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文字说明：

T=题名（书名、题名），A=作者（责任者），K=主题词，P=出版物名称，PU=出版社名称，O=机构（作者单位、学位授予单位、专利申请人），L=中图分类号，C=学科分类号，U=全部字段，Y=年（出版发行年、学位年度、标准发布年）

检索规则说明：

AND代表“并且”；OR代表“或者”；NOT代表“不包含”；(注意必须大写,运算符两边需空一格)

检索范例：

范例一：(K=图书馆学 OR K=情报学) AND A=范并思 AND Y=1982-2016
范例二：P=计算机应用与软件 AND (U=C++ OR U=Basic) NOT K=Visual AND Y=2011-2016

分类表

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文献类型

81 篇 专利
4 篇 学位论文
1 篇 期刊文献

馆藏范围

86 篇 电子文献
0 种 纸本馆藏

日期分布

学科分类号

5 篇 医学
- 4 篇 药学(可授医学、理...
- 2 篇 基础医学(可授医学...
- 1 篇 临床医学
3 篇 管理学
- 3 篇 管理科学与工程(可...
2 篇 理学
- 2 篇 生物学

主题

5 篇 数据分析流程
1 篇 检测报告系统
1 篇 宏基因组学
1 篇 多组学数据
1 篇 pcr靶向测序
1 篇 体突变
1 篇 可视化
1 篇 宏基因组测序
1 篇 微生物群落
1 篇 胚系突变
1 篇 太湖
1 篇 肠道微生物
1 篇 数据库
1 篇 单细胞转录组
1 篇 运动发酵单胞菌
1 篇 严重急性呼吸综合...
1 篇 无监督聚类
1 篇 vue.js
1 篇 人体舌苔
1 篇 细胞类型注释

机构

4 篇 东南大学
3 篇 北京航天长峰科技...
2 篇 自然资源部四川基...
2 篇 南京农业大学
2 篇 联想有限公司
2 篇 北京迈高材云科技...
2 篇 中盈优创资讯科技...
2 篇 成都优易数据有限...
2 篇 复旦大学
2 篇 浙江博真生物科技...
2 篇 北京国网电力技术...
2 篇 广州基迪奥生物科...
2 篇 成都视海芯图微电...
2 篇 西南交通大学
2 篇 为朔医学数据科技...
2 篇 广州健新科技有限...
2 篇 中国电子科技集团...
2 篇 武汉大学
2 篇 湖南海智机器人技...
2 篇 康美华大基因技术...

作者

6 篇 陈瑞
3 篇 袁芳
3 篇 孟庆涛
3 篇 吴申申
3 篇 张艳
3 篇 游佳
3 篇 高娜
3 篇 左浩雷
3 篇 李晓波
2 篇 刘守阳
2 篇 刘勇坚
2 篇 倪万茂
2 篇 张春华
2 篇 朱齐华
2 篇 张云飞
2 篇 朱亚萍
2 篇 张成松
2 篇 许达文
2 篇 袁云静
2 篇 郜洪礼

语言

86 篇 中文

检索条件"主题词=数据分析流程"

共 86 条记录，以下是1-10 订阅

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详细简洁

排序：

肿瘤基因的PCR靶向测序数据分析流程的建立

肿瘤基因的PCR靶向测序数据分析流程的建立

引用

作者：徐园东华大学

学位级别：硕士

随着高通量测序技术成本持续下降与应用拓展，生物学家愈加倾向使用高通量测序作为解决生物学问题的首选项。高通量测序包括全基因组测序、转录组测序与靶向测序等。靶向测序专门锚定捕获基因组特定区域DNA并进而构建文库与与高深度测... 详细信息

