检索结果-内蒙古大学图书馆

作者：刘爽宁夏大学

学位级别：硕士

脂肪沉积影响动物体内代谢与能量储存,是肉用家畜产业关注的热点之一和亟待解决的难题。动物体内脂肪细胞分化与代谢是一个及其复杂的过程,受诸多因素影响,编码基因和非编码基因彼此互相调控,构成了一个协调网络。解析动物脂肪组织代谢... 详细信息

脂肪沉积影响动物体内代谢与能量储存,是肉用家畜产业关注的热点之一和亟待解决的难题。动物体内脂肪细胞分化与代谢是一个及其复杂的过程,受诸多因素影响,编码基因和非编码基因彼此互相调控,构成了一个协调网络。解析动物脂肪组织代谢调控网络对提高我国肉牛肌内脂肪含量具有重要的参考价值和指导意义。miRNA对脂肪发育起重要调控作用,研究其对脂肪细胞分化与代谢的调控,有利于揭示产肉性状分子机制,为肉牛遗传改良提供理论基础。本研究以牛特异性miRNA、内含子miRNA和宿主基因调控脂肪细胞分化与代谢作为初步筛选条件,确定miR-2439-5p基因为研究对象,采用生物信息学分析、组织表达谱分析和双荧光素酶报告系统进行靶基因验证,以期探索其对肉牛脂肪肌内沉积的作用研究。试验结果发现:miR-2439-5p是牛特异性miRNA,宿主基因MRTFA的缺失可能促进脂肪祖细胞向成熟脂肪细胞发育,miR-2439-3p的产生可能对肉牛和奶牛骨骼肌细胞的成肌分化有着特殊调控机制,miR-2439-5p可能参与牛脂肪细胞分化与代谢调控;miR-2439-5p在28月龄和牛的心、肺、腹股沟脂和背脂相对高表达,在背脂中表达量最高,与心包脂、肝和脾的表达量有显著性差异(P<0.05),miR-2439-5p在28月龄秦川牛的各组织表达量无显著性差异(P>0.05);SMAD3基因是miR-2439-5p的靶基因。此外,成功分离培养和诱导分化的牛肌内脂肪前体细胞为后续的功能验证试验提供了良好的细胞材料。

关键词：脂肪沉积肉牛 miR-2439-5p 生物学信息学分析组织表达谱分析靶基因验证

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基于生物信息学分析肺炎链球菌LytR蛋白特征

引用

重庆医学 2018年第24期47卷 3125-3128,3133页

作者：吴凯峰张競之查何刘雁童华波潘卫王正蓉贵州省遵义市第一人民医院/遵义医学院第三附属医院检验科 563000 贵州医科大学检验医学院贵阳550004

目的研究肺炎链球菌spr1759(LytR)蛋白的基本理化性质,初步分析预测该蛋白的结构与功能。方法利用Bioedit、TMHMM、TargetP和ExPASy等多种生物信息学软件对肺炎链球菌spr1759蛋白进行分析,并对其功能预测。利用TMHMM软件对比肺炎链球菌s... 详细信息

目的研究肺炎链球菌spr1759(LytR)蛋白的基本理化性质,初步分析预测该蛋白的结构与功能。方法利用Bioedit、TMHMM、TargetP和ExPASy等多种生物信息学软件对肺炎链球菌spr1759蛋白进行分析,并对其功能预测。利用TMHMM软件对比肺炎链球菌spr1759蛋白与炭疽芽孢杆菌BAS5115蛋白和枯草芽孢杆菌DJ97_1211二级结构差异;利用Megalign软件分析它们之间的氨基酸序列相似性。结果肺炎链球菌spr1759蛋白为一亲水性蛋白,其相对分子质量为37.56×10~3,等电点为5.11,存在1个跨膜区。肺炎链球菌spr1759蛋白属于LytR_cpsA_psr超家族,可能具有阴离子细胞壁多聚物合成相关酶的功能。与其他细菌蛋白比对发现,该蛋白与炭疽芽孢杆菌BAS5115蛋白和枯草芽孢杆菌DJ97_1211具有相似的跨膜结构域,均含有1跨膜结构;肺炎链球菌spr1759蛋白与炭疽芽孢杆菌BAS5115蛋白和枯草芽孢杆菌DJ97_1211蛋白氨基酸序列具有较高同源性,全长序列相似性分别为35.7%和32.5%。结论肺炎链球菌LytR蛋白是具有跨膜结构的亲水性蛋白,可能具有阴离子细胞壁多聚物合成相关酶学功能。

