检索结果-内蒙古大学图书馆

中华耳鼻咽喉科杂志 2001年第2期36卷 153-156页

作者：徐先发唐平章程书钧北京中国医学科学院中国协和医科大学肿瘤医院头颈外科 100021 肿瘤研究所病因室

微卫星（microsatellite）是由1～6个核苷酸组成的重复单元串联排列而成的DNA序列。微卫星序列短，数目巨大，种类多，分布广，多态性高，具有较高的遗传稳定性，非常适合敏感的聚合酶链反应（polymerase chain reaction，PCR）扩增，... 详细信息

微卫星（microsatellite）是由1～6个核苷酸组成的重复单元串联排列而成的DNA序列。微卫星序列短，数目巨大，种类多，分布广，多态性高，具有较高的遗传稳定性，非常适合敏感的聚合酶链反应（polymerase chain reaction，PCR）扩增，是出色的遗传标记。但直到1993年在大肠癌中首次发现肿瘤的微卫星不稳定性（microsatellite instability）以后［1］，微卫星的研究才引起人们浓厚的兴趣。肿瘤微卫星不稳定性是指肿瘤组织与其相应非肿瘤组织相比，其结构性等位基因的大小发生了改变，即微卫星重复单元的增加或丢失。肿瘤中比微卫星不稳定性更常见的是微卫星的杂合性缺失（loss of heterozygosity, LOH）。

关键词：头颈部鳞状细胞癌微卫星分析分子诊断克隆

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微卫星分析在中国人膀胱癌诊断中的应用

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癌症 2000年第6期19卷 512-516页

作者：张建军范振斌白瑾峰萧泽钧安倩高燕宁程书钧中国医学科学院中国协和医科大学肿瘤医院肿瘤研究所北京100021

目的：探讨尿沉渣ＤＮＡ微卫星分析方法在中国人膀胱癌诊断中的应用价值。方法：首先选取分布于１８条染色体上的６０个微卫星位点对３８例膀胱肿瘤病人的尿沉渣和相应病理组织的ＤＮＡ进行微卫星分析，寻找覆盖病人最多的位点组合... 详细信息

目的：探讨尿沉渣ＤＮＡ微卫星分析方法在中国人膀胱癌诊断中的应用价值。方法：首先选取分布于１８条染色体上的６０个微卫星位点对３８例膀胱肿瘤病人的尿沉渣和相应病理组织的ＤＮＡ进行微卫星分析，寻找覆盖病人最多的位点组合；然后以此组合对４０例膀胱疾病病人和健康志愿者的尿沉渣进行了双盲分析，以验证此组合的特异性和可能的临床价值。结果：建立了一套由９个微卫星位点组成的诊断组合。５９例膀胱癌中，８６％（３１／３６）的癌组织和９０％（５３／５９）的尿沉渣ＤＮＡ在这９个位点中至少有一个位点发生异常；１２例非膀胱肿瘤个体的尿沉渣ＤＮＡ无一例发生改变；检出率与肿瘤分期、分级无相关性；而且，该组合与美国人报道的组合明显不同。结论：作为一种无创伤性手段，尿沉渣ＤＮＡ微卫星分析对于膀胱癌的筛查和早期诊断具有一定意义；与美国报道的诊断组合的不同，反映了人种差异和可能的病因学差异。

关键词：微卫星分析膀胱肿瘤诊断人种差异 DNA

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精子冷冻保存对大菱鲆后代遗传结构影响的微卫星分析

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高技术通讯 2005年第6期15卷 87-91页

作者：陈松林刘云国季相山中国水产科学研究院黄海水产研究所农业部海洋渔业资源可持续利用重点开放实验室青岛266071 中国海洋大学生命科学与技术学部青岛266003 山东农业大学水产系泰安271018

用微卫星技术对大菱鲆冻精和鲜精受精鱼苗的遗传结构进行了分析比较,以期间接地检验冷冻保存没有对精子的遗传结构产生影响.精子冷冻按三步法进行,冻后成活率为65%(对照为85%).精子在液氮中保存半小时后解冻授精,冻精受精率和孵化率与... 详细信息

