检索结果-内蒙古大学图书馆

中国肿瘤生物治疗杂志 2009年第3期16卷 227-231页

作者：陈明水陈强李洁羽周智锋陈淑萍叶韵斌福建医科大学教学医院福建省肿瘤医院肿瘤免疫研究室福州350014

目的:采用生物信息方法预测和鉴定survivin抗原HLA-A2+限制性CTL表位,为探索基于survivin的肿瘤免疫治疗奠定基础。方法:采用超基序法和量化基序法对靶抗原survivin HLA-A2+限制性CTL表位进行预测;选取得分>10的表位肽为候选对象,并... 详细信息

目的:采用生物信息方法预测和鉴定survivin抗原HLA-A2+限制性CTL表位,为探索基于survivin的肿瘤免疫治疗奠定基础。方法:采用超基序法和量化基序法对靶抗原survivin HLA-A2+限制性CTL表位进行预测;选取得分>10的表位肽为候选对象,并进行人工合成。采用T2细胞,以HLA-A2结合实验和流式细胞术(FITC染色)检测候选CTL表位肽的结合亲和力[以荧光系数(fluorescence index,FI)表示];以HLA-A2解离实验和流式细胞术检测其结合稳定性[以复合物解离50%的时间DC50(dissociation complex50%)表示]。结果:预测到的候选survivinCTL表位肽分别是:20STFKNWPFL28(SV20-28)、23KNWPFLEGC31(SV23-31)、96LTLGEFLKL104(SV96-104)、6LPPAWQPFL14(SV6-14)、33CTPERMAEA41(SV33-41)、46CPTE-NEPDL54(SV46-54)、130KVRRAIEQL138(SV130-138)、37RMAEAGFIH45(SV37-45)、88SVKKQFEEL96(SV88-96)。亲和力分析显示:SV20-28、SV96-104、SV130-138、SV23-31的FI分别为8.61、6.88、5.89、3.81;SV33-41、SV6-14、SV46-54、SV37-45、SV88-96的FI分别为0.31、-0.29、-0.4、-0.16和-0.03;稳定性分析结果DC50为:SV20-28、SV96-104、SV130-138>8h;SV23-31为4～6h;SV6-14、SV33-41、SV88-96为2～4h;SV46-54、SV37-45为0～2h。结果提示,SV20-28、SV96-104、SV130-138为高亲和力表位肽,SV23-31为中等亲和力表位肽,SV33-41、SV6-14、SV46-54、SV37-45、SV88-96为低亲和力表位肽。结论:超基序法、量化基序法可快速有效地预测抗原表位,SV20-28、SV96-104、SV130-138有可能是survivin HLA-A2+CTL表位,可用于后续研究。

关键词： survivin CTL表位 T2细胞生物信息方法

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SIRT1在兔膝骨关节炎关节软骨中和血清中表达的研究

SIRT1在兔膝骨关节炎关节软骨中和血清中表达的研究

引用

作者：荀瑞峰长江大学

学位级别：硕士

骨关节炎(Osteoarthritis,OA)主要病理变化是关节软骨基质减少或丢失,除此之外,骨关节炎还会出现滑膜组织增生、无菌性炎症等病理改变。目前,骨关节炎的发病机制还未研究清楚。骨关节炎临床致残率非常高,尤其是膝关节骨关节炎到了疾病... 详细信息

