检索结果-内蒙古大学图书馆

安徽师范大学学报（自然科学版） 2006年第6期29卷 582-585页

作者：李红安庆市卫生学校安徽安庆246011

末端限制性酶切片段长度多态性分析(Terminal Restriction Fragment LengthPolymorphism,T-RFLP)是近年来发展起来的、不依赖于培养的微生物群落分析方法之一.由于其在微生物群落结构分析方面的特点,包括分辨率高、易于实现自动化及互... 详细信息

末端限制性酶切片段长度多态性分析(Terminal Restriction Fragment LengthPolymorphism,T-RFLP)是近年来发展起来的、不依赖于培养的微生物群落分析方法之一.由于其在微生物群落结构分析方面的特点,包括分辨率高、易于实现自动化及互联网海量数据共享等优势,自1997年最先被报道以来得到了广泛的应用,成为环境微生物群落分析的最强有力的工具之一.类似于其他的分子微生物生态学技术,T-RFLP也有自身的缺陷,本文详细介绍了T-RFLP技术的原理及其解析环境微生物群落的基本流程,简述了近年来T-RFLP技术在群落分析中的研究进展,重点讨论了该技术的局限性及相应的解决办法.

关键词：微生物群落末端限制性片段长度多态性分析分子微生物生态学生物多样性

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再生水补水对河道底泥细菌群落结构的影响

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生态学报 2015年第20期35卷 6742-6749页

作者：马栋山郭羿宏张琼琼郭逍宇首都师范大学资源环境与旅游学院北京100048 北京市城市环境过程与数字模拟重点实验室-省部共建国家重点实验室培育基地北京100048

以北京市永定河麻峪湿地再生水补水口附近河道底泥为研究对象,应用末端限制性片段长度多态性(Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism,T-RFLP)技术探究再生水补水口附近底泥细菌群落结构的空间差异特征以及环境因子所产生... 详细信息

以北京市永定河麻峪湿地再生水补水口附近河道底泥为研究对象,应用末端限制性片段长度多态性(Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism,T-RFLP)技术探究再生水补水口附近底泥细菌群落结构的空间差异特征以及环境因子所产生的影响,并借助典范对应分析(Canonical Correspondence Analysis,CCA)方法分析麻峪湿地底泥细菌群落结构空间差异特征的形成原因。分析结果表明:河道底泥微生物群落对再生水的净化主要发生在距补水口1200m的范围内,随着再生水与上游来水径向混合净化渐变过程,在补水口2000m处河道底泥微生物群落结构与河道再生水补水口上游趋于相似。基于样点聚类结果的群落结构多样性分析表明随着再生水净化过程的实现微生物综合多样性指数呈现下降的趋势,从均匀度指数的变化趋势看,再生水补水口具有最高均匀度指数,补水口下游1200米处由于非优势菌群所占相对丰度最低以及偶见菌群缺失,导致群落结构比较单一、群落多样性和均匀度指数都最低。CCA方面分析结果表明再生水补水口上游细菌群落与因累积效应形成的重金属有密切关系,补水口出口底泥细菌群落则主要受到总磷和总有机碳的影响较大,而再生水补水与上游来水汇水径向渐变过程可能与氨氮净化具密切关系。研究区的主要优势菌种为假单胞菌属、贪食菌属和芽孢杆菌属,是与再生水中有机碳、氮降解具有密切关系的菌属。

关键词：再生水细菌群落多样性末端限制性片段长度多态性分析典范对应分析!

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黄河三角洲湿地土壤微生物群落结构分析

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应用与环境生物学报 2007年第5期13卷 691-696页

作者：刘芳叶思源汤岳琴滝川清木田建次吴晓磊清华大学环境科学与工程系北京100084 青岛海洋地质研究所山东青岛266071 熊本大学工学院

采用末端限制性片段长度多态性分析(T-RFLP)技术和16S rDNA克隆文库的方法,分析了黄河三角洲滨海湿地土壤不同深度细菌和古菌的群落结构.研究表明,随着深度的增加,细菌群落的多样性下降,而古菌群落多样性则有上升的趋势,且土壤的细菌和... 详细信息

采用末端限制性片段长度多态性分析(T-RFLP)技术和16S rDNA克隆文库的方法,分析了黄河三角洲滨海湿地土壤不同深度细菌和古菌的群落结构.研究表明,随着深度的增加,细菌群落的多样性下降,而古菌群落多样性则有上升的趋势,且土壤的细菌和古菌群落结构都呈现出规律的层状分布.该土壤包括各种硫酸盐还原菌、产甲烷古菌、光合细菌等丰富的细菌和古菌资源.

