检索结果-内蒙古大学图书馆

作者：梅琮麟东南大学

学位级别：硕士

肠道菌群是人体肠道中所寄居的微生物群落,包括细菌、真菌、病毒等多种微生物。近年来的研究表明,肠道菌群与炎症性肠炎、糖尿病、抑郁症、结直肠癌等多种疾病密切相关。随着宏基因测序技术的发展,大量种级别的肠道菌群丰度数据被整理... 详细信息

肠道菌群是人体肠道中所寄居的微生物群落,包括细菌、真菌、病毒等多种微生物。近年来的研究表明,肠道菌群与炎症性肠炎、糖尿病、抑郁症、结直肠癌等多种疾病密切相关。随着宏基因测序技术的发展,大量种级别的肠道菌群丰度数据被整理和收录,为找寻疾病生物标志物和模型构建提供基础。当前针对基于肠道菌群的疾病标志物发现和疾病预测模型构建大都使用菌种丰度数据,而丰度数据的组成性质致使其可以构成新的疾病关联特征。因此可以寻找新的疾病关联特征进一步研究肠道菌群与疾病的关系。目前研究人员在这一领域开发了多种数据库和模型平台供研究者使用,但未采用多种算法融合改进模型性能,并且功能上缺少对数据的转换以及描述性统计。因此,本课题将围绕新的疾病标志物、模型性能改进、平台功能完善等方面进行探究来设计并开发一套基于肠道菌群的疾病生物标志物数据库及预测模型平台。本课题主要包含3部分: 1、本文设计了一套基于肠道菌群的疾病生物标志物发现方法并利用该方法发现了新的疾病关联菌种。首先,收集GMrepo数据库的疾病项目数据集,进行组内低流行度过滤获得本次实验关注的菌种。接着,通过菌种丰度数据使用DBA方法寻找菌种平衡并据此进行ILR变换获得菌种平衡数据。最后,分析疾病与菌种平衡的相关性并结合外部证据推导新的疾病生物标志物。结果证明本方法是可靠的,并且在种水平上发现了两组新的疾病与菌种关联,分别是溃疡性肠炎和Coprococcus ***55/1与肥胖和Lachnospira eligens。 2、本文基于肠道菌群构建了8种疾病的预测模型,并对模型的性能优化提出了改进方案。首先,比较上述方法发现的菌种丰度和菌种平衡两种特征在不同机器学习算法下的分类效果,发现菌种平衡特征的效果更优。然后,使用菌种平衡特征构建LR、RF和SVM模型并进行优化。接着,计算这3类模型AUC值的权重并加权融合形成新模型。最后,比较本文新模型与其他模型对不同疾病的分类性能,发现该模型在性能上具有一定的优势。此外,本文还对模型进行可解释性分析,说明模型的可信度。 3、基于上述的工作进行归纳整理,本文设计并实现了一个包含疾病生物标志物数据库和疾病预测模型平台的系统。本文经过系统需求分析、系统设计、系统实现和系统测试等步骤搭建系统。并且相较于其他平台,除了模型性能表现更优,还添加了数据转换和数据描述性统计功能,表现更为全面。

关键词：肠道菌群疾病生物标志物机器学习数据库模型平台

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智能手机微孔板分析仪的开发与疾病生物标志物的快速定量检测

智能手机微孔板分析仪的开发与疾病生物标志物的快速定量检测

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作者：晁晓欣太原理工大学

学位级别：硕士

酶联免疫吸附测定法(ELISA)是将抗原-抗体的免疫反应与酶的催化反应相结合的快速检测方法,是临床上检测疾病生物标志物的常用方法,该方法是在96微孔板中进行高通量生化反应。酶标仪是分析微孔板中ELISA反应结果的专业仪器,它是一种光谱... 详细信息

