检索结果-内蒙古大学图书馆

浙江大学学报（农业与生命科学版） 2024年第6期50卷 942-953页

作者：魏旭东徐东辉曹萍陈生梅马晓慧晁生玉雷初朝马志杰青海大学畜牧兽医科学院青海西宁810016 农业农村部青藏高原畜禽遗传育种重点实验室青海西宁810016 青海省高原家畜遗传资源保护与创新利用重点实验室青海西宁810016 青海省海西州农业技术推广服务中心青海海西817099 西北农林科技大学动物科技学院陕西杨陵712100

本研究对包括25头柴达木牛在内的9个黄牛品种共计110头牛的Y染色体基因组单拷贝基因区进行单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)扫描,分析其父系遗传多样性和群体结构差异、分化状况及聚类关系。结果表明:9个品种共定义... 详细信息

本研究对包括25头柴达木牛在内的9个黄牛品种共计110头牛的Y染色体基因组单拷贝基因区进行单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)扫描,分析其父系遗传多样性和群体结构差异、分化状况及聚类关系。结果表明:9个品种共定义了14种Y染色体基因组单倍型,其中在柴达木牛中确定了4种Y染色体基因组单倍型(H7、H12、H13和H14)。遗传多样性分析表明,柴达木牛父系遗传多样性较为丰富(单倍型多样度为0.690±0.080),但与蒙古牛、延边牛、西藏牛和哈萨克牛相比较低。系统发育分析显示,柴达木牛父系遗传由普通牛Y1、Y2a和Y2b(亚)单倍型组组成,且以Y2b亚单倍型组为主,说明柴达木牛拥有普通牛父系起源。遗传分化结果表明,柴达木牛与蒙古牛、西藏牛之间的分化程度很低,与延边牛之间达到中等分化,与哈萨克牛、西门塔尔牛、安格斯牛之间的分化程度高。聚类分析显示,柴达木牛与蒙古牛聚类关系最近,与西藏牛、延边牛聚类关系较近,而与哈萨克牛、西门塔尔牛、安格斯牛聚类关系较远。本研究结果为深入了解柴达木牛的父系遗传多样性、群体遗传结构及与其他黄牛品种间的遗传关系等提供了参考,丰富了柴达木牛基因组数据库(集),为后续开展柴达木牛遗传资源的合理保护和分子育种实践奠定了基础。

关键词：柴达木牛 Y染色体基因组父系遗传多样性分化系统发育

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青海省同德牦牛群体的父系遗传多样性及遗传背景探析

引用

中国牛业科学 2021年第6期47卷 41-46页

作者：李广祯马志杰陈生梅林元李瑞哲刘书杰杨国太周桑加青海省高原家畜遗传资源保护与创新利用重点实验室青海大学畜牧兽医科学院西宁810016 青海省同德县农牧和水利局青海同德813200

[目的]为从分子水平上揭示青海省同德牦牛的父系遗传多样性、群体遗传结构和遗传背景。[方法]本研究对32头同德公牦牛使用5个Y-SNPs标记(SRY4、USP9Y、UTY19、AMELY3和OFD1Y10)和1个Y-STR标记(INRA189)进行PCR扩增、测序和分型,使用BioE... 详细信息