关键词：滨海湿地微生物群落结构末端限制性片段长度多态性分析 16S rDNA克隆文库种群多样性

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石油污染生物修复研究进展

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生态环境学报 2009年第1期18卷 361-367页

作者：黄艺礼晓蔡佳亮北京大学环境科学与工程学院北京100871

石油污染多见于油田附近的土壤污染和海上油轮泄漏造成的海域污染,自1970s便出现了利用微生物降解石油污染物的生物修复研究,总结了1970s至今的相关文献发现石油污染生物修复技术受到越来越多的关注,其目前的主要研究方向包括:添加辅助... 详细信息

石油污染多见于油田附近的土壤污染和海上油轮泄漏造成的海域污染,自1970s便出现了利用微生物降解石油污染物的生物修复研究,总结了1970s至今的相关文献发现石油污染生物修复技术受到越来越多的关注,其目前的主要研究方向包括:添加辅助营养物质或辅助乳化剂、石油污染降解过程的生物标记研究、菌株具体降解途径、工程示范研究。而由于石油污染成分复杂,不同微生物可利用的石油底物不同,降解途径也不同,因此传统的石油污染生物修复研究存在效率不高、难以维持等问题,而随着1990s以来分子生物学技术的迅速发展,其在石油污染生物修复中得到越来越多的应用,并有效地提高了修复效率。其应用主要包括以下两方面:(1)在掌握已有石油污染物生物降解途径和降解基因的基础上,研究针对石油污染不同底物的高效降解菌株,构建高效基因工程菌或功能互补的混合菌剂。譬如石油污染物的生物降解过程中,一系列的加氧酶/羟化酶起着最重要的作用,其中包括了单加氧酶和双加氧酶等。它们一般作用于降解的加羟基或后续的开环过程。而不同的脱氢酶、脱羧基酶、辅酶A连接酶等,则对底物加氧后的降解起着重要作用。因此本文重点分析整理了一系列典型石油污染物降解途径中的加氧酶及其参考菌株。(2)由于下游多态性分析方法的进步,越来越多的研究利用PCR对修复过程中群落的重要降解基因进行扩增,譬如对芳烃开环有重要作用的儿茶酚1,2-双加氧酶(C12O)、儿茶酚2,3-双加氧酶(C23O)以及对长链烷烃降解起作用的alkB,alkM等基因,并进而应用rDNA扩增及限制性位点分析、梯度凝胶电泳、末端限制性片段长度多态性分析等方法监测研究石油污染的生物降解过程。本文总结了近年来石油污染修复中应用上述方法的研究,为今后的石油污染生物修复工作提供参考。

关键词：石油污染生物降解分子生物学技术加氧酶变性梯度凝胶电泳末端限制性片段长度多态性分析

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内蒙古草原典型植物对土壤微生物群落的影响

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植物生态学报 2014年第2期38卷 201-208页

作者：王纳纳陈颖应娇妍高勇生白永飞中国科学院植物研究所植被与环境变化国家重点实验室北京100093 江西农业大学国土资源与环境学院南昌330045 内蒙古大学生命科学学院呼和浩特010021

为了分析内蒙古草原不同植物物种对土壤微生物群落的影响,采用实时荧光定量PCR(real-time PCR)以及末端限制性片段长度多态性分析(terminal restriction fragment length polymorphism,T-RFLP)等分子生物学技术,测定了退化-恢复样地上... 详细信息

