用BioNumerics5．0进行聚类分析。结果23个差异片段将17... 详细信息

目的对云南省鼠疫菌株进行基因分型，探究云南各型菌株之间的内在联系。方法选取云南家鼠、野鼠及玉龙鼠疫菌共171株进行试验，采用鼠疫菌基因组23个差异片段（DFR）进行分型，并运用BioNumerics5．0进行聚类分析。结果23个差异片段将171株鼠疫菌分为7个基因组型：Genomovar5、Genomovar7、Genomovar9型及4个新发现的基因型。7株玉龙型菌株都为Genomovar5基因型；16株野鼠型（滇西纵谷型）鼠疫菌株被分为3个基因型，其中13株为Genomovar7基因型，2株为Genomovar9基因型，1株为新发现的Genomovar—ynl基因型；148株云南家鼠型（滇闽居民型）鼠疫菌株被分为4个基因型，其中145株为Genomovar9基因型．3株为3个新发现的基因型，分别为Genomovar-yn2、一yn3、一yn4基因型。生态型聚类分析显示，玉龙型鼠疫菌株与滇西纵古型（野鼠型）菌株的基因型较为相似（87．20％），与滇闽居民型（家鼠型）相似度较小（73．75％）。2株滇西纵谷型菌株与滇闽居民型的主基因型同为Genomovar9基因型。滇西纵谷型Genomovar-ynl基因型与Genomovar7基因型相似，但缺失DFR11。滇闽居民型Genomovar-yn2、-yn3、-yn4基因型与Genomovar9基因型相似，但分别缺失了DFRIO、DFR9、DFR11。结论在野鼠型鼠疫菌株中新发现了1种基因型，在家鼠型鼠疫菌株中新发现了3种基因型，在野鼠型鼠疫菌株中发现了家鼠型鼠疫菌株。玉龙鼠疫菌株的基因型与滇西纵谷型（野鼠型）菌株的基因型相似较高，与滇闽居民型（家鼠型）菌株的基因型相似度较小。

关键词：耶尔森菌鼠疫差异片段基因分型

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小麦矮腥黑穗菌差异片段筛选与分子检测体系的建立

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微生物学报 2007年第4期47卷 725-728页

作者：年四季殷幼平袁青夏玉先王中康李敏惠重庆大学生物工程学院

采取随机扩增DNA多态性(Random amplified polymorphic DNA,RAPD)引物介导的半特异PCR技术(RAPD primer mediated hemi-specific PCR,RM-PCR),在从不同地域征集的18个小麦矮腥黑穗菌(Tilletia controversa Kühn,TCK)菌株和29个小麦网腥黑穗病菌(Tilletia caries(DC)Tul,TCT)菌株的总基因组DNA中筛选鉴定出TCK独有的大小为1322bp差异基因组片段。根据该片段序列设计筛选出2对特异性引物CQUTCK2/CQUTCK3和CQUTCK4/CQUTCK5,均可以从18个TCK菌株的菌丝体和冬孢子DNA中稳定地扩增出747bp和200bp的单一靶带DNA,而在29个TCT菌株的菌丝体或冬孢子DNA均无任何扩增产物。以腥黑穗菌属通用引物对CQUK6/CQUK7为内置对照,可以确定被检样品是否含PCR抑制物质进而判断检测体系是否正确,同时有效地排除样品检测结果的假阳性和假阴性。采用建立的TCK特异PCR检测技术体系,实现简单而快速地鉴定小麦矮腥黑穗菌冬孢子或罹病小麦组织中侵染菌丝体的目的。

关键词： TCK TCT 差异片段内置对照

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应用MS-RDA筛选胃癌甲基化差异片段

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世界华人消化杂志 2006年第4期14卷 365-369页

作者：廖爱军苏琦王珣曾斌石巍南华大学肿瘤研究所南华大学附属第一医院消化内科湖南省衡阳市421001

目的:应用甲基化敏感性代表性差异分析法(methylation-sensitive representational difference analysis,MS-RDA)筛选胃癌和正常胃组织间甲基化差异DNA片段．方法:通过MS-RDA筛选胃癌和正常胃组织间DNA甲基化差异片段,经克隆、测序后进... 详细信息

目的:应用甲基化敏感性代表性差异分析法(methylation-sensitive representational difference analysis,MS-RDA)筛选胃癌和正常胃组织间甲基化差异DNA片段．方法:通过MS-RDA筛选胃癌和正常胃组织间DNA甲基化差异片段,经克隆、测序后进行生物信息学分析．结果:获得3个甲基化差异片段,分别为 CRS1308,CRS1309,CRS1310k列,其中 CRS1309和CRS1310已被GenBank收录,登陆亏分别为AY887106和AY887107,CRS1309 序列与LOC440683基因第11外显子、 LOC440887基因的3’端,DRD5基因启动子和外显子区域均有很高的相似性(分别为98％,99％, 94％),CRS1310序列与1999年Minoru Toyota在人类结肠癌中分离出的核糖体RNA上的甲基化差异性CpG岛有很高的相似性(98％)．结论:胃癌和正常胃组织间DNA甲基化存在差异,MS-RDA可有效分析这两种不同组织间甲基化的差异,筛选出有意义的甲基化差异片段.