[目的]为从分子水平上揭示青海省同德牦牛的父系遗传多样性、群体遗传结构和遗传背景。[方法]本研究对32头同德公牦牛使用5个Y-SNPs标记(SRY4、USP9Y、UTY19、AMELY3和OFD1Y10)和1个Y-STR标记(INRA189)进行PCR扩增、测序和分型,使用BioEdit、Arlequin和Network等生物信息学软件综合分析同德牦牛的父系遗传多样性、群体遗传结构及父系起源。[结果]32头同德牦牛5个Y-SNPs标记即SRY4(969 bp)、USP9Y(470 bp)、UTY19(290 bp)、AMELY3(971 bp)和OFD1Y10(763 bp)的PCR扩增产物测序长度与先前研究结果一致,INRA189标记分型分析共检测到155 bp、157 bp和159 bp 3个等位基因;在同德牦牛群体AMELY3标记中检测到一个新的Y-SNP位点(即g.719 C>T);基于5个Y-SNPs标记11个Y-SNPs位点和INRA189标记3个等位基因的联合分型,共确定了6种Y染色体单倍型(即Y1H1、Y1H2、Y1H3、Y1H4、Y1H5和Y2H6),Y染色体单倍型多样度(Hd)为0.714±0.060,表明同德牦牛具有丰富的父系遗传多样性;系统发育分析显示同德牦牛由2个父系支系组成(即Y1和Y2),提示其拥有2个父系起源。[结论]同德牦牛拥有特殊的父系遗传信息,具有丰富的父系遗传多样性,由2个父系支系组成,拥有2个父系起源。

关键词：牦牛 Y-SNP Y-STR 父系遗传多样性群体遗传结构起源

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互助白牦牛与天祝白牦牛父系遗传差异分析

引用

黑龙江畜牧兽医 2022年第13期 120-124页

作者：魏旭东马志杰陈生梅何得仓赵金财梁育林青海大学畜牧兽医科学院西宁810016 青海省高原家畜遗传资源保护与创新利用重点实验室西宁810016 海东市互助县畜牧兽医站青海互助810599 海东市互助县巴扎乡畜牧兽医站青海互助810599 天祝藏族自治县畜牧技术推广站甘肃天祝733200

为探究青海省互助白牦牛与甘肃省天祝白牦牛间的父系遗传差异,试验使用5个Y-SNPs标记(SRY4、USP9Y、UTY19、AMELY3和OFD1Y10)和1个Y-STR标记(INRA189)对32头互助白牦牛和34头天祝白牦牛进行PCR扩增、测序和分型分析,使用BioEdit 7.2.5、... 详细信息

为探究青海省互助白牦牛与甘肃省天祝白牦牛间的父系遗传差异,试验使用5个Y-SNPs标记(SRY4、USP9Y、UTY19、AMELY3和OFD1Y10)和1个Y-STR标记(INRA189)对32头互助白牦牛和34头天祝白牦牛进行PCR扩增、测序和分型分析,使用BioEdit 7.2.5、Arlequin 3.11和Network 10.1等软件综合分析2个白牦牛品种(群体)的父系遗传多样性、群体结构、分化状况及遗传背景。结果表明:在2个白牦牛品种(群体)中共确定了5种Y染色体单倍型。其中,在互助白牦牛中共确定了4种Y染色体单倍型,即H1Y1、H10Y1、H11Y2和H12Y2;在天祝白牦牛中共确定了5种Y染色体单倍型,即H1Y1、H10Y1、H11Y2、H12Y2和H13Y2。互助白牦牛和天祝白牦牛Y染色体单倍型多样度分别为0.7500±0.0349和0.6881±0.0614。2个白牦牛品种(群体)间的固定分化指数值为0.0186,无显著遗传分化(P>0.05)。2个白牦牛品种(群体)均由Y1、Y2两个父系支系(单倍型组)组成,天祝白牦牛以Y1支系(单倍型组,59%)为主,互助白牦牛以Y2支系(单倍型组,56%)为主。说明天祝白牦牛和互助白牦牛都具有丰富的父系遗传多样性,但互助白牦牛的父系遗传多样性水平略高于天祝白牦牛;2个白牦牛品种(群体)间父系遗传分化程度很低;白牦牛有两个父系起源,天祝白牦牛和互助白牦牛均由Y1、Y2两个父系支系(单倍型组)组成,但二者分别以Y1、Y2为优势支系(单倍型组),父系遗传结构存在一定程度的差异。

关键词：互助白牦牛天祝白牦牛父系遗传多样性群体结构起源

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