为了分析内蒙古草原不同植物物种对土壤微生物群落的影响,采用实时荧光定量PCR(real-time PCR)以及末端限制性片段长度多态性分析(terminal restriction fragment length polymorphism,T-RFLP)等分子生物学技术,测定了退化-恢复样地上几种典型植物的根际土壤和非根际土壤中细菌和真菌的数量及群落结构。结果表明,不同植物物种对根际和非根际细菌及根际真菌数量均有显著影响。根际土壤中的细菌和真菌数量普遍高于非根际土壤,尤其以真菌更为明显。对T-RFLP数据进行多响应置换过程(multi-response permutation procedures,MRPP)分析和主成分分析(principal component analysis,PCA),结果表明,大多数物种的根际细菌及真菌的群落结构与非根际有明显差异,并且所有物种的真菌群落可以按根际和非根际明显分为两大类群。此外,细菌和真菌群落结构在一定程度上存在按物种聚类的现象,以细菌较为明显。这些结果揭示了不同植物对土壤微生物群落的影响特征,对理解内蒙古草原地区退化及恢复过程中植被演替引起的土壤性质和功能的变化有一定的帮助。

关键词：植物-微生物互作实时聚合酶链反应根际微生物末端限制性片段长度多态性分析

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水稻土中异化铁还原菌生物多样性的研究

水稻土中异化铁还原菌生物多样性的研究

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作者：黎慧娟中国科学院研究生院

学位级别：博士

铁是地壳中第四丰富的元素，微生物介导的异化Fe(Ⅲ)还原是生态系统中Fe(Ⅲ)还原生成Fe(Ⅱ)的主要途径。异化Fe(Ⅲ)还原是非硫厌氧环境中重要的生物地球化学循环过程，它可能是古生物圈最早的微生物呼吸方式，对于现代生态系统中C、N循... 详细信息

铁是地壳中第四丰富的元素，微生物介导的异化Fe(Ⅲ)还原是生态系统中Fe(Ⅲ)还原生成Fe(Ⅱ)的主要途径。异化Fe(Ⅲ)还原是非硫厌氧环境中重要的生物地球化学循环过程，它可能是古生物圈最早的微生物呼吸方式，对于现代生态系统中C、N循环具有重要贡献，对微量元素及重金属、放射性核素等的迁移有广泛影响，同时，在生物修复及微生物燃料电池方面都有巨大潜力。由于尚未有通用的功能基因，目前对于参与异化Fe(Ⅲ)还原的微生物群落还不是很清楚，特别是在水稻土中。因此，本文采用富集培养和原位实验的方法研究了水稻土中可能的铁还原菌；通过末端限制性片段长度多态性分析（T-RFLP）细菌16S rRNA基因和克隆文库相结合的技术揭示微生物的群落结构。\n 富集培养实验包括：1）不同短链脂肪酸，包括甲酸、乙酸、丙酸、丙酮酸、琥珀酸和柠檬酸，为电子供体水铁矿为电子受体：2）乙酸和氢气作为电子供体水铁矿和针铁矿作为电子受体；3）接种不同来源的水稻土，氢气为电子供体水铁矿和针铁矿为电子受体。研究结果表明：1）以不同短链脂肪酸为电子供体时，厚壁菌(Firmicutes)都是富集到的主要微生物；具体来说，采用不同脂肪酸富集到厚壁菌(Firmicutes)不同科属微生物。当以丙酮酸为电子供体时，梭菌(Clostridiumspp.)是富集到的占绝对优势的微生物：当以甲酸、乙酸、丙酸为电子供体时，芽孢杆菌(Bacillus)和梭菌(Clostridium)都有富集到；韦荣氏菌(Veillonellaceae)和嗜碱菌(Alkaliphilus)分别在以琥珀酸和柠檬酸为电子供体的处理中占优势；2）无论是以乙酸或氢气为电子供体，水铁矿或针铁矿为电子受体，地杆菌(Geobacter)和梭菌(Clostridiaceae)都是富集到的主要微生物；乙酸为电子供体时，红环菌(Rhodocyclaceae)也占很大丰度；3）接种不同来源水稻土以氢气为电子供体时，地杆菌(Geobacter)和梭菌（Clostridium）是富集到的丰要微生物。\n 原位实验是在没有有机质输入的情况下，通过干湿交替的培养方法探索了水稻土中铁还原菌的群落结构。实验中共进行三次干湿交替循环，首先采用完全风干的水稻土进行淹水培养，接着风干培养，然后再次淹水培养。在淹水培养过程中，铁还原是主要的生物地球化学过程。结果表明，地杆菌(Geobacter)是水稻土中重要的铁还原菌，芽孢杆菌(Bacillus)很可能是水稻土中另一个重要的铁还原菌群；能在发酵有机质中起重要作用的梭菌(Clostridiaceae)很可能也参与了呼吸型铁还原。\n 总之，研究结果表明，地杆菌(Geobacter)是水稻土中重要的铁还原菌，芽孢杆菌(Bacillus)和梭菌(Clostridiaceae)很可能也是水稻土中重要的铁还原菌，这需要通过进一步研究如分离芽孢杆菌(Bacillus)和梭菌(Clostridiaceae)的纯菌来证实。

