本发明属于分子生物学技术领域，具体涉及一种基于绿鳍马面鲀转录组测序获得的评估绿鳍马面鲀种群遗传多样性的SSR标记引物、方法及其在群体遗传多样性分析中的应用。该SSR标记引物包括10对，分别为引物对1、引物对2、引物对3、引物对4、引物对5、引物对6、引物对7、引物对8、引物对9和引物对10，所述引物对1‑10的核苷酸序列分别如SEQ ID NO：1~20所示。该引物扩增稳定，多态性强，杂合度高。该SSR分子标记用于绿鳍马面鲀种质鉴定、遗传多样性分析等领域，为今后绿鳍马面鲀种质资源调查、开发和保护提供理论基础，并为我国绿鳍马面鲀主要产地的资源状况、人工养殖及品种培育提供理论依据，为分子标记辅助育种打下基础。
为探究柴达木盆地子午沙鼠种群遗传多样性及系统发生,我们对采集自冷湖、苏干湖、花土沟、格尔木、都兰和乌兰6个地理种群的子午沙鼠的mt DNA cyt-b进行测序分析,获得了755bp的序列,包括28个多态性核苷酸变异位点,占全部碱基数的3.71%...
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为探究柴达木盆地子午沙鼠种群遗传多样性及系统发生,我们对采集自冷湖、苏干湖、花土沟、格尔木、都兰和乌兰6个地理种群的子午沙鼠的mt DNA cyt-b进行测序分析,获得了755bp的序列,包括28个多态性核苷酸变异位点,占全部碱基数的3.71%。共有22个单倍型,6个地理种群间无共享单倍型。冷湖种群遗传多样性最高(Hd=1.000;π=0.006),苏干湖种群遗传多样性最低(Hd=0.345;π=0.00178),且与其他种群之间有较高水平的遗传分化。分子变异分析(AMOVA)的结果显示:61.68%的变异来自种群内,38.32%的变异来自种群间。各地理种群间遗传距离与地理距离不相关(Mantel test:r=0.031,0p=0.938)。种群系统发生关系表明,柴达木盆地各种群之间的分化与末次冰期柴达木古湖的分离干化、青藏高原泛湖期相关,随着柴达木古湖的消亡,由西天山向东经当金山口扩散到冷湖的子午沙鼠在柴达木地区迅速扩张。约50ka BP,柴达木盆地气候开始变暖,降水量增加,盆地内位于冷湖与苏干湖之间的昆特依干盐湖和横跨格尔木与都兰的察尔汗盐湖湖面升高,面积扩大,这种环境变化不仅使种群内部遗传变异率升高,同时也形成了天然的隔离带,导致各种群间的相互隔离。
目的:为了探讨我国细颈囊尾蚴(Cysticercus tenuicollis)种群之间的遗传相似性、遗传差异及与其他带科带属绦虫的亲缘关系。方法:用PCR扩增分离自我国四川和云南2省7地区猪、山羊和绵羊共33个细颈囊尾蚴的线粒体细胞色素B(Cyt b)基因全序列并测序,用Clustal X 1.81程序对序列进行比对,DNAstar中的Megalign程序进行同源性分析,DnaSP4.0分析软件计算种群的核苷酸多样性
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