检索结果-内蒙古大学图书馆

兽类学报 2012年第2期32卷 90-100页

作者：杨帆张立教育部生物多样性与生态工程重点实验室北京师范大学生态研究所

亚洲象是我国国家一级保护动物。本文利用非损伤性取样法,以亚洲象粪便中脱落的肠道上皮细胞为DNA来源,选用线粒体DNA作为分子标记,对分布于我国境内的亚洲象种群的遗传结构和种群遗传多样性进行研究。本研究得到mtDNA序列片段长度为556... 详细信息

亚洲象是我国国家一级保护动物。本文利用非损伤性取样法,以亚洲象粪便中脱落的肠道上皮细胞为DNA来源,选用线粒体DNA作为分子标记,对分布于我国境内的亚洲象种群的遗传结构和种群遗传多样性进行研究。本研究得到mtDNA序列片段长度为556bp,经对178个个体进行扩增结果分析,共得到24个单倍型。在5个地理种群中,除南滚河种群外,其他4个种群中的114个个体共享同一单倍型,南滚河种群与其他种群间未观察到共享单倍型。系统发生分析,观察到中国境内现有亚洲象种群在进化上分为两大分支,α和β。其中分支α中包含除南滚河种群外的4个地理种群,分支β仅含有南滚河种群,表明南滚河种群与其他4个地理种群间存在明显分化。遗传多样性分析结果表明,中国境内的亚洲象种群的遗传多样性水平较低,分析原因认为是栖息地破碎化阻断了种群间有效的基因交流。

关键词：亚洲象种群遗传结构种群遗传多样性线粒体DNA 保护单元显著进化单元

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基于COI基因序列的饰纹姬蛙四川盆地种群遗传多样性

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应用与环境生物学报 2018年第5期24卷 1058-1064页

作者：张梦洁徐亮亮张婧常青王斌朱立峰江建平南京师范大学生命科学学院南京210023 中国科学院成都生物研究所成都610041

饰纹姬蛙（Microhyla fissipes）在中国广泛分布于秦岭以南地区,在四川盆地是常见的两栖动物之一,研究其种群遗传多样性可为当地两栖动物的保护与管理提供重要的遗传基础资料和理论依据.采用线粒体COI基因为分子标记,探讨四川盆地饰纹... 详细信息

饰纹姬蛙（Microhyla fissipes）在中国广泛分布于秦岭以南地区,在四川盆地是常见的两栖动物之一,研究其种群遗传多样性可为当地两栖动物的保护与管理提供重要的遗传基础资料和理论依据.采用线粒体COI基因为分子标记,探讨四川盆地饰纹姬蛙种群遗传多样性及其分化程度、种群历史动态.共采集饰纹姬蛙28个种群354只,成功获得其COI基因618 bps片段序列.分析结果发现17种单倍型,总体单倍型多样性（Hd）为0.166,核苷酸多样性（Pi）为0.000 75,基因流（Nm）为1.60.各种群间固定系数（Fst）和遗传分化系数（Gst）分别为0.270、0.140.中性检验中,Tajima’s D=-2.380,P 〈0.001;Fu’s Fs=-22.169,P 〈0.02,均具有显著性差异;错配分布图呈泊松状的单峰.通过计算得出种群扩张时间约在更新世晚期0.235 Ma BP.上述结果表明,四川盆地饰纹姬蛙种群遗传多样性较低,种群间基因交流水平高,不同种群间遗传分化不明显,并且在历史上有过扩张的现象.

关键词：饰纹姬蛙四川盆地 COI 种群遗传多样性种群扩张

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基于线粒体12S对中国两大山系大熊猫西氏贝蛔虫种群遗传多样性的分析

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兽类学报 2015年第3期35卷 328-335页

作者：谢跃周璇孙韵古小彬杨光友四川农业大学动物医学院达州市达川区动物疫病预防控制中心

大熊猫是中国特有的珍稀濒危物种,而西氏贝蛔虫是大熊猫体内最为常见的肠道寄生虫,对野生和圈养大熊猫危害极大。考虑到大熊猫因分布区域的差异而形成了不同的亚种以及寄生虫与宿主间广泛的协同进化关系,西氏贝蛔虫是否也存在与大熊猫... 详细信息

