检索结果-内蒙古大学图书馆

作者：王世林中国农业科学院

学位级别：硕士

抽穗期由主效和微效数量性状座位（Quantitative trait locus,QTL）共同控制。主效QTL主要影响品种的地区和季节适应性;微效QTL在相同或相似生态区域内微调抽穗期,在充分利用自然资源或规避逆境胁迫中发挥关键作用。本研究应用衍生于珍... 详细信息

抽穗期由主效和微效数量性状座位（Quantitative trait locus,QTL）共同控制。主效QTL主要影响品种的地区和季节适应性;微效QTL在相同或相似生态区域内微调抽穗期,在充分利用自然资源或规避逆境胁迫中发挥关键作用。本研究应用衍生于珍汕97/密阳46的近等基因系（Near isogenic line,NIL）,分别分析了Hd17–RFT1区间及Hd1和Ghd7区间对抽穗期和产量性状的遗传作用,为主效变微效的遗传机制提供理论基础。同时,应用我国南方籼稻128份改良品种和92份地方品种,分析RFT1、Hd1和Ghd7在各生态类型中的等位变异及其与抽穗期和感光性的关系,为阐明我国南方水稻品种适应性的遗传机制提供基础。主要结果如下:***1对水稻抽穗期和产量性状的微效作用构建早熟型背景、在Hd17–RFT1区间分离的NIL-F2和NIL群体各1个,种植于杭州。结果显示,密阳46等位基因促进抽穗,加性效应为0.84天-1.21天,贡献率为10.46%-18.62%;同时,NIL的2年重复研究显示,该区间显著促进抽穗的同时,对产量性状仅呈现轻微负向作用。在仅Hd17分离的2个群体中,未检测到抽穗期的显著变异,表明Hd17–RFT1区间的效应并非来源于Hd17。综上说明,密阳46的RFT1可在较低产量代价下进一步缩短早稻的生育期。***1和Ghd7对水稻抽穗期和产量性状的微效作用构建1个密阳46功能型背景、仅在Hd1和Ghd7分离的NIL群体,种植于杭州和陵水两地。杭州试验中,Hd1在Ghd7呈无功能型和功能型时分别促进和延迟抽穗,说明Hd1的双重功能受Ghd7功能影响;Ghd7延迟抽穗的能力在Hd1呈功能型时比非功能型时强,说明功能型Hd1能够增强Ghd7的功能。杭州试验中,Hd1和Ghd7在对方为非功能型时,对抽穗期仅具微效作用,加性效应分别为2.20天和2.00天;陵水试验中,无论Hd1为功能型还是非功能型,Ghd7均呈微效,加性效应分别为2.20天和1.30天。对产量性状分析发现,Hd1和Ghd7的这一微效作用同样反映在产量性状中。3.我国南方水稻品种RFT1、Hd1和Ghd7基因型特点对220份籼稻材料分析显示,RFT1、Hd1和Ghd7的等位基因频率在不同生态型之间差异大。RFT1的两种等位基因在改良品种和地方品种中频率分布相似。对于Hd1和Ghd7,Hd1ghd7在改良品种中占比最高,在地方品种中仅出现4份材料中;Hd1Ghd7在改良品种和地方品种的晚稻中均是占比最高的基因型。说明双功能型主要分布于晚稻。在两地试验中,RFT1仅在陵水对抽穗期呈显著效应,但两类材料中效应方向相反;Hd1在两地均呈显著作用,其中,地方品种分别在陵水和杭州促进和延迟抽穗,而改良品种则在两地均促进抽穗;功能型Ghd7在两地均延迟抽穗,其中,在改良品种中作用强,在地方品种中作用弱。以上结果表明,Hd1和Ghd7在南方籼稻品种的区域和季节适应性中扮演重要角色。

关键词：水稻抽穗期感光性微效作用

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qGS5.1和qGS5.2对水稻粒重和粒形的遗传控制作用

qGS5.1和qGS5.2对水稻粒重和粒形的遗传控制作用

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作者：牛小军华中农业大学

学位级别：博士

水稻粒重和粒形均属于典型的数量性状,由少数主效QTL和大量微效QTL共同控制。先前的研究主要集中在效应较大的QTL上,而微效QTL在水稻重要农艺性状调控中亦扮演着重要角色。本研究应用籼稻组合特青/IRBB52衍生群体,开展微效粒重粒形QTL... 详细信息

