检索结果-内蒙古大学图书馆

作者：王君文胡琪苏锦玲高飞 518000 广东省深圳市坪山区坑梓街道秀新社区聚龙山A路深城投创意工厂生命科学园厂房B3301

本发明涉及基因检测技术领域，尤其涉及一种多基因区域的DNA甲基化检测方法及其探针设计应用，该方法包括：对待检测的基因组DNA进行亚硫酸盐转换；针对不同目标检测基因设计引物并构建捕获探针；使用特定设计的探针对目标区域进行PCR... 详细信息

标准号: CN112779320B

本发明涉及基因检测技术领域，尤其涉及一种多基因区域的DNA甲基化检测方法及其探针设计应用，该方法包括：对待检测的基因组DNA进行亚硫酸盐转换；针对不同目标检测基因设计引物并构建捕获探针；使用特定设计的探针对目标区域进行PCR扩增；对扩增的目标区域的DNA建库并进行测序；对测序获得的原始数据进行分析，去除扩增重复，计算目标检测位点的甲基化水平。该检测方法可以实现多个基因在同一套模板下一次性全部扩增，大大降低了多基因甲基化检测的操作复杂程度和检测周期。

关键词：扩增检测目标区域多基因测序基因检测技术基因设计引物甲基化检测甲基化水平基因组DNA 捕获探针多个基因计算目标目标检测探针设计亚硫酸盐原始数据一次性构建建库位点去除转换重复应用分析

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海底沉积物温度探针研究与设计

海底沉积物温度探针研究与设计

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作者：刘庆鹏齐鲁工业大学

学位级别：硕士

随着全球经济发展加快,陆地上有限的矿产资源消耗日益增加,海底资源开发成为拓展资源空间的必经之路,使得海底沉积物温度探针技术受到越来越多的关注。同时海底温度探测技术也被广泛应用在地理调查中,海底的各种地理活动,如地壳运动、... 详细信息

随着全球经济发展加快,陆地上有限的矿产资源消耗日益增加,海底资源开发成为拓展资源空间的必经之路,使得海底沉积物温度探针技术受到越来越多的关注。同时海底温度探测技术也被广泛应用在地理调查中,海底的各种地理活动,如地壳运动、热泉喷涌、火山爆发等都会直接或间接产生吸热或放热活动,这些地理变化也直接影响着海底温度值的变化。上个世纪五十年代开始,国外温度探针技术出现,使得海底温度探测的精度和速度得到较大提升。但由于技术限制,以现在的视野来看,这些探针普遍存在测量速度慢,探针体积大,操作系统操作不便的缺点。研发新型温度探针探测设备,进行海底温度探针技术的研究具有十分重要的意义。本文主要开展了尾翼可调式温度探针系统的机械结构和控制系统的研究,实现了一种实用化的温度探针运动控制算法,并将其应用于研制的温度探针样机上。在机械设计方面主要对探针的机械外形和机械结构进行设计,重点设计了探针的舱体和尾翼,并对舱体的耐压强度和探针的流线型设计做仿真分析,提高了探针的稳定性。在硬件方面主要对舱体内的硬件进行设计,根据设计要求选用易操作、高性能的主控板和姿态控制模块,并研制了温度探针测温模块,提高了温度测量的精度和速度。在控制算法方面首先建立机体坐标系和惯性坐标系,分析探针的运动过程,定义探针尾翼标号和控制范围,最终基于PID控制方法实现了探针运动控制算法。同时研究温度数据处理算法,实现了温度测量和温度数据异常值的处理。在实现了硬件搭建和算法设计的基础上,对上位机软件需要实现的功能进行需求分析,根据软件动态过程,具体定义通信协议和设计人机交互界面。最后进行系统模拟实验说明设计的先进性。实验结果表明,本文研究的温度探针具有运动控制算法高效,探针控制性强,测温速度快、精度高,上位机软件操作方便的特点,具有实际的工程应用意义。

关键词：探针设计姿态控制温度测量

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一种高胆固醇血症致病基因筛查探针设计方法及其基因芯片

一种高胆固醇血症致病基因筛查探针设计方法及其基因芯片

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作者：王绿娅江龙张峰 100029 北京市朝阳区安贞路2号

本发明公开了一种高胆固醇血症致病基因筛查探针设计方法及其基因芯片，该方法分为3个步骤，分别是步骤1探针设计，步骤2捕获建库和测序以及步骤3生物信息分析，其中探针组的数量为7，其中探针组1为JL3_1、探针组2为JL_1、探针组3为JL4_... 详细信息