大熊猫是中国特有的珍稀濒危物种,而西氏贝蛔虫是大熊猫体内最为常见的肠道寄生虫,对野生和圈养大熊猫危害极大。考虑到大熊猫因分布区域的差异而形成了不同的亚种以及寄生虫与宿主间广泛的协同进化关系,西氏贝蛔虫是否也存在与大熊猫相适应的亚种分化一直是野生动物学家极其关注和热议的话题。为此,本文选择中国两大山系(岷山和邛崃)大熊猫种群体内共计34株西氏贝蛔虫虫体样本进行种群遗传多态性研究。利用PCR技术扩增出岷山(14株)和邛崃(20株)西氏贝蛔虫的线粒体12S基因全序列并对其做了遗传多样性分析。结果表明:(1)34个样本包含9个单倍型,呈现出一个高单倍性多样性和低核苷酸多样性的特点;(2)负的Tajima’s D和Fu’s Fs中性检验值及"多峰型"的种群歧点分布图暗示种群不久前曾经历过突增长的现象;(3)低的种群间的分化系数和高的基因流表明两个地理种群间未形成显著的遗传分化;(4)系统发育树和单倍型网络图表明两山系种群分布无区域特异性。因此,岷山和邛崃山系大熊猫体内的西氏贝蛔虫种群遗传变异性较低,分化不明显。该发现不仅暗示了西氏贝蛔虫与其宿主(大熊猫)的进化不同步,而且还为不同区域大熊猫西氏贝蛔虫病的监控提供了理论依据。

关键词：大熊猫西氏贝蛔虫种群遗传多样性线粒体12S 地理位置多态性保护生态学

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基于mtCOI基因序列的我国云南省和缅甸、柬埔寨草地贪夜蛾种群遗传多样性分析

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植物保护学报 2020年第4期47卷 789-796页

作者：李向永尹艳琼 KHIN Thein Nyunt KHAY Sathya 刘莹谌爱东云南省农业科学院农业环境资源研究所昆明650205 缅甸农业、畜牧和灌溉部农业研究司内比都15013 柬埔寨农业研究和发展研究所万象12002

为制定有效的草地贪夜蛾防控措施,分别自缅甸、柬埔寨和我国云南省采集4、2和8个种群共542个草地贪夜蛾样品,基于mtCOI基因序列分析这14个种群的遗传多样性指数、遗传分化系数及基因流。结果表明,缅甸草地贪夜蛾种群的单倍型多样性指数... 详细信息

为制定有效的草地贪夜蛾防控措施,分别自缅甸、柬埔寨和我国云南省采集4、2和8个种群共542个草地贪夜蛾样品,基于mtCOI基因序列分析这14个种群的遗传多样性指数、遗传分化系数及基因流。结果表明,缅甸草地贪夜蛾种群的单倍型多样性指数和平均核苷酸差异数分别介于0.273~0.396和4.643~6.727之间,高于我国云南省的草地贪夜蛾种群,分别介于0.047~0.214和0.791~3.636之间;除ZT种群、LS种群和TO种群外,其它11个种群的Fu’s F均为显著正值,表明缅甸、柬埔寨和我国云南省的草地贪夜蛾种群未经历种群扩张事件;在14个种群中,LS种群与其它种群分化较明显,TK种群、MY种群、CP种群、MS种群和KY种群有效迁入个数和有效迁出个数之和较高,分别为699.41、682.50、855.76、684.56和701.31,推测这5个种群在草地贪夜蛾基因交流中起着类似"中转站"的作用。

关键词：草地贪夜蛾 mtCOI基因种群遗传多样性遗传分化基因流

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大仓鼠种群遗传多样性的季节性变化

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动物学报 2002年第6期48卷 733-740页

作者：汪永庆张知彬王玉山徐来祥王福生曹小平中国科学院动物研究所农业虫鼠害综合治理研究国家重点实验室北京100080

通过随机扩增多态性DNA (RAPD)方法 ,我们对河北省固安县牛驼镇王龙村附近的大仓鼠 (Cricetu lustriton)种群的遗传多样性进行了研究。结果显示 ,在 2 0 9个大仓鼠个体中 (春季 6 0只 ,夏季 4 5只 ,秋季 5 9只 ,冬季 4 5只 )共扩增出 8... 详细信息

