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T=题名（书名、题名），A=作者（责任者），K=主题词，P=出版物名称，PU=出版社名称，O=机构（作者单位、学位授予单位、专利申请人），L=中图分类号，C=学科分类号，U=全部字段，Y=年（出版发行年、学位年度、标准发布年）

检索规则说明：

AND代表“并且”；OR代表“或者”；NOT代表“不包含”；(注意必须大写,运算符两边需空一格)

检索范例：

范例一：(K=图书馆学 OR K=情报学) AND A=范并思 AND Y=1982-2016
范例二：P=计算机应用与软件 AND (U=C++ OR U=Basic) NOT K=Visual AND Y=2011-2016

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文献类型

19 篇 期刊文献
11 篇 学位论文
3 篇 会议

馆藏范围

33 篇 电子文献
0 种 纸本馆藏

日期分布

学科分类号

20 篇 农学
- 12 篇 水产
- 6 篇 农业资源与环境
- 2 篇 林学
15 篇 理学
- 14 篇 生态学
- 1 篇 生物学
5 篇 工学
- 3 篇 仪器科学与技术
- 2 篇 农业工程
- 1 篇 控制科学与工程
- 1 篇 水利工程
- 1 篇 环境科学与工程（可...
1 篇 艺术学
- 1 篇 设计学（可授艺术学...

主题

33 篇 环境dna宏条形码
11 篇 鱼类多样性
5 篇 生物多样性
4 篇 物种检测
4 篇 生物监测
4 篇 多样性
3 篇 黄河三角洲
3 篇 鄱阳湖
3 篇 群落结构
2 篇 蚌类
2 篇 传统方法比对
2 篇 三峡水库
2 篇 传统捕捞调查
2 篇 浮游植物
2 篇 通用引物
2 篇 数据库
2 篇 水文连通
2 篇 变动回水区
2 篇 鱼类资源
2 篇 潮沟系统

机构

5 篇 南京大学
5 篇 南昌大学
2 篇 中国科学院大学
2 篇 海南大学
2 篇 烟台大学
2 篇 鄱阳湖环境与资源...
2 篇 中国科学院烟台海...
1 篇 江西省流域生态演...
1 篇 重庆交通大学
1 篇 南京林业大学
1 篇 云南省生态环境厅...
1 篇 西南大学
1 篇 浙江师范大学
1 篇 department of bi...
1 篇 江西鄱阳湖湿地保...
1 篇 中国水产科学研究...
1 篇 国家内河航道国家...
1 篇 水利部京津冀水安...
1 篇 中国科学院水生生...
1 篇 昆明学院

作者

5 篇 周春花
5 篇 吴小平
4 篇 欧阳珊
3 篇 陈金萍
3 篇 郭婷
3 篇 董志远
2 篇 陈莉
2 篇 阮高
2 篇 倪艳梅
2 篇 陈琳琳
2 篇 zhang xiaowei
2 篇 舒政博
2 篇 ouyang shan
2 篇 孙德斌
2 篇 李宝泉
2 篇 yang jianghua
2 篇 zhou chun-hua
2 篇 张效伟
2 篇 wu xiao-ping
2 篇 杨江华

语言

33 篇 中文

检索条件"主题词=环境DNA宏条形码"

共 33 条记录，以下是31-40 订阅

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排序：

江苏泗洪洪泽湖湿地国家级自然保护区后生浮游动物群落结构及影响因素

江苏泗洪洪泽湖湿地国家级自然保护区后生浮游动物群落结构及影响...

引用

作者：孙婉南京师范大学

学位级别：硕士

江苏泗洪洪泽湖湿地国家级自然保护区（以下简称为洪泽湖保护区），位于洪泽湖的西北部，是长江中下游地区具有代表性的湿地生态系统。后生浮游动物是湿地生态系统中主要的生物类群之一，了解其群落结构对洪泽湖保护区湿地修复与保护工... 详细信息