关键词：肺炎链球菌属肺炎链球菌 LytR蛋白生物学信息学分析

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脓肿分枝杆菌非溶血性磷脂酶C蛋白MAB_0555基因克隆测序及生物信息学分析

引用

中国微生态学杂志 2012年第5期24卷 405-409页

作者：王志刚杨致邦董蕾杜祎石中全邓西川重庆医科大学神经科学研究中心重庆400016 重庆医科大学基础医学实验教学中心病原生物学与免疫学实验室重庆400016 南阳市方城县人民医院妇科河南方城473200

目的克隆脓肿分枝杆菌(Mycobacterium abscessus,***)非溶血性磷脂酶C基因MAB_0555,并对其测序以及生物信息学分析,为进一步研究其生物学功能及其在脓肿分枝杆菌致病机制中的作用提供基础。方法以脓肿分枝杆菌基因组DNA为模板,PCR扩增... 详细信息

目的克隆脓肿分枝杆菌(Mycobacterium abscessus,***)非溶血性磷脂酶C基因MAB_0555,并对其测序以及生物信息学分析,为进一步研究其生物学功能及其在脓肿分枝杆菌致病机制中的作用提供基础。方法以脓肿分枝杆菌基因组DNA为模板,PCR扩增非溶血性磷脂酶C的基因片段,克隆入pQE-30质粒,构建重组原核表达载体pQE-30-MAB_0555,将其转化入大肠埃希菌DH5α,并进行序列测定及利用生物信息学软件DNAstar 5.0分析其生物学特性。结果 PCR扩增获得长1440 bp的MAB_0555基因片段,编码479个氨基酸,DNAstar等软件预测其蛋白质相对分子量(Mr)约为53 kD,并显示出具有良好的抗原性。结论成功获得序列正确的脓肿分枝杆菌MAB-0555基因,为其重组蛋白的表达及其相关研究奠定基础。

关键词：脓肿分枝杆菌 MAB-0555基因克隆序列测定生物学信息学分析

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胸膜肺炎放线杆菌血清3型与5型菌株基因组特征序列筛选与分析

胸膜肺炎放线杆菌血清3型与5型菌株基因组特征序列筛选与分析

引用

中国畜牧兽医学会生物制品学分会中国微生物学会兽医微生物学专业委员会2010年学术年会（第三届中国兽药大会学术论坛）

作者：杨峰雷连成吉林大学畜牧兽医学院

猪传染性胸膜肺炎(porcine infectious pleuropneumonia)是由胸膜肺炎放线杆菌(Actinobacilluspleuropneumoniae APP)引起的猪的高度致死性呼吸道传染病。APP血清型多达15个,由于缺乏对主要血清型特征基因的了解,使猪传染性胸膜肺炎的... 详细信息

猪传染性胸膜肺炎(porcine infectious pleuropneumonia)是由胸膜肺炎放线杆菌(Actinobacilluspleuropneumoniae APP)引起的猪的高度致死性呼吸道传染病。APP血清型多达15个,由于缺乏对主要血清型特征基因的了解,使猪传染性胸膜肺炎的诊断分型、发病机理研究、多价疫苗研究受到阻碍,目前已完成APP3型、5型菌株的基因组测序,利用信息学技术比较基因组序列已成为可能。本论文应用基因组序列比对软件GenomeComp对APP毒力较弱的3型(NC 010278)和APP毒力最强的5型(NC 009053)的全基因组进行了序列比较,共筛选出长度大于50bp的差异基因片段APP3型71处,APP5型75处,其中L20特有的基因84条共编码43个已知蛋白,其中包括与Apx毒素、荚膜多糖、脂多糖等毒力因子相关的基因,41条基因片段功能未知。其中JL03特有的基因57条,共编码32种已知蛋白,其中包括与APX毒素、溶血素、脂多糖、荚膜多糖、转铁结合蛋白等毒力因子相关的基因,25条基因片段功能未知。结果表明利用生物信息学软件对不同的基因组进行比较,是了解不同血清型菌株的特征差异序列的有效方法,这些差异基因的获得为APP分型诊断、致病机理和免疫应答研究奠定了基础。

关键词：胸膜肺炎放线杆菌生物学信息学分析差异基因

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