关键词：胃癌 DNA甲基化差异片段 MS-RDA

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筛选转化生长因子诱导血管外膜成纤维细胞表型转化的差异片段

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中国病理生理杂志 2000年第10期16卷 141-142页

作者：高平进朱鼎良赵涵芳徐洪上海第二医科大学附属瑞金医院上海市高血压研究所!上海200025 上海第二医科大学生化教研室

目的:血管外膜参与血管重塑的病变基础是细胞表型转化,其显著特征之一是外膜成纤维细胞(AF)被迅速激活并转化为肌成纤维细胞(MF),后者兼有AF及平滑肌细胞的双重功能特性,增生并迁移至中膜及内膜.本研究应用差别显示聚合酶链反应(DD-PCR... 详细信息

目的:血管外膜参与血管重塑的病变基础是细胞表型转化,其显著特征之一是外膜成纤维细胞(AF)被迅速激活并转化为肌成纤维细胞(MF),后者兼有AF及平滑肌细胞的双重功能特性,增生并迁移至中膜及内膜.本研究应用差别显示聚合酶链反应(DD-PCR)技术筛选2种表型细胞间差别表达基因.方法:1.采用传统贴片法体外培养WKY大鼠胸主动脉外膜获AF,再用TGFβ1(20 ng/mL)处理AF24 h获MF.2.用免疫细胞化学分别检测AF及MF 2种表型细胞内α-SM肌动蛋白(αSM-actin)含量.

关键词：血管外膜成纤维细胞差异片段表型转化

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应用AP-PCR DNA指纹图分离非小细胞肺癌相关差异片段

应用AP-PCR DNA指纹图分离非小细胞肺癌相关差异片段

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作者：于振涛中国协和医科大学

学位级别：博士

肺癌的发生是一个基因突变和染色体重排累积的过程，因此，肿瘤组织与正常组织之间存在着差异。寻找和克隆突变基因对于了解肿瘤的发生发展机制具有重要意义。本研究应用随机多态性DNA(Arbitrari ly primed PCR，AP-PCR)指纹图谱分... 详细信息

肺癌的发生是一个基因突变和染色体重排累积的过程，因此，肿瘤组织与正常组织之间存在着差异。寻找和克隆突变基因对于了解肿瘤的发生发展机制具有重要意义。本研究应用随机多态性DNA(Arbitrari ly primed PCR，AP-PCR)指纹图谱分析技术，对9例配对的肺癌组织及癌旁组织作基因差异分析，经低严格条件和严格条件下的两轮四十余个循环，将AP—PCR产物加样于2％琼脂糖凝胶电泳，结果显示在两例肿瘤标本中各有三个不同于正常组织的差异片段，经玻璃奶回收后克隆其中四个片段，并测序。序列分析发现四个片段长度均为429bp，与GenBank已知序列比较表明其与已知序列无同源性存在。但其中三个片段间的同源序列达99％以上，说明为相同的片段。以片段8Tdf1为探针行Southern杂交，发现九对基因组标本中的5例肿瘤组织呈现高信号。说明8Tdf虽然是一个功能未知的基因序列，它与非小细胞肺癌的发生发展可能存在一定的相关性，有待于进一步的功能性研究加以证实。

关键词：非小细胞肺癌 AP-PCR DNA 肺癌组织预后因素差异片段指纹图

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胃癌DNA甲基化差异片段的筛选与分析

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现代肿瘤医学 2006年第5期14卷 581-584页

作者：王珣廖爱军苏琦南华大学附一医院消化内科湖南衡阳421001 南华大学肿瘤研究所湖南衡阳421001

目的筛选和分析胃癌和正常胃组织间DNA甲基化差异片段。方法通过甲基化敏感性代表性差异分析法(methylation-sensitive-representationaldifferenceanalysis,MS-RDA),筛选胃癌和正常胃组织间DNA甲基化差异片段,经克隆、测序后进行生物... 详细信息