酶联免疫吸附测定法(ELISA)是将抗原-抗体的免疫反应与酶的催化反应相结合的快速检测方法,是临床上检测疾病生物标志物的常用方法,该方法是在96微孔板中进行高通量生化反应。酶标仪是分析微孔板中ELISA反应结果的专业仪器,它是一种光谱分析仪器,内部包含精密的光学元件和复杂的光路,其体积大、价格昂贵、操作复杂且数据分析依赖于电脑,难以应用到现场快速检测中。随着智能手机的不断普及及其性能的快速提升,基于智能手机的分析检测仪器数量逐年增加,这些仪器具有轻量便携、价格低廉和操作简单的优点,有望在疾病现场快速检测中得到广泛应用。本文利用智能手机作为分析检测工具,结合96微孔板开发了一种便携式智能手机微孔板分析仪。首次提出设计大口径聚焦透镜解决智能手机无法对96微孔板全范围准确成像的问题,在此基础上设计制作了光学装置,结合编写的智能手机应用程序对样品进行自动比色分析。开发的分析仪可以实现生物分子的高通量快速定量检测,有望应用于临床中疾病生物标志物的快速检测。本文主要研究内容如下:1.在研究了手机摄像头成像原理和成像光路后,提出设计制作大孔径聚焦透镜实现智能手机摄像头对96微孔板全范围准确成像。研究开发了基于智能手机的微孔板分析仪,其包括设计的便携式光学装置和编写的智能手机应用程序,可对微孔板中待测样品进行自动比色分析。2.利用开发的分析仪实现了人血清白蛋白(HSA)的高通量快速定量检测。对病人血清样品中HSA的检测结果与医院使用的全自动生化分析仪检测结果一致,其检测范围为21.45～60.06 g/L,完全可以满足临床中检测的需求。3.利用开发的分析仪实现了新生儿感染性疾病的生物标志物C-反应蛋白(CRP)、血清淀粉样蛋白(SAA)和降钙素原(PCT)的联合快速检测。分析仪对三项指标的检测范围分别是150～2400μg/L,50～800μg/L和75～1200 ng/L,对病人血清样品中三种标志物的检测结果与酶标仪检测结果具有良好的一致性,可用于临床中对三种生物标志物的联合快速检测。

关键词：数字比色 96微孔板智能手机APP 疾病生物标志物

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疾病生物标志物高灵敏检测新方法研究

疾病生物标志物高灵敏检测新方法研究

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作者：丁世家程伟李剑波鞠熀先颜玉蓉重庆医科大学

该项目基于疾病早期诊断和临床检验诊断学发展需求，通过探索多种信号转化放大新策略，研究发展了一系列针对不同类型生物标志物检测的新原理，建立了一系列高灵敏分析新方法，用于简单快速高效的检测多种生物标志物。取得如下成果： ... 详细信息

标准号: 1700670010

该项目基于疾病早期诊断和临床检验诊断学发展需求，通过探索多种信号转化放大新策略，研究发展了一系列针对不同类型生物标志物检测的新原理，建立了一系列高灵敏分析新方法，用于简单快速高效的检测多种生物标志物。取得如下成果：创新性建立多种基于核酸等温扩增和多功能纳米探针的信号转化放大新策略，发展蛋白质超灵敏定量分析新技术，用于临床重要蛋白类生物标志物的简单、快速、超灵敏检测。研发一系列病原微生物致病基因快速、高灵敏分子诊断新方法，大大缩短了病原微生物的检测周期，为致病菌的快速、高灵敏分子诊断提供了简单实用性的新方法。通过设计一种新颖的纳米复合物构建电化学细胞传感器，首次实现了完整活细胞表面聚糖的电化学定量评估。为研究细胞表面聚糖与肿瘤发生发展关系提供了新的分析策略。整合核酸适体、核酸等温扩增和电化学传感技术，发展多种小分子标志物高灵敏电化学传感新方法，用于毒品和药物的快速、现场、高灵敏定量检测。一系列创新性研究成果为疾病相关生物标志物的高灵敏检测提供了有效的手段，为临床疾病早期诊断提供新的技术支持。该系列成果共发表SCI论文25篇，用于申报所列的20篇文章中，影响因子＞5分以上8篇，该项目发表的研究成果得到国内外学术界的高度认可，总引用次数达632次，他引总次数为532次。得到了Chem. Rev.(IF47.93)、ACCOUNTS CHEM. RES.( IF22.0)、Trends Anal. Chem.(IF8.44)等一流期刊的大量正面引用评价。如：中科院上海应用物理所范春海教授在其综述(Chem. Rev.，2015，115，12491)中引用该项目四篇文章，评价课题组建立的级联信号放大策略具有很强的信号放大能力，可用于检测复杂生物基质中低丰度蛋白质。南京大学陈洪渊院士认为课题组设计的细胞传感器能够很好的评估肿瘤细胞表面聚糖表达(Biosens. Bioelectron.2010，25，2045)。美国伊利诺伊大学香槟分校Bailey评价课题组基于核酸等温扩增的信号放大策略极大的提高了检测灵敏度(Anal. Chem.2012，84，793)。加拿大阿尔伯特大学Chris Le教授认为课题组的方法极大的提高了蛋白质检测的灵敏度，并且能够实际应用(Anal. Bioanal. Chem.2010，397，3213)。

