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文字说明：

T=题名（书名、题名），A=作者（责任者），K=主题词，P=出版物名称，PU=出版社名称，O=机构（作者单位、学位授予单位、专利申请人），L=中图分类号，C=学科分类号，U=全部字段，Y=年（出版发行年、学位年度、标准发布年）

检索规则说明：

AND代表“并且”；OR代表“或者”；NOT代表“不包含”；(注意必须大写,运算符两边需空一格)

检索范例：

范例一：(K=图书馆学 OR K=情报学) AND A=范并思 AND Y=1982-2016
范例二：P=计算机应用与软件 AND (U=C++ OR U=Basic) NOT K=Visual AND Y=2011-2016

分类表

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文献类型

67 篇 专利
1 篇 学位论文

馆藏范围

68 篇 电子文献
0 种 纸本馆藏

日期分布

学科分类号

1 篇 医学
- 1 篇 临床医学

主题

1 篇 癌症样本
1 篇 临床生存结果
1 篇 基因集
1 篇 r软件包
1 篇 基因表达谱

机构

4 篇 天津橡鑫医疗器械...
4 篇 天津橡鑫生物科技...
4 篇 西安电子科技大学
4 篇 北京橡鑫生物科技...
4 篇 武汉艾米森生命科...
4 篇 北京谷海天目生物...
3 篇 哈尔滨工业大学
2 篇 上海芯超生物科技...
2 篇 深圳华大基因股份...
2 篇 西安交通大学
2 篇 江苏省原子医学研...
2 篇 上海仁东医学检验...
2 篇 凯斯西储大学
2 篇 安徽大学
2 篇 西北工业大学
2 篇 皇家飞利浦有限公...
2 篇 深圳吉因加医学检...
2 篇 苏州唯善生物科技...
2 篇 南开大学
2 篇 杭州医学院

作者

4 篇 秦钧
4 篇 曹善柏
4 篇 李恺
4 篇 孙宏
4 篇 刘明伟
4 篇 楼峰
4 篇 宋雷
4 篇 习佳宁
4 篇 汪宜
4 篇 赵国栋
4 篇 周涛
4 篇 袁细国
4 篇 刘磊
3 篇 蔡迪
3 篇 郭洪
3 篇 陶祥
2 篇 王东
2 篇 王孝举
2 篇 黄萌
2 篇 苏倚晴

语言

68 篇 中文

检索条件"主题词=癌症样本"

共 68 条记录，以下是1-10 订阅

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详细简洁

排序：

一个找出分类癌症样本并和临床生存结果有关的基因集的R软件包

一个找出分类癌症样本并和临床生存结果有关的基因集的R软件包

引用

作者：孔华磊上海交通大学

学位级别：硕士

从基因表达水平的角度对癌症样本进行分类，与传统的组织病理学分类癌症样本相比，其较高的临床预测能力已经获得越来越广泛的关注。根据癌症样本的基因表达谱发现某些基因的集合（称为基因集）可以显著区分不同癌症样本的基因表达谱并... 详细信息

从基因表达水平的角度对癌症样本进行分类，与传统的组织病理学分类癌症样本相比，其较高的临床预测能力已经获得越来越广泛的关注。根据癌症样本的基因表达谱发现某些基因的集合（称为基因集）可以显著区分不同癌症样本的基因表达谱并与癌症病人的临床结果有关。但是，目前尚未有一种灵活的，完整的且容易使用的工具帮助生物学家找到能够分类癌症样本的基因集。本文构建一个R包：CAsubtype，能够有效的找出分类癌症样本且能区分不同癌症病人临床生存结果的基因集。首先，CAsubtype从多达13000个基因集中选择能够分类癌症样本的基因集，并从TCGA数据库中下载10种癌症共计2000多个癌症样本，包括癌症样本的基因表达谱和临床生存结果。CAsubtype根据基因集（用户自己提供或从CAsubtype包中下载）对癌症样本进行主成分分析，选择前几个主成分方差百分比较高，统计学上显著且能最大程度的解释癌症样本的不同的基因集。根据选择的基因集，通过K-均值或结构层次聚类分析聚类癌症样本，并在2维或三维坐标下观察癌症样本的分布。最终，比较聚类成不同亚型的癌症病人的临床生存结果。对选出的生存结果显著的基因集，其分类成不同亚型的癌症病人可能在临床医学诊断中具有重要意义。综上所述，CAsubtype是一个灵活且完整的R包，通过提供简单的R程序操作和完整的数据，即可以帮助生物学家有效的检测给定基因集分类癌症样本的能力，同时也可以找出能显著分类癌症样本并区分不同病人临床生存结果的基因集，使得生物学家可以进一步从生物学和临床医学的角度检验基因集的功能。