通过随机扩增多态性DNA (RAPD)方法 ,我们对河北省固安县牛驼镇王龙村附近的大仓鼠 (Cricetu lustriton)种群的遗传多样性进行了研究。结果显示 ,在 2 0 9个大仓鼠个体中 (春季 6 0只 ,夏季 4 5只 ,秋季 5 9只 ,冬季 4 5只 )共扩增出 87条带 ,其中 86 2 %的条带具有多态性 ;4个季节种群的的遗传组成存在季节变化 ,其多态位点数、多态位点比率、Shannon多样性指数及Nei指数的大小顺序均一致表现为 :秋季种群 <冬季种群<夏季种群 <春季种群 ;秋季种群的遗传多态性最低 ,春季最高 ;遗传多态性与种群密度 (夹捕率 ,%)之间呈极显著的负相关关系。此结果表明遗传因素与大仓鼠种群动态有密切关系 ,但季节间遗传多态的变化不支持Ford假说 ,我们认为增殖和扩散共同决定了季节间遗传多样变化的规律。

关键词：大仓鼠种群遗传多样性季节性变化 RAPD 遗传调节种群动态

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基于AFLP技术的12个蜜蜂种群遗传多样性分析

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中国农业科学 2011年第18期44卷 3877-3885页

作者：张春香张学锋陈廷珠滕跃中刘文忠姜玉锁山西农业大学动物科技学院广东省昆虫研究所山西省养蜂管理站山西省晋中种蜂场

【目的】通过研究中国境内东方蜜蜂不同群体间及其与西方蜜蜂和大蜜蜂间的群体遗传多样性,深入了解蜜蜂种(群)间遗传变异及其分化状况,为蜜蜂种质资源的保护与合理开发利用提供理论依据。【方法】采用AFLP分子标记技术,用19对引物组合... 详细信息

【目的】通过研究中国境内东方蜜蜂不同群体间及其与西方蜜蜂和大蜜蜂间的群体遗传多样性,深入了解蜜蜂种(群)间遗传变异及其分化状况,为蜜蜂种质资源的保护与合理开发利用提供理论依据。【方法】采用AFLP分子标记技术,用19对引物组合对中国10个省市的10个东方蜜蜂群体、1个大蜜蜂群体和1个西方蜜蜂群体共12个群体的基因池DNA进行分析。【结果】蜜蜂种间的遗传相似系数较低,而东方蜜蜂群体间的遗传相似系数较高。东方蜜蜂群体与意大利蜜蜂间的相似系数介于0.2335—0.2823,与大蜜蜂间的介于0.2439—0.2871;大蜜蜂与意大利蜜蜂间为0.2650。东方蜜蜂群体间为0.3639—0.6134。12个种群明显地分为3大分支,西方蜜蜂和大蜜蜂各为一个分支,东方蜜蜂群体为一大分支。东方蜜蜂群体中,吉林和江西的东方蜜蜂各为一分支;其它地区中,南部的海南、福建、广东和云南为一类群,北部的甘肃、山西、北京及南部的四川为一类群。【结论】大蜜蜂、东方蜜蜂和西方蜜蜂3个种群间遗传分化明显。东方蜜蜂群体间的遗传相似系数较高,其中,吉林东方蜜蜂可能为一个独特的生态型。

关键词：蜜蜂基因池 AFLP分析种群遗传多样性

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金沙江河谷地区岩羊种群遗传多样性分析

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四川动物 2014年第3期33卷 342-346页

作者：朱睦楠周材权西华师范大学生命科学学院珍稀动植物研究所西南野生动植物资源保护教育部重点实验室四川省环境科学与生物多样性保护重点实验室四川南充637009

岩羊为国家Ⅱ级保护动物。目前,由于人类活动范围日益扩大,其栖息地遭到了不同程度的破坏,岩羊种群数量和分布范围呈明显下降趋势。为了及时制定科学的保护策略必须了解它们的种群遗传结构。本文以粪便为研究材料,对来自金沙江河谷地区... 详细信息