关键词：疾病生物标志物临床诊断检测方法

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重大疾病生物标志物传感分析新方法的研究

重大疾病生物标志物传感分析新方法的研究

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作者：漆红兰张成孝高强张睿李延赵灵陕西师范大学

该项目“重大疾病生物标志物传感分析新方法的研究”属于分析化学和生命科学等多学科交叉领域的应用基础研究类项目。在四个国家自然科学基金项目(20775046、20805028、20975065和21275095)的资助下，项目组经过8年系统深入的研究，以... 详细信息

该项目“重大疾病生物标志物传感分析新方法的研究”属于分析化学和生命科学等多学科交叉领域的应用基础研究类项目。在四个国家自然科学基金项目(20775046、20805028、20975065和21275095)的资助下，项目组经过8年系统深入的研究，以建立重大疾病(恶性肿瘤、出血性疾病和自身免疫性疾病等)的特定生物标志物的传感分析新方法为目的，合成了一系列基于新型分子识别物质(寡肽、凝集素、适配体等)的新型电化学发光和电化学探针，创建了一系列信号增强新策略和新方法，建立了一系列高灵敏度高选择性快速检测特定生物标志物(前列腺癌-前列腺特异性抗原、肝癌-甲胎蛋白、艾滋病HIV基因、恶性肿瘤相关蛋白-蛋白激酶和癌胚抗原、出血性疾病-凝血酶等)的电化学发光和电化学生物传感新方法；在通用型信号探针、新型分子识别物质、传感界面构筑、信号增强和多目标物同时检测等方面有多项原始性创新。该研究成果为重大疾病筛查、早期诊断和治疗评价提供了新器件和新方法，对生物传感分析和精准医学分析具有重要的科学意1和应用价值。该项目在此领域的主要学术创新点如下： (1在通用型信号探针设计研究方面，创建了钌联吡啶衍生物标记蛋白A的抗体通用型电化学发光探针新策略，并建立了基于通用型探针和磷酸化作用同时检测多种恶性肿瘤相关蛋白激酶活性的电化学发光传感分析新方法。方法通用性强，解决了多组分检测常用多个信号探针的问题，使用多个目标物质只需要一种信号探针，极大降低了检测成本。 (2)在生物传感模式研究方面，以寡肽、凝集素、适配体等为分子识别物质，创建了基于可被生物切割的新型电化学发光探针和基于糖簇效应增加探针亲合型新策略，建立了检测前列腺癌、原发性肝癌等恶性肿瘤生物标志物的电化学发光和电化学传感分析新方法，极大地提高了方法的选择性和灵敏度，拓展了生物分析应用范围。 (3)在传感界面构筑方法研究方面，创建了电聚合与共价鍵合固定化、电化学重氮盐和电化学点击反应的双电化学共价鍵合固定化的构筑新策略，建立了检测恶性肿瘤、自身免疫性疾病的电化学分析新方法，极大提高了传感器的稳定性和再生能力，避免了电极之间的交叉干扰。 (4)在信号增强策略研究方面，创建了基于纳米材料信号增强和超夹心杂交生物信号增强新策略，建立了检测出血性疾病生物标志物-凝血酶和艾滋病HIV基因的电化学发光分析新方法，大大提高了方法的灵敏度。 8篇代表性论文发表在分析化学极具国际影响力的SCI主流期刊，包括Analytical Chemistry(2篇)、Biosensors and Bioelectronics(1篇)、Sensors and Actuators B(2篇)和AnalyticaChimicaActa(1篇)等，均在SCI源刊二区以上。该成果论文发表后得到国内外同行专家的高度评价和广泛引用，截止2019年6月11日，8篇SCI代表作共他引140次(来自Web of Science所有数据库)，SCI他引126次，单篇论文记录的他人引用次数最多为37次。引用论文的国外学术刊物有：Chemical Reviews、Analytical Chemistry、Biosensors and Bioelectronics、ACS Applied Materials & Interfaces、Chemical Communications、Nano Today、ACS Catalysis、ACS Nano、Electrochimica Acta等30余种SCI源期刊。该成果项目完成过程中，培养了1名博士后，3名博士研究生和10余名硕士研究生；成果完成人中漆红兰、高强和李延，已晋升为教授。成果第一完成人漆红兰教授2013年被评为陕西省青年科技新星，2015年获得国家自然科学基金优秀青年基金项目，2016年获得陕西省化学会优秀青年奖，2018年获陕西省科技标兵称号，2019年被评为陕西省百名优秀科技新星。成果第五完成人李延2012年被评为陕西省青年科技新星。