水稻粒重和粒形均属于典型的数量性状,由少数主效QTL和大量微效QTL共同控制。先前的研究主要集中在效应较大的QTL上,而微效QTL在水稻重要农艺性状调控中亦扮演着重要角色。本研究应用籼稻组合特青/IRBB52衍生群体,开展微效粒重粒形QTL研究。首先,应用由1个含13个分离片段的高代F7单株自交构建的Ti52-2群体,对产量及其构成因子进行QTL定位;根据定位结果,确定第5染色体RM18927-RM274区间为进一步研究的对象。同时应用全基因组关联分析检测产量相关性状和抽穗期QTL,进而探究了微效QTL在自然群体中的作用。本研究主要结果如下:1.两年种植Ti52-2群体,进行单株穗数、每穗实粒数、千粒重和单株产量QTL分析,共定位到16个QTL,包括单株穗数1个,每穗实粒数5个,千粒重7个和单株产量3个。在这些QTL中,位于第5染色体RM18927–RM274区间的qTGW5效应最大、贡献率最高,且在两年试验中均检测到,选择进一步验证和分解。2.从Ti52-2群体筛选出1个杂合单株,自交构建F2:3群体,验证了qTGW5的作用。该QTL对千粒重的加性效应为0.26 g,解释33.6%的表型变异率,增效等位基因来自IRBB52,同时影响每穗实粒数,加性效应为4.3粒/穗,解释10.0%的表型变异率,增效等位基因来自特青。从该群体后代发展了2个仅在目标区间分离的NIL-F2群体,进一步验证qTGW5的作用。针对该区间发展了4套NIL群体,比较不同NIL群体的基因型及QTL定位结果,在目标区间分解出2个QTL。其中,qGS5.1界定在RM18865与Fi25273之间1896.4 kb的区域内,qGS5.2界定在Fi27293与Fi27682之间388.9 kb的区域内。2个QTL对粒重、粒形及粒数均具显著作用,且粒重与粒数的作用方向相反。3.针对qGS5.2,发展了7个杂合区间更小的NIL-F2群体,将其精细定位至68.8 kb的区间内,该区间包含6个注释基因,其中2个为编码已知功能结构域的基因,其余4个均编码表达蛋白。在2个编码已知功能结构域的基因中,LOC＿Os05g47840既在双亲间存在错义突变,又在两种NIL株系间呈表达上的差异;LOC＿Os05g47780在双亲间存在同义突变,在表达上差异不显著。4个编码表达蛋白的基因中,3个在双亲间存在核苷酸的差异,其中2个在两种NIL株系间存在表达差异。针对这些注释基因,构建了敲除载体和过表达载体并进行遗传转化,获得了转基因植株,为qGS5.2的图位克隆奠定了基础。4.于海南陵水和浙江杭州两地种植196份水稻品种资源,对产量相关性状进行全基因组关联分析,共检测到170个显著性关联位点。进而利用主效粒重粒形基因GS3和GW5的功能性标记分群,对水稻粒形性状进行全基因组关联分析,在GW5和gw5亚群体分别检测到qGS5.1和qGS5.2。通过生物信息学及候选基因单倍型分析发现,LOC＿Os05g41760可能是qGS5.1的候选基因。

关键词：水稻粒重粒形数量性状座位微效作用精细定位关联分析

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利用剩余杂合体衍生的近等基因系精细定位水稻粒长微效QTL qGL1.1

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中国水稻科学 2020年第2期34卷 125-134页

作者：李盼盼朱玉君郭梁庄杰云樊叶杨中国水稻研究所水稻生物学国家重点实验室/国家水稻改良中心杭州310006 袁隆平农业高科技股份有限公司长沙410001

【目的】本研究旨在对前期在水稻第1染色体长臂521.8 kb的区间内定位到的q TGW1.1b进行精细定位。【方法】从qTGW1.1和qTGW1.2所在区间分别呈杂合的2个BC2F9单株配组衍生的F4群体中,筛选到Wn28826-RM1231区间内杂合片段呈梯系排列的3个... 详细信息