随着高通量测序技术成本持续下降与应用拓展，生物学家愈加倾向使用高通量测序作为解决生物学问题的首选项。高通量测序包括全基因组测序、转录组测序与靶向测序等。靶向测序专门锚定捕获基因组特定区域DNA并进而构建文库与与高深度测序，适用于物种的胚系突变（如遗传疾病）和肿瘤的体突变。靶向测序锚定捕获又分为杂交捕获与PCR捕获两种方法，PCR捕获以通量高、速度快、成本低与生信计算量小备受青睐。前期，本实验室开发了PCR靶向建库方案、测序与数据分析流程，针对肿瘤靶向测序的特殊性，本研究以BRCA与POLE基因为例，揭示肿瘤基因特定分析流程专门化的必要性与重要性。　　目的：本文使用多重PCR靶向测序方法，分别捕获若干家族性乳腺癌患者的BRCA1/2基因（胚系突变）和结肠癌患者的POLE基因（体突变）序列。针对测序数据，构建一个既适用于胚系突变，又可用于体突变的肿瘤基因分析流程，并评估该流程的敏感性和准确性。　　方法：第一，使用ART软件与python脚本，构造人工模拟突变（SNV与indel）测序数据与混合模拟测序数据，分别评估胚系突变与肿瘤体突变基础分析流程的合理性;第二，对遗传性BRCA1/2进行数据分析，综合采用FASTX-toolkit、Cutadpt、BWA与GATK等主流应用软件、使用python与linux构建从接头去除、比对、变异识别的的流程。并对测得6批次BRCAI/2外显子数据变异注释分析;第三，先采用上述流程分析结肠癌患者POLE基因数据、比较胚系与体突变等位基因频率的差异、比较测序深度对肿瘤变异检出的影响并对POLE基因总体突变负荷进行分析。　　结果：(1)模拟结果发现，我们的通用流程对于SNP和INDEL的识别非常灵敏，基本达到100%的正确性;对于低频率突变，在5OX深度下，对10%变异频率的位点，其识别率为60.14%，但是当深度增加到200X的时候，其识别率达到了98.60%，表明增加测序深度有助于对低频率突变位点的识别。(2)对于BRCAI/2基因的分析结果，6批次样本的平均测序深度达到600X以上，数据比对率达到gg.g%以上。在六批次样本中一共calling出64个突变位点（包含重复的），其中4个位点在Clinvar数据库中显示是致病的突变，同时通过多个蛋白质打分软件预测出32363528位置的T＞A的突变很有可能是致病位点，而它在Clinvar数据库中被标记为VUS(Variant Uncertain Significace，意义未明突变)。表明该流程适用于胚系突变检测。(3)对于POLE基因的分析结果，深度显著影响变异的检出率，扩增子的平均测序深度达到50000X，可以灵敏识别出5%变异频率的突变位点。106个样本一共检测出10926个SNV的变异，1085个插入变异和1366个缺失变异，SNV突变中共有4421个同义突变，5324个非同义突变。并计算106个样本POLE的突变负荷，其中位数在0.15405。　　结论：本研究构建了一个多重PCR靶向测序测序的pipeline，并使用模拟生成的二代测序数据评估该流程的准确性和敏感性。发现在测序深度足够的情况下（大于200X），该流程对突变的识别率达到90%以上。该分析流程分析速度快，中间操作简单，而且广泛适用于多种不同癌症不同基因的大规模样本研究。同时使用该流程分析了家族性乳腺癌患者的BRCA1/2基因和结肠癌患者的POLE基因。对于胚系突变类似于家族性乳腺癌患者的BRCAl/2突变，研究突变致病性的影响，寻找导致突变的位点，并且比对数据库发现了4个突变会导致乳腺癌的发生，并且使用蛋白质预测软件发现了1个未在数据库中显示的有害突变。而对于体突变导致的肿瘤，寻找一个指标类似于突变负荷来预测癌症免疫治疗的疗效，这有利于精准医学的发展。该流程的开发和优化能够极大推动使用靶向测序数据研究多种不同肿瘤的应用。

关键词：肿瘤基因 PCR靶向测序数据分析流程胚系突变体突变

来源：评论

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肠道微生物宏基因组数据分析流程及报告系统的设计与实现

肠道微生物宏基因组数据分析流程及报告系统的设计与实现

引用

作者：谌献辉东南大学

学位级别：硕士

肠道微生物和人体健康息息相关,研究表明,肠道菌群通过多种方式直接或者间接地参与人体的多项代谢活动并且与多种疾病之间存在显著的关系,了解自身肠道微生物情况有助于个体的健康发展。宏基因组测序(Metagenomics sequencing,m NGS)是... 详细信息