用微卫星技术对大菱鲆冻精和鲜精受精鱼苗的遗传结构进行了分析比较,以期间接地检验冷冻保存没有对精子的遗传结构产生影响.精子冷冻按三步法进行,冻后成活率为65%(对照为85%).精子在液氮中保存半小时后解冻授精,冻精受精率和孵化率与鲜精的没有显著差异.实验用冻精和鲜精受精鱼苗各15条,且来自相同的父母本,这减少了亲本遗传结构不同对实验结果的干扰.10对微卫星引物的分析结果显示,15条鲜精受精大菱鲆苗共得到等位基因30个,基因型25个,杂合度为0.5747;15条冻精受精大菱鲆苗共得到等位基因30个,基因型25个,杂合度为0.5714.在鲜精受精大菱鲆和冻精受精大菱鲆的30个等位基因中,只有7个等位基因的频率发生了比较显著变化.

关键词：冷冻保存大菱鲆微卫星分析精子结构影响等位基因后代遗传结构微卫星技术微卫星引物分析比较分析结果基因型杂合度鲜精冻精三步法成活率孵化率受精率父母本鱼苗实验授精解冻亲本

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牙鲆4个选择性繁育后代群体遗传结构的微卫星分析

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渔业科学进展 2009年第4期30卷 57-63页

作者：徐田军陈松林田永胜农业部海洋渔业资源可持续利用重点开放实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所青岛266071 上海海洋大学生命科学与技术学院 201306

为了检测由3个牙鲆基础群体组合交配建立的4个选择性繁育后代群体的遗传多样性水平,本研究利用10对微卫星引物分析了其遗传结构信息。计算结果表明,等位基因数3～10个,平均等位基因数5.7个,有效等位基因数1.3571～4.5979,平均有效等位... 详细信息

为了检测由3个牙鲆基础群体组合交配建立的4个选择性繁育后代群体的遗传多样性水平,本研究利用10对微卫星引物分析了其遗传结构信息。计算结果表明,等位基因数3～10个,平均等位基因数5.7个,有效等位基因数1.3571～4.5979,平均有效等位基因数2.9832,各个位点的平均观测杂合度0.2083～1.0000,平均期望杂合度0.2081～0.7956,多态信息含量0.1671～0.7501,其中中度多态位点两个,高度多态位点7个,各群体的多态信息含量从大到小依次为日本亲鱼与抗病亲鱼杂交后代群体、抗病亲鱼自繁后代群体、抗病亲鱼与黄海野生亲鱼繁殖后代群体、日本亲鱼自繁后代群体。分析结果表明,4个群体的遗传多态水平均较高,对4个选择性繁育后代群体的平均观测杂合度值进行X2检验表明,群体间遗传多样性差异不显著。日本亲鱼自繁后代群体与中国海域亲鱼繁育后代群体(抗病亲鱼自繁后代群体和抗病亲鱼与黄海野生亲鱼繁殖后代群体)的遗传距离较远,分别为0.2724和0.3310。根据群体间的遗传距离利用NJ法构建系统树,抗病亲鱼自繁后代群体和抗病亲鱼与黄海野生亲鱼繁殖后代群体聚为一支,日本亲鱼自繁后代群体和日本亲鱼与抗病亲鱼杂交后代群体聚为一支,对遗传偏离指数的分析表明群体间的遗传平衡差异很大。

关键词：牙鲆养殖群体遗传多样性微卫星分析

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Romilly Hills羊遗传多样性的微卫星分析

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畜牧与兽医 2003年第6期35卷 11-13页

作者：贾斌赵茹茜剡根强雒秋江陈杰南京农业大学农业部动物生理生化重点开放实验室江苏南京210095 新疆石河子大学动物科技学院新疆石河子832003 新疆农业大学动物营养实验室新疆乌鲁木齐830057