标准号: CN110592185A

本发明公开了一种高胆固醇血症致病基因筛查探针设计方法及其基因芯片，该方法分为3个步骤，分别是步骤1探针设计，步骤2捕获建库和测序以及步骤3生物信息分析，其中探针组的数量为7，其中探针组1为JL3_1、探针组2为JL_1、探针组3为JL4_1、探针组5为JL1_1、探针组6为JL2_1、探针组7为JL‑UTR_1，探针总数量为12944，探针包大小为1.012Mbp，每个样品的推荐最小排序为202.577Mbp。所述基因芯片包括固相载体和固定于所述固相载体上的探针。本发明对所有的致病基因和SNPs进行系统性归纳和汇总，最终绘制一幅完整的筛选目标区域，能够显著提高我国家族性高胆固醇血症患者的检出率。

关键词：探针组固相载体基因芯片探针设计致病基因探针家族性高胆固醇血症高胆固醇血症生物信息分析目标区域检出率探针包测序建库筛查捕获排序归纳绘制筛选

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多区域DNA甲基化检测探针设计及其检测方法

多区域DNA甲基化检测探针设计及其检测方法

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作者：王君文胡琪苏锦玲高飞 518000 广东省深圳市坪山区坑梓街道秀新社区聚龙山A路深城投创意工厂生命科学园厂房B3301

标准号: CN112779320A

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基于二代测序的捕获探针设计方法及应用

基于二代测序的捕获探针设计方法及应用

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作者：韩志军曹鑫恺周红霞秦放王杰 200120 上海市浦东新区康新公路3399弄25号楼8层

本发明提供了一种基于二代测序的捕获探针的设计方法及应用。为使得所有目标区域的捕获性能不受该区域的GC含量的影响，本发明在不同的GC含量区域采取了不同的探针设计方案，依据探针捕获效率与探针覆盖区域GC含量的关系动态调节不同区... 详细信息

标准号: CN111710362A

本发明提供了一种基于二代测序的捕获探针的设计方法及应用。为使得所有目标区域的捕获性能不受该区域的GC含量的影响，本发明在不同的GC含量区域采取了不同的探针设计方案，依据探针捕获效率与探针覆盖区域GC含量的关系动态调节不同区域的探针层数，在GC含量低的区域增加探针层数，和/或在GC含量高的区域减少探针层数；并可进一步的调节相邻探针之间的重叠部分长度，从而提高全部目标区域的探针捕获均一性。

关键词：探针层探针目标区域捕获捕获探针捕获性能覆盖区域关系动态区域减少区域增加探针设计相邻探针均一性测序应用

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应用于SNP分型的非竞争性探针设计方法、检测方法及应用

应用于SNP分型的非竞争性探针设计方法、检测方法及应用

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作者：朱海涛 310000 浙江省杭州市江干区水湘路341号(金骏大厦)1114室

本发明公开一种应用于SNP分型的非竞争性探针设计方法、检测方法及应用，所述非竞争性探针设计方法设计对应待测SNP位点的引物探针组合，其中一条探针对应检测含有靶点位点的基因片段，另一条探针检测不含有靶点位点的基因片段，通过两... 详细信息

标准号: CN109082460B

本发明公开一种应用于SNP分型的非竞争性探针设计方法、检测方法及应用，所述非竞争性探针设计方法设计对应待测SNP位点的引物探针组合，其中一条探针对应检测含有靶点位点的基因片段，另一条探针检测不含有靶点位点的基因片段，通过两条探针荧光的比例直接获取SNP基因型，把常规的竞争性的SNP检测转变为非竞争性的SNP检测，大大降低筛选的工作量。

关键词：非竞争性基因片段探针设计靶点位点探针检测探针荧光引物探针直接获取常规的检测探针工作量应用筛选

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基于二代测序的捕获探针设计方法及应用

基于二代测序的捕获探针设计方法及应用

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作者：韩志军曹鑫恺周红霞秦放王杰 200120 上海市浦东新区康新公路3399弄25号楼8层

标准号: CN111710362B

关键词：探针层探针目标区域捕获捕获探针捕获性能覆盖区域关系动态区域减少区域增加探针设计相邻探针均一性测序应用

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用于小麦外显子测序基因定位的探针设计方法及定位方法

用于小麦外显子测序基因定位的探针设计方法及定位方法

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作者：陈中旭 610000 四川省成都市中国(四川)自由贸易试验区成都高新区天府大道北段1480号1栋A座5层31号