关键词：异化铁还原菌水稻土生物多样性试验末端限制性片段长度多态性分析克隆文库

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六种香辛料水提取物对大鼠肠道乳酸菌影响的研究

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肠外与肠内营养 2013年第1期20卷 33-36页

作者：张志超黄丽珠王聪张宁刘柳彭喜春暨南大学食品科学与工程系广东广州510632

目的:观察肉桂、干姜、丁香、小茴香、胡椒和花椒等六种香辛料水提取物对消化系统功能紊乱的积极作用。方法:本研究采用末端限制性片段长度多态性分析技术,再用总峰面积、Ribotype丰富度(S)、Shannon多样性指数(H)、均匀度指数(E)以及Ja... 详细信息

目的:观察肉桂、干姜、丁香、小茴香、胡椒和花椒等六种香辛料水提取物对消化系统功能紊乱的积极作用。方法:本研究采用末端限制性片段长度多态性分析技术,再用总峰面积、Ribotype丰富度(S)、Shannon多样性指数(H)、均匀度指数(E)以及Jacaard相似性指数等指标,针对六种常见香辛料的水提取物对大鼠结肠和直肠中乳酸菌群的数量、多样性及结构进行了分析。结果:六种香辛料的水提取物对结肠中乳酸菌群生长的影响存在差异,但均抑制了直肠中乳酸菌的生长;然而,结肠中除丁香和小茴香组外,基本上都能增加乳酸菌的多样性和分布的均一性;直肠中则只有小茴香组乳酸菌群的多样性和分布的均一性降低;六种水提取物对结肠和直肠的乳酸菌群的结构均产生了较大影响。结论:六种香辛料对消化系统功能紊乱防治功效的共性和差异可能与其对肠道乳酸菌的影响相同或不同有关。

关键词：香辛料水提取物末端限制性片段长度多态性分析乳酸菌

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肠道微生态与异甘草素抗炎症相关结直肠癌作用的相关性研究

肠道微生态与异甘草素抗炎症相关结直肠癌作用的相关性研究

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作者：武亚琦新乡医学院

学位级别：硕士

背景肠道菌群失衡与炎症相关结直肠癌(CAC)的发病密切相关。一些传统中药具有调节肠道菌群的作用。异甘草素(Isoliquiritigenin,ISL)是从甘草中提取的一种查尔酮化合物。研究发现异甘草素具有多种抗癌活性。然而,目前尚未有关于异甘草... 详细信息