【目的】本研究旨在对前期在水稻第1染色体长臂521.8 kb的区间内定位到的q TGW1.1b进行精细定位。【方法】从qTGW1.1和qTGW1.2所在区间分别呈杂合的2个BC2F9单株配组衍生的F4群体中,筛选到Wn28826-RM1231区间内杂合片段呈梯系排列的3个单株,构建了3套F5:6近等基因系。2017年种植于浙江杭州,考查千粒重、粒长和粒宽。利用SAS软件的GLM程序进行双因素方差分析,对qTGW1.1b的效应进行了验证。在此基础上,筛选出杂合片段更小且呈交迭排列的6个剩余杂合体,发展了6套F8:9近等基因系,2018年种植于海南陵水。对每套近等基因系中双亲基因型株系的表型差异进行双因素方差分析。【结果】qTGW1.1b在2个试验中对粒长和千粒重均呈极显著差异,效应方向一致且大小稳定。密阳46等位基因能分别增加粒长0.027 mm和提高千粒重0.17 g,贡献率分别达到27.12%和19.09%。【结论】鉴于qTGW1.1b在前后试验中对粒长影响最为显著,而对粒宽作用不显著,故将qTGW1.1b重新命名为qGL1.1。通过比较各套近等基因系的分离区间的基因组位置,最终将qGL1.1定位于Wn29077和Wn29154之间约76.8 kb的区间内。

关键词：水稻近等基因系微效作用粒长精细定位

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水稻成花素基因RFT1对抽穗期的促进作用

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中国稻米 2020年第3期26卷 18-22,27页

作者：王世林张振华朱玉君樊叶杨庄杰云中国水稻研究所/水稻生物学国家重点实验室/国家水稻改良中心杭州310006

进一步缩短早稻的生育期是我国南方双季稻区的重要育种目标之一。本研究以早籼稻珍汕97和中籼稻密阳46为亲本,构建了珍汕97早熟型遗传背景的近等基因系(NIL)和NIL-F2群体,分析成花素基因RFT1在早稻遗传背景和自然长日照种植条件下的遗... 详细信息

进一步缩短早稻的生育期是我国南方双季稻区的重要育种目标之一。本研究以早籼稻珍汕97和中籼稻密阳46为亲本,构建了珍汕97早熟型遗传背景的近等基因系(NIL)和NIL-F2群体,分析成花素基因RFT1在早稻遗传背景和自然长日照种植条件下的遗传作用。结果表明,与RFT1的珍汕97等位基因相比,密阳46等位基因能够显著促进抽穗,同时对产量性状呈轻微负向作用。在2个群体中,RFT1对抽穗期的加性效应为0.84~1.21 d,贡献率为10.46%~18.62%。在NIL群体2年重复试验中,每穗总粒数、每穗实粒数、千粒重和单株产量的加性效应分别为3.06粒和2.02粒、2.98粒和1.48粒、0.12 g和0.08 g、0.63 g和0.38 g,贡献率在0.99%~2.76%之间。这些结果显示,密阳46的RFT1等位基因能够在较低产量代价下缩短早稻的生育期,为晚稻提供更充裕的生长时间,进而提高双季稻的生产潜能。

关键词：水稻抽穗期成花素基因微效作用早熟多效性

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水稻第1染色体长臂上两个连锁粒形QTL的分解和精细定位

水稻第1染色体长臂上两个连锁粒形QTL的分解和精细定位

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作者：董青华中农业大学

学位级别：博士

粒重和粒形是水稻重要的产量和品质性状,二者密切相关,均属于典型的数量性状。长期以来,水稻粒重和粒形的数量性状座位（Quantitative trait locus,QTL）研究主要围绕主效QTL开展。近年来,越来越多的证据显示,微效QTL在水稻重要农艺性... 详细信息