关键词：疾病生物标志物传感分析方法电化学探针

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循环miRNA生物标志物的鉴定及诊断试剂盒研发

循环miRNA生物标志物的鉴定及诊断试剂盒研发

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作者：张辰宇1 陈熹1 巴一2 张春妮3 张峻峰1 管丹萍南京大学1 天津市肿瘤医院2 中国人民解放军东部战区总医院3 江苏命码生物科技有限公司4

生物医药领域的原创性发现和基础研究的突破，是产生并发明核心技术与方法的重要基础。该项目“循环miRNA生物标志物的鉴定及诊断试剂盒研发”系列核心技术的发明就是在“循环miRNA”发现基础上，在“循环miRNA是疾病的分子标志物”原... 详细信息

标准号: 2000010661

生物医药领域的原创性发现和基础研究的突破，是产生并发明核心技术与方法的重要基础。该项目“循环miRNA生物标志物的鉴定及诊断试剂盒研发”系列核心技术的发明就是在“循环miRNA”发现基础上，在“循环miRNA是疾病的分子标志物”原创性理论指导下产生的。在经典生物化学概念中，由于血淸/血浆等细胞外环境下存在高浓度RNA水解酶，RNA不能完整、稳定地存在，只存在无生物学功能和意义的核酸降解碎片。2007年，该项目组在国际上率先发现：动物和人的血清/血浆等体液中稳定存在完整的、高浓度、种类众多的miRNA，并能对抗酸、反复冻融及酶的降解。循环miRNA具有不同于经典RNA的理化特性，这个发现突破了生物化学的传统观念，开辟了“细胞外RNA”研宄和应用新领域。在分析2000余种循环miRNA在不同疾病中的表达谱后，发现疾病状态下循环miRNA存在特异性变化模式，提出“循环miRNA是疾病分子标志物”的理论观点。基于这个发现和相关理论研究,该项目组于2007年11月申请了国际上首个“循环miRNA”发明专利和PCT,率先提出了“血清/血浆miRNA”的概念，并发明和建立了一套涵盖循环RNA提取、高通量分析、精准定量的实验方法和技术手段。围绕“循环miRNA生物标志物的鉴定”，38项国际国内发明专利已授权。在10项代表性发明专利中，发明了低浓度循环miRNA深度测序及芯片检测的筛选方法；建立了特定循环miRNA组合的检测应用标准与归一化方法：鉴定并发明了胰腺癌、肝癌、食管癌、胃癌及肺癌的特异性循环miRNA表达谱及其作为生物标志物的筛选、测定、判定标准和方法，在上述发明核心技术的基础上，自主研发了国际上首个将循环miRNA作为生物标志物应用于临床的产品——胰腺癌血淸miRNA诊断试剂盒，准确率达88.05% (I、II期准确率为87.6%)，并于2015年11月获得国家三类医疗器械注册证，为胰腺癌的早期诊断提供了更准确的新手段，获得临床单位普遍认可，2018年签约合同总金额共计4290万美。作为该项目的成果总结，与上述发明专利相关的10篇论文共被CA-Cancer J Clin、Nat Rev Drug Discov等期刊他引4216次；最高单篇他引2684次；7篇论文入选ESI Top 1％高被引论文：国际著名的MIT“Technology Review”为“血清/血浆miRNA是疾病标志物”的发现及发明的检测方法写了专题评论；国内外也有大量跟进研究，迄今关于“循环miRNA”及其应用的SCI综述已有1178篇，国内申请循环miRNA相关专利537项。这些数据均显示出国际国内学术界、产业界对该项目科学发现和理论及由此产生的发明技术的认可。项目完成人多次受邀撰写循环miRNA相关专题评述、研究前瞻及书籍，并多次被国际会议邀请作大会报告：同时通过科技部“973”项目“循环miRNA生物学功能及临床应用”等项目的立项和执行，带动了国际国内“循环miRNA”领域的相关研究。

关键词：疾病生物标志物鉴定方法诊断试剂盒

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蛋白质组学和代谢组学在间质性肺疾病研究中的应用

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徐州医科大学学报 2024年第5期44卷 385-390页