关键词：癌症样本基因表达谱基因集 R软件包临床生存结果

来源：评论

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用于计算癌症样本纯度和染色体倍性的方法和装置

用于计算癌症样本纯度和染色体倍性的方法和装置

引用

作者：黄宇罗志辉苏瑶范新平 201203 上海市浦东新区张江祖冲之路555号

本发明提供了一种全自动、高效率、高准确性的计算癌症样本纯度和染色体倍性的方法和装置。通过本发明提供的层次混合高斯模型，实现了对癌症样本纯度和染色体倍性的快速和准确计算，节约了纯度估算的时间和经济成本，同时提高了计算结... 详细信息

标准号: CN108804876A

本发明提供了一种全自动、高效率、高准确性的计算癌症样本纯度和染色体倍性的方法和装置。通过本发明提供的层次混合高斯模型，实现了对癌症样本纯度和染色体倍性的快速和准确计算，节约了纯度估算的时间和经济成本，同时提高了计算结果的准确性。本发明在癌症样本纯度和染色体倍性计算上具有广阔的运用前景。

关键词：染色体倍性癌症样本混合高斯模型方法和装置经济成本高效率估算节约

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用于计算癌症样本纯度和染色体倍性的方法和装置

用于计算癌症样本纯度和染色体倍性的方法和装置

引用

作者：黄宇罗志辉苏瑶范新平 201203 上海市浦东新区张江祖冲之路555号

标准号: CN108804876B

关键词：染色体倍性癌症样本混合高斯模型方法和装置经济成本高效率估算节约

来源：评论

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一种个体癌症样本的生物标记物识别方法

一种个体癌症样本的生物标记物识别方法

引用

作者：李杰王东王亚东 150001 黑龙江省哈尔滨市南岗区西大直街92号

本发明是一种个体癌症样本的生物标记物识别方法。本发明先基于两种不同表型的样本数据确定差异表达基因成分，如基因，蛋白质等分子化合物，选取出q个差异表达成分；基于选取的q个差异表达成分，获得平均样本。本发明构建基于平均样本... 详细信息

标准号: CN110675917A

本发明是一种个体癌症样本的生物标记物识别方法。本发明先基于两种不同表型的样本数据确定差异表达基因成分，如基因，蛋白质等分子化合物，选取出q个差异表达成分；基于选取的q个差异表达成分，获得平均样本。本发明构建基于平均样本和单体样本的回归模型，对样本进行回归预测，得到样本回归预测的结果；基于样本回归预测的结果和差异表达成分，确定单样本的生物标记。本发明可以针对不同的个体样本选出差异化的生物标记物。

关键词：样本差异表达生物标记物回归预测差异表达基因分子化合物癌症样本个体样本回归模型生物标记样本数据差异化表型构建蛋白质基因

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用于癌症样本miRNA测序定量结果评价的试剂、制备方法和应用