岩羊为国家Ⅱ级保护动物。目前,由于人类活动范围日益扩大,其栖息地遭到了不同程度的破坏,岩羊种群数量和分布范围呈明显下降趋势。为了及时制定科学的保护策略必须了解它们的种群遗传结构。本文以粪便为研究材料,对来自金沙江河谷地区林线以上岩羊和林线以下矮个子岩羊共4个地理种群的169份有效样品进行线粒体CR全序列分析,共检测出210个变异位点,定义了4种单倍型,单倍型多样性为0.68,核苷酸多样性为0.0242,显示种群整体遗传多样性水平较低。基于最大简约法构建的系统发育树中,金沙江河谷地区的4个地理种群被划分到四川种群的2个亚分支中,但云南曲宗贡的部分岩羊和四川竹巴笼的矮个子岩羊单倍型存在共享现象。根据分子钟计算,林线上下岩羊分化时间在39～32万年前,在中更新世早中期（105～36万年前）气候影响下,导致岩羊在金沙江河谷高低海拔之间相互迁移。对于岩羊在历史上所表现出的潜在迁徙能力,我们建议将白马雪山自然保护区到竹巴笼自然保护区之间的金沙江河谷地区作为岩羊和矮个子岩羊的栖息地整体保护。

关键词：岩羊粪便种群遗传多样性金沙江河谷地区

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内蒙古自治区3个地区布氏田鼠的种群遗传多样性及种群遗传结构研究

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中国媒介生物学及控制杂志 2023年第3期34卷 291-297页

作者：刘雨秋鲁亮刘蓬勃赵宁李贵昌栗冬梅宋秀平王君刘起勇中国疾病预防控制中心传染病预防控制所媒介生物控制室传染病预防控制国家重点实验室北京102206

目的利用16对微卫星引物分析采自内蒙古自治区(内蒙古)3个样地(新巴尔虎右旗、东乌珠穆沁旗和锡林浩特市)共9批布氏田鼠样本群的遗传多样性。方法对2021年5、7、9月采用鼠夹法和鼠笼法采集的275只布氏田鼠用磁珠法提取DNA,用16对荧光标... 详细信息

目的利用16对微卫星引物分析采自内蒙古自治区(内蒙古)3个样地(新巴尔虎右旗、东乌珠穆沁旗和锡林浩特市)共9批布氏田鼠样本群的遗传多样性。方法对2021年5、7、9月采用鼠夹法和鼠笼法采集的275只布氏田鼠用磁珠法提取DNA,用16对荧光标记的微卫星引物做PCR扩增,用GeneMarker软件获取微卫星数据,用GenAIEx 6.5、Arlequin(version 30)、structure 2.3.4等生物信息软件分析布氏田鼠的种群遗传多样性及种群遗传结构。结果16对微卫星引物共检测到472个等位基因,多态信息含量平均值为0.8213,香农信息指数平均值为1.812,观察杂合度波动区间为0.478~0.951,期望杂合度的波动区间为0.575~0.891,聚类分析及主成分分析表明均可以将9个布氏田鼠样本群主要按照月份划分为4个类群,4个类群的遗传多样性指标5月>7月>9月,分子方差分析表明布氏田鼠个体间的变异(88.51%)远大于类群间(5.04%)和种群间(6.45%)的变异。Mantel test结果显示布氏田鼠遗传距离和地理距离无显著相关性(R2=0.0016)。结论此次采集的内蒙古地区布氏田鼠呈较高的遗传多样性,布氏田鼠种群的遗传变异主要存在于个体间,季节变化可能是影响布氏田鼠种群遗传结构的主要因素。

关键词：布氏田鼠微卫星分子标记种群遗传多样性种群遗传结构

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马铃薯甲虫在时空尺度上的种群遗传多样性

马铃薯甲虫在时空尺度上的种群遗传多样性

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作者：刘宁中国科学院大学

学位级别：博士

马铃薯甲虫(Leptinotarsadecemlineata(Say))是著名的世界性入侵害虫，严重危害马铃薯等茄科作物，150多年来该虫从原产地北美扩散到欧洲和亚洲等30多个国家和地区。1993年马铃薯甲虫首次在中国新疆的伊犁和塔城地区发现，近20年来该虫... 详细信息