利用 1 0个微卫星标记对新疆兵团农七师从南非引进的罗米丽 (RomillyHills)绵羊和中国美利奴羊 (新疆军垦型 )遗传多样性进行了检测。统计了两群体的等位基因组成、平均有效等位基因数 (E)和平均基因纯合率 ,利用等位基因频率计算出两... 详细信息

利用 1 0个微卫星标记对新疆兵团农七师从南非引进的罗米丽 (RomillyHills)绵羊和中国美利奴羊 (新疆军垦型 )遗传多样性进行了检测。统计了两群体的等位基因组成、平均有效等位基因数 (E)和平均基因纯合率 ,利用等位基因频率计算出两群体的平均遗传杂合度 (h)、多态信息含量 (PIC)。结果表明 1 0个微卫星位点在RomillyHills羊、中国美利奴羊群体中的平均多态信息含量分别为 0 5952和 0 5859,除BM1 82 4、MAF65外均为高度多态 ,可作为有效的遗传标记用于两品种绵羊遗传多样性分析 ;RomillyHills羊的群体遗传变异大于中国美利奴羊 ,其遗传多样性相对丰富 ,有较大的选育潜力。

关键词：罗米丽绵羊 Romilly-Hills羊遗传多样性微卫星分析遗传结构

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栉江珧形态性状对重量性状的影响及五个野生群体遗传多样性的微卫星分析

栉江珧形态性状对重量性状的影响及五个野生群体遗传多样性的微卫...

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作者：白临建 上海海洋大学

学位级别：硕士

栉江珧(Atrina pectinata)在我国沿海分布较广,经济价值很高。目前关于栉江珧的研究较少,主要集中在形态学和繁殖生物学,群体遗传学和分子生物学研究相对较少。本研究以野生栉江珧为材料,首先探讨了栉江珧形态性状对重量性状的影响效果... 详细信息

栉江珧(Atrina pectinata)在我国沿海分布较广,经济价值很高。目前关于栉江珧的研究较少,主要集中在形态学和繁殖生物学,群体遗传学和分子生物学研究相对较少。本研究以野生栉江珧为材料,首先探讨了栉江珧形态性状对重量性状的影响效果,为栉江珧质量性状的选育提供了一定的理论参考;其次进行了微卫星多态性引物的筛选及在我国野生栉江珧群体的遗传多样性分析,丰富了栉江珧群体遗传学和分子生物学的研究内容。取得的主要结果如下:\n 1.栉江珧形态性状对重量性状的影响:随机选取101只山东日照的野生栉江珧,测量其壳长(SL)、壳宽(SW)、壳高(SH)、壳顶角(AG)4个形态性状和体重(WG)、软体重(WT)、闭壳肌重(WM)3个重量性状,采用相关分析和通径分析得出了不同形态性状对重量性状的影响效果。结果表明,除壳顶角与闭壳肌重的相关系数不显著外,其余形态性状与重量性状间的相关系数均达极显著水平(P<0.01);壳高对重量性状的直接作用和间接作用均较大,是影响重量性状的主要因素;壳长和壳宽通过壳长对重量性状的间接作用较大,直接作用较小,是影响重量性状的两个次要因素;利用逐步回归分析建立了栉江珧形态性状关于体重(Y=69.112SH+52.823SW-751.367)、闭壳肌重(Y=4.275SH-18.610)和软体重(Y=37.161SH+43.404SW+4.111SA-614.096)的最优回归方程。实验结果为栉江珧的选择育种研究提供了一定的理论参考。\n 2.栉江珧微卫星富集文库的构建与多态性引物的筛选:首先用限制性内切酶Msp I对基因组 DNA进行酶切,并将酶切产物与 Msp I接头(HMA1:5\'-GATCATGAGTCCTGCT-3\',HMA2:5\'-CGAGCAGGACTCAGAA-3\')进行连接,连接产物与生物素标记的寡核苷酸探针(AC)15进行杂交,并将杂交产物与包被有链霉亲和素的磁珠相结合,对杂交产物-探针-磁珠的杂交复合物进行洗脱,洗脱得到的微卫星序列进行 PCR扩增后克隆进 pMD18-T载体中,然后转入到感受态细胞中,挑选阳性克隆进行测序。对192个菌落中的109个阳性克隆进行微卫星测序,其中93个序列测序成功,使用SSR Hunter软件处理序列得到66个重复5次以上的微卫星序列,其中完美型51个,占77.3%;不完美型11个,占16.7%;混合型4个,占6.1%。根据测序结果共设计微卫星引物32对,经退火温度和多态性筛选,有26对能扩增出特异性目的片段,21对在群体扩增中具有多态性。\n 3.我国5个地理群体栉江珧的遗传多样性分析:从筛选出的21对多态性较强的引物中,选择产物较好的8对,以5个栉江珧野生群体(中国北方:山东蓬莱、文登和日照;中国南方:广东湛江和海南三亚)共150个栉江珧样本为研究对象,进行了遗传多样性分析。8对微卫星引物在5个地理群体中共检测到41个等位基因,平均每对引物检测到5.13个,有效等位基因分别为1.6590~6.1205个,平均3.0339个。5个栉江珧地理群体的期望杂合度分别为0.4863、0.5704、0.5512、0.5703、0.5806,杂合度较高;平均多态信息含量(PIC)为0.4162、0.4869、0.4805、0.4881、0.5017,均达到高度多态,杂合度和PIC说明5个群体的栉江珧遗传多样性较高。两两群体间遗传分化指数(Fst)为0.0292~0.2805,遗传距离为0.0853~0.5458,北方三个群体之间遗传分化较弱,遗传距离较近,可认为是一个物种的不同地理群体;南方两个群体的遗传距离与Fst也表明其为同一个物种的两个地理群体;但南北群体的遗传距离较大,表明了新的种或亚种的存在。根据遗传距离(NJ法)进行了聚类分析,结果表明五个群体的栉江珧聚合为两支:北方群体和南方群体首先各自聚为一支,然后南北群体聚合在一起。