用于癌症样本miRNA测序定量结果评价的试剂、制备方法和应用

引用

作者：宗亮丁芬姚秋林田志坚唐美芳 518083 广东省深圳市盐田区洪安三街21号华大综合园7栋7层-14层

本申请公开了一种用于癌症样本miRNA测序定量结果评价的试剂及其制备方法和应用。本申请的试剂包括SEQ ID NO.1至SEQ ID NO.8所示序列的RNA中的至少一种。本申请的试剂，将其定量的加入待测RNA样品中，并通过测序定量分析所加入的试剂... 详细信息

标准号: CN108707663B

本申请公开了一种用于癌症样本miRNA测序定量结果评价的试剂及其制备方法和应用。本申请的试剂包括SEQ ID NO.1至SEQ ID NO.8所示序列的RNA中的至少一种。本申请的试剂，将其定量的加入待测RNA样品中，并通过测序定量分析所加入的试剂的量，将定量分析结果与实际加入量进行比较，以此评价整个miRNA测序定量结果的准确性和可靠性；该方法简便、易用，能够有效的评价miRNA测序定量结果的可信度。本申请的试剂各方面特性都与真实的miRNA十分接近，因此，采用本申请的试剂能够更真实、准确、可靠的反映人源miRNA测序定量结果的实际情况，从而对癌症样本miRNA测序定量结果作出更准确、可靠的评价。

关键词：测序定量结果申请癌症样本制备方法和应用定量分析结果定量分析人源miRNA 可信度

来源：评论

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用于癌症样本miRNA测序定量结果评价的试剂、制备方法和应用

用于癌症样本miRNA测序定量结果评价的试剂、制备方法和应用

引用

作者：宗亮丁芬姚秋林田志坚唐美芳 518083 广东省深圳市盐田区洪安三街21号华大综合园7栋7层-14层

标准号: CN108707663A

关键词：测序定量结果申请癌症样本制备方法和应用定量分析结果定量分析人源miRNA 可信度

来源：评论

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一种个体癌症样本的生物标记物识别方法

一种个体癌症样本的生物标记物识别方法

引用

作者：李杰王东王亚东 150001 黑龙江省哈尔滨市南岗区西大直街92号

本发明是一种个体癌症样本的生物标记物识别方法。本发明先基于两种不同表型的样本数据确定差异表达基因成分，如基因、蛋白质等分子化合物，选取出q个差异表达成分；基于选取的q个差异表达成分，获得平均样本。本发明构建基于平均样本... 详细信息

标准号: CN110675917B

本发明是一种个体癌症样本的生物标记物识别方法。本发明先基于两种不同表型的样本数据确定差异表达基因成分，如基因、蛋白质等分子化合物，选取出q个差异表达成分；基于选取的q个差异表达成分，获得平均样本。本发明构建基于平均样本和单体样本的回归模型，对样本进行回归预测，得到样本回归预测的结果；基于样本回归预测的结果和差异表达成分，确定单样本的生物标记。本发明可以针对不同的个体样本选出差异化的生物标记物。

关键词：样本差异表达生物标记物回归预测差异表达基因分子化合物癌症样本个体样本回归模型生物标记样本数据差异化表型构建蛋白质基因

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用于识别功能性患者特异性体细胞畸变的整合方法和系统

用于识别功能性患者特异性体细胞畸变的整合方法和系统

引用

作者： A·拉齐 V·瓦拉达恩 N·迪米特罗娃 N·班纳吉荷兰艾恩德霍芬

公开了一种系统和方法，其用于通过将癌症样本中的多组学测量结果与团体策划的生物通路进行整合来确定体细胞突变和基因组畸变对下游细胞过程的功能影响。所述方法包括以下步骤：从良好策划的生物通路来源提取生物通路信息；使用所述通... 详细信息