本发明涉及小麦功能基因定位技术领域，特别是涉及用于小麦外显子测序基因定位的探针设计方法，通过高通量测序平台进行测序获得转录组数据后与比对参考基因组进行比对分析，再进行转录本拼接、合并，再进行ORF预测，去掉重复区域的序... 详细信息

标准号: CN112837746A

本发明涉及小麦功能基因定位技术领域，特别是涉及用于小麦外显子测序基因定位的探针设计方法，通过高通量测序平台进行测序获得转录组数据后与比对参考基因组进行比对分析，再进行转录本拼接、合并，再进行ORF预测，去掉重复区域的序列，将筛选的序列进行高密度探针合成，即得。基因定位方法包括：将小麦DNA打断成片段，再将打断后的小麦DNA与上述高密度探针进行杂交，磁珠富集后洗脱，再进行高通量测序、变异检测、统计定位即可。本发明解决现有技术中因小麦基因组庞大导致基因定位成本高昂的问题，通过设计超高密度多重引物探针，只针对于基因外显子序列进行测序，在同样的基因测序深度情况下，减少了80％的测序成本。

关键词：基因定位测序高密度探针高通量测序小麦DNA 打断定位技术领域基因外显子外显子测序小麦基因组小麦比对分析变异检测磁珠富集多重引物功能基因基因测序探针设计重复区域基因组转录本转录组比对探针洗脱拼接合成杂交筛选参考合并预测统计

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一种miRNA检测的引物探针设计方法、检测组合物及试剂盒

一种miRNA检测的引物探针设计方法、检测组合物及试剂盒

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作者：王频艺丁平慧纪博知郭俊周榕刘佳戴立忠 410205 湖南省长沙市高新技术产业开发区麓松路680路

本发明属于分子生物学检测领域，具体地，属于miRNA检测领域，更具体地，涉及miRNA的一步法检测。本发明提供了一种miRNA检测的引物和探针设计方法，包括该引物和探针设计方法设计的引物和探针的检测组合物，包括该检测组合物的检测试... 详细信息

标准号: CN114085893A

本发明属于分子生物学检测领域，具体地，属于miRNA检测领域，更具体地，涉及miRNA的一步法检测。本发明提供了一种miRNA检测的引物和探针设计方法，包括该引物和探针设计方法设计的引物和探针的检测组合物，包括该检测组合物的检测试剂盒。使用本发明方法设计的引物和探针，能够使得miRNA的检测可以采用一步法进行，不会出现非特异性扩增，并且其灵敏度高，达到1000拷贝/mL，特异性好。操作更加简单、安全，结果更为可信。

关键词：引物探针设计探针检测分子生物学检测一步法检测非特异性检测试剂灵敏度一步法拷贝扩增可信安全

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一种用于芯片质控的通用序列标签寡核苷酸探针的设计(英文)

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中国热带医学 2011年第1期11卷 39-42页

作者：杨琼沈年汉蔡翠霞周珏宇李凌郑文岭南方医科大学基因工程研究所广东广州510515

目的设计一种带有通用序列标签的寡核苷酸探针以应用于寡核苷酸芯片点样的质量控制。方法以HIV寡核苷酸探针作为核心序列,在其一端或两端连接上多种通用序列标签(UST)构建新型探针。然后打印芯片,以Cy5标记的通用引物(Cy5-UP,与UST互补... 详细信息

目的设计一种带有通用序列标签的寡核苷酸探针以应用于寡核苷酸芯片点样的质量控制。方法以HIV寡核苷酸探针作为核心序列,在其一端或两端连接上多种通用序列标签(UST)构建新型探针。然后打印芯片,以Cy5标记的通用引物(Cy5-UP,与UST互补)进行杂交,筛选出5条荧光信号强的探针,重新打印芯片。再分别以不同浓度梯度的、Cy5标记的通用引物(Cy5-UP)和随机引物(Cy5-RP)与芯片杂交,比较两者杂交效率。结果 Cy5-UP的杂交结果显著优于Cy5-RP的杂交结果,特别是在较低浓度时。结论利用Cy5标记的通用引物检测探针上的通用序列标签,可以为芯片点样的质量控制提供一种更有效的方法。

关键词：寡核苷酸芯片质量控制探针设计

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