关键词：栉江珧地理群体微卫星分析遗传多样性

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用于大规模微卫星分析的富集和测序-分型方法的开发

用于大规模微卫星分析的富集和测序-分型方法的开发

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作者：牟鑫东北林业大学

学位级别：硕士

微卫星是应用非常广泛的分子标记。目前,微卫星的分析主要包括位点筛选、PCR扩增、毛细管电泳分型或大规模平行测序分型等实验流程。这一策略需要逐个物种筛选微卫星,对位点进行扩增体系和程序、多态性、分型错误风险以及群体遗传学特... 详细信息

微卫星是应用非常广泛的分子标记。目前,微卫星的分析主要包括位点筛选、PCR扩增、毛细管电泳分型或大规模平行测序分型等实验流程。这一策略需要逐个物种筛选微卫星,对位点进行扩增体系和程序、多态性、分型错误风险以及群体遗传学特征等的系统评价;然后才能应用到样本分析。这一过程工作量很大,费用很高,可用的微卫星位点数量比较有限。为了打破上述策略的局限性,本研究提出了一个全新的技术方案,依托高通量测序平台,实现样品中微卫星DNA的富集--测序分型一体化。这一方案包括DNA的CviKI-1限制性酶切(平端)、末端加A、与通用接头连接、微卫星富集、平行扩增、高通量测序、分型等步骤。其中富集采用微卫星基序(GA和CA)为引物,5'端连接生物素,经过变性、退火、延伸、缓慢降温,获得目的片段的双链和新生链形成的三聚体,以磁珠进行俘获,变性条件下去除磁珠及其相连的新生链,缓慢复性得到富集的微卫星DNA。以花尾榛鸡(Bonasa bonasia)、黑斑蛙(Pelophylax nigromaculatus)、梅花鹿(Cervus nippon)、王锦蛇(Elaphe carinata)的组织样本和梅花鹿的粪便等实验材料进行测试。结果显示,从5种样品中获得了 5729±2124～614±254个微卫星位点,通过比较侧翼序列识别位点,根据核心序列的重复次数和相对应的read数确定等位基因。得到的位点数与俘获后的扩增循环数呈正相关(P=0.695)。微卫星重复单元的类型除了 GA和CA外,还有23.67±5.43～67.67±4.99种。这些结果表明,本方案不受物种限制,无需事先筛选位点,基于序列分型,可以大规模分析微卫星位点,成本低廉。经过进一步优化,可望在基因组变异度的分析中得到广泛应用。