粒重和粒形是水稻重要的产量和品质性状,二者密切相关,均属于典型的数量性状。长期以来,水稻粒重和粒形的数量性状座位（Quantitative trait locus,QTL）研究主要围绕主效QTL开展。近年来,越来越多的证据显示,微效QTL在水稻重要农艺性状调控中扮演着重要角色,但微效粒重/粒形QTL研究尚处于起步阶段,迄今未见克隆报道。实验室前期应用籼稻组合珍汕97///珍汕97//珍汕97/密阳46衍生的近等基因系（Near isogenic line,NIL）,将qTGW1.2c定位在第1染色体长臂上2.1 Mb区间内。本研究应用来源于同一个BC2F9单株的18个NIL-F2群体和15套NIL群体,对该区间进一步分析,在420 kb的区间内分解出2个控制粒重和粒形的QTL,进而开展了精细定位和候选基因分析。具体结果如下:1 2个水稻粒形QTL的分解首先,在qTGW1.2c前期定位区间内发展了7个新的多态性标记,重新分析其交换区域的基因型,将qTGW1.2c区间缩小到RM11800和RM11844之间1.1 Mb的区域内。针对更新后的定位区间,筛选出杂合区间分别为RM11807–RM11842和RM265–RM11842的2个BC2F10单株,自交获得2个BC2F11群体;从中筛选珍汕97纯合型和密阳46纯合型单株,自交发展成2套BC2F11:12 NIL群体。在这些群体中均检测到qTGW1.2c对粒重和粒形性状的显著作用,因此将该QTL界定在所用群体共有分离区间RM265-RM11842中。针对RM265-RM11842区间,发展了杂合区间呈梯系排列的4个BC2F13群体;从中筛选双亲纯合单株,自交发展了4套BC2F13:14 NIL群体。对各NIL-F2和NIL群体进行QTL检测,并比较不同群体的试验结果,在目标区间内分解出2个QTL。一个界定在Wn35183与RM11828之间132.4 kb的区域内,对粒长和粒宽作用相反,显著影响长宽比而不影响粒重;由于该QTL主要控制粒形（Grain shape）,定位区间的第1个分离标记RM265位于水稻第1染色体35.2 Mb处,因此我们将其命名为qGS1-35.2。另一个位于Wn35518与Wn35643之间125.5 kb的区域内,主要通过粒宽（Grain width）影响粒重,同理,将其命名为qGW1-35.5。2 qGW1-35.5的精细定位针对qGW1-35.5,发展了2个在定位区间呈杂合BC2F14群体,并筛选双亲纯合单株发展成2套BC2F14:15 NIL群体,进一步验证了qGW1-35.5的遗传作用。继续发展了2个杂合区间交叠排列并覆盖目标区间的BC2F15群体,并筛选纯合单株构建了2套BC2F15:165:16 NIL群体。应用这2个NIL-F2和2套NIL群体,将qGW1-35.5定位区间缩小至Wn35518-Wn35618。针对更新区间,自交发展3个杂合区间呈梯系排列的BC2F16群体。比较这3个群体的QTL分析结果,最终将qGW1-35.5界定在Wn35518和Wn35604之间86.3 kb的区域内。在qGW1-35.5分离的2套BC2F15:165:16 NIL中,密阳46等位基因分别增加粒宽0.008 mm和0.013 mm,提高粒重0.09 g和0.08 g。qGW1-35.5在增加粒宽的同时可显著提高粒重,为水稻高产育种提供了新的基因资源。3 qGS1-35.2的精细定位针对qGS1-35.2区间,发展了3个杂合区间呈梯系排列的BC2F14群体,从中筛选双亲纯合型单株,自交产生3套BC2F14:15 NIL群体。利用这些群体,将qGS1-35.2界定在Wn35183与Wn35263之间。针对更新区间,进一步发展了杂合区间交叠排列的2个BC2F15群体,利用其中双亲纯合型单株自交构建了2套BC2F15:16 NIL群体。比较这些群体的QTL检测结果,最终将qGS1-35.2界定在Wn35183-RM11824之间57.7 kb的区间内。在qGS1-35.2分离的BC2F15:165:16 NIL中,珍汕97等位基因可增加粒长0.030 mm,降低粒宽0.006 mm,从而使得长宽比增加0.015;结果还表明,该QTL对粒厚、粒重、单株穗数、每穗实粒数和单株产量均无显著影响。qGS1-35.2仅控制粒形而对其他产量性状无显著作用,可在不降低产量的情况下改变粒形以提高稻米外观品质。采用qGS1-35.2 NIL群体中2种纯合型株系进行电镜观察、细胞周期基因的表达水平检测和转录组分析。与密阳46型株系相比,珍汕97型株系的颖壳纵向细胞显著增多,细胞周期调控基因CYCB2.1的转录水平显著增高,而细胞周期抑制基因KRP4的表达显著降低。这些结果表明,qG