马铃薯甲虫(Leptinotarsadecemlineata(Say))是著名的世界性入侵害虫，严重危害马铃薯等茄科作物，150多年来该虫从原产地北美扩散到欧洲和亚洲等30多个国家和地区。1993年马铃薯甲虫首次在中国新疆的伊犁和塔城地区发现，近20年来该虫已入侵到新疆38个县市，直接威胁中国马铃薯的生产。为了探索马铃薯甲虫入侵和扩散过程中的遗传变异规律，本研究利用线粒体基因和微卫星标记，从时空水平分析了马铃薯甲虫种群的遗传多样性的变化。实验样本包括2007～2009年采集自美国、法国、俄罗斯、西班牙等国家样品和2003年、2007年和2009年在新疆不同发生地点连续3个年份采集的26个马铃薯甲虫种群。主要研究结果如下：　　(1)在世界范围内，马铃薯甲虫在入侵地的种群遗传多样性明显低于原产地种群。1个原产地种群的36个体中有7个单倍型，8个入侵地种群的117个体仅有1个单倍型;种群等位基因丰富度(Ar)和期望杂合度(He)按照美国>法国/西班牙/俄罗斯>中国的顺序依次降低。在中国新疆范围内，种群间的遗传多样性变化不明显，仅中哈边境的阿勒泰种群(09ALT)的等位基因丰富度Ar和期望杂合度He(4.65和0.62)略高于内陆的木垒种群(09ML，2.71和0.45)。　　(2)在大的时间尺度上(定殖时间6～139年)，马铃薯甲虫种群间的遗传多样性随定殖年份增加而升高，定殖6年的新疆木垒(CML)种群的多样性最低Ar为2.71，He为0.45;定殖137年的美国缅因州(UME)种群的最高，Ar为4.91，He为0.71。在小的时间尺度(定殖时间6～16年)，新疆马铃薯甲虫种群在不同定殖年份间的等位基因丰富度(Ar)和期望杂合度(He)保持稳定，总体变化不明显。　　(3)2003年新疆的马铃薯甲虫种群在遗传上可分为2组，组间遗传差异系数(Fct)为0.02(P=0.02)，2007年和2009年的种群在遗传上均可分为3组，组间遗传差异系数(Fct)分别0.07和0.07(P=0.00)，种群遗传分组数量的变化暗示在新疆至少有2个以上的不同来源的入侵发生，也表明新疆马铃薯甲虫种群从快速扩张阶段进入稳定发生阶段。新疆11个地理种群中，6个种群的遗传组分在2003、2007和2009年均有变化，这些地区可能发生了多次入侵。在2003～2007年阿勒泰和霍城种群的遗传组分和有效种群大小发生明显变化，暗示阿勒泰种群可能有外来虫源的补充，霍城种群可能由于种群发生数量低而受遗传漂变影响。　　(4)2007和2009年，新疆的塔城、乌苏、乌鲁木齐、奇台和木垒种群间的基因交流和遗传相似程度均较高，遗传关系较近，这暗示塔城种群是新疆内陆的主要扩散来源。2007年这些种群间分化系数Fst和基因流Nm分别为0.06和1.59～49.75;2009年为0.04和2.83～372.75，种群间的基因交流频繁，遗传组分逐渐均一。在扩散前沿地区，奇台和木垒种群是多个来源种群的混合，其中木垒种群(09ML)来自塔城(09TC)的概率为0.56，来自乌苏(09WS)的概率为0.62，而自身指定概率为0.54，迁入个体的概率超过了当地定居个体的概率，这暗示种群向扩散前沿的迁移仍在继续。

关键词：马铃薯甲虫微卫星种群遗传多样性遗传结构时空尺度

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黑头酸臭蚁中国大陆与岛屿种群遗传多样性比较研究

黑头酸臭蚁中国大陆与岛屿种群遗传多样性比较研究

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作者：郑春艳华南农业大学

学位级别：硕士

黑头酸臭蚁（Tapinoma melanocephalum）属于昆虫纲膜翅目（Hymenoptera）,蚁科（Formicidae）,臭蚁亚科（Dolichadernae）,是比较常见的家居和农林业害虫。黑头酸臭蚁原产于热带和亚热带地区,借助商业贸易等人为因素扩散至温带地区,对... 详细信息