关键词：微卫星分析高通量测序俘获富集测序分型

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实时灾光定量PCR微卫星分析技术检测脑胶质瘤1p、19q、10q杂合性缺失

实时灾光定量PCR微卫星分析技术检测脑胶质瘤1p、19q、10q杂合性...

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作者：苏江首都医科大学

学位级别：硕士

第一部分目的:通过比较6种从甲醛固定石蜡包埋组织(FFPET)中提取DNA的方法，探讨并建立一种操作简便，污染少、经济实用的石蜡包埋组织提取DNA的方法。 　　材料与方法: 3例甲醛固定石蜡包埋脑胶质瘤组织取自北京市... 详细信息

第一部分目的:通过比较6种从甲醛固定石蜡包埋组织(FFPET)中提取DNA的方法，探讨并建立一种操作简便，污染少、经济实用的石蜡包埋组织提取DNA的方法。 　　材料与方法: 3例甲醛固定石蜡包埋脑胶质瘤组织取自北京市神经外科研究所神经病理室。3例脑胶质瘤患者均于2009年3月在北京天坛医院脑胶质瘤治疗中心行肿瘤切除术，术后标本立即投入甲醛。按WHO中枢神经系统肿瘤分类标准，星形细胞瘤1例，少突星形细胞瘤2例。 　　应用六种方法(酚氯仿抽提法、改良TES水浴法、微波加热法及MN、威格拉斯、全式金公司三种试剂盒)提取DNA，通过DNA浓度、纯度及PCR反应的对比，探讨简单、高效的甲醛固定石蜡包埋组织的DNA提取方法。 　　结果: 　　 (1)二甲苯的脱蜡效果较其他方法较好； 　　 (2)酚氯仿抽提法、改良TES水浴法提取的DNA产物含有较多的短链DNA； 　　 (3)微波加热法、威格拉斯公司试剂盒提取DNA浓度较低，且纯度不高； 　　 (4)试剂盒法(MN、全式金)提取DNA的效果基本相似； 　　 (5)酚氯仿抽提法、改良TES水浴法、MN及全式金公司试剂盒法的DNA经PCR均可得到目的产物。 　　结论:酚氯仿抽提法、改良TES水浴法、试剂盒法的DNA均可保证普通PCR反应的进行。试剂盒法(MN、全式金公司)提取效果及PCR扩增效果均较好。 　　第二部分目的：本实验以实时荧光定量PCR微卫星分析(QuMA)技术为原理，检测脑组织1号染色体短臂(1p)、19号染色体长臂(19q)和10号染色体长臂(10q)正常DNA拷贝数范围。 　　材料与方法：10例冰冻癫痫病灶组织为正常对照脑组织，手术切除后立即放入液氮内冷冻储存，-80℃冰箱保存。采用实时荧光定量PCR微卫星分析技术对10例正常脑组织进行染色体1p、19q和10q DNA拷贝数检测，1号染色体整条短臂的5个检测位点包括D1S450，D1S2783，D1S2737，D1S252，D1S453；10号染色体长臂检测位点是D10S1690和D10S555两个微卫星位点；19号染色体长臂检测位点是D19S900和D19S926两个微卫星位点。并根据量效关系曲线确定组织DNA模板浓度。 　　结果：根据实时荧光定量PCR原理，计算出了每一个检测位点正常DNA拷贝数参考值范围结论采用改良的QuMa技术，建立了1p、19q和10q LOH的检测方法。 　　第三部分目的：1p/19q杂合性缺失是少突胶质细胞肿瘤典型的分子遗传学特征，10q杂合性缺失是其进展期标志。本实验以实时荧光定量PCR微卫星分析(QuMA)技术为原理，检测脑胶质瘤1号染色体短臂(1p)、19号染色体长臂(19q)和10号染色体长臂(10q)杂合性缺失(LOH)情况。 　　材料与方法：选取2007年6月到2009年4月期间，首都医科大学附属天坛医院胶质瘤治疗中心手术切除的63例脑胶质瘤患者肿瘤组织标本，术后病理诊断均为脑胶质细胞瘤。男38例，女25例；年龄19-59岁，平均41.3岁，所有患者术前均未接受放疗或化疗。按2007年WHO中枢神经系统肿瘤分类标准确定病理类型和级别，少突胶质细胞瘤(WHOⅡ级)15例，间变型少突胶质细胞瘤(WHOⅢ级)9例，少突星形胶质细胞瘤(WHOⅡ级)14例，星形胶质细胞瘤(WHOⅡ级)11例，间变星形胶质细胞瘤(WHOⅢ级)6例，胶质母细胞瘤(WHOⅣ级)8例。 　　采用实时荧光定量PCR微卫星分析技术对63例少突胶质细胞肿瘤进行染色体1p、19q和10q LOH检测，并对少突胶质细胞肿瘤组和星形细胞类肿瘤组的染色体缺失情况进行统计学分析。 　　结果： 　　 (1)发生1p LOH的少突胶质细胞肿瘤有25例(65.7％)；星形细胞类肿瘤有4例(16％)；二者之间有显著性统计学意义。 　　 (2)发生19q LOH的少突胶质细胞肿瘤有26例(68.4％)，星形细胞类肿瘤有7例(28％)；二者之间有显著性统计学意义。 　　 (3)发生10q LOH的少突胶质细胞肿瘤有5例(15.1％)，星形细胞类肿瘤有9例(36％)；二者之间有统计学意义。 　　结论：以实时荧光定量PCR微卫星分析析技术，证实了1p LOH或1p和19q是少突胶质细胞肿瘤的典型分子遗传学特征，在星形细胞瘤和胶质母细