关键词：水稻粒形粒重数量性状座位微效作用紧密连锁

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水稻微效千粒重QTL qTGW1.2b的精细定位

水稻微效千粒重QTL qTGW1.2b的精细定位

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2017年中国作物学会学术年会

作者：王琳琳王文慧樊叶杨庄杰云中国水稻研究所国家水稻改良中心/水稻生物学国家重点实验室

【研究背景】千粒重作为稻谷产量的直接决定性因素之一,其高低与粒长和粒宽密切相关,而谷粒形状本身往往决定着稻米的外观品质及加工品质,分离鉴定控制水稻粒重和粒形的数量性状QTL,不单有助于我们深入了解水稻粒重和粒形的分子遗传机理... 详细信息

【研究背景】千粒重作为稻谷产量的直接决定性因素之一,其高低与粒长和粒宽密切相关,而谷粒形状本身往往决定着稻米的外观品质及加工品质,分离鉴定控制水稻粒重和粒形的数量性状QTL,不单有助于我们深入了解水稻粒重和粒形的分子遗传机理,更为水稻高产优质分子育种提供了有力的依据。经典数量遗传学认为,数量性状是由少数几个主效QTL和多个微效QTL共同控制,微效QTL对于数量性状的表型变异具有重要作用;然而目前已克隆的粒重QTL均为主效QTL,未见微效粒重QTL克隆的报导,因此,有必要对控制水稻粒重的微效QTL进行研究。【材料与方法】在前期研究中,我们应用籼稻组合珍汕97～3/密阳46衍生的高倍回交群体,在第1染色体长臂12 Mb的区域内检测到了3个千粒重QTL qTGW1.2a、qTGW1.2b和qTGW1.2c,其中,qTGW1.2b位于RM11781和Wn34526之间372 kb的区域内。本研究通过发展分离区间更小且相互交叠的近等基因系（NIL）,对千粒重QTL qTGW1.2b进行了精细定位和候选基因分析。【结果与分析】为了验证qTGW1.2b的效应,首先从珍汕97～3/密阳46的BCF群体中筛选出1个在水稻第1染色体长臂RM212-RM11787区间呈杂合的单株,应用分子标记检测其衍生的BCF群体,筛选出在RM11787和Wn33304-RM11787区间呈杂合的单株各1个,种植2个单株自交衍生的1个BCF和3个BCF群体,并在目标区间增加4个InDel标记,通过标记检测挑选其中的珍汕97纯合型和密阳46纯合型材料,自交收获种子,产生4套近等基因系。各套近等基因系表型变异的双因素方差分析结果表明,每套近等基因系均存在千粒重QTL的分离,加性效应为0.16～0.30g,增效等位基因均来自密阳46,同时对粒长具显著作用。经比较各套近等基因系的分离区间,可将qTGW1.2b的位置缩小至108 kb的区间内。其中1套近等基因系分别在浙江杭州和海南陵水两地种植,在两地均检测到了显著的QTL效应,加性效应分别为0.15 g和0.16 g,说明qTGW1.2b能在不同环境下稳定表现。为进一步对qTGW1.2b进行精细定位,从上述BCF群体中筛选出2个杂合单株,经过连续自交和标记检测,构建了3套BCF近等基因系。3套近等基因系表型变异的双因素方差分析结果表明,每套近等基因系均存在千粒重QTL的分离,加性效应为0.1.2～0.18g,增效等位基因均来自密阳46,同时对粒长具显著作用。经比较各套近等基因系的分离区间,最终将qTGW1.2b精细定位至44 kb的区间内。【结论】本研究通过7套近等基因系将qTGW1.2b精细定位至44 kb的区间内,该区间内包含6个候选基因,经双亲比较测序发现,ORF5的编码区存在1个SNP和1处3碱基的插入缺失,能够引起编码氨基酸的变化;此外,ORF5预测该基因能编码一种与胚乳生长和种子大小密切相关的蛋白,因此推断ORF5最有可能是qTGW1.2b。

