地球上的水体为人类提供着无法计量的生态系统服务和相应的生态价值。然而,水生生态系统一直承受着巨大的捕捞和环境压力。为更好地分析人类以及自然扰动对水生生态系统的影响,并建立科学合理的管理机制,许多研究种群结构和动态的模型软件以及建模方法被开发出来。这些模型包括单种群模型、多物种虚拟种群分析模型(Multispecies virtual population analyses,MSVPA)以及基于食物网的生态系统模型等。单种群模型难以全面地反映整个生态系统的结构和功能,也难以预测渔业和环境变迁在系统水平上的影响,从而无法实现宏观和科学的决策。MSVPA的局限性则在于其所需参数过于复杂,
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