关键词：脑胶质瘤实时荧光定量杂合性缺失微卫星分析

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微卫星分析蜜蜂群体遗传结构的新研究策略

微卫星分析蜜蜂群体遗传结构的新研究策略

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全国生物遗传多样性高峰论坛

作者：曹联飞胡福良浙江农业科学院畜牧兽医研究所浙江大学动物科学学院

微卫星分析由于其众多优点,已经成为群体遗传结构、遗传多样性研究中常用的方法。微卫星分析在蜜蜂群体遗传结构研究中也得到了大量应用。本文介绍了一种基于工蜂父本雄蜂基因型的新的微卫星研究策略。新研究策略可以大大减少采

关键词：微卫星分析群体遗传结构研究策略

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微卫星分析蜜蜂群体遗传结构的新研究策略

微卫星分析蜜蜂群体遗传结构的新研究策略

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中国养蜂学会蜜蜂育种专业委员会、蜜源与蜜蜂授粉专业委员会2012年会议

微卫星分析由于其众多优点,已经成为群体遗传结构、遗传多样性研究中常用的方法.微卫星分析在蜜蜂群体遗传结构研究中也得到了大量应用.本文介绍了一种基于工蜂父本雄蜂基因型的新的微卫星研究策略.新研究策略可以大大减少采样的工作量... 详细信息

微卫星分析由于其众多优点,已经成为群体遗传结构、遗传多样性研究中常用的方法.微卫星分析在蜜蜂群体遗传结构研究中也得到了大量应用.本文介绍了一种基于工蜂父本雄蜂基因型的新的微卫星研究策略.新研究策略可以大大减少采样的工作量,尤其适合对采样难度较大的野生蜂种进行相关研究.

关键词：蜜蜂群体遗传结构微卫星分析

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