关键词：水稻(Oryza sativa L.) 千粒重数量性状座位(QTL) 微效作用近等基因系

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水稻第1染色体qTGW1.2区域粒重组分性状QTL的剖析

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中国水稻科学 2015年第3期29卷 232-240页

作者：王琳琳陈玉宇郭梁张宏伟樊叶杨庄杰云中国水稻研究所国家水稻改良中心/水稻生物学国家重点实验室杭州310006

对水稻第1染色体长臂上控制粒重、粒长和粒宽的3个 QTLs 进行了剖析.从珍汕973/密阳46的 BC2 F8群体中筛选到1个在 RM212－RM265区间呈杂合的单株,应用 DNA 标记检测其衍生的 BC2 F9群体,筛选出在 RM212－RM11787和RM11787－RM265区间... 详细信息

对水稻第1染色体长臂上控制粒重、粒长和粒宽的3个 QTLs 进行了剖析.从珍汕973/密阳46的 BC2 F8群体中筛选到1个在 RM212－RM265区间呈杂合的单株,应用 DNA 标记检测其衍生的 BC2 F9群体,筛选出在 RM212－RM11787和RM11787－RM265区间呈杂合的单株各1个,其杂合区间分别覆盖前期定位的千粒重 QTL qTGW1．2a 和 qTGW1．2b .种植2个 BC2 F10群体,筛选出杂合区间相互交叠的单株各3个,自交后获得6个 BC2 F11群体,在 RM11781－RM11800区间检测到了1个控制粒长的 QTL,并将 qTGW1．2a 和 qTGW1．2b 分别缩小至580 kb 的 RM11730－ Wn33304和2．0 Mb 的RM11807－RM11885区间内.同时,筛选出5个杂合区间相互交叠的单株,衍生了5个 BC2 F12群体.QTL 分析结果表明,每个群体均检测到粒长 QTL,加性效应为0．03~0．06 mm,增效等位基因来自密阳46；经比较各个群体的分离区间,将控制粒长的 QTL qGL1．2界定在 RM11781和 Wn34526之间372 kb 的区间内；该 QTL 呈加性作用,可能同时控制粒重、粒长与粒宽.

关键词：水稻(Oryza sativa L.) 数量性状座位粒长千粒重微效作用

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水稻第1染色体qTGW1.2区域3个QTL的分解和验证

水稻第1染色体qTGW1.2区域3个QTL的分解和验证

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作者：王琳琳中国农业科学院

学位级别：硕士

千粒重是稻谷产量三要素之一,其高低主要由粒长和粒宽决定,而谷粒形状本身又是影响稻米外观品质和加工品质的重要因素之一。鉴定控制水稻粒重、粒长和粒宽的数量性状座位(QTL),可为阐明水稻粒重和粒形的遗传机理提供新的知识,并为水稻... 详细信息