背景肠道菌群失衡与炎症相关结直肠癌(CAC)的发病密切相关。一些传统中药具有调节肠道菌群的作用。异甘草素(Isoliquiritigenin,ISL)是从甘草中提取的一种查尔酮化合物。研究发现异甘草素具有多种抗癌活性。然而,目前尚未有关于异甘草素在抗结直肠癌和对肠道微生物的影响方面的相关研究报道。目的(1)对比四种从粪便中提取微生物基因组DNA的方法,从中选取高效且能更为客观全面反映粪便中微生物群落特征的提取方法。(2)分析小鼠粪便及肠道各部位内容物中细菌群落结构的差异,探讨粪便取样研究肠道微生物与疾病关系的科学性和客观性,为研究肠道微生物与疾病相关实验提供依据。(3)构建氧化偶氮甲烷(azoxymethane,AOM)/葡聚糖硫酸钠(dextran sodium sulfate,DSS)小鼠模型,通过细菌16S rRNA的T-RFLP、荧光定量PCR和高通量测序技术分析对照组和模型组小鼠肠道微生物群落结构,阐述AOM/DSS模型小鼠CAC发展过程中的微生态演变规律;通过不同剂量异甘草素干预AOM/DSS模型,评估异甘草素对CAC发展的干预作用,并分析异甘草素对肠道微生态演变的影响。方法(1)在第一部分中,采用本实验室优化的GITC法、Tiangen商业试剂盒、Omega商业试剂盒和广泛应用的蛋白酶K-CTAB法从粪便样品中提取微生物总DNA,比较这四种方法提取的DNA的浓度、纯度和经PCR-DGGE(变性梯度凝胶电泳)分析所代表样品的微生物多样性和群落结构。(2)在第二部分中,利用末端限制性片段长度多态性(T-RFLP)和荧光定量PCR技术(qPCR)对BALB/c小鼠肠道不同部位(十二指肠、空肠、回肠、盲肠、结肠和直肠)内容物及粪便中细菌群落组成和丰度进行比较,分析细菌群落在小鼠粪便及肠道各部位的分布差异。(3)在第三部分中:1)设置氧化偶氮甲烷/葡聚糖硫酸钠(AOM/DSS)诱导的炎症相关结直肠癌BALB/c小鼠组(CACM)、三个不同浓度异甘草素干预AOM/DSS诱导炎症相关结直肠癌小鼠组(150 mg/kg,CIH;75 mg/kg,CIM;30 mg/kg,CIL)、空白对照组(CK)和异甘草素对照组(ISL+CK)。2)利用荧光定量PCR分析各组小鼠肠道上皮炎性细胞因子(IL-6、IL-10、TNF-α、IL-1β、IKKβ)以及炎症因子COX-2的变化;将肠组织切片进行HE染色分析各组小鼠肠上皮病理变化,评估AOM/DSS诱导炎症相关结直肠癌进程以及异甘草素对小鼠肠道的保护作用。3)通过末端限制性片段长度多态性(T-RFLP)和高通量测序方法分析小鼠肠道细菌群落结构演变,分析异甘草素对炎症相关结直肠癌小鼠肠道菌群的影响。4)结合小鼠肠上皮组织病理特征和肠道菌群结构特点,综合分析肠道菌群在异甘草素干预炎症相关结直肠癌发生发展过程中的作用。结果(1)四种从粪便中提取粪便中微生物基因组DNA对比结果:1)商业试剂盒提取的DNA纯度最高但是浓度最低;蛋白酶K-CTAB所得的DNA浓度最高但是纯度最低;GITC法所得DNA的浓度高于商业试剂盒,纯度高于蛋白酶K-CTAB法。2)细菌16S rRNA的PCR-DGGE分析结果表明,GITC法提取得到DNA所代表细菌的丰富度和多样性显著高于其他三种方法。本实验室所优化的GITC法可最为全面地反映小鼠粪便细菌群落结构组成。(2)小鼠粪便及肠道各部位内容物细菌群落结构分析结果:1)粪便与直肠、结肠中优势片段均为244 bp、255 bp和449 bp,而小肠内容物(十二指肠、空肠及回肠)的优势片段则为60 bp、73 bp、261 bp、268 bp和272 bp,且小肠各部位之间细菌群落结构差异较大。粪便样品可客观反映小鼠结直肠部位肠道菌群组成。2)十二指肠和空肠内容物中的细菌丰度较低,分别为6.9 log(copies)/g和8.3log(copies)/g,而粪便中细菌丰度高达11.8 log(copies)/g,约2倍于十二指肠细菌丰度,显著高于十二指肠和空肠(P<0.05),与大肠各部位及回肠内容物细菌丰度相当,差异不显著(P>0.05)。(3)异甘草素通过调节肠道微生物抑制小鼠炎症相关结直肠癌结果:1)组织病理学分析表明异甘草素可显著下调与炎症相关的细胞因子并抑制AOM/DSS小鼠模型中肿瘤的发生率。2)基于T-RFLP的CA分析表明,在AOM/DSS诱导的CAC发展过程中,小鼠肠道微生物群落结构发生显著变化,而ISL能在一定程度上抑制CAC对肠道微生物群落结构的影响,且ISL不会改变正常小鼠肠道微生物群落结构。3)基于细菌16S rRNA的高通量测序结果表明,肠道微生物在AOM/DSS诱导的CAC小鼠肠道和异甘草素干预下的CAC小鼠肠道中均发生显著变化。与健康小鼠相