江苏泗洪洪泽湖湿地国家级自然保护区（以下简称为洪泽湖保护区），位于洪泽湖的西北部，是长江中下游地区具有代表性的湿地生态系统。后生浮游动物是湿地生态系统中主要的生物类群之一，了解其群落结构对洪泽湖保护区湿地修复与保护工作起着重要作用。为探究洪泽湖保护区后生浮游动物物种组成及群落结构，本研究于2020年至2021年间对洪泽湖保护区水域的后生浮游动物进行了一年周期四个季度的调查，测定了与浮游动物群落结构密切相关的水体理化因子。利用形态鉴定的方法分析洪泽湖保护区后生浮游动物群落在季节、生态功能区的动态变化及其影响因子，对洪泽湖保护区水质进行评价。同时采集了洪泽湖保护区环境dna样品，探究环境dna宏条形码技术在洪泽湖保护区后生浮游动物及鱼类调查中的可行性。主要研究结果如下:　　1.形态鉴定共发现后生浮游动物22科62属112种，其中轮虫32属67种,枝角类17属31种，桡足类13属14种。后生浮游动物平均密度为1636.31 ind./L,不同季节、不同生态功能区的后生浮游动物密度具有显著差异。保护区后生浮游动物优势种15种，主要优势种有4种，包括:裂痕龟纹轮虫(Anuraeopsis fissa）、暗小异尾轮虫(Trichocercapusilia）、针簇多肢轮虫（Polyarthra trigla）、螺形龟甲轮虫（Keratellacochlearis）。优势种生态位宽度指数为0.14～0.84,生态位重叠指数为0.22～0.95,不同季节的优势种生态位重叠度差异较大。不同季节间后生浮游动物的Shannon-Wiener多样性指数及Margalef丰富度指数差异极显著，Pielou均匀度指数差异显著;不同生态功能区下三种多样性指数差异均不显著。水体理化因子与后生浮游动物优势种的冗余分析结果表明，酸碱度（pH）、水温（WT）、透明度（SD）、硝氮（NO3-N）、总氮（TN）是影响洪泽湖保护区后生浮游动物群落结构的主要环境因子。利用浮游动物生物多样性指数评估洪泽湖保护区水质，显示水质处于轻度-中度污染水平，需重点关注水质情况，加强生态治理工作。　　2.环境dna宏条形码技术共检测到后生浮游动物21科32属50种，包括轮虫10科14属23种，枝角类7科11属17种，桡足类4科7属10种。其中，环境dna宏条形码技术与形态鉴定方法均检出的后生浮游动物为28种。检测到鱼类8目23科63属82种，包括1种重点管理入侵物种:齐氏罗非鱼（Coptodon zillii）。构建后生浮游动物与鱼类物种共生网络图，结果显示:洪泽湖保护区后生浮游动物与鱼类之间的生态相互作用呈现复杂化，竞争、捕食等生物因素对后生浮游动物群落具有重要影响。环境dna宏条形码技术可以用于洪泽湖保护区后生浮游动物与鱼类的日常调查与监测。

关键词：洪泽湖保护区浮游动物群落结构形态鉴定环境dna宏条形码

来源：评论

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七连屿浅水礁区鱼类多样性及其条形码初步研究

七连屿浅水礁区鱼类多样性及其条形码初步研究

引用

作者：陈梓林浙江海洋大学

学位级别：硕士

有效获取物种多样性信息是监测和保护珊瑚礁鱼类的基础。由于珊瑚礁生境的复杂空间异质性和珊瑚礁鱼类的极高多样性,珊瑚礁鱼类多样性研究的复杂性显著高于内陆与近海鱼类研究。采用网捕等常规调查方法难以准确反映珊瑚礁鱼类群落的物... 详细信息