千粒重是稻谷产量三要素之一,其高低主要由粒长和粒宽决定,而谷粒形状本身又是影响稻米外观品质和加工品质的重要因素之一。鉴定控制水稻粒重、粒长和粒宽的数量性状座位(QTL),可为阐明水稻粒重和粒形的遗传机理提供新的知识,并为水稻高产优质分子育种提供技术基础。在前期研究中,我们应用籼稻组合珍汕973/密阳46衍生的群体,在水稻第1染色体长臂上1个12.0 Mb的区间中分解出互斥连锁的2个千粒重QTL,分别称为q TGW1.1和q TGW1.2,进而又将q TGW1.2分解为互引连锁的2个QTL,其中,q TGW1.2a位于RM11730和RM11762之间934 kb的区域内,q TGW1.2b位于RM11800和RM11885之间2.1 Mb的区域内。本研究针对覆盖q TGW1.2a和q TGW1.2b、总物理距离为3.96 Mb的RM11730-RM11885区间,发展分离区间更小且相互交叠的近等基因系(NIL)和NIL-F2群体,提高了q TGW1.2a和q TGW1.2b的定位精度,并在这2个QTL之间检测到1个控制粒长的QTL q GL1.2。主要结果如下所述。从珍汕973/密阳46的BC2F8群体中筛选到1个在水稻第1染色体长臂上RM212-RM265区间呈杂合的单株,应用SSR标记检测其衍生的BC2F9群体,筛选出在RM212-RM11787和RM11787-RM265区间呈杂合的单株各1个,其杂合区间分别覆盖前期定位的千粒重QTL q TGW1.2a和q TGW1.2b。种植2个BC2F10群体,筛选出杂合区间相互交叠的单株各3个,自交后获得6个BC2F11群体。应用10个SSR和1个In Del标记检测这6个群体的基因型,在RM11781-RM11800区间检测到1个控制粒长的QTL,并将q TGW1.2a和q TGW1.2b的位置分别缩小至580 kb的RM11730-Wn33304和2.0 Mb的RM11807-RM11885区间内。同时,针对q GL1.2区间,增加了2个In Del标记,筛选出5个杂合区间相互交叠的单株,衍生了5个BC2F12群体,采用Windows QTL Cartographer 2.5对其进行QTL分析;结果表明,5个群体均检测到粒长QTL,加性效应为0.03～0.06 mm,增效等位基因均来自密阳46。经比较各个群体的分离区间,将控制粒长的QTL q GL1.2界定在RM11781和Wn34526之间372 kb的区间内;该QTL呈加性作用,可能同时控制粒重、粒长和粒宽。为进一步验证q TGW1.2a、q GL1.2和q TGW1.2b,从上述BC2F9群体中筛选出在RM212-RM265区间呈交叠排列的6个单株,自交后获得6个BC2F10群体,从这些群体中筛选出珍汕97纯合型、密阳46纯合型和杂合型材料,自交收获种子,产生6套BC2F10:11近等基因系。各套近等基因系表型变异的双因素方差分析结果表明,每套近等基因系均存在千粒重QTL的分离,加性效应为0.11～0.31 g,增效等位基因均来自密阳46;这些QTL同时对粒长和(或)粒宽具显著作用。经比较各套近等基因系的分离区间,分解出3个QTL,分别对应于q TGW1.2a、q GL1.2和q TGW1.2b,其中,q TGW1.2a和q TGW1.2b表现为加性作用,q GL1.2表现为正向完全显性。

关键词：水稻(Oryza sativa L.) 千粒重微效作用数量性状座位分解

来源：评论

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水稻第1染色体qTGW1.2区域3个QTL的分解和验证

水稻第1染色体qTGW1.2区域3个QTL的分解和验证

引用

中国作物学会2015年学术年会

作者：王琳琳郭梁张宏伟樊叶杨庄杰云中国水稻研究所国家水稻改良中心/水稻生物学国家重点实验室杭州310006

千粒重是稻谷产量三要素之一,其高低主要由粒长和粒宽决定,而谷粒形状本身又是影响稻米外观品质和加工品质的重要因素之一.鉴定控制水稻粒重、粒长和粒宽的数量性状座位(QTL),可为阐明水稻粒重和粒形的遗传机理提供新的知识,并为水稻高... 详细信息

千粒重是稻谷产量三要素之一,其高低主要由粒长和粒宽决定,而谷粒形状本身又是影响稻米外观品质和加工品质的重要因素之一.鉴定控制水稻粒重、粒长和粒宽的数量性状座位(QTL),可为阐明水稻粒重和粒形的遗传机理提供新的知识,并为水稻高产优质分子育种提供技术基础.在前期研究中,我们应用籼稻组合珍汕973/密阳46衍生的群体,在水稻第1染色体长臂上1个12.0 Mb的区间中分解出互斥连锁的2个千粒重QTL,分别称为qTG W1.1和qTGW1.2,进而又将qTGW1.2分解为互引连锁的2个QTL,其中,qTGW1.2a位于RM11730和RM11762之间934 kb的区域内,qTGW1.2b位于RM11800和RM11885之间2.1Mb的区域内.本研究针对覆盖qTGW1.2a和qTGW1.2b、总物理距离为3.96 Mb的RM 11730-RM11885区间,发展分离区间更小且相互交叠的近等基因系(NIL)和NIL-F2群体,提高了qTGW1.2和qTGW1.2b的定位精度,并在这2个QTL之间检测到1个控制粒长的QTL qGL1.2.主要结果如下所述.