关键词： BALB/c小鼠氧化偶氮甲烷/葡聚糖硫酸钠末端限制性片段长度多态性分析高通量测序肠道菌群炎症相关结直肠癌

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印染废水处理系统构建调试过程中微生物群落进化研究

印染废水处理系统构建调试过程中微生物群落进化研究

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作者：王佳河南师范大学

学位级别：硕士

工业废水生物处理系统在构建的过程中常常使用城市污水处理厂的活性污泥作为种污泥接种，该污泥中的微生物群落在适应新的废水环境过程中可能发生巨大变化，这种变化有时会导致新系统构建的失败。因此理解微生物群落在工业废水处理系统... 详细信息

工业废水生物处理系统在构建的过程中常常使用城市污水处理厂的活性污泥作为种污泥接种，该污泥中的微生物群落在适应新的废水环境过程中可能发生巨大变化，这种变化有时会导致新系统构建的失败。因此理解微生物群落在工业废水处理系统构建过程中以及系统之后的运行过程中的进化规律将有助于废水处理工程的构建操作和调试运行。而全规模污水处理系统，特别是印染废水处理系统中这种微生物群落进化过程的追踪研究还鲜有报道。本研究在追踪检测日处理量为1000吨的印染废水生物处理系统在构建和3个多月的调试运行效果的基础上，利用PCR-DGGE和T-RFLP两种分子生物学方法研究了包括细菌、真菌和古菌在内的三大域微生物的群落进化过程。具体研究成果包括如下几方面： (1)印染废水生物处理系统包括两级生化处理装置，分别为水解酸化+活性污泥和水解酸化+好氧接触氧化。经过3个多月调试过程中的连续监测结果表明，COD和色度的总去除率分别高达85%和84.9%。培养和定量PCR对微生物计数的结果表明，细菌是这所有的处理单元中的绝对优势菌群，真菌数量次之，古菌最少；随着系统运行，真菌数量逐渐减少，古菌的数量明显增加，特别是二级生化处理系统中，在运行3个月末，古菌的数量超过细菌成为明显的优势菌群，古菌占细菌的比率为1:0.58。 (2)利用PCR-DGGE的方法对系统构建和调试运行中的微生物群落进行追踪研究，结果表明，系统中细菌的多样性明显高于古菌和真菌；从种污泥到系统构建成功，细菌和真菌在系统中的持留率接近（细菌为57.3%，真菌为57.6%）并且明显高于古菌（34.8%）；由于废水组分和主要污染物始终处于变化中，因此驱动着各类群的微生物种群结构在整个调试运行过程中一直发生着变化，其中，细菌和古菌的多样性都在增加，而真菌的多样性则逐渐减少；二级生化处理单元接收一级生化池处理之后的废水，其组分波动相对较小，因此其中的微生物群落稳定性明显高于一级处理单元。DGGE条带切胶测序的结果表明，系统中的细菌广泛分布在α-变形菌纲（Alphaproteobacteria）、β-变形菌纲（Betaproteobacteria）、γ-变形菌纲（Gammaproteobacteria）、拟杆菌（Bacteroidetes）、梭菌纲（Clostridia）、芽孢杆菌纲（Bacilli）、暖蝇菌纲（Caldilineaceae）、硝化螺旋菌纲（Nitrospira）、绿菌纲（Chlorobia）、酸杆菌纲（Acidobacteria）十个纲中；真菌主要分布在壶菌纲（Chytridiomycetes）和结合纲（Zygomycota)；古菌主要分布在广古菌门（Euryarchaeota）其中大部分是产甲烷菌（Methanogen），和泉古菌门（Crenarchaeota）。 (3)利用另外一种分子生物学方法T-RFLP法对该系统中的微生物群落进化过程进行追踪研究，所得结果和DGGE的结果相似，其中主要的优势细菌分布在α-变形菌纲（Alphaproteobacteria）、 β-变形菌纲（Betaproteobacteri）、 γ-变形菌纲（Gammaproteobacteria）、暖蝇菌纲（Caldilineaceae）、硝化螺旋菌纲（Nitrospira）、绿菌纲（Chlorobia），其中Caldilineaceae占4.46%-11.6%，Alpha-proteobacteria占7.51-9.67%，Chloroflexi bacterium占6.02%-7.15%，Rhodobacter sp.24.32%-28.81%，Thermomonas sp占17.34%-38.95%；主要的优势真菌是壶菌纲（Chytridiomycetes），其中Blastocladiales sp.占2.30%-3.12%；主要的优势古菌是广古菌门（Euryarchaeota）中的产甲烷（Methanogen）。 (4)通过对系统构建过程以及3个多月的调试运行过程中的微生物群落结构进化过程的追踪研究发现，尽管微生物群落发生了很大变化，但系统的运行效率没有明显的变化，古菌和真菌的多样性和种群稳定性明显比细菌大，说明细菌具有巨大的功能冗余保证系统稳定运行。古菌随着系统的运行数量明显上升并且在二级好氧生化处理系统中超过细菌的数量成为优势菌群的现象值得关注，提示古菌可能在难降解物质的降解方面具有还未知的作用。

