组蛋白去乙酰化酶抑制剂(histone deacetylase inhibitor,HDACi)是近年来治疗癌症的重要靶向药物,其中羟氨酸类,苯甲酰胺类多种药物已进入临床试验阶段,但对于亲电酮类HDACi还有待于进一步研究,本研究应用比较分子力场分析法(comparative molecular field analysis,CoMFA),比较分子相似性指数法(compara-tive similarity indices analysis,CoMSIA)对29个亲电酮类HDAC抑制剂分子进行了定量构效关系分析,CoMFA模型的q2=0.668,r2=0.999;CoMSIA模型的q2=0.686,r2=0.995,所建模型预测能力较好。分子对接(sur-flex-dock)研究也进一步揭示出抑制剂分子与蛋白酶的作用模式,结合其作用模式比较合理地探讨了这类抑制剂的活性原因,为设计新型高效的亲电酮类HDACi提供了理论依据。
利用分子力场分析法(comparative molecular field analysis,CoMFA)、比较分子相似性指数法(comparative molecular similarity indices analysis,CoMSIA)和分子对接方法对一系列喹唑啉类TNKS抑制剂进行三维定量构效关系研究。构建的CoM...
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利用分子力场分析法(comparative molecular field analysis,CoMFA)、比较分子相似性指数法(comparative molecular similarity indices analysis,CoMSIA)和分子对接方法对一系列喹唑啉类TNKS抑制剂进行三维定量构效关系研究。构建的CoMFA(q^(2)=0.578,r^(2)=0.998,r^(2)_(pred)=0.815)和CoMSIA(q^(2)=0.624,r^(2)=0.929,r^(2)_(pred)=0.747)模型具有良好的鲁棒性、预测能力和机制可解释能力。分子对接实验结果表明:Ser1221和Gly1185是影响这些抑制剂活性的主要氨基酸。研究对设计新型TNKS抑制剂具有参考意义。
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