关键词：水稻(Oryza sativaL.) 千粒重微效作用数量性状座位分解

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水稻第1染色体qTGW1.2区域3个QTL的分解和验证

水稻第1染色体qTGW1.2区域3个QTL的分解和验证

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中国作物学会——2015年学术年会

作者：王琳琳郭梁张宏伟樊叶杨庄杰云中国水稻研究所国家水稻改良中心/水稻生物学国家重点实验室

千粒重是稻谷产量三要素之一,其高低主要由粒长和粒宽决定,而谷粒形状本身又是影响稻米外观品质和加工品质的重要因素之一。鉴定控制水稻粒重、粒长和粒宽的数量性状座位(QTL),可为阐明水稻粒重和粒形的遗传机理提供新的知识,并为水稻高产优质分子育种提供技术基础。在前期研究中,我们应用籼稻组合珍汕973/密阳46衍生的群体,在水稻第1染色体长臂上1个12.0 Mb的区间中分解出互斥连锁的2个千粒重QTL,分别称为qTGW1.1和qTGW1.2,进而又将qTGW1.2分解为互引连锁的2个QTL,其中,qTGW1.2a位于RM11730和RM11762之间934 kb的区域内,qTGW1.2b位于RM11800和RM11885之间2.1 Mb的区域内。本研究针对覆盖qTGW1.2a和qTGW1.2b、总物理距离为3.96Mb的RM11730-RM11885区间,发展分离区间更小且相互交叠的近等基因系(NIL)和NIL-F2群体,提高了qTGW1.2a和qTGW1.2b的定位精度,并在这2个QTL之间检测到1个控制粒长的QTL qGL.1.2。主要结果如下所述。从珍汕973/密阳46的BC2F8群体中筛选到1个在水稻第1染色体长臂上RM212-RM265区间呈杂合的单株,应用SSR标记检测其衍生的BC2F9群体,筛选出在RM212-RM11787和RM11787-RM265区间呈杂合的单株各1个,其杂合区间分别覆盖前期定位的千粒重QTLqTGW1.2a和qTGW1.2b。种植2个BC2F10群体,筛选出杂合区间相互交叠的单株各3个,自交后获得6个BC2F11群体。应用10个SSR和1个InDe1标记检测这6个群体的基因型,在RM11781-RM11800区间检测到1个控制粒长的QTL,并将qTGW1.2a和qTGW1.2b的位置分别缩小至580 kb的RM1 1730-Wn33304和2.0 Mb的RM11807-RM11885区间内。同时,针对qGL1.2区间,增加了2个InDe1标记,筛选出5个杂合区间相互交叠的单株,衍生了5个BC2F12群体,采用Windows QTL Cartographer 2.5对其进行QTL分析;结果表明,5个群体均检测到粒长QTL,加性效应为0.03～0.06 mm,增效等位基因均来自密阳46。经比较各个群体的分离区间,将控制粒长的QTL qGL1.2界定在RM11781和Wn34526之间372 kb的区间内;该QTL呈加性作用,可能同时控制粒重、粒长和粒宽。为进一步验证qTGW1.2a、qGL1.2和qTGW1.2b,从上述BC2F9群体中筛选出在RM212-RM265区间呈交叠排列的6个单株,自交后获得6个BC2F10群体,从这些群体中筛选出珍汕97纯合型、密阳46纯合型和杂合型材料,自交收获种子,产生6套BC2F10:11近等基因系。各套近等基因系表型变异的双因素方差分析结果表明,每套近等基因系均存在千粒重QTL的分离,加性效应为0.11～0.31g,增效等位基因均来自密阳46;这些QTL同时对粒长和(或)粒宽具显著作用。经比较各套近等基因系的分离区间,分解出3个QTL,分别对应于qTGW1.2a、qGL1.2和qTGW1.2b,其中,qTGW1.2a和qTGW1.2b表现为加性作用,qGL1.2表现为正向完全显性。

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