作者：奚斌孟晓张露刘文文陈碧徐州医科大学附属医院呼吸与危重症医学科江苏徐州221002

间质性肺疾病是一类异质性疾病,以炎症浸润、纤维化、细胞增殖等病理变化累及肺间质为共同特征。该病的临床病因目前尚未完全明确,尤其是在急性加重期,患者的预后往往较差。蛋白质组学和代谢组学联合使用,有希望成为筛选间质性肺疾病新... 详细信息

间质性肺疾病是一类异质性疾病,以炎症浸润、纤维化、细胞增殖等病理变化累及肺间质为共同特征。该病的临床病因目前尚未完全明确,尤其是在急性加重期,患者的预后往往较差。蛋白质组学和代谢组学联合使用,有希望成为筛选间质性肺疾病新型生物标志物的有力工具。本文综述了蛋白质组学和代谢组学技术在间质性肺疾病研究中的应用,以期明确当前的研究现状,并对未来的研究方向进行展望。

关键词：间质性肺疾病蛋白质组学代谢组学疾病生物标志物发病机制代谢途径

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肺癌早期诊治技术创新与应用

肺癌早期诊治技术创新与应用

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作者：张永奎陈志军乐涵波王善军续力云曹捍波竺王玉王和浙江省舟山医院

肺癌是全球范围内发病率和死亡率位居首位的恶性肿瘤。然而，据最新的Cancer Statistics数据显示，肺癌整体的5年生存率仍只有18％，晚期肺癌仅4％，这与肺癌患者发现已是晚期有关。因此，早期诊断，早期治疗是提高肺癌患者生存率的根... 详细信息

肺癌是全球范围内发病率和死亡率位居首位的恶性肿瘤。然而，据最新的Cancer Statistics数据显示，肺癌整体的5年生存率仍只有18％，晚期肺癌仅4％，这与肺癌患者发现已是晚期有关。因此，早期诊断，早期治疗是提高肺癌患者生存率的根本，寻找有效的早期诊断和早期治疗手段是肺癌研究的热点。该项目在卫生部科学研究基金-浙江省医药卫生重大科技计划、浙江省科技重大项目基金等多项科研计划资助下，组建了由胸外科、放射诊断中心、病理科、实验室、呼吸科等联合的多学科肺癌诊治创新团队，以肺癌的早期诊断技术为出发点，结合临床流行病学调查、疾病生物标志物、微创手术创新和综合治疗体系的建立等问题开展了系列创新性研究，通过查新机构检索，该项目具有多项创新点：(1)从海岛肺癌流行病学调查着手，建立了具有海岛特色的肺癌流行病学数据库；(2)开展微小肺癌早期诊断研究，建立基于CT三维重建技术的肺结节诊断模型；通过影像-病理对照研究，建立基于“肺泡塌陷”的原位腺癌诊断模型，综合诊断手段使肺小结节的术前诊断准确率达到92.1％；(3)临床应用中药蟾蝓保元汤和DC-CIK细胞免疫治疗，有效提高患者免疫功能，改善患者生活质量；(4)发现外周血清miRNAs结合手术前CT征象可鉴别诊断非侵袭性和侵袭性肺腺癌，为早期肺小结节的诊断提供了重要的实验室依据；(5)自主创新研发术中即时的体表肺结节定位法及肺表面解剖定位法。所有项目均按时完成，并达到技术指标要求。技术指标：1)项目共发表相关论文76篇，其中重要代表性SCI学术论文11篇，总影响因子为20.376，总他引205次；2)获授权发明专利1项，实用新型专利8项；3)开展技术推广培训9场(其中国家级继续教育项目4项)，参会人次近千人，学员遍及全国11省份；5)建有共有500人参与的舟山肺癌多学科中心微信群，群成员遍布全国各地，在网上在线授课54次；6)项目建设研究成果多次在浙江日报、舟山日报、舟山晚报等各种媒体报道，吸引各级医院前来参观学习，其中包括国内知名三级甲等医院；7)项目研究成果在国内4个省，5家单位推广应用，受益患者千余人次，提高肺小结节早期诊断准确率，提高肺癌精准诊断和治疗水平，推动了地市级医院肺癌诊治技术的进步，树立了“国内多学科交叉、协同创新的地市级医院肺癌诊治研究模式的典范”。

关键词：肺癌流行病学调查疾病生物标志物肿瘤治疗

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