骨关节炎(Osteoarthritis,OA)主要病理变化是关节软骨基质减少或丢失,除此之外,骨关节炎还会出现滑膜组织增生、无菌性炎症等病理改变。目前,骨关节炎的发病机制还未研究清楚。骨关节炎临床致残率非常高,尤其是膝关节骨关节炎到了疾病的晚期常常只有几种单一的治疗方法。然而,手术治疗存在手术费用高,病人经济压力较大的缺点。从骨关节炎的诊断方面来说,当前临床上对于骨关节炎的诊断只能通过影像学资料和病人的特有的专科体征来判断。因此,为了提高骨关节炎患者的生活质量、降低骨关节炎的发生率、以及发现新的诊断标记物就显得非常重要了。这样就可以对骨关节炎患者进行早诊断、进而可以早干预、早治疗。目前有众多学者对于骨关节炎疾病的基础研究有着浓厚的兴趣。一般情况下,在哺乳动物机体中存在7种Sirtuin蛋白。目前认可率比较高的观点认为,沉默信息调节因子1(SIRT1)在哺乳动物或低等生物中发挥着延长细胞寿命、对抗细胞应激、促进新陈代谢等作用。为了发现对一些衰老性相关的疾病诊断和治疗有效的基因,我们希望对SIRT1因子进行更深入的研究。根据相关研究发现,SIRT1在机体代谢、抑制细胞凋亡等信号通路方面起到极其重要的作用,主要途径是通过对转录因子的赖氨酸残基进行去乙酰化修饰,调节相关基因的高表达或低表达。根据目前所查阅的资料了解到,SIRT1会受到其它多种因素的影响,例如底物的有效性、转录因子和RNA蛋白表达的调控等等。另外,SIRT1的活性也与其发生磷酸化、甲基化等修饰有关。最重要的是SIRT1和多种转录因子的基因调控通路之间的密切关系影响着干细胞的扩增与分化,这样也会影响SIRT1的活性。综上所述,本研究通过检测兔膝关节骨关节炎膝关节软骨组织中、血清中SIRT1的表达情况,旨在为临床上对骨关节炎疾病的诊断方法和治疗方法提供一些新的思路。目的:分析沉默信息调节因子1在实验兔不同退变程度的膝关节关节软骨组织中和血清中的表达,为未来骨关节炎基因治疗提供一些新思路。方法:选取40只实验大白兔随机编号,按随机数字法将其分为4组(甲组、乙组、丙组、丁组),每组10只。丁组为对照组,不做任何处理,甲、乙、丙组采用伸直位石膏固定法建立兔膝骨关节炎模型,甲组固定6周,乙组固定8周,丙组固定10周。各组实验兔膝关节造模前,采用耳缘静脉采血法采集适量的静脉血置于试管中,离心10分钟(3000转/分)后,取上层血清放置于冻存管并冰冻于-20℃冰箱待检。造模成功后也用同样的采血法、同样的血清标本制作方法采集实验兔的血清标本。用空气栓塞法处死实验兔,取股骨远端软骨组织,连续切片,相邻的两组切片一组进行HE染色,另一组进行免疫组化检查。经过HE染色,根据结果进行Mankin评分,软骨组织切片分为正常软骨标本10份、骨关节炎软骨轻度退变组9份、骨关节炎软骨中度退变组10份、骨关节炎软骨重度退变组9份。用免疫组织化学定量方法将相邻的38份切片分组并进行SIRT1免疫组化检测,分析各组实验兔关节软骨SIRT1的表达情况。最后将采集的上层血清样本采用酶联免疫吸附(enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA)法检测血清 SIRT1的水平。分析造模前后实验兔血清中SIRT1的表达情况。统计学分析采用IBM SPSS 21.0软件进行,P<0.05认为具有统计学意义。结果:将4组软骨组织标本的免疫组化平均灰度值进行统计发现:正常软骨组中SIRT1的平均灰度值为144.40±1.78,轻度骨关节炎组SIRT1的平均灰度值为123.44±4.03,中度骨关节炎组SIRT1的平均灰度值为112.50±4.97,重度骨关节炎组SIRT1的平均灰度值为94.22±3.27。随着软骨组织退变加重,软骨组织中的SIRT1灰度值也逐渐降低。通过对造模前和造模后各组实验兔外周血清中SIRT1因子浓度比较发现:造模后血清中SIRT1的浓度(6.84±1.71)较造模前(10.70±0.96)明显下降,具有显著的统计学意义(P<0.05)。进一步对造模前后各组实验兔进行组间统计分析发现:造模后甲、乙、丙组实验兔血清SIRT1浓度比造模前的浓度降低,统计结果具有统计学意义(P<0.05)。结论:SIRT1可能在骨关节炎软骨退变过程中发挥着某些关键作用。膝关节软骨退化越严重的软骨组织中,血清中和软骨组织中SIRT1表达量和浓度较正常软骨实验兔低。

关键词：骨关节炎(OA) SIRT1 软骨退变生物信息方法

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