黑头酸臭蚁（Tapinoma melanocephalum）属于昆虫纲膜翅目（Hymenoptera）,蚁科（Formicidae）,臭蚁亚科（Dolichadernae）,是比较常见的家居和农林业害虫。黑头酸臭蚁原产于热带和亚热带地区,借助商业贸易等人为因素扩散至温带地区,对入侵地的生态系统、人类健康等构成威胁。本研究采用微卫星分子标记技术和线粒体COI基因序列分析（mt DNA COI）探究了中国华南地区6个黑头酸臭蚁大陆种群、5个岛屿种群及蚁群的遗传多样性,揭示了地理隔离对种群及蚁群的遗传多样性差异及遗传分化的影响,为进一步有效控制其危害提供了理论依据。主要研究结果如下:1筛选获得了10对微卫星引物本研究利用第二代测序技术中454GS FLX测序平台成功得到了黑头酸臭蚁的部分基因组信息。经过微卫星位点分离、引物多态性检测,得到了10对能稳定扩增且处于中高等多态性的微卫星引物,为黑头酸臭蚁的种群遗传多样性的研究提供了有效的工具。2比较研究了地理隔离对黑头酸臭蚁种群遗传多样性的影响采用上述10对中的6对多态性的引物（位点）对黑头酸臭蚁的不同地理种群的遗传多样进行分析。Hardy-Weinberg平衡检验结果显示,6个位点中有4个位点显著偏离平衡（P<0.05）。对6个位点进行无效等位基因检测发现,位点loci364具有较高的无效等位基频率。为了避免其对后续结果的评估造成影响,删掉该位点。5对微卫星位点标记11个黑头酸臭蚁种群中,共检测到128个等位基因,平均等位基因个数为25.600。各个位点等位基因丰富度（AR）范围在7.600～14.664之间,平均表观杂合度（HO）和期望杂合度（HE）分别为0.460和0.663。对上述结果经t检验发现,黑头酸臭蚁大陆种群间的多样性和岛屿的相比没有显著性差异。在蚁群水平上,上川岛中各个蚁群的遗传多样性与其他地区的蚁群相比呈现出多样性水平低,但没有显著性差异。在种群水平上,除了山咀和北海两地种群外,上川岛种群的表观杂合度（HO）显著低于大陆部分地区即上川岛黑头酸臭蚁种群遗传多样性显著低于大陆部分地区种群的遗传多样性。基于线粒体COI基因序列对黑头酸臭蚁地理种群间的序列变异分析,结果显示序列片段长度为610bp,总共7个单倍型。大陆与岛屿种群均处于中低水平的遗传多样性,与利用微卫星标记各个地理种群的分析方法得到的结果相似。3比较研究了地理隔离对黑头酸臭蚁种群遗传结构的影响对黑头酸臭蚁种群进行贝叶斯聚类分析发现,大陆与岛屿的黑头酸臭蚁各个种群及蚁群有较高的混合比例,与地理分布没有相关性。种群遗传分化结果显示,有的岛屿与大陆种群之间的处于低等水平分化程度。除了山咀种群外,上川岛的种群与其他大陆和岛屿间种群有中高等遗传分化(FST>0.05)。Mantel检验发现各个大陆和岛屿的蚁群间的遗传距离与地理距离没有显著相关性。经分子方差分析（AMOVA）结果显示,黑头酸臭蚁的遗传变异来源于蚁群内个体间。对各个种群间所有个体进行相关性分析发现,上川岛不同蚁群的个体间相关性R值（识别度）相比其他蚁群高,并且种群遗传多样性低,与其他种群遗传分化程度高,这有利于其岛屿种群形成超级蚁群。BOTTLEN ECK分析显示,山咀、湛江、梅州、涠洲、东澳岛这几个种群在近期可能经历过瓶颈效应。对11个黑头酸臭蚁地理种群进行中性检验发现,总体分析Tajima’s D和Fu’s Fs的值分别为-0.0725和-0.250,结合整个种群单倍型错配分析发现,整个大陆和岛屿种群处于一个相对稳定发展状态。

关键词：黑头酸臭蚁微卫星分子标记线粒体COI基因地理隔离种群遗传多样性种群遗传结构

来源：评论

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