标准号: CN108292326B

公开了一种系统和方法，其用于通过将癌症样本中的多组学测量结果与团体策划的生物通路进行整合来确定体细胞突变和基因组畸变对下游细胞过程的功能影响。所述方法包括以下步骤：从良好策划的生物通路来源提取生物通路信息；使用所述通路信息来生成针对每个感兴趣基因的上游调控亲本子网络树；整合针对癌症样本和正常样本两者的基于测量的组学数据，以基于所述基因的表观遗传学信息和调控网络状态来确定针对每个基因表达水平的非线性函数；使用所述非线性函数来预测基因表达水平，并且将激活评分和一致性评分与输入的患者特异性基因表达数据进行比较；并且使用患者特异性基因表达预测来识别个体患者样本中基因表达水平与预期水平的显著偏差和不一致性，以识别在提供与癌症和癌症处置相关的预测信息中的潜在的生物标志物。

关键词：基因表达水平生物通路特异性基因表达非线性函数癌症样本整合组学癌症表观遗传学生物标志物不一致性功能影响患者样本通路信息网络状态下游细胞预测信息正常样本基因基因组潜在的体细胞子网络调控畸变预测亲本突变测量激活上游团体

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一种基于尿液进行前列腺癌早期筛查模型的构建方法、筛查模型及试剂盒

一种基于尿液进行前列腺癌早期筛查模型的构建方法、筛查模型及试...

引用

作者：曹善柏丁峰刘磊孙宏周涛王旺楼峰 102600 北京市大兴区北京经济技术开发区科创十三街18号院5号楼16层1601

本申请涉及生物技术的技术领域，具体公开了一种基于尿液进行前列腺癌早期筛查模型的构建方法、筛查模型及试剂盒。该构建方法具体包括：提取健康样本和癌症样本的尿液并测序，获得测序结果；对所述测序结果进行分析，获得所述健康样本... 详细信息

标准号: CN114743593A

本申请涉及生物技术的技术领域，具体公开了一种基于尿液进行前列腺癌早期筛查模型的构建方法、筛查模型及试剂盒。该构建方法具体包括：提取健康样本和癌症样本的尿液并测序，获得测序结果；对所述测序结果进行分析，获得所述健康样本和癌症样本的前列腺癌相关突变marker；所述前列腺癌相关突变marker包括CNV事件、motif类型、片段分布特征、甲基化特征；将所述前列腺癌相关突变marker的标志marker数据进行标准化处理，建立前列腺癌早期筛查模型。以及构建的前列腺癌早期筛查模型。本申请提供的筛查模型能够通过非侵入的方法实现高精度的前列腺癌早期筛查。

关键词：前列腺癌早期筛查测序构建突变癌症样本健康样本尿液筛查标准化处理分布特征甲基化侵入的试剂盒申请生物技术分析

来源：评论

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一种膀胱癌早期筛查模型及其构建方法、试剂盒及其使用方法

一种膀胱癌早期筛查模型及其构建方法、试剂盒及其使用方法

引用

作者：楼峰王云凯周涛刘磊朱帅鹏孙宏曹善柏 100176 北京市大兴区北京经济技术开发区科创十三街18号院5号楼16层1601

本申请涉及膀胱癌筛查的技术领域，具体公开了一种膀胱癌早期筛查模型及其构建方法、试剂盒及其使用方法。构建方法包括以下步骤：S1、分别获得健康样本和癌症样本的gDNA测序结果、cfDNA测序结果；S2、根据cfDNA测序结果处理获得SNP/IN... 详细信息

标准号: CN114566285A

本申请涉及膀胱癌筛查的技术领域，具体公开了一种膀胱癌早期筛查模型及其构建方法、试剂盒及其使用方法。构建方法包括以下步骤：S1、分别获得健康样本和癌症样本的gDNA测序结果、cfDNA测序结果；S2、根据cfDNA测序结果处理获得SNP/INDEL特征；以gDNA测序结果处理得到CNV特征；根据SNP/INDEL特征和CNV特征进行分类，绘制ROC曲线；S3、建立膀胱癌早期筛查模型；试剂盒基于该模型进行膀胱癌筛查。本申请的试剂盒具有准确筛查膀胱癌的优点。

关键词：膀胱癌测序试剂盒筛查结果处理早期筛查构建癌症样本健康样本申请绘制分类

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