有效获取物种多样性信息是监测和保护珊瑚礁鱼类的基础。由于珊瑚礁生境的复杂空间异质性和珊瑚礁鱼类的极高多样性,珊瑚礁鱼类多样性研究的复杂性显著高于内陆与近海鱼类研究。采用网捕等常规调查方法难以准确反映珊瑚礁鱼类群落的物种丰富度,且对珊瑚礁生态系统具有侵入性。新兴的环境dna宏条形码技术在内陆及近海鱼类多样性研究中已有较多应用案例,证实能够弥补常规方法的缺陷,可作为常规方法的有效补充,并在大范围和长期监测中的监测活动作用前景广泛。本研究基于对环境dna技术的初步研究,以我国南海西沙群岛中的七连屿海域珊瑚礁鱼类为研究对象,探索该技术在该海域珊瑚礁鱼类多样性研究中的适用性并为七连屿海域的珊瑚礁鱼类多样性和环境dna效用研究提供科学基础。目前,该技术在珊瑚礁鱼类研究中尚缺乏应用,本研究以南海西沙群岛七连屿海域岛礁鱼类为研究对象,首先探索dna条形数据库对珊瑚礁鱼类的鉴定效果,以推测环境dna宏条形码技术对该海域鱼类识别力的极限;之后整理研究海域鱼类名录,收集相关鱼种线粒体序列,建立序列数据库,作为宏条形码分析判定鱼种的标准序列,并对数据库序列缺失程度进行分析和补充;最后对4对候选宏条形码PCR引物的鱼种鉴别力进行定量和比较,以筛选出最适PCR引物。本研究主要结果如下:(1)dna条形码数据库对珊瑚礁鱼类的鉴定效果于西沙七连屿海域采集珊瑚礁鱼类1 15尾,测定其线粒体COI部分序列。检测、合并重复序列后,共获得特异性序列86条。之后将特异性序列分别检索“中国重要渔业生物dna条形码信息平台(CFDBS)、MitoFish和BOLD。结果,三大数据库的未检出率分别为67.44%、59.30%和3.49%,检出物种数分别为16、27和31。将上述三库结果合并,则仅有1条序列未检索到近缘序列,未检出率降至1.16%;有85条检索到近缘序列,能鉴定至种的有46条,其中共包含33个物种(隶属6目19科27属),占预期检出种数的55.9%,表明dna条形码数据库对珊瑚礁鱼类种级别的鉴定率偏低。为提升鉴定精度,对未能鉴定至种的39条序列的检索结果进行物种名录过滤,结果,其中仅能鉴定至属的序列降至21条,仅能鉴定至科的序列降至0条,能鉴定至种的序列上升至64条,检出物种数上升至46个,占预期检出种数的77.96%,表明物种名录过滤可显著提升dna条形码物种鉴定精度。经形态学鉴定,从上述115尾样本中共鉴定出59个物种,隶属7目25科38属。和数据库鉴定结果对比,两者一致性很强。通过数据库检索可鉴定到种的样本,其鉴定结果与形态学鉴定一致;其它样本,形态学鉴定结果都包含在其数据库鉴定得出的参考物种组中。由数据表明,环境dna宏条形码技术对珊瑚礁鱼类种级别识别率预计<77.96%。此外根据上述结果,重新梳理了鉴定流程,并绘制了优化后的鉴定流程图。(2)西沙群岛鱼类线粒体序列数据库的构建通过检索文献及整理作者实验室所有在研究海域的采样记录,建立了《西沙群岛鱼类名录》,其中包含鱼种667个,隶属35目106科306属,物种信息表明,鲈形目为该海域的绝对优势种,约占总种类数的70%,物种数最多的前三科分别是.隆头鱼科、雀鲷科、蝴蝶鱼科。研究结果表明西沙群岛鱼类群落物种间的亲缘比东海陆架、大亚湾更为接近。物种多样性较高而分类多样性较低是西沙群岛鱼类多样性分布格局的主要特征。通过检索MitoFish和NCBI数据库,收集名录中所有物种已报道的线粒体dna序列,结果有213个种具有线粒体基因组全序列,有619个种具有COI序列,有500个种具有16S rRNA序列,有406个种具有12s rRNA序列,有422个种具有CytB序列,有236种具有控制区序列,可知上述各序列的缺失率分别为68.22%、7.95%、25.64%、39.88.%、37.33%、65%,表明各线粒体基因缺失率存在明显差异,数据库序列的大幅缺失会显著降低环境dna宏条形分析的物种识别率。利用作者实验室的样品库对12个种的14个缺失基因片段进行了补充测序。之后,将上述dna序列进行整理,消减重复序列和异常序列,建立了《西沙群岛鱼类线粒体dna序列数据库》,作为宏条形码分析的物种注释数据库。(3)宏条形码PCR引物筛选从作者实验室七连屿珊瑚礁鱼类样品库中随机抽取55个种(隶属6目23科38属)的样本,每种1尾,提取其基因组总dna,分别使用COI及4对宏条形码研究候选PCR引物(CytB、Am12S、Ve16S、Ac16S)进行扩增、测序并分别进行序列比对,计算序列间K2P距离(Kimura two parameter distances)。COI引物的扩增序列在各样品对间的K2P距离均值为0.221,有3对样品之间的K2P距离<0.03,导致6个物种无法通过该引物准确鉴别,占实验物种总数的10.9%,

关键词：鱼类多样性环境dna宏条形码 dna条形码珊瑚礁鱼类七连屿

来源：评论

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基于edna技术的东海中南部海域鱼类多样性研究及大黄鱼资源量评估

基于eDNA技术的东海中南部海域鱼类多样性研究及大黄鱼资源量评估

引用

作者：童锋厦门大学

学位级别：硕士

在人类活动的干预下,东海区的生物多样性及其生态系统遭到了空前的破坏,对东海的生物多样性进行准确评估具有重要意义。大黄鱼(Larimichthys crocea)隶属于鲈形目(Perciformes)、石首鱼科(Sciaenidae)、黄鱼属(Larimichthys),是东海区... 详细信息