肠道微生物和人体健康息息相关,研究表明,肠道菌群通过多种方式直接或者间接地参与人体的多项代谢活动并且与多种疾病之间存在显著的关系,了解自身肠道微生物情况有助于个体的健康发展。宏基因组测序(Metagenomics sequencing,m NGS)是不依赖于传统的微生物培养,直接对临床样本中的核酸进行高通量测序,从而综合分析出样本中的各类微生物的组成及功能,并应用于人体的健康管理和疾病诊断的一种新型技术手段。随着m NGS在临床应用上的不断深入,测序数据的标准化分析流程及报告系统的临床实用性显得越来越重要。本课题通过对m NGS测序数据分析相关工具进行综合评估和筛选,开发一套兼具肠道微生物测序数据分析标准化流程和个体化健康评估报告为一体的数据分析系统,以期望用于基于肠道微生物测序的个体化健康管理及临床诊断中。本课题主要分为两个部分: 1.构建了一个针对于人类肠道微生物组测序数据的分析流程。首先,对m NGS测序数据的菌种分类器进行了相应的评估,评估的工具有Kraken2、Meta Phl An4、Kaiju,三种工具分别代表不同类型的分类器。根据评估结果选用Kraken2和Bracken构建了针对于人类肠道微生物组测序数据的分析流程,并通过搜集公共数据库上的人类肠道常见菌种基因组,搭建了一个适用于人类肠道菌群检测的参考数据库。该分析流程能够对肠型、益生菌、中性菌、有害菌、微生物多样性、耐药风险等进行评估。相较于现有的m NGS分析方法,此流程对人体中一些低丰度以及人体常见菌种有较好的敏感性,该流程可为个体健康评估或临床研究提供参考。 2.在分析流程基础上开发了一个基于m NGS分析结果的肠道菌群检测报告系统。本课题通过文献查询和收集GMrepo数据库中肠道菌群数据构建了一个人类核心肠道微生物菌种知识库,该知识库包含核心菌种相对丰度基线参考值及菌种潜在功能特性信息。结合菌种知识库,开发了基于m NGS分析结果的肠道菌群检测报告系统,可提供完善的信息化服务,如样本管理,菌种知识库管理以及报告管理等功能。该系统可对分析流程生成的结果文件进行导入和分析,结合知识库模型,最终生成针对于个体健康评估的个性化报告,该报告检测菌种全面、参数设置合理、格式用户友好,具有一定的健康咨询或临床适用潜力,为后续的肠道微生物临床应用奠定了基础。

关键词：肠道微生物宏基因组测序数据分析流程检测报告系统

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一种用于构建数据分析流程的数据分析服务推荐方法及系统

一种用于构建数据分析流程的数据分析服务推荐方法及系统

引用

作者：王菁赵汝涛陈高建栗倩文袁云静 100041 北京市石景山区晋元庄路5号

本发明提供一种用于构建数据分析流程的数据分析服务推荐方法，包括：S1、获取待分析数据集以及待分析数据集对应的数据分析任务描述信息；S2、响应于数据分析服务的首次推荐需求，根据待分析数据集对应的数据分析任务描述信息、待分析... 详细信息

标准号: CN112417304B

本发明提供一种用于构建数据分析流程的数据分析服务推荐方法，包括：S1、获取待分析数据集以及待分析数据集对应的数据分析任务描述信息；S2、响应于数据分析服务的首次推荐需求，根据待分析数据集对应的数据分析任务描述信息、待分析数据集的特征，从数据分析服务集合中为待分析数据集进行第一步单步服务推荐，获得第一步单步服务推荐集合。本发明通过在数据分析流程构建过程中为用户提供即时服务推荐，指导用户进行决策分析，可以支持没有数据分析专业知识的普通业务用户也能方便地使用数据分析服务来完成业务需求，大大降低数据分析的难度，有效节约人力成本，提高数据分析的质量和效率。

关键词：分析数据数据分析数据分析服务数据分析流程任务描述单步构建集合分析服务决策分析人力成本使用数据业务需求业务用户用户提供专业知识服务节约响应

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一种面向天线测试的数据分析流程建模的系统及方法

一种面向天线测试的数据分析流程建模的系统及方法

引用

作者：王兆业王亚海刘毅陈鹏飞邹德军张明柱常庆功周杨 266555 山东省青岛市黄岛区香江路98号

本发明公开了一种面向天线测试的数据分析流程建模的系统及方法，属于测试技术领域，本发明的提出了构建决策树回归的数学模型，输入天线测试数据和测试数据分析流程，训练模型，实现智能化决策、生成数据分析流程，极大的降低了天线测... 详细信息

标准号: CN118171556A

本发明公开了一种面向天线测试的数据分析流程建模的系统及方法，属于测试技术领域，本发明的提出了构建决策树回归的数学模型，输入天线测试数据和测试数据分析流程，训练模型，实现智能化决策、生成数据分析流程，极大的降低了天线测试数据分析软件开发工作量和开发难度；通过数据采集功能模块获取网络端数据，为决策树模型增量学习提供大量训练集数据，提高分析流程生成的准确度；将算法仓库封装成微服务部署到云端，提高算法的可重用性，解决分析资源浪费的问题；分析流程判定模型解决用户自定义流程可行性判断的需求，方便用户及时修改流程缺陷，提高天线测试数据分析效率。