目的筛选和分析胃癌和正常胃组织间DNA甲基化差异片段。方法通过甲基化敏感性代表性差异分析法(methylation-sensitive-representationaldifferenceanalysis,MS-RDA),筛选胃癌和正常胃组织间DNA甲基化差异片段,经克隆、测序后进行生物信息学分析。结果获得3个甲基化差异片段CRS1308、CRS1309、CRS1310序列。其中CRS1309和CRS1310已被GenBank收录,登陆号分别为AY887106和AY887107。CRS1309序列与LOC440683基因、LOC440887基因的3'端、DRD5基因均有很高的相似性;CRS1310序列与1999年MinoruToyota在人类结肠癌中分离出的核糖体RNA上的甲基化差异性CpG岛有很高的相似性。结论胃癌和正常胃组织间DNA甲基化存在差异,LOC440683、LOC440887、DRD5基因的异常甲基化可能与胃癌的发生相关,胃癌中CRS1310序列所在核糖体RNA上的CpG岛易发生甲基化。

关键词：胃癌 DNA甲基化差异片段筛选分析

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反向Northern筛查冠心病血瘀证差异片段

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中国中医基础医学杂志 2004年第9期10卷 29-30,34页

作者：杨保林王阶姜燕中国中医研究院西苑医院北京100091 天津天士力集团天津300402

目的 :降低mRNA差异显示假阳性。方法 :采用反向Northern杂交方法进行筛查差异片段的真实性。结果 :差异片段再扩增后经检测符合杂交条件的有 96条 ,反向杂交后 ,有 10条DNA片段属于真实的差异片段。结论

关键词：反向Northern 冠心病血瘀证差异片段

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抑制性消减杂交法筛选鸡白痢沙门氏菌基因组差异片段

抑制性消减杂交法筛选鸡白痢沙门氏菌基因组差异片段

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遗传学进步与人口健康高峰论坛

作者：徐耀辉焦新安李求春潘志明黄金林扬州大学生物科学与技术学院扬州大学兽医学院江苏扬州扬州大学生物科学与技术学院扬州大学兽医学院江苏扬州扬州大学生物科学与技术学院扬州大学生物科学与技术学院扬州大学生物科学与技术学院

采用抑制性消减杂交技术(suppression subtractive hybridization,SSH)对鸡白痢沙门氏菌 C79-13株与鸡伤寒沙门氏菌 Sg9株进行基因组差异片段分析．从 C79-13株中共检出13个特异性差异片段。经同源分析,这些序列可分为3类：噬菌体相关... 详细信息

采用抑制性消减杂交技术(suppression subtractive hybridization,SSH)对鸡白痢沙门氏菌 C79-13株与鸡伤寒沙门氏菌 Sg9株进行基因组差异片段分析．从 C79-13株中共检出13个特异性差异片段。经同源分析,这些序列可分为3类：噬菌体相关序列、质粒相关序列、已知功能序列．这些差异片段包含一些重要的沙门氏菌毒力相关基因,如大肠杆菌素、

关键词：鸡白痢沙门氏菌特异性基因组差异差异片段抑制性消减杂交

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布鲁氏菌强毒株与弱毒株基因组DNA差异基因筛选与鉴定

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中国预防兽医学报 2009年第7期31卷 513-518页

作者：张俊敏韩文瑜雷连成孙长江赵瑞利冯新赵伟栋杜涛峰吉林大学农学部畜牧兽医学院吉林长春130062

本研究应用代表性差异分析技术(RDA)对流产布鲁氏菌强毒株544A和弱毒株104M进行基因组差减分析。经过3轮差减杂交,获得强毒株特有的9条差异片段和弱毒株特异的17条差异片段。经BLAST分析和PCR鉴定,最终证实3条差异片段,与流产布鲁氏菌... 详细信息

本研究应用代表性差异分析技术(RDA)对流产布鲁氏菌强毒株544A和弱毒株104M进行基因组差减分析。经过3轮差减杂交,获得强毒株特有的9条差异片段和弱毒株特异的17条差异片段。经BLAST分析和PCR鉴定,最终证实3条差异片段,与流产布鲁氏菌经典弱毒株S19同源性在98%～99%之间,只在弱毒株104M基因组中检测出,而在强毒株544A中不存在。该实验为建立布鲁氏菌自然感染菌与疫苗株的基因鉴别诊断方法奠定了基础。

关键词：流产布鲁氏菌代表性差异分析差异片段鉴定

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2004北京“植物分子生物学与生物信息学国际学术研讨会”论文摘要

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Journal of Genetics and Genomics 2004年第9期31卷 1001-1021页

作者： Julian I.Schroeder

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