在人类活动的干预下,东海区的生物多样性及其生态系统遭到了空前的破坏,对东海的生物多样性进行准确评估具有重要意义。大黄鱼(Larimichthys crocea)隶属于鲈形目(Perciformes)、石首鱼科(Sciaenidae)、黄鱼属(Larimichthys),是东海区的主要经济捕捞种之一,由于过度捕捞,其资源量持续下降,对大黄鱼资源分布情况进行准确评估意义重大。传统的生物多样性与渔业资源调查主要依赖于野外捕捞作业,费时费力。环境dna(edna)是对一切环境样本中的dna的统称,已有研究表明其在生物多样性调查和资源评估中的适用性和可行性。本研究首次结合传统的渔业资源调查方法,利用edna技术对东海中南部海域的生物多样性进行了研究,同时设计了一对qPCR特异性引物对东海大黄鱼资源分布情况进行了评估,证实了 edna技术用于鱼类多样性研究的适用性和准确性,同时设计的大黄鱼特异性引物及其方法可以为大黄鱼资源评估及其生活史研究提供技术支撑,本文主要结论如下: 1、利用环境dna宏条形码技术对东海大面调查2018年秋季航次和2019年春季航次的各9个站位点的鱼类多样性以及物种丰度进行了检测,结果如下:2018年秋季航次和2019年春季航次9个站位的高通量测序得到的高质量序列数在51,857-959,284和8,449-2,703,779之间,两个航次9个站位的样本高通量测序测得的OTU基于3%的差异性水平,经注释比对后,总共产生了 749个OTU。经过人工校准、核验后,有591个OTU注释到了鱼类序列,其中2018年秋季鉴定到了 319种鱼类,隶属于3纲,31目、121科、230属;2019年春季鉴定到266种鱼类,隶属于3纲、26目、112科、203属。除此之外,比较了传统渔业资源调查方法所获得的捕捞数据和高通量测序结果,表明环境dna宏条形码技术检测到的鱼类分别可以覆盖2018年秋季和2019年春季68%和75%的捕捞数据,且本研究中利用环境dna宏条形码技术还成功地鉴定出了东海的七星底灯鱼隐存种。从垂直空间尺度上来说,Alpha多样性结果表明,东海两个航次的表层水体的群落丰富度均高于底层水体,两个航次的表层水体的群落多样性和底层水体的群落多样性之间的差异不显著。从季节尺度上来说,Alpha多样性结果表明2018年秋季的鱼类群落多样性和群落丰富度均要高于2019年春季。Beta多样性分析结果则表明,基于edna技术测得的东海中南部海域鱼类组成在季节上(秋季与春季)存在显著差异,而在垂直空间尺度上(表层与底层)差异不显著。同时各站位的表、底之间的鱼类组成存在一定的差异,并且这种差异和表、底水层之间的水温差、盐度差和深度差存在一定的相关关系。 2、对高通量测序测得的大黄鱼OTU丰度进行了分析,发现大黄鱼OTU丰度水平分布特征存在一定的季节差异,具体表现为:2018年秋季大黄鱼OTU丰度在26°00′-28°30′N,121°30′-123°30′E之间的区域较高,而其余区域较低;2019年春季大黄鱼OTU丰度在调查海域则在27°30′-29°00′N,121°30′-123°30′E之间的区域较高,而其余区域较低。为进一步精确定量各站位的大黄鱼丰度差异,本研究进一步设计开发了一对大黄鱼特异性引物,用Real-time qPCR的方法对两个航次8个大黄鱼捕捞站位的表层和底层水样进行了大黄鱼edna浓度检测,结果显示qPCR方法测得的大黄鱼edna浓度和大黄鱼的捕捞生物量之间存在良好的相关关系,同时通过比较发现各站位表、底水层检出的大黄鱼edna浓度之间不仅存在一定的差异,而且和不同生活史阶段的大黄鱼扩散途径有关,因此本研究所设计的引物及其方法,不仅可以用于大黄鱼资源量的评估,还可以为判断大黄鱼不同发育阶段的扩散迁移途径提供重要的信息,对大黄鱼生活史的研究及其资源的准确评估和保护具有重要意义。

关键词：生物多样性环境dna 环境dna宏条形码荧光定量PCR 大黄鱼

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