关键词：分析流程天线测试算法测试技术领域测试数据分析数据采集功能数据分析流程数据分析软件决策树模型可行性判断训练集数据准确度测试数据服务部署可重用性流程缺陷模块获取生成数据输入天线数据分析数学模型训练模型增量学习决策树网络端智能化自定义云端构建建模封装工作量判定仓库开发回归决策分析

来源：评论

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一种用于构建数据分析流程的数据分析服务推荐方法及系统

一种用于构建数据分析流程的数据分析服务推荐方法及系统

引用

作者：王菁赵汝涛陈高建栗倩文袁云静 100041 北京市石景山区晋元庄路5号

标准号: CN112417304A

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一种生物信息数据分析流程管控方法及装置

一种生物信息数据分析流程管控方法及装置

引用

作者：李晨 430000 湖北省武汉市东湖新技术开发区高新大道666号武汉国家生物产业基地B、C、D区研发楼C1栋B213号

本发明公开一种生物信息数据分析流程管控方法及装置，所述方法包括：根据不同分析需求分别建立满足不同要求的生物信息分析流程配置模板；为不同的分析流程配置模板设置对应的功能配置文件，形成基本流程库；通过设置需求配置模板来获... 详细信息

标准号: CN112597751A

本发明公开一种生物信息数据分析流程管控方法及装置，所述方法包括：根据不同分析需求分别建立满足不同要求的生物信息分析流程配置模板；为不同的分析流程配置模板设置对应的功能配置文件，形成基本流程库；通过设置需求配置模板来获取用户的分析需求，生成样本配置文件和需求配置文件；基于样本配置文件和需求配置文件从基本流程库中匹配最佳的分析流程配置模板推荐给用户；基于最佳的分析流程配置模板、对应的功能配置文件、样本配置文件生成分析流程文件，实现数据分析流程运作。本发明可实现生物信息数据分析流程自主生成，简化数据分析操作流程，实现数据分析流程全生命周期的可控。

关键词：配置文件分析流程配置模板样本生物信息数据数据分析流程基本流程生物信息分析全生命周期操作流程流程配置数据分析需求配置管控可控匹配分析运作

来源：评论

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用于数据分析流程调度的方法、装置和服务器集群

用于数据分析流程调度的方法、装置和服务器集群

引用

作者：余健伟张成松杨帆胡成伟 100085 北京市海淀区上地信息产业基地创业路6号

本公开提供了一种用于数据分析流程调度的方法，包括：根据单个业务数据分析流程之间的依赖关系，获取多业务的分析有向流程；根据预设的调度规则，或者预设的调度规则和预设的依赖规则对所述分析有向流程进行调度。本公开还提供了一种... 详细信息

标准号: CN108763482A

本公开提供了一种用于数据分析流程调度的方法，包括：根据单个业务数据分析流程之间的依赖关系，获取多业务的分析有向流程；根据预设的调度规则，或者预设的调度规则和预设的依赖规则对所述分析有向流程进行调度。本公开还提供了一种用于数据分析流程调度的装置以及一种服务器集群。

关键词：数据分析流程预设调度规则调度有向服务器集群单个业务依赖关系多业务分析

来源：评论

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一种多时间序列肠道菌群数据分析流程控制方法

一种多时间序列肠道菌群数据分析流程控制方法

引用

作者：邓煜盛韩丽娟周勇 518000 广东省深圳市宝安区西乡街道桃源社区航城工业区新安实业公司B3栋4层

本发明公开了一种多时间序列肠道菌群数据分析流程控制方法，该分析流程主要包括以下阶段：样本获取、肠道菌群数据预处理、多样性分析、(时序序列)聚类分析，关联分析、菌落互作网络构建、单一菌种变化趋势(序列)预测。用户根据流程文... 详细信息

标准号: CN112151118B

本发明公开了一种多时间序列肠道菌群数据分析流程控制方法，该分析流程主要包括以下阶段：样本获取、肠道菌群数据预处理、多样性分析、(时序序列)聚类分析，关联分析、菌落互作网络构建、单一菌种变化趋势(序列)预测。用户根据流程文件要求输入文件及相应的参数，系统将自动化分析数据，输出相应的文件及可视化结果。让科研人员，包括不懂数据分析的科研人员能高效地完成一套标准化的基于时间序列肠道菌群数据分析流程，获得最终结果。从而达到提高科研工作效率，降低科研成本的目的。