关键词：印染废水生物处理实时定量PCR 变性梯度凝胶电泳末端限制性片段长度多态性分析微生物群落进化

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深圳大鹏湾海域锥状斯氏藻赤潮期间细菌群落结构变化研究

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现代生物医学进展 2014年第10期14卷 1801-1807页

作者：常虹王博姚蜜蜜蔡中华清华大学生命科学学院北京100084 清华大学深圳研究生院海洋科学与技术学部广东深圳518055

目的:近年来,赤潮在我国的发生呈增加的趋势,并造成了极大的经济损失。过去研究赤潮发生的机理主要集中在理化因素的影响,而越来越多的证据表明仅凭借营养盐等环境因素并不能解释大部分赤潮现象,藻际微生物可能发挥着重要作用。本文跟... 详细信息

目的:近年来,赤潮在我国的发生呈增加的趋势,并造成了极大的经济损失。过去研究赤潮发生的机理主要集中在理化因素的影响,而越来越多的证据表明仅凭借营养盐等环境因素并不能解释大部分赤潮现象,藻际微生物可能发挥着重要作用。本文跟踪观测了2010年7月深圳大鹏湾海域爆发的锥状斯氏藻赤潮生消过程中细菌群落丰度种类的变化,从微生物与赤潮藻相互作用的角度探讨了赤潮的生消过程,讨论了不同时期不同关键菌群的特殊作用,为解释赤潮爆发和消亡提供了新的视角,为赤潮的监控和防治新方法的建立奠定了理论基础。方法:本文按时间顺序共采集该赤潮9次样本,利用末端限制性酶切片段长度多态性分析(T-RFLP)等分子生物学方法,通过主成分分析、克隆文库的构建,研究了微生物群落的变化过程,并探讨了特定种属的微生物在赤潮发生、发展和消亡过程中的作用。结果:从浮游细菌丰度来看,随着锥状斯氏藻细胞数量的波动,浮游细菌总数也随之呈现相应的变化。从浮游细菌的种类来看,它们主要属于变形杆菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和厚壁菌门(Firmicutes)。从浮游细菌的动态变化过程来看,赤潮生消过程中,浮游细菌群落呈现出一定的演替现象,特别是在赤潮后期,群落主成分变化尤为显著。从关键菌群的作用来看,属于γ变形杆菌门的Alteromonas sp.一直占有较高的丰度,赤潮中后期受到菌群相互作用导致比例下降,而赤潮后期其他关键菌群的丰度的增高可能是导致赤潮消亡的重要原因。结论:本文利用T-RFLP这一DNA指纹技术分析微生物群落结构和多样性特征,通过研究赤潮生消过程中藻际浮游细菌群落的动态变化,发现随着赤潮的发展,浮游细菌群落发生着相应的变化。结果说明赤潮藻体丰度数量的改变影响着浮游细菌群落的组成。相对地,细菌群落的适应调整迅速造成赤潮藻体局部生长环境的改变,从而影响赤潮的发展过程。

关键词：赤潮锥状斯氏藻微生物群落末端限制性片段长度多态性分析

来源：评论

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